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大口黑鲈MsDmrt3的基因结构、系统进化及时空表达

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中国水产科学 2021年第11期28卷 1406-1416页

作者：生锡绘董浚键孙成飞李武辉胡婕田园园高风英闫宁宁杨超卢迈新陈刚叶星广东海洋大学水产学院中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室上海海洋大学水产与生命学院

基于大口黑鲈(Micropterus salmoides)全长转录组数据,克隆测序获得大口黑鲈MsDmrt3 cDNA序列,其开放阅读框为1245bp,共编码474个氨基酸,含有高保守的DM结构域和DMA结构域,且DM结构域有2个保守的锌指样结合位点。蛋白三维预测结构与人(H... 详细信息

基于大口黑鲈(Micropterus salmoides)全长转录组数据,克隆测序获得大口黑鲈MsDmrt3 cDNA序列,其开放阅读框为1245bp,共编码474个氨基酸,含有高保守的DM结构域和DMA结构域,且DM结构域有2个保守的锌指样结合位点。蛋白三维预测结构与人(Homo sapiens)和青鳉(Oryzias latipes)的DMRT3相似。结合大口黑鲈基因组数据分析显示,MsDmrt3位于基因组7号染色体上,基因序列长3353bp,由2个外显子与1个内含子组成。进化树聚类分析显示, Ms DMRT3属于DMRT3家族,且可能与低等节肢动物Dmrt93B起源于共同的原始DMRT。对大口黑鲈14种组织以及8个发育时期的MsDmrt3基因的表达情况进行定量分析,结果显示MsDmrt3基因在成熟个体的脊髓中高表达,精巢和眼次之,但在卵巢和肝脏几乎不表达;MsDmrt3在各发育时期均有表达,在6dpf前呈逐渐上调趋势,之后逐渐下调至最低水平。本研究表明, MsDmrt3基因序列与结构具有高保守性,且具有显著的性别表达二态性,推测其与性别决定和分化有关。同时,根据MsDmrt3基因在脊椎和胚胎发育早期的高表达,推测其可能在神经系统和胚胎早期生长发育中发挥作用。本研究旨在为大口黑鲈性别决定与性别分化分子机制的深入研究奠定基础。

关键词：大口黑鲈 MsDmrt3基因基因结构系统进化分析时空表达

大口黑鲈鲁氏耶尔森氏菌的分离鉴定、主要毒力基因及致病性研究

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水产学报 2022年第5期46卷 825-835页

作者：王巧煌林楠元丽花季静林丹福建省水产技术推广总站福建省农林大学

为探明2021年3月福建某水库养殖大口黑鲈疾病暴发的原因，实验从患病大口黑鲈肝脏、肾脏、脾脏中分离优势菌，通过人工感染实验确定病原菌，并综合16S rDNA基因序列分析、生理生化和质谱特征等技术对该病原菌进行种属鉴定，同时，进行... 详细信息

为探明2021年3月福建某水库养殖大口黑鲈疾病暴发的原因，实验从患病大口黑鲈肝脏、肾脏、脾脏中分离优势菌，通过人工感染实验确定病原菌，并综合16S rDNA基因序列分析、生理生化和质谱特征等技术对该病原菌进行种属鉴定，同时，进行毒力基因检测、药物敏感性实验以及组织病理学观察。结果显示，从病鱼脾脏中分离获得1株优势菌并鉴定为鲁氏耶尔森氏菌；该菌株对大口黑鲈的半致死剂量为3.8×10~5 CFU/尾；该菌株携带yrP1、yhl A、yhl B等毒力基因，对恩诺沙星、盐酸多西环素、氟甲喹、硫酸新霉素、氟苯尼考等5种药物相对敏感。组织病理学观察发现，鲁氏耶尔森氏菌的感染造成大口黑鲈肝脏、肾脏、脾脏不同程度的损伤，表现为明显的变性、坏死及炎症细胞的浸润等。本研究首次报道了鲁氏耶尔森氏菌对养殖大口黑鲈的致病性，可为养殖大口黑鲈鲁氏耶尔森氏菌病的诊断和药物防治提供参考依据。

关键词：大口黑鲈鲁氏耶尔森氏菌分离鉴定致病性药物敏感性

大口黑鲈摄食含小肽饲料后的胃排空特征和消化酶活性变化

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动物营养学报 2022年第7期34卷 4642-4656页

作者：丛湘明李向华雪铭宓水潮杭莹易婉婷上海海洋大学农业农村部环境生态与鱼类营养研究中心上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水生遗传资源重点实验室上海201306 上海海洋大学国家水产科学实验教育示范中心上海201306 常州亚源生化科技有限公司常州213111

为探究小肽对大口黑鲈(Micropterus salmoides)胃排空特征和消化酶活性变化规律的影响,配制3种试验饲料,D0^(+)饲料满足大口黑鲈的营养需求(正对照组),D0^(-)饲料在D0^(+)饲料基础上降低3%蛋白质水平(负对照组),D2饲料则在D0^(-)饲料基... 详细信息

为探究小肽对大口黑鲈(Micropterus salmoides)胃排空特征和消化酶活性变化规律的影响,配制3种试验饲料,D0^(+)饲料满足大口黑鲈的营养需求(正对照组),D0^(-)饲料在D0^(+)饲料基础上降低3%蛋白质水平(负对照组),D2饲料则在D0^(-)饲料基础上添加2%小肽。这3种饲料投喂初始体重在(21.27±0.17)g的大口黑鲈60 d,每组4个重复,每个重复45尾。饲养试验结束后每组分别挑选规格相同、体重为(85.58±1.81)g的大口黑鲈80尾,放入8个网箱中,每个网箱10尾。所有网箱的鱼投喂与养殖试验对应的饲料,表观饱食投喂1次,在投喂结束后的0、3、6、9、12、18、24、30 h随机对各组8个网箱中的1个网箱取样。比较摄食上述3种饲料后胃内容物剩余重量百分比、3种数学模型对各组胃排空曲线的拟合程度以及消化酶活性变化。结果发现:使用大口黑鲈胃内容物干重进行拟合效果较好,饲料中蛋白质水平的变化及添加小肽对大口黑鲈的胃排空特征及最优模型未产生显著影响,胃排空变化均为先慢后快再慢型,但变化趋势不尽相同。线性、指数和平方根模型均能很好地拟合大口黑鲈的胃排空曲线,模拟D0^(+)组胃排空规律的最佳模型是指数模型,D0^(-)组和D2组的最佳模型是平方根模型。根据各组最佳模型计算可知50%和80%胃排空的理论时间,D0^(+)组分别为8.14和19.04 h,D0^(-)组分别为11.28和21.40 h,D2组分别为10.21和19.67 h。3组大口黑鲈胃肠道中的消化酶(淀粉酶、蛋白酶和脂肪酶)活性在胃排空过程中均呈先升高后降低的趋势,D0^(+)组摄食后9 h时胃肠道中的淀粉酶、脂肪酶和蛋白酶活性达到最高值,显著高于同组其他时间点(P大口黑鲈投喂间隔时间为8~21 h,每日2次。

关键词：大口黑鲈小肽胃排空率消化酶活性投喂频率

大口黑鲈POU1F1启动子区域SNPs对生长的影响

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水产学报 2011年第6期35卷 793-800页

作者：杜芳芳白俊杰李胜杰李小慧樊佳佳中国水产科学研究院珠江水产研究所中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室上海海洋大学水产与生命学院

采用基因组步移技术克隆了大口黑鲈垂体特异性转录因子POU1F1启动子序列,该序列全长1 629 bp,预测存在4个八聚体转录因子1(Oct-1)结合位点和TATA框等基本转录元件,1个Homeobox转录因子结合位点和2个cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合位点... 详细信息

采用基因组步移技术克隆了大口黑鲈垂体特异性转录因子POU1F1启动子序列,该序列全长1 629 bp,预测存在4个八聚体转录因子1(Oct-1)结合位点和TATA框等基本转录元件,1个Homeobox转录因子结合位点和2个cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合位点。采用直接测序法研究发现,大口黑鲈POU1F1启动子序列的-18和-183两个位点存在SNPs,该两个突变位点只检测到A、B两种单倍型。对养殖群体进行不同单倍型的基因频率和生长关联分析,结果表明,单倍型A的等位基因频率为0.246,单倍型B的等位基因频率为0.754;群体关联分析表明,基因型为AA型和AB型的个体在体质量、体长、全长、体高和体宽等方面明显高于BB型个体,但基因型为AB型和AA型的个体之间在体质量方面没有明显差异。该研究结果为下一步进行分子标记辅助选择提供了基础。

关键词：大口黑鲈垂体特异性转录因子单核苷酸多态性(SNPs) 关联分析

大口黑鲈Myf5基因cDNA和基因组序列的克隆与分析

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中国水产科学 2008年第4期15卷 568-576页

作者：郭玉函白俊杰劳海华叶星罗建仁上海200090 中国水产科学研究院珠江水产研究所中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室广东广州510380 上海海洋大学生命科学与技术学院

Myf5是生肌调节因子家族成员之一。为研究该基因在大口黑鲈(Micropterus salmoide)肌肉生长发育中的作用,运用RT-PCR和RACE技术获得大口黑鲈Myf5 cDNA序列1093bp,其中开放阅读框长723bp,编码240个氨基酸,经分析该蛋白无信号肽序列,属核... 详细信息

Myf5是生肌调节因子家族成员之一。为研究该基因在大口黑鲈(Micropterus salmoide)肌肉生长发育中的作用,运用RT-PCR和RACE技术获得大口黑鲈Myf5 cDNA序列1093bp,其中开放阅读框长723bp,编码240个氨基酸,经分析该蛋白无信号肽序列,属核蛋白,含有一典型的碱性螺旋-环-螺旋结构域。使用Genome walker技术获得启动子区序列2690bp,预测含有肌肉特异性转录调控相关元件:E-框、肌细胞特异增强子2(MEF2)、核转录因子1(SP1)、上游激活因子(USF)、血清应答因子(SRF)等结合位点。含有早期生长应答因子α(EGRα)、早期快反应生长应答因子1,2(EGR-1,2)等结合位点,它们可能是Myf5能够在体节形成早期表达的主要原因。获得Myf5 3个外显子与2个内含子序列,内含子1中存在一个在不同鱼类中高度保守的长度为123bp的序列,推测参与调节了Myf5基因的时空和组织特异性表达。本研究旨为进一步研究该基因对大口黑鲈肌肉生长发育的作用机理奠定基础。

关键词：肌肉 Myf5基因调节大口黑鲈

大口黑鲈对饲料中丁基羟基茴香醚的耐受性评价

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动物营养学报 2016年第3期28卷 747-758页

作者：于利莉薛敏王嘉韩芳郑银桦吴秀峰吴立新大连海洋大学水产与生命学院大连116023 中国农业科学院饲料研究所国家水产饲料安全评价基地北京100081

本试验旨在通过生长性能、血浆生化指标、组织抗氧化指标及肝脏、肠道组织学变化,评价大口黑鲈对饲料中丁基羟基茴香醚(BHA)的耐受性。以初始体重为(6.20±0.01)g的大口黑鲈为靶动物,在基础饲料中依次添加0(D0组,作为对照组)、150(D150... 详细信息

本试验旨在通过生长性能、血浆生化指标、组织抗氧化指标及肝脏、肠道组织学变化,评价大口黑鲈对饲料中丁基羟基茴香醚(BHA)的耐受性。以初始体重为(6.20±0.01)g的大口黑鲈为靶动物,在基础饲料中依次添加0(D0组,作为对照组)、150(D150组)、300(D300组)和1 500 mg/kg(D1500组)的BHA,其中300和1 500 mg/kg分别是最高推荐剂量(150 mg/kg)的2和10倍,进行为期10周的饲喂试验。每组6个重复,每个重复30尾鱼。结果表明:4组中以D150组的生长性能最好,其余各组的终末均重、特定生长率、增重率和摄食量无显著差异(P>0.05)。各组肥满度、脏体比和肝体比无显著差异(P>0.05)。对照组血浆中总胆固醇、甘油三酯含量及碱性磷酸酶活性显著高于其余各组(P0.05)。D150和D300组肝脏中超氧化物歧化酶活性显著低于对照组(P0.05)。饲料中添加1 500 mg/kg BHA可以显著提高肝脏中总抗氧化能力(P大口黑鲈的肝脏、肠道都有不同程度的损伤,但D150和D1500组的损伤相对较少。上述结果表明,饲料中添加150 mg/kg BHA对大口黑鲈具有一定的脂肪代谢促进作用和抗氧化保护功能,且对大口黑鲈是安全的,安全系数为10倍。

关键词：大口黑鲈丁基羟基茴香醚耐受性生长血液指标抗氧化组织学

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循环水养殖大口黑鲈摄食颗粒饲料的声学特征

农业工程学报 2021年第20期37卷 219-225页

作者：曹晓慧刘晃戚仁宇张成林刘世晶上海海洋大学水产与生命学院上海201306 中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所上海200092

为突破智能投饲系统的技术瓶颈,近年来采用被动声学技术开展鱼虾摄食行为研究成为热点之一。该研究主要采用被动声学技术获取单体大口黑鲈(Micropterus salmoides)摄食声信号,从混合信号中提取完善的摄食信号,筛选可作为衡量大口黑鲈摄... 详细信息

为突破智能投饲系统的技术瓶颈,近年来采用被动声学技术开展鱼虾摄食行为研究成为热点之一。该研究主要采用被动声学技术获取单体大口黑鲈(Micropterus salmoides)摄食声信号,从混合信号中提取完善的摄食信号,筛选可作为衡量大口黑鲈摄食活跃度的声学特征参数,以期对摄食活跃度进行量化。根据大口黑鲈喂食期间的同步音频与视频记录,确定信号类别并进行标记,主要提取每次吞食饲料的时域与频域特征,对比各参数与吞食次序之间的相关度。研究结果表明,摄食声信号能量主要集中于4.2~7.4 kHz,且大口黑鲈吞食间隔与吞食次序呈正相关,稳定性较强;而时域特征中的波形振幅极差与频域特征的功率积分值均与吞食次序呈负相关。吞食间隔、振幅极差及功率积分值均可以作为衡量摄食活跃度的量化指标,而共振峰与平均梅尔倒谱系数可作为摄食声识别参数,研究结果可为今后养殖鱼类被动声学智能投饲系统研发提供理论基础。

关键词：水产养殖摄食行为声信号大口黑鲈

大口黑鲈(Micropterus salmoides)致病性维氏气单胞菌的分离鉴定及其特性分析

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海洋与湖沼 2022年第5期53卷 1180-1188页

作者：雷宁郝贵杰黄爱霞王雨辰林锋沈小明朱俊杰湖州师范学院生命科学学院浙江湖州313000 农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省鱼类健康与营养重点实验室浙江省淡水水产研究所浙江湖州313001 德清昊源水产种业有限公司浙江湖州313200

大口黑鲈(Micropterus salmoides)是我国重要的淡水养殖经济鱼类品种,目前包括细菌性疾病在内的诸多因素影响了其养殖业的健康发展。维氏气单胞菌是引起淡水鱼败血症和溃疡综合征的重要病原菌。从患病大口黑鲈肝脏组织中分离到1株病原菌... 详细信息

大口黑鲈(Micropterus salmoides)是我国重要的淡水养殖经济鱼类品种,目前包括细菌性疾病在内的诸多因素影响了其养殖业的健康发展。维氏气单胞菌是引起淡水鱼败血症和溃疡综合征的重要病原菌。从患病大口黑鲈肝脏组织中分离到1株病原菌,通过形态学观察、生理生化特性分析、16S rRNA序列和特定毒力基因分析对其进行鉴定,并通过人工回归感染试验和药敏试验分析其致病性和耐药性。结果表明该菌为致病性维氏气单胞菌(Aeromonas veronii),含有aer、act、lip、fla、gcaT和OMPA I等毒力基因;药敏试验显示其对头孢曲松、氯霉素、氟苯尼考、强力霉素、四环素、多粘菌素、复方新诺明、左氟沙星等8种抗生素高度敏感,对新霉素、恩诺沙星、庆大霉素、链霉素、阿齐霉素、环丙沙星等6种抗生素中度敏感,对其他8种抗生素具有一定耐药性;人工回归感染实验表明该菌具有较高的致病性,对大口黑鲈的半致死浓度为1.4×10^(6) CFU/mL。维氏气单胞菌是水产养殖中的条件性致病菌,研究结果揭示了该菌株的部分生物学特性,有利于丰富维氏气单胞菌属的基础数据,同时也为鲈鱼养殖过程中的病害防控提供了一定的参考依据。

关键词：大口黑鲈维氏气单胞菌药敏试验毒力基因

大口黑鲈养殖塘水-气界面CO2、CH4、N2O排放特征及其影响因素

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水生生物学报 2024年

作者：卢慧贤李诗琦李民敬郭超覃丽蓉张堂林刘家寿李为中国科学院水生生物研究所水产品种创制与高效养殖重点实验室中国地质大学环境学院中国科学院大学湖北省稻田综合养殖工程技术研究中心

为探究大口黑鲈（Micropterus salmoides）养殖系统温室气体的排放特征和规律,于2023年7月—2023年10月采用静态箱-气相色谱法对大口黑鲈养殖塘水-气界面CO2、CH4、N2O排放通量进行了测定,并结合水体表层环境因子和氮磷营养变化分析了... 详细信息

为探究大口黑鲈（Micropterus salmoides）养殖系统温室气体的排放特征和规律,于2023年7月—2023年10月采用静态箱-气相色谱法对大口黑鲈养殖塘水-气界面CO2、CH4、N2O排放通量进行了测定,并结合水体表层环境因子和氮磷营养变化分析了其主要影响因素。结果表明:监测期间大口黑鲈养殖塘水-气界面CO2、CH4、N2O的排放通量均值分别为（241.4±14.5）、（1.38±0.31）和（0.24±0.04） mg/（m2·h）,养殖塘整体上表现为温室气体排放源。皮尔森分析结果表明CO2排放通量与水温（WT）、温度（T）、叶绿素a（Chl.a）、压强（P）和pH呈显著正相关,与氨氮（NH+4-N）呈显著负相关;N2O排放通量与总氮（TN）、亚硝态氮（NO-2-N）、硝态氮（NO-3-N）和溶解氧（DO）呈显著正相关,与WT呈显著负相关;CH4排放通量与环境因子无显著相关关系。冗余分析表明WT是影响水-气界面CO2、CH4、N2O排放的关键环境因子。在90d的重要养殖期内,大口黑鲈养殖塘百年全球增温潜势为7.74×103kg/hm2,暗示大口黑鲈池塘养殖或有促进温室效应的潜力。

关键词：温室气体排放通量全球增温潜势大口黑鲈池塘养殖