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昆虫学报 1987年第4期30卷 377-386页

作者：金明洁蔡宜权中国科学院武汉病毒研究所

应用杂交法和混合酶解法组建棉铃虫(Heliothis armigera)核型多角体病毒(HaNPV)的基因组物理图谱。确定了XhoI酶解位点的全部顺序,部分确定了PstⅠ和BamHⅠ酶解片段的顺序和它们对XhoI位点的相对位置。

关键词：棉铃虫核型多角体病毒基因组物理图谱限制性内切酶 DNA杂交

鸡沙门菌NCTC13346株基因组物理图谱的建立与结构特征的比较

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哈尔滨医科大学学报 2006年第6期40卷 450-453页

作者：祁丹妮张凤民哈尔滨医科大学微生物学教研室黑龙江省高校重点实验室黑龙江哈尔滨150081

目的建立鸡沙门菌NCTC13346株基因组物理图谱,并比较其结构特征。方法制备鸡沙门菌NCTC13346株基因组DNA,用rrl基因特异性的I-CeuⅠ内切酶以及限制性内切酶XbaⅠ和AvrⅡ酶切后,进行脉冲凝胶电泳(PFGE),分离出DNA片段,最后用噬菌体P22转... 详细信息

目的建立鸡沙门菌NCTC13346株基因组物理图谱,并比较其结构特征。方法制备鸡沙门菌NCTC13346株基因组DNA,用rrl基因特异性的I-CeuⅠ内切酶以及限制性内切酶XbaⅠ和AvrⅡ酶切后,进行脉冲凝胶电泳(PFGE),分离出DNA片段,最后用噬菌体P22转导已知携带沙门氏菌基因的Tn10插入子的方法定位基因排列,根据酶切片断的连接与已知基因的定位,绘制该菌的基因组结构物理图,并与已知鸡沙门菌SARB21基因组结构进行比较。结果建立鸡沙门菌NCTC13346株基因组物理图谱,与鸡沙门菌SARB21基因组物理图谱相比,两者具有相对于鼠伤寒沙门氏菌LT2的相似的基因插入和缺失片段,但由于两者基因组中含有rrn操纵子的DNA片段的不同排列,分别表现为迥异的基因组结构。结论建立鸡沙门菌基因组物理图谱可用于分析同种细菌的基因组特点与进化。

关键词：鸡沙门菌基因组物理图谱 I-CeuⅠ 基因组重排脉冲凝胶电泳

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应用荧光原位杂交技术构建日本血吸虫基因组物理图谱草图

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应用荧光原位杂交技术构建日本血吸虫基因组物理图谱草图

作者：莫筱瑾中国疾病预防控制中心

学位级别：硕士

[目的]应用荧光原位杂交技术构建日本血吸虫基因组物理图谱草图,明确日本血吸虫BAC克隆在日本血吸虫染色体上的定位,获取更多相关信息,探寻定位在性染色体上的BAC克隆,为新的潜在药物和候选疫苗靶点提供线索,为日本血吸虫精细测序提供基... 详细信息

[目的]应用荧光原位杂交技术构建日本血吸虫基因组物理图谱草图,明确日本血吸虫BAC克隆在日本血吸虫染色体上的定位,获取更多相关信息,探寻定位在性染色体上的BAC克隆,为新的潜在药物和候选疫苗靶点提供线索,为日本血吸虫精细测序提供基础,为改善现有日本血吸虫药物靶点和疫苗研究现况提供帮助。 [方法]从日本血吸虫细菌人工染色体克隆文库中,随机挑选100个细菌人工染色体单克隆,抽提获得这100个细菌人工染色体克隆DNA。以安徽贵池阳性钉螺为原料,制备获得日本血吸虫中期染色体玻片。采用C显带方法识别日本血吸虫8对染色体,并计算20个日本血吸虫染色体分裂相中所有染色体的相对长度和臂比值。采用荧光原位杂交方法或双色荧光原位杂交方法,将随机挑选的100个日本血吸虫BAC克隆DNA标记生物素或地高辛作为探针,先与日本血吸虫中期染色体进行杂交,后与FITC-亲和素或罗丹明-抗地高辛抗体结合,最后经DAPI荧光染料复染,观察BAC克隆在日本血吸虫中期染色体上的定位。采用双色荧光原位杂交方法,将分属于9个重叠群支架（supercontig）的20个BAC克隆定位在日本血吸虫染色体上。选择9个经全序列测序的BAC克隆,用生物学信息分析软件进行基因预测和基因注释分析。 [结果]抽提获得随机挑选的100个BAC克隆DNA,并预测BAC克隆大小主要集中在75kb-140kb之间。以日本血吸虫阳性钉螺为原料,制备获得300张日本血吸虫中期染色体玻片。计算日本血吸虫染色体臂比值,得到日本血吸虫核型公式为：2n=6m+6st+4sm（ZZ）和2n=5m+6st+5sm（ZW）。日本血吸虫染色体经C带分析,获得日本血吸虫8对染色体C带模式图。采用荧光原位杂交技术或双色荧光原位杂交技术将随机挑选的100个BAC克隆中的97个BAC克隆分别定位在日本血吸虫7对常染色体和1对性染色体上,其中有22个定位在1号染色体;各有14个定位在2号和3号染色体;有9个定位在4号染色体;各有3个定位在5号、6号和7号染色体;有38个定位在2条性染色体。应用双色荧光原位杂交技术验证并非所有属于同一个supercontig的BAC克隆都定位在相同染色体的同一部位。预测9个经全长测序的BAC克隆所含的基因和其功能,并选择蛋白长度大于90个氨基酸的序列进行翻译,发现每个BAC克隆包含12-25个不等的蛋白序列。 [结论]采用荧光原位杂交和双色荧光原位杂交技术,首次构建日本血吸虫基因组物理图谱。日本血吸虫有7对常染色体和1对性染色体,按染色体大小,将这8对染色体分为3组：第一组为1号染色体和性染色体;第二组为2号、3号和4号染色体;第三组为5号、6号和7号染色体。按染色体臂比值计算结果,获得日本血吸虫染色体核型公式为2n=6m+6st+4smm（ZZ）和2n=5m+6st+5sm（ZW）,初步认为日本血吸虫性染色体Z属于中部着丝粒染色体,W属于亚中部着丝粒染色体,不属于亚端部着丝粒染色体,与曼氏血吸虫性染色体不同。明确从基因组文库中随机挑选的97个BAC克隆在日本血吸虫8对染色体上的定位,其中有38个BAC克隆定位在日本血吸虫性染色体,这些BAC克隆的序列信息可为今后寻找新的潜在的药物靶点和疫苗靶点提供线索。对于前期基因组草图研究中获得的supercontig,本研究应用双色荧光原位杂交技术验证并非所有同属于一个supercontig的BAC克隆都定位在同一个染色体的相同或相近部位,说明日本血吸虫基因组草图拼装方法有待改进。用生物学信息软件分析了9个BAC克隆序列,并预测每个BAC克隆包含12-25个不等的蛋白序列及其功能,为将来目的基因信息挖掘提供帮助。

关键词：日本血吸虫荧光原位杂交细菌人工染色体 C带基因组物理图谱中期染色体序列分析

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水稻基因组物理图谱构建完成

生命的化学 1997年第2期17卷 16-16页

作者：李潇

水稻基因组物理图谱构建完成中国科学院国家基因研究中心洪国藩研究员在１９９６年举行的国际水稻分子生物学会议上报告，他们研究组已完成高分辨率水稻基因组物理图谱的构建。水稻基因组研究计划包括三个阶段工作；遗传图的构建、物理... 详细信息

水稻基因组物理图谱构建完成中国科学院国家基因研究中心洪国藩研究员在１９９６年举行的国际水稻分子生物学会议上报告，他们研究组已完成高分辨率水稻基因组物理图谱的构建。水稻基因组研究计划包括三个阶段工作；遗传图的构建、物理图的构建和ＤＮＡ全序列测定。水稻基...

关键词：基因组物理图谱水稻中国科学院国家基因研究中心

荧光原位杂交技术在血吸虫生物学中的应用及进展

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2011年第3期29卷 224-228,232页

作者：莫筱瑾冯正胡薇中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所卫生部寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织疟疾、血吸虫病和丝虫病合作中心上海200025

血吸虫病是危害最为严重的寄生虫病之一。深入探索血吸虫功能基因可为该病的诊断、疫苗和药物靶点研究提供基础和依据。荧光原位杂交技术可用于血吸虫的功能基因在染色体上定位、构建基因组物理图谱和染色体识别等方面的研究。本文就荧... 详细信息

血吸虫病是危害最为严重的寄生虫病之一。深入探索血吸虫功能基因可为该病的诊断、疫苗和药物靶点研究提供基础和依据。荧光原位杂交技术可用于血吸虫的功能基因在染色体上定位、构建基因组物理图谱和染色体识别等方面的研究。本文就荧光原位杂交技术在血吸虫研究中的应用,以及将来可行的研究方向作一简要综述。

关键词：血吸虫荧光原位杂交功能基因染色体定位基因组物理图谱

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科技动态

中国科技投资 2012年第12期 8-9页

"十二五"863计划"鲤生长等经济性状的主效基因发掘及育种潜力评估"课题取得阶段性进展近日,"十二五"863计划"鲤生长等经济性状的主效基因发掘及育种潜力评估"课题召开工作会,该课题完成了鲤鱼200倍覆盖度的全基因组测序,装配获得鲤鱼基... 详细信息

"十二五"863计划"鲤生长等经济性状的主效基因发掘及育种潜力评估"课题取得阶段性进展近日,"十二五"863计划"鲤生长等经济性状的主效基因发掘及育种潜力评估"课题召开工作会,该课题完成了鲤鱼200倍覆盖度的全基因组测序,装配获得鲤鱼基因组框架图谱,建立了BAC文库,构建了鲤鱼基因组物理图谱,建立了鲤鱼高密度连锁图谱、鲤鱼-斑马鱼比较基因组图谱、鲤鱼基因组资源数据库和网站。项目组构建的鲤基因组资源数据库网站(Common Carp Genome Database)为公共服务性、界面友好的交互式网站,为非生物信息专业人员查找信息资源和进行在线数据分析提供了平台,将会有力促进鲤基因组资源的广泛共享和利用。

关键词：鲤鱼育种潜力空间天气压电材料压电体电介质基因组图谱在线数据分析石墨烯薄膜科技动态非生物信息基因组物理图谱主效基因

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你知道吗?

科学与文化 2008年第12期 16-17页

为什么十雾九晴?形成雾的条件有三个:一是近地层的水汽比较充足;二是空气中要有较多的凝结核;三是空气中的水汽要能够达到过饱和。一般情况下,近地层的水汽是较充足的。凝结核,如尘埃、烟粒等,空气中是具备的。关键在第三个条件,

关键词：油气田近地层莫扎特效应基因组物理图谱凝结核土壤细菌过饱和沙漠区

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资讯

中国花卉园艺 2018年第7期 52-53页

科学家成功绘制"墨兰基因组物理图谱"本刊讯3月23日上午,中国花卉协会兰花分会在广东翁源举办了"墨兰基因组与国兰形态的进化"新闻发布会,科学家成功绘制了"墨兰基因组物理图谱",揭示了国兰观赏性状的分子调控机制。未来,兰花品种有望实... 详细信息

科学家成功绘制"墨兰基因组物理图谱"本刊讯3月23日上午,中国花卉协会兰花分会在广东翁源举办了"墨兰基因组与国兰形态的进化"新闻发布会,科学家成功绘制了"墨兰基因组物理图谱",揭示了国兰观赏性状的分子调控机制。未来,兰花品种有望实现"个性化"订制。墨兰品种繁多,是国兰中较为庞大的家族,具有较高的观赏价值。为了抢占科研先机,获取大量基因资源和信息,2017年1月,广东省农科院环境园艺研究所、深圳市兰科植

关键词：上海植物园基因组物理图谱兰科植物