检索结果-南通市图书馆

作者：杨萌北京协和医学院

学位级别：硕士

我国是葛属植物的起源和分布中心之一,约有葛属植物11种（9种及2变种）,其中野葛（Pueraria lobata（Willd）Ohwi）和甘葛藤（Pueraria thomsonii Benth）资源丰富,作为中药材葛根的基原植物在生活中有着较为广泛的应用。野葛和甘葛藤... 详细信息

我国是葛属植物的起源和分布中心之一,约有葛属植物11种（9种及2变种）,其中野葛（Pueraria lobata（Willd）Ohwi）和甘葛藤（Pueraria thomsonii Benth）资源丰富,作为中药材葛根的基原植物在生活中有着较为广泛的应用。野葛和甘葛藤经加工后的干燥根曾被统称为葛根。传统医学认为葛根具有解肌退热、透疹、生津、升阳止泻等功效。现代药理学研究表明,葛根除可以改善和治疗心脑血管疾病之外,还可以治疗糖尿病和高血压、降低血液中的酒精含量等,而粉葛与野葛的有效成分种类相似,含量差异较大。故在2005年《中国药典》中将二者进行了区分。随着人们对健康与养生的日益重视,葛根和粉葛在生活中的应用越来越广泛,然而野葛、甘葛藤的外观性状十分相似,经过炮制加工后的中药饮片则更加难以区分,这在很大程度上影响了对葛根和粉葛的鉴别、规范化使用以及临床药效等。本研究首次以野葛和甘葛藤作为试验材料,提取叶片总DNA,然后构建DNA测序文库,由Illumina HiSeq X-ten平台进行高通量测序,使用系列生物信息软件对测序数据进行拼接组装及基因组比较分析,分别得到野葛和甘葛藤的完整叶绿体基因组序列,通过对二者进行叶绿体基因组比较分析和分子标记的开发寻找可用有效区分野葛和甘葛藤的分子标记,同时从叶绿体基因组水平探寻其在豆科植物系统发育中的位置关系,从分子标记和叶绿体基因组水平对市场中常见的峨眉葛进行鉴定,从叶绿体基因组水平判定其为甘葛藤的一个品种。此外还对叶绿体叶绿体基因组中的小RNA进行了初步预测。研究结果表明:野葛和甘葛藤叶绿体基因组皆为典型的环状四分结构,即长单拷贝区（LSC）、短单拷贝区（SSC）、两个反向互补区（IRa、IRb）;野葛叶绿体基因组全长153,393 bp,LSC区、SSC区及IR区的长度分别为84,089 bp、17,992 bp、25,656bp,甘葛藤叶绿体基因组全长为153,441 bp,LSC区、SSC区及IR区长度分别为84,162 bp、25,640 bp、17,999 bp;野葛LSC区、SSC区、IR区的GC含量分别为 32.87%、28.90%、41.87%,甘葛藤 LSC 区、SSC 区、IR区的 GC 含量则为 32.86%、28.90%、41.88%。比较基因组分析发现野葛和甘葛藤叶绿体基因组间的差异位点多位于非编码区,基因编码区也有少部分差异位点存在。通过对差异区进行了分子标记的开发,针对高变区设计了 PCR引物,筛选出6对可以快速、有效鉴别野葛、甘葛藤的分子标记。对比对上叶绿体基因组的小RNA进行分析,发现长度18到20 nt的小RNA较多,且其clean reads加和数目超过总的小RNA clean reads数的60%。小RNA在野葛叶绿体基因组中的分布存在两个聚集区,分别位于反向互补区（IRa和IRb）,这与甜瓜等物种上的结果较为一致,暗示着这些小RNA在叶绿体中的分布较为保守。最后,将野葛、甘葛藤叶绿体基因组与已发表的42个豆科物种叶绿体基因组进行了系统发育分析,烟草和拟南芥作为外类群物种,探究了野葛及甘葛藤在豆科植物中的系统发育位置,结果表明野葛与甘葛藤在豆科植物中聚为一小支,与大豆、豇豆属植物的亲缘关系最为接近,与传统植物分类学中的分类结论一致。本研究结果对于葛属植物资源的分类鉴别及药材混伪品的鉴别有一定的参考价值。

关键词：野葛甘葛藤叶绿体基因组比较分析分子标记鉴别

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绒毛栗色鼠尾草叶绿体基因组结构及系统进化分析

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分子植物育种 2024年

作者：徐元江胡盈赵芳玉重庆市中药研究院西藏农牧学院食品科学学院

为明确绒毛栗色鼠尾草的叶绿体基因组结构与进化特征，本研究基于IlluminaHiSeq 4000测序仪对其叶绿体基因组进行测序、组装和注释，并对其特征与系统进化关系进行分析。结果表明，绒毛栗色鼠尾草叶绿体基因组全长为151 590 bp，GC含量... 详细信息

为明确绒毛栗色鼠尾草的叶绿体基因组结构与进化特征，本研究基于IlluminaHiSeq 4000测序仪对其叶绿体基因组进行测序、组装和注释，并对其特征与系统进化关系进行分析。结果表明，绒毛栗色鼠尾草叶绿体基因组全长为151 590 bp，GC含量为38.0%，为典型的环状四分体结构；叶绿体基因组有134个编码基因，其中编码蛋白的基因为85个，RNA基因45个，假基因2个；绒毛栗色鼠尾草叶绿体基因组具有210个简单重复序列(simple sequence repeats， SSR)位点，以单核苷酸重复为主；密码子分析表明，编码亮氨酸(Leu)的密码子最多，占比为10.51%，同义密码子相对使用频率(RSCU)值大于1的密码子有30个，且多以A/U结尾为主。对唇形科74个叶绿体基因组构建系统发育树，发现绒毛栗色鼠尾草与戟叶鼠尾草亲缘关系最近。本研究为鼠尾草属的分子进化和系统发育研究提供了参考，为绒毛栗色鼠尾草的药用以及新品种选育等提供了依据。

关键词：叶绿体基因组基因组比较分析系统发育分析绒毛栗色鼠尾草

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白花除虫菊叶绿体基因组特征及系统发育研究

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基因组学与应用生物学 2024年第1期43卷 63-77页

作者：吕薇付瀚森李伽文刘科新柏锦学王彩云何杰芳曾拓贵州师范大学生命科学学院贵阳550000 华中农业大学园艺与林业科学学院教育部园艺植物生物学重点实验室农业农村部华中都市农业重点实验室武汉430000 云南南宝生物科技有限责任公司玉溪653100

白花除虫菊(Tanacetum cinerariifolium)是全球唯一集约化种植的杀虫园艺作物,从其头状花序提取的天然除虫菊酯广泛应用于有机农业和家居害虫防控,具有极高的商业价值。本研究通过Illumina HiSeq 2500测序平台对白花除虫菊叶绿体基因组... 详细信息

白花除虫菊(Tanacetum cinerariifolium)是全球唯一集约化种植的杀虫园艺作物,从其头状花序提取的天然除虫菊酯广泛应用于有机农业和家居害虫防控,具有极高的商业价值。本研究通过Illumina HiSeq 2500测序平台对白花除虫菊叶绿体基因组进行了测序,并对其结构特征及系统进化关系进行了分析。结果表明,白花除虫菊叶绿体基因组为典型的四分体结构,基因组大小为150171 bp,包括84个蛋白质编码基因、37个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因;密码子偏好性分析发现其叶绿体基因组中密码子末端偏好以A和U结尾,其中亮氨酸的密码子是最常用的,其使用UUA密码子的频率最高,RSCU值为1.88。在其叶绿体基因组中鉴定到简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)位点共41个,包含37个单核苷酸重复序列、4个复合型核苷酸重复序列;基于菊科(Asteraceae)39个叶绿体基因组序列构建的系统发育树表明,其叶绿体基因组高度保守,除近缘红花除虫菊(***)外,除虫菊类与同为菊科的植物蒿子杆(Ismelia carinata)亲缘较近。本研究结果能为白花除虫菊分子标记的开发、遗传多样性,以及为进一步研究菊蒿属(Tanacetum)植物的保护生物学和种群遗传学奠定基础。

关键词：除虫菊酯叶绿体基因组基因组比较分析系统发育分析白花除虫菊

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