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广西壮族自治区低档场所中老年嫖客与暗娼HIV-1感染者基因亚型研究

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中华流行病学杂志 2017年第3期38卷 326-330页

作者：邓月琴李剑军方宁烨王斌王江伟梁淑家沈智勇蓝光华张鸿满吴兴华陆华湘葛宪民广西医科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学教研室南宁530023 广西壮族自治区疾病预防控制中心艾滋病防制所南宁530028

目的了解广西壮族自治区低档场所中老年嫖客与暗娼的HIV-1感染者病毒基因亚型特征及传播规律。方法采用方便抽样的方法，于2012年对广西壮族自治区4个城市和9个县（区）低档场所的嫖客（年龄≥50岁）与暗娼开展分子流行病学调查，进行HI... 详细信息

目的了解广西壮族自治区低档场所中老年嫖客与暗娼的HIV-1感染者病毒基因亚型特征及传播规律。方法采用方便抽样的方法，于2012年对广西壮族自治区4个城市和9个县（区）低档场所的嫖客（年龄≥50岁）与暗娼开展分子流行病学调查，进行HIV-1抗体筛查，对HIV-1抗体阳性者血浆进行pol区基因片段扩增和序列测定，对获得的基因序列进行系统进化树构建并鉴定毒株的基因亚型，分析毒株亚型分布特征及传播规律。结果共招募4048例中老年嫖客和784例低档暗娼，共发现116例HIV-1抗体阳性，中老年嫖客与暗娼的HIV-1抗体阳性检出率分别为2．5％（103／4048）、1．7％（13／784），对其中84例HIV-1抗体阳性者进行基因扩增和序列测定，53例获得基因序列（中老年嫖客48例、暗娼5例）。发现3种基因亚型，均为重组株，CRF01_AE占90．6％（48／53），CRF08_BC占7．5％（4／53），CRF07_BC占1．9％（1／53）。经系统进化树分析发现，48例CRF01_AE流行毒株聚集成2个传播簇Cluster1和2；4例CRF08_BC聚集成1个传播簇。在CRF01_AECluster1中又形成4个亚簇C1-SC1、2、3、4，各亚簇对象来源于同一处或相邻低档场所、或与同一省道毗邻乡镇的低档场所。结论广西壮族自治区低档场所中老年嫖客与暗娼HIV-1感染者流行毒株仍以CRF01AE为主，以同一处或相邻低档场所或毗邻乡镇呈小范围聚集，当地HIV-1阳性的中老年嫖客与暗娼可能是该人群易感者毒株快速传播的重要传染源。

关键词：艾滋病病毒基因亚型传播簇嫖客暗娼

河南省302例新确证HIV感染者和艾滋病患者中HIV毒株基因亚型分布和原发耐药研究

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中华预防医学杂志 2016年第8期50卷 733-737页

作者：孙定勇刘佳许巍何翠燕晶邢辉薛秀娟樊盼英李宁朱谦王哲河南省疾病预防控制中心性病艾滋病防治研究所郑州450016 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心

目的分析河南省新确证HIV感染者和艾滋病患者中新发感染者HIV毒株的基因亚型分布和原发耐药情况。方法纳入2013年1—6月和2014年1—6月新确证并上报于河南省6个地级市（南阳、漯河、平顶山、商丘、许昌和郑州）的市级和县级CDC的HI... 详细信息

目的分析河南省新确证HIV感染者和艾滋病患者中新发感染者HIV毒株的基因亚型分布和原发耐药情况。方法纳入2013年1—6月和2014年1—6月新确证并上报于河南省6个地级市（南阳、漯河、平顶山、商丘、许昌和郑州）的市级和县级CDC的HIV感染者和艾滋病患者为研究对象，收集其阳性报告时报卡信息和随访信息（人口学信息、感染途径和抗病毒治疗情况等）。采集研究对象的血液样本再进行确证试验，共402例，排除11例未能采集到足够血样或溶血、89例未能扩增出或扩增结果不完整的研究对象，最终获取302例完整病例结果纳入最终研究。使用BED捕获酶联法判定研究对象新发和既往感染病例，使用in-house方法进行基因亚型和耐药性的检测。结果 302例研究对象的年龄为（44.0±15.5）岁，其中2013和2014年分别为160例（53.0%）和142例（47.0%），新发感染者占29.5%（89例），其中01_AE、07_BC、B、01_B和其他亚型的新发感染比例分别为31.3%（20/64）、40.5%（30/74）、21.3%（32/150）、3/8和4/6（χ2=13.48，P=0.009）。既往感染者中B亚型所占比例为55.4%（118/213），高于新发感染者[36%（32/89）]（χ2=9.49，P=0.002），而07_BC和其他亚型的构成比[20.7%（44/213）和1%（2/213）]均低于新发感染者[33.7%（30/89）和5%（4/89）]（χ2值分别为5.78、4.08，P值分别为0.016、0.044）。302例研究对象的原发耐药率为6.0%（18例），核苷类逆转录酶抑制剂（NRTI）的耐药率为2.7%（8例），非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTI）的耐药率为3.6%（11例）；B和07_BC亚型的原发耐药率均较高，分别为8.7%（13例）和5.4%（4例）。结论河南省新确证上报的HIV感染者和艾滋病患者中的HIV毒株亚型中出现一定比例的非B亚型；B亚型的原发耐药率较高，应及时开展HIV的分子流行病学调查并定期开展原发耐药的监测。

关键词：病例报告 HIV 基因亚型原发耐药

异源双链泳动分析法在人类免疫缺陷病毒1基因亚型分析中的应用

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中华流行病学杂志 2002年第2期23卷 127-130页

作者：陈亮严延生翁育伟王惠榕吴守丽陈舸郑兆双郑健颜苹苹福建省卫生防疫站艾滋病防治研究室福州350001

目的　运用异源双链泳动分析法 (HMA )进行人类免疫缺陷病毒 1(humanimmunodeficiencyvirus 1,HIV 1)基因亚型分析 ,了解福建省HIV 1亚型的流行情况。方法　收集细胞培养中HIV 1感染的外周血单个核细胞 (PBMC) ,聚合酶链反应 (PCR)扩增H... 详细信息

目的　运用异源双链泳动分析法 (HMA )进行人类免疫缺陷病毒 1(humanimmunodeficiencyvirus 1,HIV 1)基因亚型分析 ,了解福建省HIV 1亚型的流行情况。方法　收集细胞培养中HIV 1感染的外周血单个核细胞 (PBMC) ,聚合酶链反应 (PCR)扩增HIV 1膜蛋白基因(env)区的核酸片段 ,与标准亚型的对照质粒的PCR产物进行杂交 ,形成异源双链二聚体 ,根据其在聚丙烯酰胺凝胶电泳中的泳动率确定其亚型 ,并进一步对标本进行序列测定和系统树分析。结果15份标本中 ,80 .0 0 %为E亚型 ,6 .6 7%为B亚型 ,2份不能确定其亚型。比较异源双链泳动法和序列测定法的结果 ,显示两种分析方法对HIV 1病毒基因分型有较高的一致性 ,其亚型一致率为86 .6 7%。结论　福建省流行的HIV 1毒株以E亚型为主。亚型分析法具有快速、简便、经济和高特异性的特点 ,可用作对HIV流行毒株进行长期监测的重要手段。

关键词：异源双链泳动分析法人类免疫缺陷病毒1 基因亚型 HIV-1 序列测定

艾滋病住院初治患者HIV-1基因亚型及传播性耐药现状分析

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四川大学学报（医学版） 2024年第5期55卷 1295-1300页

作者：刘欢霞何盛华杨彤彤蔡琳程殿霞成都市公共卫生临床医疗中心感染科成都610061

目的分析感染科艾滋病住院初治患者HIV-1基因亚型分布特征、传播性耐药(transmitted drug resistance,TDR)现状及其影响因素。方法纳入2020年1月–2022年12月期间在成都市公共卫生临床医疗中心感染科住院并确诊的初治艾滋病患者,收集患... 详细信息

目的分析感染科艾滋病住院初治患者HIV-1基因亚型分布特征、传播性耐药(transmitted drug resistance,TDR)现状及其影响因素。方法纳入2020年1月–2022年12月期间在成都市公共卫生临床医疗中心感染科住院并确诊的初治艾滋病患者,收集患者抗病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)前的血液样本,采用in-house法进行HIV基因扩增、测序,系统进化树分析HIV-1基因亚型,HIV耐药数据库在线比对分析耐药突变位点、耐药种类、耐药程度,进行HIV-1基因亚型分布特征和TDR发生情况及其影响因素分析。结果共收集213例患者的血样,HIV基因扩增成功率83.10%(177/213),共检出10种基因亚型,以CRF07_BC最常见(43.50%,77/177),其次为CRF01_AE(37.85%),独特重组亚型(unique recombinant forms,URFs)较少(8.47%),其他亚型10.17%;这4种HIV-1基因亚型仅在不同年龄的分布差异有统计学意义(P=0.024),进一步分析发现仅CRF01_AE和URFs在年龄为30~50岁和年龄>50岁的分布差异有统计学意义,URFs在年龄为30~50岁人群占比较高(P=0.008)。CRF07_BC、CRF01_AE、URFs、其他亚型耐药发生率分别为6.49%、8.96%、13.33%、5.56%,差异无统计学意义(P>0.05);TDR总发生率6.57%,非核苷类逆转录酶抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTIs)TDR发生率5.16%,突变位点主要为V179D/E、E138A/G、V106M/I、Y181C,核苷类逆转录酶抑制剂(nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NRTIs)TDR发生率1.88%,突变位点主要为M184V,1例患者发生NNRTIs、NRTIs双重耐药;4.23%高度耐药,0.47%中度耐药,1.88%低度耐药;本研究未发现TDR在不同年份、人口学特征、感染途径、基线状况、机会性感染方面的差异有统计学意义(P>0.05)。结论艾滋病住院初治患者HIV-1基因亚型复杂、多样,TDR总发生率较高,需加强TDR监测,以优化ART治疗、减少耐药传播。

关键词：获得性免疫缺陷综合征基因亚型传播性耐药

辽宁省2008--2010年HIV-1基因亚型分布特征及流行病学分析

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中华流行病学杂志 2012年第4期33卷 442-443页

作者：鄂爽吴少慧马宁熊建萍梁雪威郭惠君周金玲卢春明王莉辽宁省疾病预防控制中心沈阳110005

HIV-1毒株的感染力较强，是目前HIV流行的主要病毒株和重点研究对象。HIV-1分为M（main）、O（outlier）和N（non．M—non-O）3个组。其中M组又分为A—K亚型。近年又证实了至少16种各种亚型的重组型CRY01至CRF016。本研究对59例H1V-1感... 详细信息

HIV-1毒株的感染力较强，是目前HIV流行的主要病毒株和重点研究对象。HIV-1分为M（main）、O（outlier）和N（non．M—non-O）3个组。其中M组又分为A—K亚型。近年又证实了至少16种各种亚型的重组型CRY01至CRF016。本研究对59例H1V-1感染者血浆样本进行基因扩增和序列分析并收集相关流行病学资料，结果报道如下。

关键词：人类免疫缺陷病毒1型基因亚型

云南省2个边境地区新报告艾滋病病毒感染者HIV-1基因亚型分析

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中华流行病学杂志 2018年第12期39卷 1617-1620页

作者：韦焘杨朝军陈敏贾曼红马艳玲罗红兵陆林昆明医科大学公共卫生学院 650500 云南省疾病预防控制中心昆明650022 云南省卫生和计划生育委员会昆明650200

目的了解云南省2个边境地区新报告HIV感染者HIV-1基因亚型分布特征。方法2015年11月至2016年10月在云南省德宏傣族景颇族自治州(德宏州)和红河哈尼族彝族自治州(红河州)边境地区,连续纳人年龄≥18岁新报告HIV感染者共233例,提取病毒RNA... 详细信息

目的了解云南省2个边境地区新报告HIV感染者HIV-1基因亚型分布特征。方法2015年11月至2016年10月在云南省德宏傣族景颇族自治州(德宏州)和红河哈尼族彝族自治州(红河州)边境地区,连续纳人年龄≥18岁新报告HIV感染者共233例,提取病毒RNA,扩增pol和env)基因区,进行基因分型检测和序列分析。结果233份标本共有146份获得HIV-1基因亚型。德宏州有8种HIV-1基因亚型,以独特重组型(URFs)为主(52.8%,57/108),其中中国籍的URFs占56.8%(21/37),缅甸籍的占50.7%(36/71);红河州有4种HIV-1基因亚型,以CRF01AE为主(71.1%,27/38),其中越南籍的占81.0%(17/21),中国籍的占58.8%(10/17)。2个州HIV-1基因亚型总体分布的差异有统计学意义(Χ^2=61.072,P基因亚型分布差异较大,应对中国籍和外国籍HIV感染者采取有针对性的防治措施。

关键词：艾滋病病毒感染者基因亚型边境地区

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洛阳市人群芽囊原虫感染现状及基因亚型分析

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2022年第2期40卷 216-222页

作者：陈慧慧李云霞宁超群邓艳张红卫韦雪芳锁慧芳张颋刘琴陈军虎田利光中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心) 国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织热带病合作中心国家级热带病国际联合研究中心上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院上海200025 洛阳市疾病预防控制中心洛阳471000 西安医学院第三附属医院西安710068 河南省疾病预防控制中心郑州450016 洛宁县疾病预防控制中心洛宁471799

目的了解洛阳市人群芽囊原虫感染情况及基因亚型分布。方法2020年9月13—20日,采取整群随机抽样的方法选择洛阳市土源性线虫病流动监测点中的洛宁县作为调查点,分别在程家庄、西街村、中高村、南坡村、磨沟村等5个行政村抽取3周岁以上... 详细信息

目的了解洛阳市人群芽囊原虫感染情况及基因亚型分布。方法2020年9月13—20日,采取整群随机抽样的方法选择洛阳市土源性线虫病流动监测点中的洛宁县作为调查点,分别在程家庄、西街村、中高村、南坡村、磨沟村等5个行政村抽取3周岁以上常住居民不少于200人。采集调查对象基本信息,包括姓名、性别、年龄、民族、职业、文化程度、村庄和调查前3个月内是否服用驱虫药。调查芽囊原虫感染者的生活卫生条件及临床体征等信息。提取感染者粪样DNA,PCR扩增芽囊原虫小亚基RNA(SSU r RNA)基因,测序后在GenBank数据库中进行BLAST比对,鉴定扩增序列所属基因亚型。采用Mega 7.0最大似然法构建基于SSU r RNA基因的系统发育树。采用SPSS 25.0统计学软件进行统计分析。结果共调查890人,检出芽囊原虫阳性20例,总感染率为2.2%(20/890)。其中男性感染率为2.0%(8/399),女性感染率为2.4%(12/491),二者差异无统计学意义(χ^(2)=0.193,P>0.05)。11~20岁年龄组感染率最高,为5.1%(3/59),不同年龄组间感染率差异有统计学意义(Fisher=11.895,P0.05)。初中文化程度感染率最高,为2.7%(12/452),不同文化程度感染率差异无统计学意义(Fisher=1.283,P>0.05)。中高村居民芽囊原虫感染率最高,为4.3%(7/164),5个行政村居民芽囊原虫感染率差异有统计学意义(Fisher=10.929,P基因片段,大小约1100 bp。测序结果以ST3基因亚型为主,占90.0%(18/20),ST1基因型占10.0%(2/20)。磨沟村和中高村的感染者包括ST3和ST1基因亚型,南坡村和西街村的感染者均为ST3基因亚型。系统进化树结果显示,20份阳性粪样中,有18份与奥地利分离株(GenBank登录号MN914073.1)、德国分离株(GenBank登录号MK801403.1)和新加坡分离株(GenBank登录号KX618192.1)处于同一个进化分支,均为ST3基因亚型;2份分别与德国分离株(GenBank登录号MK801408.1)和奥地利分离株(GenBank登录号MN914072.1)处于同一个分支,为ST1基因亚型,测序结果一致。对20例感染者进行卫生条件及临床体征调查结果显示,使用旱厕或粪池者占65.0%(13/20),使用水冲厕所者占35.0%(7/20);家中饲养宠物或家畜者占45.0%(9/20);3例有腹痛、腹泻、腹胀等症状,分别为1例ST1亚型、2例ST3亚型;4例有大便干结等症状,分别为1例ST1基因亚型,3例ST3基因亚型。结论洛阳市人群芽囊原虫总感染率较低,主要为ST3基因亚型。

关键词：芽囊原虫基因亚型流行病学调查洛阳市

四川地区HIV/AIDS患者基因亚型及传播性耐药现状研究

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四川大学学报（医学版） 2022年第5期53卷 851-856页

作者：刘欢霞何盛华周锐峰何沅鸿杨彤彤姚远成都市公共卫生临床医疗中心感染一科成都610061

目的分析四川地区初治HIV/AIDS患者的HIV基因亚型分布特点和传播性耐药现状。方法纳入四川地区住院且无抗反转录病毒治疗(ART)药物暴露史的成年HIV/AIDS患者,采用In-house测序法进行HIV基因测序,系统进化树判定HIV基因亚型,美国斯坦福大... 详细信息

目的分析四川地区初治HIV/AIDS患者的HIV基因亚型分布特点和传播性耐药现状。方法纳入四川地区住院且无抗反转录病毒治疗(ART)药物暴露史的成年HIV/AIDS患者,采用In-house测序法进行HIV基因测序,系统进化树判定HIV基因亚型,美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线比对耐药突变位点并确定是否存在耐药及耐药种类、耐药水平。结果共纳入符合标准的120例患者,采集120份血液样本。87.5%样本HIV基因扩增成功(105/120),HIV基因亚型分布特点:CRF01_AE占比46.67%(49/105),CRF07_BC占比39.05%(41/105),其他占比14.28%(15/105)。不同性别、年龄、民族、感染途径、耐药、HIVRNA水平、CD4水平等基因亚型的差异均无统计学意义(P>0.05)。25份样本检测到耐药突变位点(20.83%),20份样本潜在耐药(16.67%),5份样本传播性耐药(4.17%)。24份样本对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药,V179D/E位点突变频率最高,1份样本对蛋白酶抑制剂耐药,突变位点M46I,未发现核苷类反转录酶抑制剂耐药及整合酶抑制剂耐药。结论四川地区初治住院成年HIV/AIDS患者HIV基因亚型分布特点以CRF01_AE和CRF07_BC为主,传播性耐药率较低,以NNRTIs耐药为主。进行HIV基线耐药检测对制定有效ART方案具有重要意义。

关键词： HIV/AIDS患者抗病毒治疗基因亚型传播性耐药

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广西壮族自治区2020年新报告≥50岁男性HIV感染者的HIV-1基因亚型分布及其与首次CD4+T淋巴细胞的关联

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中华疾病控制杂志 2022年第12期26卷 1389-1394页

作者：李剑军陈燕兰葛宪民岑平蓝光华阳世雄梁淑家唐凯玲方宁烨庞贤武何芹林兆森郭伟贵邓鑫晖冯献湘周丽芳黄运轩阳冬莫靖林钟坚莫洪志农爱丹梁旭覃熙茂莫实德曾梓罗柳红陈欢欢朱秋映朱金辉陆华湘孟琴刘帅凤李博广西壮族自治区疾病预防控制中心艾滋病防制所南宁530028 钦州市疾病预防控制中心艾滋病防制科钦州535099 南宁市疾病预防控制中心性病艾滋病防制科南宁530023 北海市疾病预防控制中心性病艾滋病防制科北海536000 来宾市疾病预防控制中心艾滋病防制科来宾546100 柳州市疾病预防控制中心艾滋病防制所柳州545007 贵港市疾病预防控制中心艾滋病防制科贵港537100 桂林市疾病预防控制中心性病艾滋病防制科桂林541001 梧州市疾病预防控制中心艾滋病防制科梧州543002 河池市疾病预防控制中心艾滋病与皮肤性病防制科河池547000 崇左市疾病预防控制中心性病与艾滋病预防控制科崇左532200 百色市疾病预防控制中心艾滋病皮肤病与性病防制科百色533000 玉林市疾病预防控制中心艾滋病防治科玉林537000 防城港市疾病预防控制中心滋病防治科防城港538021 贺州市疾病预防控制中心艾滋病防治科贺州542899

目的分析2020年广西壮族自治区(简称广西)新报告50岁及以上男性(简称中老年男性)HIV感染者的HIV-1基因亚型构成特点及不同基因亚型与首次CD4+T淋巴细胞(简称CD4)计数的关联。方法以市为抽样单位,采用分层随机抽样法选取广西2020年新... 详细信息

目的分析2020年广西壮族自治区(简称广西)新报告50岁及以上男性(简称中老年男性)HIV感染者的HIV-1基因亚型构成特点及不同基因亚型与首次CD4+T淋巴细胞(简称CD4)计数的关联。方法以市为抽样单位,采用分层随机抽样法选取广西2020年新报告中老年男性HIV感染者为研究对象,对其血浆进行病毒RNA提取、逆转录扩增、测序、HIV-1基因亚型和亚簇判定,使用多因素模型评价CD4计数可能存在统计学关联的影响因素。结果共纳入分析606例HIV感染者,主要流行毒株有CRF01_AE、CRF07_BC及CRF08_BC三种,其构成比分别为57.6%(349/606)、17.2%(104/606)及22.1%(134/606),其首次CD4中位数分别为145(51, 271)个/μL、212(110, 330)个/μL及178(100, 307)个/μL。CRF01_AE感染者首次CD4值低于CRF07_BC感染者(Z=-3.363,P=0.002),也低于CRF08_BC感染者(Z=-2.983,P=0.009)。二元logistic回归分析模型分析显示,CRF01_AE为广西中老年人群CD4≤200个/μL的独立危险因素(aOR=1.453, 95%CI:1.047~2.017)。结论 CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC为广西2020年新报告中老年男性HIV感染者主要毒株,其构成以CRF01_AE为主,CRF01_AE为CD4≤200个/μL的独立危险因素,提示感染CRF01_AE毒株中老年男性的疾病进展较快,对广西艾滋病流行危害较大。

关键词：艾滋病病毒中老年男性基因亚型 CD4+T淋巴细胞计数