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假单胞菌属双组分信号转导系统调控吩嗪生物合成研究进展

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微生物学通报 2022年第1期49卷 352-362页

作者：邱薇刘磊康杰叶泽铭葛菁萍黑龙江大学农业微生物技术教育工程研究中心黑龙江哈尔滨150500 黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室黑龙江哈尔滨150080

吩嗪是由假单胞菌或链霉菌产生的一类具有抗菌、抗肿瘤和抗寄生虫活性的含氮杂环代谢物,在农业和医疗领域具有广泛的应用。但吩嗪的合成受到复杂的级联网络调控。本文总结了假单胞菌属中双组分信号转导系统(two-component signal transd... 详细信息

吩嗪是由假单胞菌或链霉菌产生的一类具有抗菌、抗肿瘤和抗寄生虫活性的含氮杂环代谢物,在农业和医疗领域具有广泛的应用。但吩嗪的合成受到复杂的级联网络调控。本文总结了假单胞菌属中双组分信号转导系统(two-component signal transduction system,TCS)对吩嗪生物合成的调控机制,阐明在双组分信号转导系统的控制下小RNA(small RNA)和群体感应(quorum sensing)对吩嗪生物合成的影响,为假单胞菌属调控吩嗪合成级联网络的进一步研究提供参考。

关键词：假单胞菌属吩嗪双组分信号转导系统群体感应小RNA

假单胞菌属细菌中整合子的分布及其可转移耐药性研究

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临床检验杂志 2007年第1期25卷 10-12页

作者：凌华志李涛徐元宏曹红霞安徽医科大学第一附属医院检验科合肥230022 安徽医科大学第一附属医院感染科合肥230022

目的研究临床分离假单胞菌属细菌中Ⅰ、Ⅱ类整合子分布及其可转移耐药情况。方法将Ⅰ、Ⅱ类整合酶基因通用引物置于同一反应体系,对假单胞菌属细菌以多重PCR法检测其整合子的分布,并对整合酶基因阳性菌进行接合转移,最后对接合转移成功... 详细信息

目的研究临床分离假单胞菌属细菌中Ⅰ、Ⅱ类整合子分布及其可转移耐药情况。方法将Ⅰ、Ⅱ类整合酶基因通用引物置于同一反应体系,对假单胞菌属细菌以多重PCR法检测其整合子的分布,并对整合酶基因阳性菌进行接合转移,最后对接合转移成功菌以平板稀释法测其临床株和接合子MIC值。结果Ⅰ类和Ⅱ类整合酶基因在临床分离假单胞菌属细菌中检出率分别为38.1%和2.2%,含整合酶基因的接合子在转移成功接合子中所占比率为13.6%。结论Ⅰ类整合子在假单胞菌感染的临床分离株中所占比例已相当高,但水平传播率还较低。

关键词：假单胞菌属整合子多重PCR 接合子

假单胞菌属细菌LV1强化序批式生物膜反应器喹啉降解性能

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化工进展 2024年

作者：陈虎王莹王璞玉吕永康太原理工大学环境科学与工程学院中国辐射防护研究所省部共建煤基能源清洁高效利用国家重点实验室山西浙大新材料与化工研究院

本研究以能够降解喹啉的假单胞菌属细菌LV1为研究对象，首先研究了碳源对菌株LV1喹啉降解性能的影响，结果表明适当添加乙酸钠可以促进菌株LV1的喹啉降解性能，且当乙酸钠添加量为1.00 g/L时促进效果最为显著。基于此，采用外施乙酸钠... 详细信息

本研究以能够降解喹啉的假单胞菌属细菌LV1为研究对象，首先研究了碳源对菌株LV1喹啉降解性能的影响，结果表明适当添加乙酸钠可以促进菌株LV1的喹啉降解性能，且当乙酸钠添加量为1.00 g/L时促进效果最为显著。基于此，采用外施乙酸钠和梯度增加喹啉浓度方式成功启动了序批式生物膜反应器。然后将菌株LV1接种至反应器考察其对反应器喹啉降解性能的影响，结果表明接种LV1后反应器运行35 d后出水喹啉和CODcr去除率分别稳定在95.70% ± 1.25%和86.49% ± 0.99%。与未接种LV1相比，强化后反应器喹啉和CODcr去除分别提高了近46%和33%，表明菌株LV1能够强化反应器对喹啉的降解。最后通过16s rDNA高通量测序技术分析了反应器强化前后菌群结构的影响，接种LV1后显著改变了系统微生物的种群多样性以及菌群结构，假单胞菌科和丛毛单胞菌科是反应器启动阶段和生物强化阶段降解喹啉污染物的核心种群，其中归属于β-变形杆菌纲丛毛单胞菌科在强化阶段的相对丰度显著增加。根据PICRUSt结果发现挂膜启动和生物强化阶段编码芳香环裂解酶基因特别是编码氮杂环裂解酶基因的相对丰度显著增强，这些均有利于维持或增强反应器的喹啉降解性能。

关键词：喹啉降解假单胞菌属序批式生物膜反应器生物强化微生物群落结构

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假单胞菌属脂肪酶的分子生物学研究进展

中国生物工程杂志 2015年第9期35卷 114-121页

作者：查代明张炳火李汉全闫云君九江学院药学与生命科学学院九江332000 华中科技大学生命科学与技术学院武汉430074

微生物脂肪酶是商品化脂肪酶的主要来源,并广泛应用于诸多工业领域。与其他微生物脂肪酶相比,细菌脂肪酶催化反应的类型更多、活性更高、稳定性更好,其中又以假单胞菌属(Pseudomonas)脂肪酶的性能最为优越。作为性能最为优越、应用最为... 详细信息

微生物脂肪酶是商品化脂肪酶的主要来源,并广泛应用于诸多工业领域。与其他微生物脂肪酶相比,细菌脂肪酶催化反应的类型更多、活性更高、稳定性更好,其中又以假单胞菌属(Pseudomonas)脂肪酶的性能最为优越。作为性能最为优越、应用最为广泛的一类脂肪酶,假单胞菌属脂肪酶研究一直是脂肪酶领域的热点。就假单胞菌属脂肪酶的分子生物学研究进展进行归纳和述评,包括基因资源挖掘及克隆、基因表达调控及分泌机制、活性过表达策略、蛋白质结晶及3D结构解析、蛋白质工程,并对其未来研究方向做出展望,以期为后续研究提供有益参考。

关键词：假单胞菌属脂肪酶基因表达调控

假单胞菌属的GacS/GacA双组分系统及其作用机制研究进展

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微生物学通报 2024年第11期51卷 4349-4358页

作者：尤欢邓强张雷张立新安徽农业大学植物保护学院作物有害生物综合治理安徽省重点实验室安徽合肥230036

微生物的信号转导系统有助于它们适应复杂的环境变化,由感应蛋白激酶和反应调控蛋白构成的双组分系统(two-component system,TCS)是革兰氏阴性细菌中的全局性调控系统,在调控次生代谢和信号通讯中扮演着重要角色。GacS/GacA双组分系统... 详细信息

微生物的信号转导系统有助于它们适应复杂的环境变化,由感应蛋白激酶和反应调控蛋白构成的双组分系统(two-component system,TCS)是革兰氏阴性细菌中的全局性调控系统,在调控次生代谢和信号通讯中扮演着重要角色。GacS/GacA双组分系统在细菌适应土壤环境、对植物的致病性和耐受性中起着调控的作用。假单胞菌属(Pseudomonas)中GacS和GacA的结构高度同源,在属内不同的种以及致病变种中的调控机理存在不同程度的差异,本文从GacS/GacA双组分系统在假单胞菌属中的信号转导、调控网络,以及在调控途径中的主要功能等多个角度总结了其研究进展,期望为GacS/GacA双组分系统参与调控细菌致病性的机理研究提供参考。

关键词： GacS/GacA 假单胞菌属基因调控致病性信号转导

实时荧光定量PCR法检测环境假单胞菌属细菌丰度

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东南大学学报（自然科学版） 2006年第1期36卷 143-146页

作者：赵传鹏浦跃朴尹立红梁戈玉吕锡武李先宁东南大学公共卫生学院南京210009 东南大学土木工程学院南京210096

应用实时荧光定量PCR法，建立了总细菌及假单胞菌属的标准曲线，并以环境样本中假单胞菌属与总细菌的比值反映其细菌丰度．应用该方法评价人工除藻反应器中组合填料、无纺布、弹性填料等介质对太湖水中溶藻细菌之一的假单胞菌属的富集... 详细信息

应用实时荧光定量PCR法，建立了总细菌及假单胞菌属的标准曲线，并以环境样本中假单胞菌属与总细菌的比值反映其细菌丰度．应用该方法评价人工除藻反应器中组合填料、无纺布、弹性填料等介质对太湖水中溶藻细菌之一的假单胞菌属的富集情况．结果显示：该方法对总细菌的检测范围为10^3～10^8个基因拷贝/μL（R^2=0．997）；假单胞菌属的检测范围为1～10^5个基因拷贝／μL（R^2=0．994）．对除藻反应器溶藻细菌富集效果的评价显示，所建立的方法能有效检测反应器中填料对该类溶藻细菌的富集程度．初步证明所建立的方法可有效定量假单胞菌属在环境样本中的丰度．

关键词：实时荧光定量PCR 假单胞菌属人工介质溶藻细菌

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假单胞菌属合成环脂肽分子的研究进展

中国生物制品学杂志 2014年第7期27卷 974-980页

作者：向照举李小璐李治陕西师范大学生命科学学院陕西西安710119

假单胞菌属合成的环脂肽是一类由脂肪酸和肽链组成、通过酯键成环、具有两亲性的分子。环脂肽有多种生理功能,除具表面活性外,还具有抗细菌、抗病毒、抗真菌、抑制肿瘤细胞等活性,可作为潜在的抗生素类药物被开发。本文就假单胞菌属所... 详细信息

假单胞菌属合成的环脂肽是一类由脂肪酸和肽链组成、通过酯键成环、具有两亲性的分子。环脂肽有多种生理功能,除具表面活性外,还具有抗细菌、抗病毒、抗真菌、抑制肿瘤细胞等活性,可作为潜在的抗生素类药物被开发。本文就假单胞菌属所合成环脂肽的种类、功能和生物合成机制进行总结,同时对分子生物学、生物信息学等新兴学科技术结合传统分离鉴定技术在发现新型环脂肽类物质方面的运用作一综述。

关键词：假单胞菌属环脂肽生理功能抗生素

假单胞菌属中新型Inc_(pGRT1)质粒的遗传特性及其潜在传播风险

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安徽医科大学学报 2023年第8期58卷 1261-1266页

作者：李昕悦王鹏陈方舟穆小飞卢秀慧贺家琪郑亚丽周冬生殷喆安徽医科大学基础医学院合肥230032 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的分析来自假单胞菌的Inc_(pGRT1)质粒的基因组结构和遗传特征,阐明其潜在的传播风险。方法对临床分离菌株15420352进行分纯和保种后提取基因组DNA,随后进行全基因组测序。测序获得了质粒p420352-strA的完整序列,并对其进行质粒型... 详细信息

目的分析来自假单胞菌的Inc_(pGRT1)质粒的基因组结构和遗传特征,阐明其潜在的传播风险。方法对临床分离菌株15420352进行分纯和保种后提取基因组DNA,随后进行全基因组测序。测序获得了质粒p420352-strA的完整序列,并对其进行质粒型别判断。对所有5个已测序的同型别质粒进行了骨架区和外源插入区的精细注释,其中包括本研究中测序的1个质粒p420352-strA和来自GenBank的4个质粒。主要通过RAST、Plasmidfinder、Blast、ResFinder和ISfinder等核定质粒的ORFs并筛查耐药毒力等相关的关键基因。结果 5个质粒被划分为新的Inc_(pGRT1)型质粒。它们均存在保守的IncpGRT1骨架标记,除主复制子repAInc_(pGRT1)外,还筛查到这些质粒均获取了一个辅复制子。5个IncpGRT1质粒携带了至少3个不同的主要外源插入区:srp区域、msr区域、Tn5053家族转座子。这些质粒中共发现3个已知的涉及2类抗生素耐药和重金属抗性的基因:strA、strB、mer。并发现在这些质粒里携带了至少1种毒力因子msr和5种关键的转运蛋白srp、emrE、mod、phn及lpt。结论 IncpGRT1型质粒已经成为一些耐药基因及毒力基因在假单胞菌属中积累和传播的重要载体,并提高了菌株的环境适应性。

关键词：假单胞菌属移动元件质粒比较基因组学

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假单胞菌属的分类现状

国外医学（微生物学分册） 1996年第2期19卷 20-23页

作者：赵乃昕山东潍坊医学院微生物学教研室

随着DNA-rRNA杂交与165rRNA测序等技术的使用,原来假单胞菌属的种除少数外,陆续分别转入重新建立的近12个新菌属中,因此在分类命名上出现了较大的变动。本文描述了近10年来有关种的这些变化。

关键词：假单胞菌属分类