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2008—2016年16省16～25岁异性性行为感染HIV-1者亚型亚簇分布

中国艾滋病性病 2019年第9期25卷 895-898,910页

作者：周佳佳李杨李苗苗甘梦泽沈建洋阮玉华冯毅廖玲洁邵一鸣邢辉中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心

目的了解我国2008—2016年16省(市/区)16~25岁异性性行为感染艾滋病病毒(HIV)者中HIV毒株亚型亚簇的分布情况。方法收集调查对象血浆样本,提取HIV核糖核酸并扩增其Pol区片段(PR区,RT区),应用HIV Sequence Database网站和MEG 6.0等软件... 详细信息

目的了解我国2008—2016年16省(市/区)16~25岁异性性行为感染艾滋病病毒(HIV)者中HIV毒株亚型亚簇的分布情况。方法收集调查对象血浆样本,提取HIV核糖核酸并扩增其Pol区片段(PR区,RT区),应用HIV Sequence Database网站和MEG 6.0等软件等进行亚型亚簇分析。结果本研究共分析pol区序列1 779条,HIV基因分型显示:856例男性感染者中CRF01AE亚型346例(40.4%)和CRF07BC亚型298例(34.8%),主要亚簇是CRF07BC的MSM簇(69.5%,207/298);898例女性感染者CRF01AE亚型323例(36.0%)和CRF07BC亚型281例(31.3%),主要亚簇是CRF01AE的C1簇(51.1%,165/323)。男性和女性感染者中亚型亚簇中呈上升趋势的有CRF01AE的C5簇、CRF07BC的MSM簇及CRF5501B(P亚型毒株的构成比分别为12.0%和15.3%。结论 16~25岁年龄组男性和女性异性感染者中流行HIV毒株的亚簇不同,源自男男性行为者(MSM)的CRF01AE的C5簇、CRF07BC的MSM簇及CRF5501B毒株在我国小年龄异性性传播感染者中呈上升趋势。

关键词：艾滋病病毒异性性传播亚型亚簇

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广西柳州1998-2018年新发现HIV阳性者基因亚型亚簇变化

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中国热带医学 2019年第9期19卷 818-822,828页

作者：康瑞华罗柳红陈欢欢李剑军梁淑家朱秋映蓝光华沈智勇唐振柱杨文敏廖玲洁冯毅邵一鸣邢辉阮玉华中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心北京102206 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西南宁530028

目的了解广西柳州1998—2018年新发现HIV阳性者基因亚型亚簇变化情况。方法选取HIV阳性者,采集全血标本进行DNA提取、pol基因区扩增、测序和判定亚型。采用趋势卡方检验分析不同时间段亚型亚簇变化情况。结果自2007年起检测发现CRF01AE... 详细信息

目的了解广西柳州1998—2018年新发现HIV阳性者基因亚型亚簇变化情况。方法选取HIV阳性者,采集全血标本进行DNA提取、pol基因区扩增、测序和判定亚型。采用趋势卡方检验分析不同时间段亚型亚簇变化情况。结果自2007年起检测发现CRF01AE的cluster 3和cluster 4两个亚簇,自2010年起检测发现CRF5501B亚型。广西柳州地区流行的亚型、亚簇种类在增加。1998—2006年、2007—2009年、2010—2014年和2015—2018年这四个时间段,CRF01AE亚型的构成比分别为95.3%(346/363)、96.7%(734/759)、94.8%(1 536/1 620)和88.0%(499/567);CRF01AE亚型cluster 1的构成比分别为93.4%(339/363)、91.8%(697/759)、89.3%(1 447/1 620)和79.5%(451/567),趋势卡方检验表明CRF01AE亚型和cluster 1感染者的构成比呈下降趋势(P亚型在2010—2014年和2015—2018年分别发现为7和12人。结论CRF01AE为广西柳州市的主要流行亚型,但该亚型感染者的构成比有下降趋势;该地区CRF01AE亚型中亚簇和HIV亚型种类的增加,提示可能存在新的HIV毒株传入。

关键词：艾滋病病毒基因亚型亚簇

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我国16-25岁异性性传播感染者HIV基因变化及耐药特征研究

我国16-25岁异性性传播感染者HIV基因变化及耐药特征研究

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作者：周佳佳中国疾病预防控制中心

学位级别：硕士

研究背景和目的:2019年1月-10月新报告HIV感染者中,异性性传播(heterosexual transmission,HET)占73.7%。该途径已成为我国HIV感染者/AIDS病人最主要的感染途径。2015年一份全国性调查显示在我国流行的HIV毒株有20多种,是全球流行毒株... 详细信息

研究背景和目的:2019年1月-10月新报告HIV感染者中,异性性传播(heterosexual transmission,HET)占73.7%。该途径已成为我国HIV感染者/AIDS病人最主要的感染途径。2015年一份全国性调查显示在我国流行的HIV毒株有20多种,是全球流行毒株较多的国家之一,其中CRF01E(39.0%)、CRF07C(35.6%)和CRF08C(8.9%)三种重组型毒株的构成比已经超过80%,所以我国不仅HIV流行毒株种类众多,而且是以重组型流行株为主的国家,因此这也是我国不同于其他国家的艾滋病流行特点,也是防控的难点之一。16-25岁较年青HIV感染者的性行为被认为在近几年发生,可近似代表HIV新近感染者的流行现状。故本研究拟以2008年-2018年11年间我国16-25岁HET的HIV感染者为研究对象,以期揭示HET人群中HIV毒株基因变化及耐药特征。研究方法:1.从我实验室2008-2018年历年的耐药监测数据中筛选16-25岁HET的HIV感染者(自报为HET)pol基因区序列,利用邻近参与法(Neighbor-Joining)进行系统进化分析,结合贝叶斯中的GTR模型和Gamma模型进行亚型及亚簇的流行史分析。应用HIV耐药数据库(https://***/)参考WHO耐药指南推荐选取的12种常用抗病毒药物,判别其耐药传播特征。2.对上述研究中不能明确归类为已知亚型(不能明确划分亚型)的po1基因区序列,进行下述进一步研究(1)了解我国部分地区2008-2018年16-25岁po1基因区不能明确划分亚型的HIV HET感染者基因特征。(2)选取部分代表性样本进行近全长基因扩增(约9000bp)。用HIV database在线工具(RIP和jpHMM)及SimPlot软件进行序列重组分析,确定新的HIV流行重组株。研究结果:第一部分共收集2008-2018年16-25岁HET感染者1990例,主要流行亚型为:CRF01E(37.3%,742/1990)、CRF07C(33.2%,661/1990)、CRF08C(8.1%,162/1990)、B亚型(5.4%,107/1990)、CRF551B(2.3%,46/1990)和新型重组亚型(1.5%,29/1990),另有11.4%不能明确划分亚型(226例);主要流行的亚簇为CRF01E-Cluster 1(13.4%,267/1990)、CRF01E-Cluster 4簇(11.7%,232/1990)CRF01E-Cluster 5 簇(3.0%,60/1990)和 CRF07C-MSM 簇(15.8%,314/1990)。以往主要在HET人群中流行的CRF01E-Cluster 1呈下降趋势(P=0.001),源自同性性传播人群的CRF01E-Cluster 5、CRF07C-MSM亚簇和CRF551B亚型却呈上升趋势(P亚簇为CRF01E-Cluster 4(19.0%,188/990)和CRF07C-MSM(25.1%,248/973);HET女性感染者中主要流行的亚簇为CRF01-AE-Cluster 1(18.4%,179/973)和CRF07C-Other(25.2%,245/973),上述亚型亚簇构成比的变化趋势与分层前一致。CRF01E-Cluster 4和CRF01E-Cluster 5进入我国HET的时间约为 1996年和2000年,而进入MSM人群的时间分别为1994年和1995年,在两个人群中快速增长的时间段均为1997-2006年;CRF07C-MSM和CRF551B在HET人群中与MSM人群增长时期相同。本研究人群耐药率为2.8%(55/1990),与16-25岁年龄组男男性行为(men having sex with men,MSM)人群(耐药率为3.0%)接近,低于2015年一份全国性调查中全年龄组人群的耐药率(3.6%)。分2008-2011年、2012-2014年和2015-2018年3个时间点看耐药率基本一致,无明显变化(P=0.458)。第二部分(1)不能划分亚型毒株以URF和URFC为主,二者共占总调查人群的84.1%(190/226)。43.8%(99/226)的不能明确划分亚型毒株在po1基因区发现存在2个及以上的亚型片段,另确定1例URF1和5例URF。(2)通过全长序列扩增新确定了两个CRFs(CRF1031B和CRF106px)。CRF103-01B是由3个B片段插入CRF01E骨架重组形成的;CRF106px由2个CRF01-AE片段和3个B片段插入到C骨架重组形成的。研究结论:16-25岁年龄组异性HIV

关键词： HIV HET 亚型亚簇

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