我国16-25岁异性性传播感染者HIV基因变化及耐药特征研究

作     者：周佳佳 

作者单位：中国疾病预防控制中心 

学位级别：硕士

导师姓名：邢辉;廖玲洁;冯毅

授予年度：2020年

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

主      题：HIV HET 亚型 亚簇 

摘      要：研究背景和目的:2019年1月-10月新报告HIV感染者中,异性性传播(heterosexual transmission,HET)占73.7%。该途径已成为我国HIV感染者/AIDS病人最主要的感染途径。2015年一份全国性调查显示在我国流行的HIV毒株有20多种,是全球流行毒株较多的国家之一,其中CRF01E(39.0%)、CRF07C(35.6%)和CRF08C(8.9%)三种重组型毒株的构成比已经超过80%,所以我国不仅HIV流行毒株种类众多,而且是以重组型流行株为主的国家,因此这也是我国不同于其他国家的艾滋病流行特点,也是防控的难点之一。16-25岁较年青HIV感染者的性行为被认为在近几年发生,可近似代表HIV新近感染者的流行现状。故本研究拟以2008年-2018年11年间我国16-25岁HET的HIV感染者为研究对象,以期揭示HET人群中HIV毒株基因变化及耐药特征。研究方法:1.从我实验室2008-2018年历年的耐药监测数据中筛选16-25岁HET的HIV感染者(自报为HET)pol基因区序列,利用邻近参与法(Neighbor-Joining)进行系统进化分析,结合贝叶斯中的GTR模型和Gamma模型进行亚型及亚簇的流行史分析。应用HIV耐药数据库(https://***/)参考WHO耐药指南推荐选取的12种常用抗病毒药物,判别其耐药传播特征。2.对上述研究中不能明确归类为已知亚型(不能明确划分亚型)的po1基因区序列,进行下述进一步研究(1)了解我国部分地区2008-2018年16-25岁po1基因区不能明确划分亚型的HIV HET感染者基因特征。(2)选取部分代表性样本进行近全长基因扩增(约9000bp)。用HIV database在线工具(RIP和jpHMM)及SimPlot软件进行序列重组分析,确定新的HIV流行重组株。研究结果:第一部分共收集2008-2018年16-25岁HET感染者1990例,主要流行亚型为:CRF01E(37.3%,742/1990)、CRF07C(33.2%,661/1990)、CRF08C(8.1%,162/1990)、B亚型(5.4%,107/1990)、CRF551B(2.3%,46/1990)和新型重组亚型(1.5%,29/1990),另有11.4%不能明确划分亚型(226例);主要流行的亚簇为CRF01E-Cluster 1(13.4%,267/1990)、CRF01E-Cluster 4簇(11.7%,232/1990)CRF01E-Cluster 5 簇(3.0%,60/1990)和 CRF07C-MSM 簇(15.8%,314/1990)。以往主要在HET人群中流行的CRF01E-Cluster 1呈下降趋势(P=0.001),源自同性性传播人群的CRF01E-Cluster 5、CRF07C-MSM亚簇和CRF551B亚型却呈上升趋势(P0.01)。按性别分层发现,HET男性感染者中主要流行的亚簇为CRF01E-Cluster 4(19.0%,188/990)和CRF07C-MSM(25.1%,248/973);HET女性感染者中主要流行的亚簇为CRF01-AE-Cluster 1(18.4%,179/973)和CRF07C-Other(25.2%,245/973),上述亚型亚簇构成比的变化趋势与分层前一致。CRF01E-Cluster 4和CRF01E-Cluster 5进入我国HET的时间约为 1996年和2000年,而进入MSM人群的时间分别为1994年和1995年,在两个人群中快速增长的时间段均为1997-2006年;CRF07C-MSM和CRF551B在HET人群中与MSM人群增长时期相同。本研究人群耐药率为2.8%(55/1990),与16-25岁年龄组男男性行为(men having sex with men,MSM)人群(耐药率为3.0%)接近,低于2015年一份全国性调查中全年龄组人群的耐药率(3.6%)。分2008-2011年、2012-2014年和2015-2018年3个时间点看耐药率基本一致,无明显变化(P=0.458)。第二部分(1)不能划分亚型毒株以URF和URFC为主,二者共占总调查人群的84.1%(190/226)。43.8%(99/226)的不能明确划分亚型毒株在po1基因区发现存在2个及以上的亚型片段,另确定1例URF1和5例URF。(2)通过全长序列扩增新确定了两个CRFs(CRF1031B和CRF106px)。CRF103-01B是由3个B片段插入CRF01E骨架重组形成的;CRF106px由2个CRF01-AE片段和3个B片段插入到C骨架重组形成的。研究结论:16-25岁年龄组异性HIV