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香苏杂交猪ARHGAP24基因SNP检测及生长性状关联分析

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农业生物技术学报 2024年第4期32卷 833-842页

作者：蒋传美阮涌李吉凤肖美美许家利黄家锦许厚强贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室/动物科学学院

RhoGTP酶激活蛋白24(Rho GTPase activating protein 24, ARHGAP24)基因与肌动蛋白重塑、细胞极性控制和细胞迁移密切相关，本研究旨在探究ARHGAP24基因多态性与香苏杂交猪(Sus scrofa)生长性状的关系，以便为后期继续研究香苏杂交猪分... 详细信息

RhoGTP酶激活蛋白24(Rho GTPase activating protein 24, ARHGAP24)基因与肌动蛋白重塑、细胞极性控制和细胞迁移密切相关，本研究旨在探究ARHGAP24基因多态性与香苏杂交猪(Sus scrofa)生长性状的关系，以便为后期继续研究香苏杂交猪分子选育工作提供理论参考。本研究采集164头相同饲养条件下的香苏杂交猪血液DNA，通过PCR扩增、测序，确定ARHGAP24基因SNP位点。利用SPSS 25.0软件中的一般线性模型对ARHGAP24基因SNP位点与香苏杂交猪生长性状进行关联分析。结果显示，在香苏杂交猪9个外显子中共检测出5个SNP位点，分别位于外显子1和外显子8。g.735024 A>G非同义突变导致mRNA上第455位缬氨酸变为天冬氨酸，对mRNA结构影响不明显，但导致蛋白质二级结构中α-螺旋以及无规则卷曲所占百分比上升，β-转角和延伸链降低；g.735242 A>C位点非同义突变后导致第528位缬氨酸变为丝氨酸，从而导致mRNA结构产生明显变化，而对蛋白质的二级结构影响则不明显，只是使各结构所占比例发生了轻微的波动。关联结果分析显示，g.735313 C>T位点对胸围有极显著影响(PT位点与香苏杂交猪胸围和腹围均存在显著关联，呈中度多态且处于Hardy-Weinberg平衡状态，可作为后期香苏杂交猪遗传标记分子育种候选位点。

关键词：香苏杂交猪 RhoGTP酶激活蛋白24(ARHGAP24) 生长性状关联分析

稻田沟坑对金背鲤肠道结构、消化酶活性及微生物群落的影响

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华南农业大学学报 2024年

作者：马兰蒙庆米李嘉尧秦国兵姚俊杰王秀龙杨立贵州大学渔业资源与环境研究中心贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室上海海洋大学农业农村部稻渔综合种养生态重点实验室贵阳市水产站

【目的】探究金背鲤的稻田适应性特征及肠道与不同稻田生长环境之间的作用关系。【方法】本研究以平板式稻田、“一”字沟稻田以及“十”字沟稻田生长的金背鲤为研究对象，采用形态学、酶学及生物信息学的方法探究稻田增加沟坑对金背鲤... 详细信息

【目的】探究金背鲤的稻田适应性特征及肠道与不同稻田生长环境之间的作用关系。【方法】本研究以平板式稻田、“一”字沟稻田以及“十”字沟稻田生长的金背鲤为研究对象，采用形态学、酶学及生物信息学的方法探究稻田增加沟坑对金背鲤肠道结构、消化酶活性及微生物群落的影响。【结果】“十”字沟组金背鲤肠道的绒毛宽度最宽（173.59 μm），其次是“一”字沟组（157.72 μm），最低的是平板式组（139.69 μm）。“十”字沟组、“一”字沟组的胰蛋白酶活性分别为4 662.65、4 676.12 U·gprot-1，显著高于平板式组的3 752.34 U·gprot-1（P＜0.05）。从门水平看，增加稻田沟坑后，变形菌门、厚壁菌门仍然是优势菌门，但放线菌门取代梭杆菌门成为优势菌门；从属水平看，平板式的优势菌属为链球菌属、鲸杆菌属、红杆菌属，“一”字沟组和“十”字沟组优势菌属的变化较大，在各组前三的优势菌属中，“一”字沟组有1种优势菌属发生了改变，“十”字沟中有2种优势菌属发生了改变。【结论】稻田中增加沟坑后金背鲤肠道的结构、消化酶活性、微生物群落及优势菌群会发生改变，调节代谢以适应新的稻田水环境，但金背鲤肠道核心菌群的组成仍然保持相对稳定。

关键词：稻田沟坑金背鲤肠道结构消化酶微生物群落

海拔对稻田金背鲤肠道结构、消化酶活性和肠道菌群的影响

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华南农业大学学报 2024年

作者：杨立蒙庆米白天泉李嘉尧姚俊杰马兰贵州大学渔业资源与环境研究中心/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室独山县养殖业发展中心农业农村部稻渔综合种养生态重点实验室

【目的】探究在不同海拔下稻田金背鲤Cyprinuscarpio var. Jinbei的肠道结构、消化酶活性和肠道菌群特征。【方法】以低（580 m）、中（830 m）和高（1340 m）3个不同海拔的稻田金背鲤为研究对象，采用组织学、酶学以及分子生物学等方... 详细信息

【目的】探究在不同海拔下稻田金背鲤Cyprinuscarpio var. Jinbei的肠道结构、消化酶活性和肠道菌群特征。【方法】以低（580 m）、中（830 m）和高（1340 m）3个不同海拔的稻田金背鲤为研究对象，采用组织学、酶学以及分子生物学等方法比较分析其肠道的组织结构、消化酶活性和肠道菌群特征。【结果】低海拔组金背鲤肠道的绒毛高度（521.04 μm）显著高于中海拔组（438.01 μm）和高海拔组（419.39 μm）（P＜0.05）；中海拔组金背鲤肠道的胰蛋白酶（Trypsin）活性（4541.65 U/mg）显著高于低海拔组（4023.72 U/mg）和高海拔组（3722.1 U/mg）（P＜0.05）；放线菌门、厚壁菌门、变形菌门、绿弯菌门和软壁菌门是稻田金背鲤肠道的主要菌群门类。【结论】不同海拔对稻田金背鲤的肠道形态组织结构、消化酶活性和肠道菌群产生影响。虽然稻田金背鲤的肠道菌群在不同海拔下出现相应的变化，但是，仍保持以放线菌门为主的相对稳定菌群，说明金背鲤的肠道具有对稻田生态环境的适应。

关键词：海拔金背鲤肠道消化酶肠道菌群

香苏杂交猪KAT2B基因多态性与其生长性状的关联分析

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南方农业学报 2024年第5期55卷 1463-1470页

作者：李吉凤阮涌蒋传美肖美美黄家锦许家利许厚强高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室/贵州大学动物科学学院贵州贵阳550025

【目的】了解香苏杂交猪组蛋白乙酰转移酶P300/CBP结合因子(KAT2B)基因在组织中的表达量,筛选其单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并分析基因多态性与生长性状的关联性,为香苏杂交猪新品系培育提供参考依据。【... 详细信息

【目的】了解香苏杂交猪组蛋白乙酰转移酶P300/CBP结合因子(KAT2B)基因在组织中的表达量,筛选其单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并分析基因多态性与生长性状的关联性,为香苏杂交猪新品系培育提供参考依据。【方法】以香苏杂交猪为研究对象,采用实时荧光定量PCR检测KAT2B基因在3日龄和6月龄不同组织中的相对表达量,通过直接测序检测KAT2B基因的SNP位点,统计SNP位点等位基因频率、基因型频率、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)及平均多肽信息含量(PIC)等,以卡方(χ^(2))检验分析基因型是否处于Hardy-Weinberg平衡状态,分析不同基因型与香苏杂交猪生长性状的关联性。【结果】实时荧光定量PCR结果显示,KAT2B基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌6个组织中均有表达,与3日龄相比,6月龄KAT2B基因相对表达量在肝脏和脾脏组织中极显著升高(PA、g.104540G>T和g.106651A>G,3个SNPs位点PIC均处于中度多态性水平且Hardy-Weinberg平衡。g.36682G>A位点优势基因型为GA型,等位基因频率G>A;g.104540G>T位点优势基因型为GG型,等位基因频率G>T;g.106651A>G位点优势基因型为AA型,等位基因频率A>G。关联分析结果表明,g.36682G>A位点各基因型生长性状之间无显著差异(P>0.05),g.106651A>G位点AA基因型与AG基因型胸深存在显著差异(PA、g.104540G>T和g.106651A>G),KAT2B基因可作为与香苏杂交猪生长性状相关的候选基因。

关键词：香苏杂交猪 KAT2B基因实时荧光定量PCR SNPs 生长性状

黑木耳UGP基因家族全基因组鉴定及其与菌丝生长多糖合成的相关性研究

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种子 2024年第4期43卷 69-80页

作者：苏世贤吴媛刘翀江苏燕刘青媛陈孟谈龙茶汪淘徐彦军田风华韦金江郎云龙牟海林徐乾城李伟贵州大学农学院贵阳550025 贵州大学食用菌研究院贵阳550025 贵州省高等学校设施蔬菜工程研究中心贵阳550025 贵州高原蓝梦菇业科技有限公司贵州毕节551700

黑木耳多糖是具有药用价值的生物活性分子,然而黑木耳高多糖的合成分子机理尚未明确。本研究对处于多糖合成途径关键位置的UGP家族基因进行了鉴定,从黑木耳基因组中鉴定出2个AhUGPs基因,并从另外21个食用菌基因组内挖掘出39个UGPs基因,... 详细信息

黑木耳多糖是具有药用价值的生物活性分子,然而黑木耳高多糖的合成分子机理尚未明确。本研究对处于多糖合成途径关键位置的UGP家族基因进行了鉴定,从黑木耳基因组中鉴定出2个AhUGPs基因,并从另外21个食用菌基因组内挖掘出39个UGPs基因,通过生物信息学分析发现,UGP基因家族成员在真菌体内具有较高的保守性,成员数量少但仍发挥着重要作用,木耳属的4个UGPs则表现出了更高的保守性。在对黑木耳AhUGPs的启动子区域分析中发现了较多的光响应元件和激素响应元件,说明AhUGPs较易受到光和激素调节。在对AhUGPs的表征中,发现AhUGP1的表达水平与菌丝生长速度、菌丝生物量、多糖含量都显著相关,相较于AhUGP2,AhUGP1在菌丝生长和多糖合成中的重要性更高。

关键词：黑木耳 UGP基因家族多糖合成菌丝生长

杜鹃兰qRT-PCR内参基因的筛选及稳定性评价

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农业生物技术学报 2024年第4期32卷 926-938页

作者：张玉琎吉军肖鑫张静怡王利琴高燕燕田宇航张明生贵州大学生命科学学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵州医科大学药学院

杜鹃兰(Cremastra appendiculata)为兰科珍稀药用植物，因其具有较高的药用价值而获得广泛关注。由于存在严重的繁殖障碍，加之人类的掠夺式采挖，导致其资源濒临枯竭，利用现代生物分子技术解决杜鹃兰物种繁殖困难的问题是资源保护的... 详细信息

杜鹃兰(Cremastra appendiculata)为兰科珍稀药用植物，因其具有较高的药用价值而获得广泛关注。由于存在严重的繁殖障碍，加之人类的掠夺式采挖，导致其资源濒临枯竭，利用现代生物分子技术解决杜鹃兰物种繁殖困难的问题是资源保护的有效途径之一。本研究以杜鹃兰不同器官(根,茎和叶)和不同萌发阶段的种子(共生萌发和非共生萌发种子)为材料，采用qRT-PCR技术检测肌动蛋白(β-actin, ACT)、翻译延伸因子(translation elongation factor 1 beta, ef-1β)、亲环蛋白(cyclophilin, CYP)、核糖体蛋白(ribosomal protein, RPL)、核糖体蛋白S8(ribosomal protein S8, RPS)、泛素C(ubiquitin C, UBC)、微管蛋白(α-tubulin, TUB)共计7个常用管家基因的表达情况，并结合geNorm、NormFinder和BestKeeper软件对候选基因的稳定性进行综合评价，根据分析结果筛选适于杜鹃兰qRT-PCR的内参基因；并通过目的基因赤霉素氧化酶基因(GA 3-beta dioxygenase, GA3ox)和凝集素蛋白编码基因10(lectin protein coding gene 10,Lectin10)对内参基因的稳定性进行验证。研究发现，在杜鹃兰不同处理条件和不同组织下均可引入双内参基因进行实验；在不同器官中，RPL和ef-1β的表达相对一致，稳定性较好，适合作为内参基因；在不同萌发阶段的共生萌发种子中，UBC和TUB表达最为稳定，而不同萌发阶段的非共生萌发种子中最稳定的内参基因为RPL和ef-1β。分别选择相对稳定的UBC和TUB作为内参基因时，目的基因GA3ox和Lectin10在不同萌发阶段的共生杜鹃兰种子中相对表达变化趋势基本一致，而稳定性较差的ACT并没有对目的基因的表达分析进行有效校正，其数据出现明显偏差。本研究为不同研究条件下杜鹃兰相关基因的表达分析提供了校正和标准化基因，有效提高了后续研究的准确性和可靠性。

关键词：杜鹃兰共生萌发非共生萌发 qRT-PCR 内参基因

刺梨及其活性成分对2型糖尿病小鼠糖脂代谢的影响

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食品科学 2022年第13期43卷 146-154页

作者：陈超谭书明王画杨笙代晓桐贵州大学酿酒与食品工程学院贵州省农畜产品贮藏与加工重点实验室贵州贵阳550025

目的:探讨刺梨冻干粉(Rosa roxburghii Tratt,RRT)、刺梨总多糖提取物(Rosa roxburghii Tratt polysaccharide extraction,RPS)、刺梨总黄酮提取物(Rosa roxburghii Tratt flavonoid extraction,RF)对2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)小鼠糖脂代谢的影响。方法:采用超声辅助联合酶法从RRT中提取RPS和RF,并用大孔树脂纯化。采用高脂高糖饲料联合链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)建立T2DM小鼠模型;设置空白组(生理盐水)、模型组、阳性组(盐酸二甲双胍)、RRT组、RPS组、RF组,干预周期28 d;期间测定小鼠体质量、进食量、饮水量、空腹血糖值(fasting blood glucose,FBG)及糖耐量。解剖后测定脏器指数、脂肪质量、血清血脂指标、肝脏抗氧化指标、葡萄糖激酶(glucokinase,GK)活力、肝糖原含量、过氧化物增殖物激活受体-γ(peroxisome proliferators-activated receptor-γ,PPAR-γ)水平,并进行肝脏病理学变化观察。结果:与空白组比,模型组体质量、棕色脂肪质量显著下降(P<0.05),进食量、饮水量、FBG、脏器指数、白色脂肪质量显著上升(P<0.05),糖耐量异常,血清总胆固醇(total cholesterol,TC)、甘油三酯(triacylglycerol,TG)、低密度脂蛋白胆固醇(low-density lipoprotein cholesterol,LDL-C)浓度显著升高(P<0.05),高密度脂蛋白胆固醇(high-density lipoprotein cholesterol,HDL-C)浓度显著降低(P<0.05);肝脏过氧化氢酶(catalase,CAT)、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)、肝糖原、GK水平显著降低(P<0.05),丙二醛(malondialdehyde,MDA)、PPAR-γ含量显著增加(P<0.05),肝细胞排列紊乱、脂肪变性、水肿、发炎。与模型组比,RRT组、RPS组、RF组进食量、饮水量、脏器指数、白色脂肪质量、FBG下降,体质量、棕色脂肪质量上升;血清TC、TG、LDL-C浓度明显下降,HDL-C浓度明显上升;肝脏MDA、PPAR-γ含量明显下降,CAT、SOD、GK活力和肝糖原含量明显增加,病理损伤明显改善。结论:RRT、RPS、RF均能改善T2DM小鼠糖脂代谢紊乱,其中RPS、RF效果显著优于RRT(P<0.05),RF效果整体上优于RPS和阳性药物盐酸二甲双胍。

关键词：刺梨冻干粉总多糖提取物总黄酮提取物 2型糖尿病糖脂代谢氧化应激

刺梨多酚对急性酒精中毒大鼠的解酒和护肝作用

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食品科学 2021年第17期42卷 163-169页

作者：周宏炫黄颖谭书明涂永丽罗继伟贵州大学酿酒与食品工程学院贵州省农畜产品贮藏与加工重点实验室贵州贵阳550025

目的:研究刺梨多酚(Rosa roxburghii ***,RRTP)对急性酒精中毒大鼠的解酒和护肝作用。方法:将大鼠随机分为正常组、模型组、阳性对照组(海王金樽,100 mg/(kg mb·d))以及RRTP低、中、高剂量组(50、100、200 mg/(kg mb·d)),连续灌胃30 d... 详细信息

目的:研究刺梨多酚(Rosa roxburghii ***,RRTP)对急性酒精中毒大鼠的解酒和护肝作用。方法:将大鼠随机分为正常组、模型组、阳性对照组(海王金樽,100 mg/(kg mb·d))以及RRTP低、中、高剂量组(50、100、200 mg/(kg mb·d)),连续灌胃30 d后,除正常组给予生理盐水外,其余各组均灌胃15 mL/kg mb白酒(乙醇体积分数56%)建立急性酒精中毒模型。分别于酒后30、60、90、120 min剪尾取血,测定血液乙醇质量浓度;酒后12 h取血与肝脏,测定大鼠血清中谷丙转氨酶(alanine aminotransferase,ALT)、谷草转氨酶(aspartate aminotransferase,AST)和甘油三酯(triglyceride,TG)水平,测定肝脏中乙醇代谢酶活力和抗氧化指标水平,并进行苏木精-伊红染色观察肝脏病理学变化;实时荧光定量聚合酶链式反应测定肝组织核因子E2相关因子2(nuclear factor erythroid-2 related factor 2,Nrf2)和血红素加氧酶-1(heme oxygenase-1,HO-1)mRNA相对表达水平。结果:与模型组相比,RRTP各剂量组均能降低大鼠血液乙醇、ALT、AST、TG水平和肝脏丙二醛含量,提高乙醇脱氢酶、乙醛脱氢酶、超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶、过氧化氢酶活力和谷胱甘肽含量,上调Nrf2、HO-1 mRNA表达量,并改善肝组织病理情况。结论:RRTP对急性酒精中毒大鼠具有较好的解酒和护肝作用,可能与其加快乙醇代谢和增强机体抗氧化能力有关。

关键词：刺梨多酚急性酒精中毒解酒作用护肝作用

刺梨口服液对消化不良小鼠胃肠动力的促进作用

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现代食品科技 2021年第1期37卷 17-23页

作者：涂永丽谭书明周宏炫罗继伟贵州大学酿酒与食品工程学院贵州贵阳550025

研究刺梨口服液对消化不良小鼠胃肠动力的促进作用。通过复方地芬诺酯诱导消化不良模型小鼠,将造模成功的小鼠分成模型组(MC)、阳性组(PC)、刺梨口服液(DF)、刺梨口服液(HF)、正常组(NC);正常组及模型组灌胃配制生理盐水,阳性组灌胃多... 详细信息

研究刺梨口服液对消化不良小鼠胃肠动力的促进作用。通过复方地芬诺酯诱导消化不良模型小鼠,将造模成功的小鼠分成模型组(MC)、阳性组(PC)、刺梨口服液(DF)、刺梨口服液(HF)、正常组(NC);正常组及模型组灌胃配制生理盐水,阳性组灌胃多藩立酮悬浮液;刺梨口服液DF、HF灌胃口服液;造模前后测量小鼠的饮食量及体质量;给药结束后,测量小鼠胃残留率及小肠运动率、血清胃动素MTL、胃泌素GAS含量评价其促消化功效。研究发现:与MC相比,DF、HF的小鼠饮食量增加了4.42%、10.38%、体质量5.87%、7.08%(p研究证明刺梨口服液具备较好的促消化作用,可有效促进胃肠动力运动效果。

关键词：刺梨消化不良胃肠运动胃肠激素