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了哥王叶绿体基因组分析

浙江农林大学学报 2024年第2期41卷 297-305页

作者：吴民华叶晓霞谭靖怡梁秋婷吴子健黄琼林广东医科大学基础医学院广东湛江524023 广东医科大学药学院广东湛江524023 广东医科大学第一临床医学院广东湛江524023

【目的】阐明药用植物了哥王Wikstroemia indica的叶绿体基因组结构特点及系统进化地位,为了哥王的资源保护和可持续利用提供科学依据。【方法】采用Illumina测序平台进行了哥王叶绿体基因组测序,并通过生物信息技术和软件进行序列拼接... 详细信息

【目的】阐明药用植物了哥王Wikstroemia indica的叶绿体基因组结构特点及系统进化地位,为了哥王的资源保护和可持续利用提供科学依据。【方法】采用Illumina测序平台进行了哥王叶绿体基因组测序,并通过生物信息技术和软件进行序列拼接、注释以及比对和系统进化分析。【结果】了哥王叶绿体基因组全长为149864 bp,由86347 bp的大单拷贝区(LSC)、10601 bp的小单拷贝区(SSC)以及穿插在它们之间均为26458 bp的一对反向重复区(IR)构成,具有环状双链四分体结构,包含124个基因。在了哥王叶绿体基因组中共找到64种24180个密码子,其中30种为高频使用密码子,高频使用密码子中又有29种是以A/T结尾;搜索到93个简单重复序列(SSR),其中单核苷酸重复居多(72个),且以A或T及两者组合形成的基序为优势基序。了哥王与近缘植物的叶绿体基因组IR边界存在较为明显的变异。序列比较和系统进化树显示了哥王与同属细轴荛花***具有最高的序列同源性。【结论】了哥王叶绿体基因组具有植物叶绿体基因组的典型结构,有密码子使用偏好性,含多态性较为丰富的SSR,且与细轴荛花的亲缘关系最近。

关键词：了哥王叶绿体基因组密码子偏好性简单重复序列序列比对系统进化关系

不同贮藏条件下水酶法牡丹籽油的氧化稳定性与货架期预测

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中国油脂 2024年第6期49卷 112-116页

作者：荣菡蔡至彦邓晓彤甘露菁杨丹北京理工大学珠海学院材料与环境学院广东珠海519088 中粮营养健康研究院营养健康与食品安全北京市重点实验室北京102209

旨在为水酶法牡丹籽油的品质控制提供理论依据,探究不同贮藏条件下水酶法牡丹籽油的氧化稳定性,并对其货架期进行预测。采用Schaal烘箱模拟加速氧化法,探究了抗氧化剂、包装材料、温度对牡丹籽油过氧化值的影响,并进行了氧化动力学分析... 详细信息

旨在为水酶法牡丹籽油的品质控制提供理论依据,探究不同贮藏条件下水酶法牡丹籽油的氧化稳定性,并对其货架期进行预测。采用Schaal烘箱模拟加速氧化法,探究了抗氧化剂、包装材料、温度对牡丹籽油过氧化值的影响,并进行了氧化动力学分析,采用Arrhenius方程进行拟合,建立了水酶法牡丹籽油货架期预测模型。结果表明:不同抗氧化剂的抗氧化效果排序为0.01%柠檬酸+0.01%TBHQ>0.02%TBHQ>0.02%柠檬酸>0.2%γ-谷维素;包装材料的抗氧化效果排序为棕色PET瓶>棕色玻璃瓶>透明PET瓶>透明玻璃瓶;随着温度升高,牡丹籽油的过氧化值明显增加;建立的货架期预测模型预测牡丹籽油在10、20、30℃下的货架期分别为117、77、51d,其实测货架期分别为134、90、60d。综上,使用抗氧化剂、避光、低温均能有效延缓水酶法牡丹籽油的氧化进程,建立的水酶法牡丹籽油货架期预测模型准确率良好。

关键词：牡丹籽油水酶法氧化稳定性货架期预测

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横风下不同编组长度城际动车组气动载荷规律分析

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铁道科学与工程学报 2024年第4期21卷 1567-1578页

作者：黄尊地彭程陈传仰许振国周镇斌伊严严常宁五邑大学轨道交通学院广东江门529020

横风是城际动车组运行时产生晃动和不稳定现象的重要原因。为提高城际动车组在横风条件下的运行安全性和稳定性,并找到动车组最优的编组配置,开展城际动车组在横风环境下的气动载荷研究。基于三维、非定常、不可压的DES湍流模型,采用新... 详细信息

横风是城际动车组运行时产生晃动和不稳定现象的重要原因。为提高城际动车组在横风条件下的运行安全性和稳定性,并找到动车组最优的编组配置,开展城际动车组在横风环境下的气动载荷研究。基于三维、非定常、不可压的DES湍流模型,采用新型城际动车组研究有/无横风环境不同编组长度对列车气动特性的影响,分析城际动车组在高架运行时各节车厢周围流场变化情况,探究城际动车组气动载荷变化规律。研究结果表明:当无横风时,头车和尾车的阻力系数大于中间车,且随着车速的增加头车和尾车的阻力系数基本不变;尾车的升力系数大于头车和中间车,且随着车速的增加头车和尾车的升力系数基本不变。当有横风时,头车的阻力系数反向增大,尾车的阻力系数正向增大,头尾车阻力系数随速度的增大而减小,中间车基本不变;头车升力系数小于尾车和中间车,编组越长,中间车升力系数波动减缓,且随速度的增大而减小。对于侧向力系数,横风使头车侧向力系数最大,中间车次之,尾车最小。编组越长,中间车侧向力系数波动越小;对于倾覆力矩系数,横风使头车倾覆力矩反向最大,中间车次之,尾车最小,随速度的增大而减小。此外,不同编组的城际列车在运行中存在着不同的气动特性,长编组列车在相同条件下具有更好的稳定性和舒适性,且城际动车组车头各种载荷变化波动最大,需要重点关注。研究可为优化列车设计、提高运行安全性和稳定性提供科学依据。在城际动车组设计和编组时,应当优先选择较长编组,以确保列车运行安全和稳定。

关键词：横风不同编组城际动车组气动特性数值仿真

配体调控CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6)复合薄膜的合成、发光性能及白光LED应用

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发光学报 2024年第7期45卷 1077-1085页

作者：蒋东亮张国星朱兴华李源陈岩五邑大学应用物理与材料学院广东江门529000

全无机CsPbX_(3)(X=Cl,Br,I)钙钛矿纳米晶(PNCs)的合成通常需要高温条件和惰性气体的参与,严重阻碍了其实际应用。本文首先利用2-甲基咪唑配体调控再结晶的方法在室温下成功地制备出具有优异发光性能的双相CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6)PN... 详细信息

全无机CsPbX_(3)(X=Cl,Br,I)钙钛矿纳米晶(PNCs)的合成通常需要高温条件和惰性气体的参与,严重阻碍了其实际应用。本文首先利用2-甲基咪唑配体调控再结晶的方法在室温下成功地制备出具有优异发光性能的双相CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6)PNCs,然后与多种聚合物结合制备出纳米晶复合薄膜。通过X射线粉末衍射(XRD)、透射电子显微镜(TEM)和紫外-可见吸收光谱等测试,证明了聚合物中的双相钙钛矿结构,筛选出综合性能优异的CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6)@PDMS和CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6)@EVA复合薄膜,并进行了发光二极管(LED)器件封装。通过Cs4PbBr6 PNCs和聚合物的双重保护,CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6)@PDMS显示出超过80%的荧光量子产率(PLQY),CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6)@EVA的水稳定性和空气稳定性得到了显著提高。最后,将CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6)@EVA复合薄膜成功应用于白光LED器件,其CIE色度坐标为(0.331,0.332),具有标准白光发射。

关键词：配体调控 CsPbBr_(3)/Cs_(4)PbBr_(6) 复合薄膜白光LED器件

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五指毛桃叶绿体基因组结构与序列特征分析

福建农林大学学报（自然科学版） 2024年第3期53卷 323-331页

作者：黄琼林谭靖怡叶晓霞梁秋婷蒲柳池吴民华广东医科大学基础医学院广东医科大学药学院广东医科大学第一临床医学院广东湛江524023

【目的】阐明药食两用植物五指毛桃的叶绿体基因组结构及其系统进化关系,为其资源利用和产品开发等研究提供基因组信息。【方法】采用高通量测序技术对五指毛桃叶绿体基因组测序,并借助生物信息工具和软件进行序列拼接、注释、比对和系... 详细信息

【目的】阐明药食两用植物五指毛桃的叶绿体基因组结构及其系统进化关系,为其资源利用和产品开发等研究提供基因组信息。【方法】采用高通量测序技术对五指毛桃叶绿体基因组测序,并借助生物信息工具和软件进行序列拼接、注释、比对和系统进化分析。【结果】五指毛桃叶绿体基因组为环状双链四分体分子,长度160 340 bp,GC含量为35.9%,包含130个基因。该基因组含有26 679个密码子,偏好使用以A/T结尾的密码子;共有93个简单重复序列,其中以A/T形成的单、二核苷酸重复为优势重复基序。五指毛桃与其他榕属植物相比,叶绿体基因组序列同源性较高,碱基变异位点数量较少,主要分布在非编码区域如rpoB-trnC、trnT-trnL、rpl32-trnL等,与薜荔具有最高的序列相似度。【结论】五指毛桃叶绿体基因组具有典型的高等植物叶绿体基因组结构和基因组成,存在密码子偏好性,包含类型丰富的简单重复序列,且与同属植物薜荔的亲缘关系最近。

关键词：五指毛桃叶绿体基因组密码子偏好性简单重复序列序列比对系统进化关系

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鸡矢藤叶绿体基因组分析

河南农业科学 2024年第1期53卷 70-77页

作者：吴民华吴子健叶晓霞谭靖怡王燊黄琼林广东医科大学基础医学院广东湛江524023 广东医科大学第一临床医学院广东湛江524023 广东医科大学药学院广东湛江524023

为了阐明岭南特色药用植物鸡矢藤的叶绿体基因组序列特征,采用高通量测序技术开展鸡血藤叶绿体基因组测序,再借助生物信息学方法对测得序列进行拼接、注释和比对分析。结果表明,鸡矢藤叶绿体基因组为153456 bp的环状双链四分体结构,共编... 详细信息

为了阐明岭南特色药用植物鸡矢藤的叶绿体基因组序列特征,采用高通量测序技术开展鸡血藤叶绿体基因组测序,再借助生物信息学方法对测得序列进行拼接、注释和比对分析。结果表明,鸡矢藤叶绿体基因组为153456 bp的环状双链四分体结构,共编码133个基因。在鸡矢藤叶绿体基因组中发现54个简单重复序列,其中A/T单核苷酸重复最多,占比61.1%;共找到26983个密码子,第3位碱基是A/T的密码子具有更高的使用频次。序列比对分析显示,鸡矢藤等5种茜草科植物在基因间隔区和内含子等非编码区域存在显著的碱基突变。系统进化树清晰地展现了鸡矢藤在茜草科内的进化位置,且不同来源的鸡矢藤序列同源性高。

关键词：鸡矢藤叶绿体基因组序列特点序列比对系统进化分析

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五爪金龙叶绿体基因组特征分析

广西科学 2024年第3期31卷 451-458页

作者：黄琼林陈依虹叶晓霞谭靖怡梁秋婷吴民华广东医科大学基础医学院广东湛江524023 广东医科大学第一临床医学院广东湛江524023 广东医科大学药学院广东湛江524023

为了阐明药用植物五爪金龙Ipomoea cairica的叶绿体基因组特征,选用五爪金龙叶片为样品,采用试剂盒法提取DNA并建立测序文库,随后使用新一代细胞器基因组测序技术进行高通量测序,并利用生物信息学手段进行序列组装和特征分析。结果显示... 详细信息

为了阐明药用植物五爪金龙Ipomoea cairica的叶绿体基因组特征,选用五爪金龙叶片为样品,采用试剂盒法提取DNA并建立测序文库,随后使用新一代细胞器基因组测序技术进行高通量测序,并利用生物信息学手段进行序列组装和特征分析。结果显示,五爪金龙叶绿体基因组为环状双链四分体分子,全长161780 bp,由88205 bp的大单拷贝区(Large Single Copy,LSC)、30747 bp的反向重复区(Inverted Repeat,IR)A、12081 bp的小单拷贝区(Small Single Copy,SSC)和30747 bp的反向重复区B(IRB)排列而成,含有131个基因;共有28757个密码子,偏好使用以A或T结尾的密码子;存在67个简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR),并以A/T单核苷酸重复居多。五爪金龙与近缘植物在IRB-SSC边界之间存在较为明显的变异,与同属三裂叶薯***、番薯***等的亲缘关系更近。本研究报道了五爪金龙叶绿体基因组的结构和序列组成,并分析其特征,为五爪金龙的物种鉴定、遗传进化及开发利用提供了基因组信息。

关键词：五爪金龙叶绿体基因组密码子偏好性简单重复序列系统进化关系

白桦脂醇酯类衍生物合成及体外抗氧化活性评价

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中药新药与临床药理 2024年第4期35卷 563-569页

作者：张彦南张欣邹梓萱余梓楷王涛广州中医药大学广东广州510006

目的通过对白桦脂醇不同位点的修饰及进一步抗氧化活性分析,探讨白桦脂醇各修饰位点与抗氧化活性间的关系。方法以白桦脂醇为起始物,以四氢呋喃(THF)或二甲基甲酰胺(DMF)作溶剂,控制反应温度及酸酐当量,进行酰化、羟基保护、氯铬酸吡啶... 详细信息

目的通过对白桦脂醇不同位点的修饰及进一步抗氧化活性分析,探讨白桦脂醇各修饰位点与抗氧化活性间的关系。方法以白桦脂醇为起始物,以四氢呋喃(THF)或二甲基甲酰胺(DMF)作溶剂,控制反应温度及酸酐当量,进行酰化、羟基保护、氯铬酸吡啶鎓盐(PCC)氧化、脱保护基等反应合成7个目标化合物,即3,28-二乙酰基白桦脂醇、3,28-二烯丙酰基白桦脂醇、28-乙酰基白桦脂醇、28-烯丙酰基白桦脂醇、3-乙酰基白桦脂醇、3-烯丙酰基白桦脂醇和3-羰基白桦脂醇。采用1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH)法测定目标化合物的体外抗氧化活性。结果白桦脂醇衍生物的结构通过核磁共振(NMR)图谱、高分辨液质联用(HRLC-MS)综合解释得以验证。DPPH法测试结果显示,白桦脂醇、3-乙酰基或烯丙酰基白桦脂醇及28-乙酰基或烯丙酰基白桦脂醇对DPPH均有一定的清除作用,且呈浓度依赖性,28-乙酰基或烯丙酰基白桦脂醇对DPPH的清除效果优于白桦脂醇及3-乙酰基或烯丙酰基白桦脂醇。在相同条件下,3-羰基白桦脂醇与3,28-双酰基(乙酰基或烯丙酰基)取代白桦脂醇无明显清除DPPH的作用。此外,烯丙酰基修饰的白桦脂醇体外抗氧化活性优于对应的乙酰基修饰的白桦脂醇。结论建立了简单易行的白桦脂醇酰化及羟基官能团保护方法。28-烯丙酰基白桦脂醇表现出更优良的体外抗氧化活性,提示白桦脂醇28-位引入吸电子作用基团可能提高其抗氧化作用。

关键词：白桦脂醇酯类衍生物合成抗氧化活性修饰位点

外源性脂多糖对马冈鹅胚胎期胸腿肌发育的影响

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南京农业大学学报 2024年第1期47卷 52-60页

作者：王金辉付梦思李发达江丹莉田允波许丹宁黄运茂张续勐仲恺农业工程学院动物科技学院广东广州510225

[目的]胚胎期是脊椎动物肌肉发育的重要时期,在鹅胚发育过程中,易受到种鹅体内脂多糖(LPS)垂直污染而导致死胚和弱苗的产生。本研究通过注射外源性LPS,模拟受LPS污染的马冈鹅胚胎,探究外源性LPS对马冈鹅胚胸腿肌发育的影响。[方法]选取... 详细信息

[目的]胚胎期是脊椎动物肌肉发育的重要时期,在鹅胚发育过程中,易受到种鹅体内脂多糖(LPS)垂直污染而导致死胚和弱苗的产生。本研究通过注射外源性LPS,模拟受LPS污染的马冈鹅胚胎,探究外源性LPS对马冈鹅胚胸腿肌发育的影响。[方法]选取8胚龄(E8)马冈鹅胚,分别注射含0、25、50和100μg LPS的生理盐水100μL于尿囊腔。于15胚龄(E15)、23胚龄(E23)和雏鹅1日龄(1 d)时采集尿囊液(1日龄采集血清)进行LPS含量检测,取胸腿肌组织进行HE染色切片并统计肌束面积和密度,检测胸腿肌中基因和1 d时蛋白表达量。[结果]外源性LPS显著降低鹅胚的孵化率。E23时,100μg LPS组雏鹅尿囊液LPS含量显著高于其他3组(P<0.05)。LPS显著降低E23和1 d胸肌肌束面积,显著降低E15肌束密度,显著提高E23胸肌肌束密度,显著降低E15和1 d腿肌肌束面积(P<0.05)。LPS组E15鹅胚胸肌炎症相关因子基因(IL-6、TNF-α)和成肌增殖相关基因(IGF-1、MyoD)的表达量显著降低(P<0.05);1 d时,IGF-1基因表达量显著升高,成肌分化相关基因(Myogenin,Myh1)表达量显著降低(P<0.05);LPS组E15鹅胚腿肌IL-6、TNF-α、MyoD、Myogenin和Myh1基因表达量显著上调,IGF-1基因表达量显著下调(P<0.05),1 d时,仅100μg组IL-6和Myogenin基因表现出显著上调(P<0.05)。蛋白表达方面,1 d时,外源性LPS组胸肌TNF-α蛋白表达量显著升高,MyoD蛋白表达量显著降低(P<0.05);腿肌IL-6、TNF-α和MyHC蛋白表达量显著升高,MyoD蛋白表达量显著降低(P<0.05)。[结论]外源性LPS会导致雏鹅孵化率降低,胸腿肌肌束横截面积显著降低,炎症因子表达量上升,成肌增殖相关基因表达量降低,不利于马冈鹅胚胎肌纤维生长发育。

关键词：马冈鹅脂多糖(LPS) 胚胎胸腿肌

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