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花椒窄吉丁转录组及化学感受相关基因的分析

昆虫学报 2019年第5期62卷 547-560页

作者：杨平谢寿安巩雪芳车显荣王延来吕淑杰西北农林科技大学林学院

【目的】建立花椒窄吉丁 Agrilus zanthoxylumi 转录组数据库,挖掘其基因组数据。【方法】采用高通量测序平台Illumina NovaSeq6000对花椒窄吉丁成虫不同组织(触角、头、胸、腹、足、翅)进行转录组测序、序列组装,使用BLAST软件将花椒... 详细信息

【目的】建立花椒窄吉丁 Agrilus zanthoxylumi 转录组数据库,挖掘其基因组数据。【方法】采用高通量测序平台Illumina NovaSeq6000对花椒窄吉丁成虫不同组织(触角、头、胸、腹、足、翅)进行转录组测序、序列组装,使用BLAST软件将花椒窄吉丁unigenes序列与公共数据库进行比对,BLAST同源性搜索的方法从中筛选出与其化学感受相关的基因,并与其他已研究发表的鞘翅目昆虫化学感受相关基因的核酸序列比对,进行系统发育分析。利用RPKM值对这些基因在花椒窄吉丁成虫不同组织中的表达量进行分析。【结果】经测序及序列拼接后共得到80 320条unigenes和 169 398 条contigs,其G+C比例分别是37.63%和39.18%,平均长度分别为828.75和1 084.33 bp;unigenes长度主要分布在200~400 bp的共有37 374条,占全部unigenes的46.53%。在NR数据库中注释的与花椒窄吉丁转录组相似基因所属物种分布为赤拟谷盗 Tribolium castaneum 所占比例26.80%,其后依次是小家鼠 Mus musculus (13.87%),蛀犀金龟 Oryctes borbonicus (5.26%),山松甲虫 Dendroctonus ponderosae (4.10%),黑蚁 Lasius niger (2.36%),其他物种所占比例是47.61%。在GO数据库中比对到27 488个unigenes,可分为分子功能、细胞组分和生物学进程三大类共59个过程;利用KOG数据库功能注释分为25类,注释到unigenes 最多功能类别的是普通功能,共 4 666个,最少的是与细胞移动相关,共40个;将80 320个unigenes映射到KEGG数据库中,21 104条unigens注释到代谢通路35个,占26.27%,注释最多的代谢途径是转录途径,共涉及到2 037条unigenes。从NR数据库中共注释到8个气味受体(odorant receptor, OR)基因、7个离子型受体(ionotropic receptor, IR)基因和6个味觉受体(gustatory receptor, GR)基因,各组织中的基因表达量分析发现,这3类化学感受相关基因在成虫触角中的表达量显著高于其他组织中的表达量,雌、雄触角中表达量差异最显著的为 AzanOR 1,而在雌、雄成虫足中这3类化学感受相关基因表达量没有差异。【结论】本研究首次获得了花椒窄吉丁转录组数据,为进一步研究花椒窄吉丁的基因功能奠定了分子基础。

关键词：花椒窄吉丁转录组高通量测序基因注释生物信息学

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岷江百合实生后代生长发育特性的研究

西北农林科技大学学报（自然科学版） 2012年第9期40卷 195-201页

作者：陈明月张延龙牛立新肖菲菲刘旭西北农林科技大学林学院陕西杨凌712100 西北农林科技大学园艺学院陕西杨凌712100

【目的】研究岷江百合实生后代的生长发育特性,为岷江百合的实生繁殖、杂交育种及品种选育提供依据。【方法】以岷江百合4、5年生实生后代为材料,对其在日光温室和露地2种栽培环境下的生长发育规律、植株形态进行定期实地观测。【结果... 详细信息

【目的】研究岷江百合实生后代的生长发育特性,为岷江百合的实生繁殖、杂交育种及品种选育提供依据。【方法】以岷江百合4、5年生实生后代为材料,对其在日光温室和露地2种栽培环境下的生长发育规律、植株形态进行定期实地观测。【结果】在露地环境下,岷江百合实生后代萌芽时间较日光温室晚22d左右,但在2种栽培环境下,生长停止时间基本一致。同一栽培环境下,5年生岷江百合实生后代叶片数和叶面积显著大于4年生实生后代;同一生长年限,日光温室内岷江百合株高、茎粗、叶片数、叶面积、花冠横径及内侧和外侧花瓣长大于露地,且差异显著;露地4、5年生岷江百合实生后代群体现蕾率、开花率分别较日光温室内高9.6%,1.4%和4.5%,3.5%,但其单株多花率分别低于日光温室6.1%和13.5%;日光温室和露地5年生岷江百合实生后代现蕾率、开花率分别较4年生高30.3%,6.4%和25.2%,8.5%,单株多花率较4年生分别高25.9%和18.5%。【结论】岷江百合实生后代在露地环境下较日光温室内更易度过童期;2种栽培环境下,4年生实生后代的营养生长较5年生实生后代旺盛,群体生长到第5年仍然没有完全度过童期。

关键词：岷江百合实生后代生长发育特性童期

麦棉两熟种植模式对棉仁脂肪及蛋白质代谢的影响

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作物学报 2015年第8期41卷 1237-1245页

作者：沈天垚杜祥备杨洪坤张宇晓郑宇飞周治国陈兵林南京农业大学/农业部作物生理生态与生产管理重点实验室江苏南京210095

研究麦棉两熟种植模式影响棉仁脂肪及蛋白质代谢机制,可为我国麦棉两熟棉区在稳定棉花产量和品质的基础上提高棉籽品质提供理论依据。试验于2012年和2013年在江苏省大丰市稻麦原种场进行,以泗杂3号(中晚熟品种)和中棉所50(早熟品种)棉... 详细信息

研究麦棉两熟种植模式影响棉仁脂肪及蛋白质代谢机制,可为我国麦棉两熟棉区在稳定棉花产量和品质的基础上提高棉籽品质提供理论依据。试验于2012年和2013年在江苏省大丰市稻麦原种场进行,以泗杂3号(中晚熟品种)和中棉所50(早熟品种)棉花品种为材料,以单作棉为对照(CK),设置棉花生产上常用的麦套移栽棉(IC)、麦后移栽棉(TC)和麦后直播棉(DC)麦棉种植模式,研究麦棉两熟不同种植模式对棉仁脂肪和蛋白质的累积动态、关键酶活性及其相互关系的影响。结果表明:(1)两熟棉棉仁脂肪含量皆较CK低,IC、TC和DC呈依次下降的趋势;IC和TC棉仁蛋白质含量皆高于CK,DC低于CK;中棉所50棉仁脂肪和蛋白质含量均略高于泗杂3号。(2)两熟棉棉仁磷脂酸磷酸酯酶(PPase)和6-磷酸葡萄糖脱氢酶(G6PDH)活性低于CK,丙酮酸羧化酶(PEPC)活性高于CK;IC、TC棉仁谷氨酰胺合成酶(GS)和谷氨酸合酶(GOGAT)活性高于CK,DC低于CK;中棉所50棉仁具有较高的PPase、G6PDH、GS和GOGAT活性,PEPC活性稍低于泗杂3号。(3)棉仁最终脂肪含量与棉仁代谢过程中PPase、G6PDH活性呈极显著正相关,与PEPC活性呈极显著负相关;棉仁最终蛋白质含量与G6PDH活性及GS、GOGAT活性分别呈显著和极显著正相关。总之,在我国麦棉两熟棉区选择应用中熟棉花品种、麦套移栽方式可以在稳定棉花产量和品质的基础上提高棉籽品质。

关键词：麦棉种植模式棉仁脂肪蛋白质关键酶

基于量子行为遗传算法的船体局部结构优化设计

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船舶力学 2017年第4期21卷 484-492页

作者：刘波林焰吕振望管官纪卓尚大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室辽宁大连116024 大连理工大学船舶工程学院辽宁大连116024

采用遗传算法解决船舶复杂结构中混合设计变量优化问题时,其效果很有效,且能获得全局最优可行解。然而,简单遗传算法局部搜索能力差且易于早熟。为了提高对船舶复杂结构设计变量解空间的搜索能力,该文设计了一种基于二进制编码的适用于... 详细信息

采用遗传算法解决船舶复杂结构中混合设计变量优化问题时,其效果很有效,且能获得全局最优可行解。然而,简单遗传算法局部搜索能力差且易于早熟。为了提高对船舶复杂结构设计变量解空间的搜索能力,该文设计了一种基于二进制编码的适用于混合变量的量子行为遗传算法,比较适合于复杂函数的全局寻优,且搜索能力优于标准遗传算法。通过三个算例对算法的寻优能力进行测试,实验结果表明,采用量子行为遗传算法进行的船体局部结构优化设计具有较好的计算质量与计算效率。

关键词：量子行为遗传算法船体局部结构结构优化设计混合设计变量搜索能力

基于液相色谱-质谱联用技术的多囊卵巢综合征患者血清脂质组学分析

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分析化学 2015年第10期43卷 1445-1451页

作者：杨兆鹏徐芳赵欣捷侯丽辉许国旺中国科学院大连化学物理研究所黑龙江中医药大学附属第一医院妇产科

多囊卵巢综合征是育龄期妇女最为常见的内分泌以及代谢紊乱疾病,是女性不孕的主要原因之一。多囊卵巢综合征患者临床存在很大的异质性,其致病机理尚未完全阐明。本研究基于反相液相色谱与串联四级杆飞行时间质谱联用技术(RPLC/Q-TOF-MS)... 详细信息

多囊卵巢综合征是育龄期妇女最为常见的内分泌以及代谢紊乱疾病,是女性不孕的主要原因之一。多囊卵巢综合征患者临床存在很大的异质性,其致病机理尚未完全阐明。本研究基于反相液相色谱与串联四级杆飞行时间质谱联用技术(RPLC/Q-TOF-MS),对74例多囊卵巢综合征患者和54例正常女性的血清进行了脂质组学分析,定性鉴别出15类314种脂质化合物。数据采用非参数检验寻找潜在的差异化合物,p<0.05为显著性差异。结果表明:多囊卵巢综合征患者与正常人相比,不饱和脂肪酸、部分鞘磷脂、甘油二酯、甘油三酯呈上调趋势;部分磷脂酰胆碱、溶血性磷脂酰胆碱、溶血性磷脂酰乙醇胺呈下调趋势。而肥胖多囊卵巢综合征患者与非肥胖多囊卵巢综合征患者相比,不饱和脂肪酸、鞘磷脂、甘油二酯、甘油三酯上调更为明显;溶血性磷脂酰胆碱、部分磷脂酰胆碱下调更为明显。本研究结果表明,脂质组学是研究疾病分型的有效手段。

关键词：多囊卵巢综合征液相色谱-质谱联用脂质组学脂质代谢异常

太原市大气PM2.5季节传输路径和潜在源分析

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中国环境科学 2019年第8期39卷 3144-3151页

作者：任浦慧解静芳姜洪进王淑楠刘瑞卿山西大学环境与资源学院

为了研究太原市大气PM2.5不同季节的传输路径和污染源区,利用HYSPLIT后向轨迹模型和NCEP的GDAS全球气象要素数据,对2017~2018年不同季节太原市逐日48h气流后向轨迹进行聚类分析,同时结合小时污染物质量浓度数据,分析不同季节太原市PM2.... 详细信息

为了研究太原市大气PM2.5不同季节的传输路径和污染源区,利用HYSPLIT后向轨迹模型和NCEP的GDAS全球气象要素数据,对2017~2018年不同季节太原市逐日48h气流后向轨迹进行聚类分析,同时结合小时污染物质量浓度数据,分析不同季节太原市PM2.5的潜在源贡献因子(WPSCF)和浓度权重轨迹(WCWT).结果表明,太原市PM2.5的质量浓度在季节上呈现冬季(77.56μg/m^3)>秋季(69.89μg/m^3)>春季(63.78μg/m^3)>夏季(45.51μg/m3)的变化趋势.PM2.5与SO2、NO2和CO之间存在明显的同源性和二次转化过程.春、秋和冬季大气传输路径主要以西和西北方向近距离、慢移速的轨迹为主,夏季以南和东方向轨迹为主.PM2.5潜在源区季节变化明显:夏季主要受太原本地和晋中地区的影响;春、秋和冬季主要受陕西中北部、吕梁、临汾和晋中等地的影响.

关键词： PM2.5 后向轨迹聚类分析潜在源贡献因子法浓度权重轨迹法

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水下图像边缘特征提取的BEMD自适应算法

哈尔滨工业大学学报 2013年第2期45卷 117-122页

作者：刘波林焰王运龙大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室辽宁大连116024 大连理工大学船舶工程学院辽宁大连116024

针对应用二维经验模式分解算法进行水下图像边缘检测时需要人工设定检测阈值的问题,提出一种BEMD与ROC曲线分析相结合的自适应图像边缘检测新方法.首先通过BEMD算法将水下图像分解成多层内禀模式函数(IMF)分量图像,然后利用不同参数组合... 详细信息

针对应用二维经验模式分解算法进行水下图像边缘检测时需要人工设定检测阈值的问题,提出一种BEMD与ROC曲线分析相结合的自适应图像边缘检测新方法.首先通过BEMD算法将水下图像分解成多层内禀模式函数(IMF)分量图像,然后利用不同参数组合的Canny检测算子对IMF分量图像进行细化处理,生成各层IMF分量的二值化图像集,最后利用ROC曲线分析技术求得IMF分量图像的最佳检测阈值,从而确定了理想的BEMD边缘特征提取图.实验结果表明:该算法能够避免人工设置检测阈值带来的操作误差,可实现图像边缘特征提取检测阈值的自适应设定.水下图像处理实例验证了所提方法的正确性和有效性.

关键词：水下图像二维经验模式分解 ROC曲线分析边缘检测

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杜仲雄花中三萜类化学成分研究

中国中药杂志 2014年第21期39卷 4225-4229页

作者：丁艳霞王腾宇张耀文黄玉梅马琳李冬冬窦德强李钦河南省杜仲栽培与利用工程实验室河南开封475001 河南大学中药研究所河南开封475001 辽宁中医药大学药学院辽宁大连116600

该研究采用正相硅胶柱色谱,反相柱色谱（RP-18）,凝胶色谱（Sephadex LH-20）以及重结晶等多种分离纯化手段,从杜仲雄花中分离得到9个化合物,通过化合物的理化性质和光谱数据鉴定其结构分别为：3-oxo-12-en-ursane-28-O-α-Larabinofura... 详细信息

该研究采用正相硅胶柱色谱,反相柱色谱（RP-18）,凝胶色谱（Sephadex LH-20）以及重结晶等多种分离纯化手段,从杜仲雄花中分离得到9个化合物,通过化合物的理化性质和光谱数据鉴定其结构分别为：3-oxo-12-en-ursane-28-O-α-Larabinofuranosyl（1→6）-β-D-glucopyranoside（1）,2α,3β-dihydroxyurs-12-en-28-oic acid（28→1）-β-D-glucopyranosyl ester（2）,熊果酸（3）,α-香树脂醇（4）,熊果醇（5）,3-O-乙酰基熊果酸乙酸酯（6）,3-O-乙酰基齐墩果酸（7）,白桦脂酸（8）,白桦脂醇（9）。其中化合物1为新化合物,化合物2,4~7为首次从该科植物中分离得到。采用MTT法对所分离的9个化合物进行抗肿瘤活性测试,结果表明仅有化合物3对K562和Hep G2细胞显示出一定的抗肿瘤活性,其余化合物对所选的2种细胞均无明显活性。

关键词：杜仲雄花三萜抗肿瘤活性

不同栽培方式对长江下游棉田资源利用效率的影响

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作物学报 2015年第7期41卷 1105-1111页

作者：张常赫戴艳娇杨洪坤张馨月杜祥备陈兵林周治国南京农业大学农学院/农业部作物生长调控重点开放实验室江苏南京210095

我国农业对自然环境依赖性强,农业生产环境相对恶劣、资源利用效率低下,作物栽培理论与技术需要不断创新和完善。为建立与当前生产模式相匹配的作物高产高效栽培管理方式,选用棉花品种泗杂3号,于2012—2013年在长江下游棉区(江苏大丰)... 详细信息

我国农业对自然环境依赖性强,农业生产环境相对恶劣、资源利用效率低下,作物栽培理论与技术需要不断创新和完善。为建立与当前生产模式相匹配的作物高产高效栽培管理方式,选用棉花品种泗杂3号,于2012—2013年在长江下游棉区(江苏大丰)不同地力水平田块(高、低)进行麦棉两熟栽培管理方式定位试验,设超高产栽培、常规栽培和高产高效栽培,系统测定棉花生物量、产量和生育期间的温光、氮肥资源利用效率。结果表明,栽培方式和地力水平显著影响棉花产量,而产量的差异主要由温光、氮肥资源利用效率的差异造成。棉花产量提高的限制因子是低下的资源利用效率。高产高效栽培较常规栽培产量提高27.5%,温光资源利用效率分别提高27.7%、23.4%、氮肥偏生产力提高10.1%,是长江下游较为适宜的栽培方式。因此未来生产中应进一步合理优化栽培方式来提高棉田资源利用效率,以达到高产高效的目标。

关键词：棉花栽培管理方式产量资源利用效率