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发酵杂粕型饲粮中添加小肽对肉牛瘤胃发酵参数及微生物区系的影响

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动物营养学报 2024年第8期36卷 5094-5106页

作者：曾钰游茵洁高彦华姜菲吴华卓彭忠利董贤文重庆市畜牧科学院重庆402460 西南民族大学畜牧兽医学院成都610041 湖北省黄冈市团风县农业农村局黄冈438000

本试验旨在研究发酵杂粕型饲粮中添加小肽对肉牛瘤胃发酵参数及微生物区系的影响。选取初重为(481.43±36.36)kg、健康状况良好的肉牛28头,随机分为4组,每组7个重复,每个重复1头牛。4组肉牛分别饲喂小肽添加水平为0(Ⅰ组,作为对照组)、0... 详细信息

本试验旨在研究发酵杂粕型饲粮中添加小肽对肉牛瘤胃发酵参数及微生物区系的影响。选取初重为(481.43±36.36)kg、健康状况良好的肉牛28头,随机分为4组,每组7个重复,每个重复1头牛。4组肉牛分别饲喂小肽添加水平为0(Ⅰ组,作为对照组)、0.5%(Ⅱ组)、1.0%(Ⅲ组)和1.5%(Ⅳ组)的发酵杂粕型全混合日粮。预试期15 d,正试期60 d。结果显示:1)随着小肽添加水平的增加,丁酸的比例呈二次曲线变化(P=0.037),异戊酸的比例有线性降低的趋势(P=0.080),丙酸的比例有二次曲线变化的趋势(P=0.082)。2)随着小肽添加水平的增加,Ace指数和Chao指数呈二次曲线变化(P=0.030、0.036)。3)门水平上,各组的优势菌门均为拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门,随着小肽添加水平的增加,厚壁菌门、柔膜菌门和Saccharibacteria的相对丰度有二次曲线变化的趋势(P=0.097、0.074、0.077)。属水平上,普雷沃氏菌属1为优势菌属,随着小肽添加水平的增加,普雷沃氏菌属1的相对丰度有二次曲线变化的趋势(P=0.089);理研菌科RC9肠道群的相对丰度随着小肽添加水平的增加呈二次曲线变化(P=0.042),与丙酸(r=-0.489,P=0.029)和戊酸比例(r=-0.529,P=0.016)显著负相关;Ⅱ组克里斯腾森菌科R7群的相对丰度显著高于其余组(P<0.05),与乙酸(r=0.678,P=0.001)、丁酸比例(r=0.481,P=0.032)和乙酸/丙酸(r=0.729,P<0.001)显著正相关,与丙酸比例(r=-0.723,P<0.001)显著负相关。综上所述,发酵杂粕型饲粮中添加小肽影响了肉牛瘤胃菌群的丰富度和多样性,影响了门和属水平菌群组成,改善了挥发性脂肪酸的组成和比例。

关键词：发酵杂粕小肽肉牛瘤胃发酵参数微生物区系

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珍珠粟WD40基因家族鉴定及表达特征分析

作物学报 2024年第9期50卷 2219-2236页

作者：杨煜琛靳雅荣骆金婵祝鑫李葳航贾纪原王小珊黄德均黄琳凯重庆市畜牧科学院重庆402460 四川农业大学草业科技学院四川成都611130

珍珠粟是世界范围重要的谷物,拥有极强的光合能力和高生产潜力,较其他作物相比,珍珠粟具有对贫瘠土壤的耐受性,能够适应多种非生物胁迫和多样化的环境条件。PgWD40基因家族在植物抵御生物和非生物胁迫以及调控植物生长发育中扮演着重要... 详细信息

珍珠粟是世界范围重要的谷物,拥有极强的光合能力和高生产潜力,较其他作物相比,珍珠粟具有对贫瘠土壤的耐受性,能够适应多种非生物胁迫和多样化的环境条件。PgWD40基因家族在植物抵御生物和非生物胁迫以及调控植物生长发育中扮演着重要角色。本研究利用生物信息学方法全面鉴定和分析了珍珠粟中的PgWD40基因家族及其表达模式。研究结果显示,共鉴定出209个PgWD40基因家族成员,通过对珍珠粟和水稻的系统进化分析将其归为5个亚家族,在同一亚族内的成员中,它们的保守序列和基因结构表现出一定的相似性。此外,通过对启动子顺式作用元件的分析显示, 176个PgWD40基因与植物的生长和发育相关, 208个PgWD40基因成员含有不同激素胁迫响应的顺式作用元件,进一步通过转录组数据分析和qRT-PCR分析显示,PMA3G03393.1、PMA4G00558.1、PMA5G02217.1等基因受到盐、热和干旱胁迫的诱导,表明这些基因可能通过依赖不同激素的信号通路来调控和响应非生物胁迫,可作为进一步研究PgWD40基因家族耐受性功能的候选基因。并且PgWD40基因家族成员在珍珠粟抽穗期的不同时期存在表达差异。通过基因表达热图以及GO和KEGG等分析,发现许多PgWD40基因家族成员参与了植物生长发育和籽粒形成的各个阶段。研究结果为全面解析PgWD40基因结构与生物学功能、耐逆性分子机制以及分子育种提供了理论基础,为今后培育高效抗逆作物新品种提供基因资源。

关键词：珍珠粟 WD40基因家族生物信息学分析产量逆境胁迫

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四川省种植业碳排放现状、动态演进及预测

中国生态农业学报（中英文） 2024年第7期32卷 1136-1147页

作者：熊鹰但玉玲王斌向智敏刘宗敏四川省农业科学院农业信息与农村经济研究所成都610066 四川省农业机械科学研究院成都610066 中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所北京100081

加强种植业碳排放测算,可为推进种植业绿色低碳转型提供重要依据。本文针对种植业从投入到产出的全过程,基于农地利用碳排放、稻田CH4排放和农地N2O排放3类主要来源,运用碳排放系数法测算2010—2021年四川省种植业碳排放量,从时序特征... 详细信息

加强种植业碳排放测算,可为推进种植业绿色低碳转型提供重要依据。本文针对种植业从投入到产出的全过程,基于农地利用碳排放、稻田CH4排放和农地N2O排放3类主要来源,运用碳排放系数法测算2010—2021年四川省种植业碳排放量,从时序特征和地区差异揭示四川省种植业碳排放特征,采用核密度分析法剖析四川省种植业碳排放动态演进趋势,运用灰色预测模型预测2022—2030年四川省种植业碳排放量和碳排放强度。结果表明:1)四川省种植业碳排放量在2010—2016年间呈波动上升趋势,2016年以后呈波动下降趋势,其碳排放强度在2010—2021年间持续降低,四川省种植业碳排放以农地利用和稻田CH_(4)碳排放为主,2021年较2010年农地利用碳排放和稻田CH_(4)排放比重均略有减少,而农地N_(2)O排放比重有所上升。2)四川省各市(自治州)种植业碳排放量和强度差异明显,2021年碳排放量最高的南充市比最低的甘孜高24.69倍,碳排放强度最高的巴中市比最低的甘孜高2.8倍。3)四川省五大区域种植业碳排放动态演进呈差异化特征,成都平原、川南、川东北、攀西和川西北五大区域种植业碳排放强度总体均呈下降趋势,但下降速度和变化幅度各异,总体上五大区域内碳排放强度的差距在逐步缩小。4)四川省种植业碳排放量和碳排放强度预计保持稳步下降态势,估计到2025年和2030年四川省种植业碳排放量将分别减少约68.72万t和137.84万t,碳排放强度将分别减少约0.13 t·万元^(-1)和0.26 t·万元^(-1)。基于此,四川省种植业碳减排应主要关注源于化肥投入和稻田CH4碳排放,因此需因地制宜采取差异化的减排措施,强化农业科技创新和推广,提升四川省种植业绿色低碳整体发展水平。

关键词：种植业碳排放测算核密度分析灰色预测模型四川省

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香芹酚对单增李斯特菌的抑制作用

食品科技 2024年第6期49卷 278-284页

作者：吴轩李佳玟肖龙泉王娟刘达玉王新惠徐纲周闯成都大学食品与生物工程学院四川成都610106 宜宾市娥天歌食品有限公司四川宜宾644100 重庆市计量质量检测研究院重庆400020

为探究香芹酚对单增李斯特菌(Listeria monocytogenes)的抑制作用,通过添加不同浓度香芹酚,测定其对单增李斯特菌抑制效果,为其在冷鲜肉中的抗菌保鲜应用提供理论依据。研究结果表明,香芹酚浓度大于等于0.20μL/mL时,它对单增李斯特菌... 详细信息

为探究香芹酚对单增李斯特菌(Listeria monocytogenes)的抑制作用,通过添加不同浓度香芹酚,测定其对单增李斯特菌抑制效果,为其在冷鲜肉中的抗菌保鲜应用提供理论依据。研究结果表明,香芹酚浓度大于等于0.20μL/mL时,它对单增李斯特菌的泳动性、群集性、产胞外蛋白酶活和生物被膜能力均有明显的抑制作用;当采用0.10~0.30μL/mL香芹酚处理后,其生物被膜量相比空白组降低34.73%~74.82%(P<0.05);此外,核酸泄露结果表明,香芹酚处理对单增李斯特菌细胞膜造成伤害,导致核酸等内容物泄漏。综上所述,香芹酚对单增李斯特菌的抑菌效果显著,能够破坏细胞膜、抑制生物被膜形成,从而产生抑菌效果。

关键词：香芹酚单增李斯特菌抑菌作用冷鲜肉

四川麻兔背最长肌DNA甲基化和转录组联合分析

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中国畜牧杂志 2024年

作者：李钰莹邝良德郑洁李丛艳郭志强雷岷谢晓红四川省畜牧科学研究院动物遗传育种四川省重点实验室

本试验旨在研究四川麻兔肌肉组织不同发育阶段的甲基化水平和基因表达差异，筛选调控肌肉发育的甲基化差异基因，选取胚胎期24 d、出生0 d、35 d和84 d的四川麻兔背最长肌，开展MethyRad甲基化测序和转录组测序筛选差异甲基化区域和差... 详细信息

本试验旨在研究四川麻兔肌肉组织不同发育阶段的甲基化水平和基因表达差异，筛选调控肌肉发育的甲基化差异基因，选取胚胎期24 d、出生0 d、35 d和84 d的四川麻兔背最长肌，开展MethyRad甲基化测序和转录组测序筛选差异甲基化区域和差异表达基因。结果表明：四川麻兔从胚胎期24 d至出生后84 d，共有85个基因表达量显著变化，其中29个基因表达量持续下调，16个基因持续上调，19个基因先上调35 d后下调。四川麻兔背最长肌DNA甲基化主要发生在CG序列上，在CG序列环境下，启动子和第1外显子区域的甲基化水平低于基因其他区域，胚胎期24 d至出生0 d、0 d 至35 d、35 d至84 d在CG序列环境下的共有差异甲基化区域（DMRs）为954个，CWG序列环境下的共有DMRs为209个，胚胎期24 d至出生后84 d DMRs逐渐减少；35 d和0 d阶段，筛选到高甲基化低表达基因有5个，低甲基化高表达基因有9个，其中ACADL、ACSM5和TMEM209等基因可能为影响四川麻兔肌肉发育的重要基因。

关键词：四川麻兔转录组背最长肌甲基化

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四川现代农业全产业链标准化试点研究

四川农业科技 2024年第1期 18-21页

作者：施波黄建轶吴亚姗四川省农产品质量安全中心成都610041

四川开展现代农业全产业链标准化试点,是贯彻落实党中央有关要求,用标准化助力农业高质量发展,助推农业强省建设的务实举措。首批试点选择蒲江柑橘、大安肉鸡、荥经茶叶3个产业,分别以产品为主线,构建现代农业全产业链标准体系,组织标... 详细信息

四川开展现代农业全产业链标准化试点,是贯彻落实党中央有关要求,用标准化助力农业高质量发展,助推农业强省建设的务实举措。首批试点选择蒲江柑橘、大安肉鸡、荥经茶叶3个产业,分别以产品为主线,构建现代农业全产业链标准体系,组织标准落地应用示范试点,目前已取得一定进展。文章总结试点工作的做法经验,立足四川农业产业标准化发展现状及需要进行分析研究,梳理全产业链标准化试点工作的困难,从标准制定、标准应用、关键主体3个方面提出建议。

关键词：现代农业全产业链农业标准化农产品

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四川省油菜生产布局特征及发展趋势

中国油脂 2024年

作者：杨泽鹏李珊珊马明坤郑盛华万柯均敖玉琴万学宋昕刘定辉陈尚洪陈红琳四川省农业科学院农业资源与环境研究所/农业部西南山地农业环境重点实验室

通过分析四川省油菜生产布局的时空变化特征及发展趋势，为进一步优化油菜生产区域布局和推动产业发展提供参考。运用比较优势指数法和资源禀赋优势指数法，系统分析2001-2021年五大农业区域生产布局变化特征；运用时间序列分析方法，预... 详细信息

通过分析四川省油菜生产布局的时空变化特征及发展趋势，为进一步优化油菜生产区域布局和推动产业发展提供参考。运用比较优势指数法和资源禀赋优势指数法，系统分析2001-2021年五大农业区域生产布局变化特征；运用时间序列分析方法，预测2022-2026年四川省油菜生产变化发展趋势。结果表明：2001-2021年，丘陵地区是油菜第一大产区，2021年生产集中度指数达71.49%，年均增幅为0.63%；成都平原区生产效率和资源禀赋优势高于全省平均水平，但生产地位不断下降；盆周山区油菜生产规模指数和生产集中度指数缓慢上升，至2021年与成都平原区无明显差别；川西南山地区和高原山地区对全省油菜生产贡献度较小。预测2022-2026年四川省油菜生产潜力进一步发挥，2026年种植面积和总产量较2021年分别增加10.34%和14.80%；未来全省油菜种植面积的增加主要来自于丘陵地区和盆周山区，油菜总产量增加主要来自于丘陵地区、成都平原区和盆周山区。四川油菜增产途径主要在于扩大五大农业区域的油菜种植面积，同步提高高原山地区和川西南山地区的单产水平。

关键词：油菜四川省农业分区生产布局发展趋势

基于转录组测序对黄秋葵籽内参基因的发掘与验证

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种子 2024年第8期43卷 119-125页

作者：孙婷秦廷豪张艳刘玉珊冯媛媛杨马进李臻张景荣四川省农业特色植物研究院成都611730 成都师范学院成都611130

为获得黄秋葵籽不同发育时期均稳定表达的内参基因,本研究对授粉后3 d、6 d、15 d、25 d和40 d的黄秋葵籽粒进行转录组测序,基于黄秋葵全基因组注释信息和黄秋葵籽转录组测序数据,筛选出6个新的候选内参基因ZCCHC11、SEU、RPL11、FKBP62... 详细信息

为获得黄秋葵籽不同发育时期均稳定表达的内参基因,本研究对授粉后3 d、6 d、15 d、25 d和40 d的黄秋葵籽粒进行转录组测序,基于黄秋葵全基因组注释信息和黄秋葵籽转录组测序数据,筛选出6个新的候选内参基因ZCCHC11、SEU、RPL11、FKBP62、MBR2L、BOB1,与文献报道的6个常用持家基因GAPDH、EF1-α、TUA5、YLS8、ACT2、eIF4A的稳定性进行对比。采用qRT-PCR检测上述基因在不同发育时期黄秋葵籽中的表达水平,运用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder综合评价其表达稳定性,然后利用淀粉合成酶基因AeAGPL2对筛选出的内参基因进行验证。结果表明,ZCCHC11L和SEU的稳定性最佳,TUA5稳定性最差;新发掘的内参基因ZCCHC11L、SEU及其ZCCHC11L+SEU组合可作为黄秋葵籽不同发育时期的内参基因。

关键词：黄秋葵籽粒内参基因 qRT-PCR

从CT图像中检测新型冠状病毒感染导致的肺炎:一种细节上采样和注意力引导的深度学习方法

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四川大学学报（医学版） 2024年第2期55卷 455-460页

作者：陈俊任陈芮邱甲军殷晋张磊四川大学计算机学院成都610065 四川大学华西医院/华西临床医学院华西生物医学大数据中心成都610041 清华大学电子工程系北京100086

目的通过对细节信息的恢复并结合局部信息的挖掘,构建基于深度学习的目标检测方法以帮助放射科医生快速诊断新型冠状病毒感染导致的肺炎(novel coronavirus pneumonia, NCP)患者CT图像中的病灶。方法提出一种细节上采样和注意力引导... 详细信息

目的通过对细节信息的恢复并结合局部信息的挖掘,构建基于深度学习的目标检测方法以帮助放射科医生快速诊断新型冠状病毒感染导致的肺炎(novel coronavirus pneumonia, NCP)患者CT图像中的病灶。方法提出一种细节上采样和注意力引导的深度学习方法。该方法使用一种基于三双线插值的线性上采样算法来增强特征图在上采样过程中细节信息的恢复能力,并在特征提取模块中嵌入基于垂直和水平空间的视觉注意力机制以增强目标检测算法对NCP病灶关键信息的表征能力。结果在NCP数据集上的实验结果显示,使用基于细节上采样算法的检测方法与基线模型相比提升了1.07%的召回率,达到了85.14%的AP50。在特征提取模块中嵌入注意力机制后取得了86.13%的AP50和73.92%的召回率以及90.37%的精确率,优于流行的目标检测模型。结论 CT图像中基于深度学习的特征信息挖掘能够进一步提升病灶检测能力,所提出的方法有助于放射科医生快速检测CT图像中的NCP病灶,为NCP患者的早期干预和高强度监测提供重要的临床依据。

关键词：新型冠状病毒感染目标检测深度学习注意力机制肺炎