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印度华首线虫核糖体和线粒体基因序列多态性分析

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2019年第1期37卷 81-86页

作者：周成艳马君刘伟徐前明朱兴全安徽农业大学动物科技学院合肥230036 中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室甘肃省动物寄生虫病重点实验室兰州730046 湖南农业大学动物医学院长沙410128 兽用蛋白质工程疫苗湖南省重点实验室长沙410128

目的分析印度华首线虫的核糖体基因和线粒体基因序列,探讨其作为分子标记的应用潜力。方法 2016年6月,于湖南省长沙市长沙县榔梨镇捕捉到2条野生大王蛇,并从蛇体内分离获得7条印度华首线虫。提取7条印度华首线虫基因组DNA, PCR扩增核糖... 详细信息

目的分析印度华首线虫的核糖体基因和线粒体基因序列,探讨其作为分子标记的应用潜力。方法 2016年6月,于湖南省长沙市长沙县榔梨镇捕捉到2条野生大王蛇,并从蛇体内分离获得7条印度华首线虫。提取7条印度华首线虫基因组DNA, PCR扩增核糖体DNA内转录间隔区1和2 (ITS-1和ITS-2)、 5.8S、线粒体DNA细胞色素c氧化酶亚基1 (cox1)、核糖体RNA小亚基12S、 ATP酶亚基6 (atp6)、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基4 (nad4)基因,测序。采用ClustalX 1.83软件拼接各基因测序结果,并进行多序列比对。基于cox1、 12S、 atp6、 nad4线粒体基因序列,以旋盘尾丝虫为外群,采用贝叶斯(BI)法构建系统进化树,分析7条印度华首线虫PCR扩增序列的种内变异。结果ITS-1、 5.8S和ITS-2扩增产物长度约为900 bp, cox1、 12S、atp6和atp4扩增产物长度依次约为400、 600、 500和400 bp。ITS-1、 5.8S和ITS-2的A+T含量为52.6%～53.7%,高于G+C含量(46.3%～47.4%), cox1、 12S、 atp6和atp4的A+T含量分别为67.1%～68.9%、 76.9%～77.4%、 73.0%～75.5%和70.3%～73.3%,均高于其G+C含量(31.1%～32.9%、 22.6%～23.1%、 24.5%～27.0%和26.7%～29.7%)。ITS-1、 5.8S、 ITS-2、 cox1、 12S、 atp6和atp4的种内变异依次为0～2.5%、 0、 0～5.0%、 0～2.6%、 0～3.7%、 0.7%～8.7%和0～11.0%。7条印度华首线虫线粒体基因序列聚于一支,与钩口科锡兰钩口线虫的亲缘关系最近。结论印度华首线虫核糖体基因序列中ITS-2变异程度最大,有望成为研究印度华首线虫种内变异的理想分子标记。线粒体基因序列变异程度从低到高依次为cox1 <12S

关键词：印度华首线虫核糖体DNA 线粒体DNA 序列分析

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大豆的孢囊线虫抗性研究新进展

中国科学：生命科学 2016年第5期46卷 535-547页

作者：刘世名彭德良中国农业科学院植物保护研究所北京100193 湖南农业大学植物保护学院长沙410128

大豆孢囊线虫(Heterodera glycines Ichinohe,soybean cyst nematode,SCN)病害是大豆(Glycine max(L.)Merr.)生产上危害最严重的病害,每年造成巨大的经济损失.种植抗性大豆品种是防治SCN最经济、有效且对环境友好的措施.大豆对SCN的抗... 详细信息

大豆孢囊线虫(Heterodera glycines Ichinohe,soybean cyst nematode,SCN)病害是大豆(Glycine max(L.)Merr.)生产上危害最严重的病害,每年造成巨大的经济损失.种植抗性大豆品种是防治SCN最经济、有效且对环境友好的措施.大豆对SCN的抗性受多基因位点控制.近年来,大豆的SCN抗性基因研究取得了突破性进展,几乎同时鉴定出了大豆的2个主要SCN抗性位点基因rhg1和Rhg4,并揭示了2种完全不同的植物抗病机制.rhg1采取的是一种由一段约31 kb长的基因组序列上的3个基因共同控制的多拷贝抗病机制,而Rhg4采取的是一种由丝氨酸羟甲基转移酶控制、可能由一碳代谢参与的抗病新机制.本文就近年来(2003年7月以来)在大豆的抗SCN位点的鉴定及新抗性种质资源挖掘、rhg1和Rhg4基因克隆与功能鉴定以及特异性分子标记开发与对SCN抗性的大豆资源品种的高通量筛选等研究方面取得的一些最新进展进行综述.

关键词：大豆大豆孢囊线虫抗性位点基因 rhg1 Rhg4 抗性种质资源分子标记高通量筛选

饲粮高剂量氧化锌及其替代物在断奶仔猪中的研究进展

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动物营养学报 2021年第3期33卷 1257-1265页

作者：张彦利蒋显仁李习龙中国农业科学院饲料研究所农业农村部饲料生物技术重点实验室北京100081

饲粮添加高剂量氧化锌能够缓解断奶仔猪腹泻、促进仔猪生长、提高仔猪免疫力等。但是氧化锌的过度使用带来了环境污染、细菌耐药性增加、锌中毒等一系列问题,因此亟需寻找一种绿色有效的高剂量氧化锌替代物。本文综述了饲粮高剂量氧化... 详细信息

饲粮添加高剂量氧化锌能够缓解断奶仔猪腹泻、促进仔猪生长、提高仔猪免疫力等。但是氧化锌的过度使用带来了环境污染、细菌耐药性增加、锌中毒等一系列问题,因此亟需寻找一种绿色有效的高剂量氧化锌替代物。本文综述了饲粮高剂量氧化锌在断奶仔猪中的实际应用和可能的作用机制以及一些氧化锌替代物的研究现状,旨在为寻找合适的高剂量氧化锌替代物提供理论依据。

关键词：高剂量氧化锌腹泻氧化锌替代物断奶仔猪

STXM-NEXAFS研究铁(Ⅲ)离子诱发柠檬酸在高岭石表面的固定机制

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化学学报 2017年第6期75卷 617-620页

作者：刘瑾杨建军曾希柏 Wang Jian Donald Sparks 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所北京100081 中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所北京100081 萨斯卡切温大学加拿大光源加拿大萨斯卡切温省萨斯卡通市S7N2V3 特拉华大学特拉华环境研究所美国特拉华州纽瓦克市19711

热带地区土壤有机碳的稳定性受有机碳与高岭石、三价铁离子[Fe(Ⅲ)]交互作用的强烈影响.低分子量有机酸(LMWOAs)是土壤有机碳中最易被微生物降解的组分,研究LMWOAs在高岭石-Fe(Ⅲ)-LMWOAs三相系统中的固定机制对于理解热带地区土壤有机... 详细信息

热带地区土壤有机碳的稳定性受有机碳与高岭石、三价铁离子[Fe(Ⅲ)]交互作用的强烈影响.低分子量有机酸(LMWOAs)是土壤有机碳中最易被微生物降解的组分,研究LMWOAs在高岭石-Fe(Ⅲ)-LMWOAs三相系统中的固定机制对于理解热带地区土壤有机碳循环具有重要意义;然而LMWOAs在该三相系统中固定机制仍不清楚,并缺乏分子水平上的直接证据.本研究以柠檬酸(CA)为LMWOAs的典型代表,通过采集Fe/CA初始物质的量比2.0条件下获取的吸附样品,利用同步辐射X射线扫描透射显微术(STXM)在亚微米尺度上表征C,Fe和Si的分布特征,发现C-Fe分布的相关性与C-Si分布相当;并在高C,Fe微区中利用C的K边和Fe的L3边X射线近边吸收精细结构谱(NEXAFS)在分子水平上揭示了Fe在不同富集微区分别以水铁矿和高岭石-Fe(Ⅲ)-CA三元配合体形式存在,从而表明水铁矿诱发的吸附/共沉淀以及以Fe(Ⅲ)为架桥形成高岭石-Fe(Ⅲ)-CA三元配合作用是CA固定的重要机制.本研究成果对于理解热带地区土壤中CA稳定性和低分子量有机酸的碳固定和循环机制提供了重要科学依据.

关键词：土壤碳固定多价阳离子 X射线扫描透射显微术 X射线近边吸收精细结构谱水铁矿

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果胶酶苎麻脱胶:一种生产还原糖的新途径

中国麻业科学 2024年

作者：马世航成莉凤冯湘沅杨琦席果果彭正红段盛文中国农业科学院麻类研究所

为提高苎麻生物质利用效率，使用果胶酶对苎麻韧皮进行水解，通过Box-Behnken响应面法优化果胶酶水解苎麻果胶工艺，采用3，5-二硝基水杨酸（DNS）法测果胶水解液中的还原糖含量。结果表明：还原糖最佳提取工艺为水解温度52 ℃，果胶酶... 详细信息

为提高苎麻生物质利用效率，使用果胶酶对苎麻韧皮进行水解，通过Box-Behnken响应面法优化果胶酶水解苎麻果胶工艺，采用3，5-二硝基水杨酸（DNS）法测果胶水解液中的还原糖含量。结果表明：还原糖最佳提取工艺为水解温度52 ℃，果胶酶浓度4.8%，水解时间7 h。在该条件下，水解液中还原糖含量可达（10.32±0.47）mg/mL。该工艺适用于将苎麻韧皮中果胶组分转化为可溶性还原糖，为后续生物质资源再利用提供依据。

关键词：苎麻果胶响应面法还原糖含量

非洲猪瘟病毒毒力因子MGF360-4L靶向降解RIPK3促进病毒复制的研究

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中国兽医科学 2024年第8期54卷 995-1001页

作者：曹雪静范许许朱兆宇裴丹诗王一卓张继燕何路李熙忠任青峰郑海学万博李伟伟河南农业大学动物医学院中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室

本研究首先利用CellTiter-Glo试剂盒测定MGF360-4L对细胞活力的影响；通过蛋白免疫印迹（Western-blot）检测MGF360-4L及其突变体对细胞坏死通路关键接头分子表达的影响；通过同源重组技术构建MGF360-4L缺失毒株（ASFV-ΔMGF360-4L）；... 详细信息

本研究首先利用CellTiter-Glo试剂盒测定MGF360-4L对细胞活力的影响；通过蛋白免疫印迹（Western-blot）检测MGF360-4L及其突变体对细胞坏死通路关键接头分子表达的影响；通过同源重组技术构建MGF360-4L缺失毒株（ASFV-ΔMGF360-4L）；利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析ASFV野生毒株（ASFV-WT）与其缺失毒株（ASFV-ΔMGF360-4L）复制水平的差异；通过Western-blot检测MGF360-4L缺失对ASFV诱导的细胞坏死的影响。结果表明，MGF360-4L包含1个RHIM，并通过溶酶体途径降解RIPK3，从而抑制细胞坏死通路的活化；MGF360-4L发挥上述功能依赖其RHIM结构域；ASFV-ΔMGF360-4L毒株复制水平低于野生毒株，且该缺失毒株能够诱导更高水平的细胞坏死。本研究证实ASFV毒力因子MGF360-4L依赖其RHIM结构域靶向降解RIPK3，并促进病毒自身复制，为ASFV致病机理的阐明提供了科学数据。

关键词：非洲猪瘟病毒细胞坏死 RHIM RIPK3 MGF360-4L

新一代信息技术对农产品追溯系统智能化影响的综述

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农业工程学报 2020年第5期36卷 182-191页

作者：钱建平吴文斌杨鹏中国农业科学院农业资源与农业区划研究所/农业农村部农业遥感重点实验室北京100081

从为应对疯牛病问题至今,追溯系统作为农产品及食品质量安全保障的有效手段引入已有近30a,如何降低追溯断链化、增强追溯可信度、提升质量预警力,已成为追溯系统研究的热点,也是应用中亟待解决的问题。该文基于国内外相关文献,瞄准热点... 详细信息

从为应对疯牛病问题至今,追溯系统作为农产品及食品质量安全保障的有效手段引入已有近30a,如何降低追溯断链化、增强追溯可信度、提升质量预警力,已成为追溯系统研究的热点,也是应用中亟待解决的问题。该文基于国内外相关文献,瞄准热点问题,综述了新一代信息技术对农产品追溯系统智能化的影响。首先,提出了追溯系统从1.0到3.0的发展历程,总结了追溯系统1.0以信息记录为主、2.0以数据整合为主、3.0以智能决策为主的核心特征;其次,描述了以物联网、大数据、云计算、人工智能、区块链等为核心的新一代信息技术之间在信息感知、数据处理、高效计算、智能分析、加密防伪等方面各有侧重又相互关联的内在关系,分析了大数据、人工智能及区块链的发展趋势;最后,从人工智能技术降低追溯过程断链程度、大数据技术提升质量安全预警能力、区块链技术增强全程追溯可信度等3个方面,综述了相关研究,结合发展趋势提出了深入研究的方向,即人工智能从供应链内部及供应链之间提升追溯粒度,大数据从微观、中观及宏观层面实现预测与优化,区块链从追溯区块结构优化、隐私保护及共识算法等方面增强追溯可信度。该文为把握农产品追溯系统发展趋势、研究热点、应用瓶颈提供有益参考。

关键词：农产品追溯新一代信息技术人工智能大数据区块链食品安全

Notch信号通路调控HP-PRRSV感染诱导的炎性反应机制

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Notch信号通路调控HP-PRRSV感染诱导的炎性反应机制

作者：陆艳中国农业科学院

学位级别：硕士

高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(Highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus,HP-PRRSV)是一种重要的病原,在临床上引起猪的繁殖障碍以及呼吸道疾病,给我国的养猪业带来了巨大的损失。在肺部,HP-PRRSV通... 详细信息

高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(Highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus,HP-PRRSV)是一种重要的病原,在临床上引起猪的繁殖障碍以及呼吸道疾病,给我国的养猪业带来了巨大的损失。在肺部,HP-PRRSV通过感染猪肺泡巨噬细胞(porcine alveolar macrophages,PAMs)导致肺部疾病,主要表现为间质性肺炎。需要指出的是,HP-PRRSV感染诱导的炎性反应是导致间质性肺炎的根本原因。尽管现如今,已有的研究在揭示HP-PRRSV诱导炎性反应方面取得了一些进展,但是,具体的机制仍需要进一步研究。Notch信号通路作为一种进化过程中保守的信号通路,通过影响细胞的分化、增生、存活等在宿主发育中起着必要的作用。除了在调控细胞命运中起着关键的作用,Notch信号通路在免疫系统中也发挥着重要的作用。其中,在巨噬细胞细胞激活方面,已有的研究显示TLR信号通路影响Notch信号通路中受体和配体的表达,继而通过Notch信号通路调控炎性因子的分泌以及巨噬细胞的激活。另外,NF-κB信号通路和MAPK信号通路参与调控Notch信号通路中受体和配体的表达。已有的研究显示HP-PRRSV感染通过TLR4、NF-κB和MAPK等信号通路调控炎性因子的产生。另外,已报道的RNA-seq的结果以及我们的前期结果显示病毒感染后上调Jagged1的表达。因此,这些结果促使我们假想:HP-PRRSV感染可激活Notch信号通路,继而通过Notch信号通路调控炎性反应。本研究聚焦于HP-PRRSV感染通过Notch信号通路调控炎性反应的机制研究,具体如下:首先,我们利用qPCR的方法检测了HP-PRRSV感染对Notch信号通路的影响,我们的结果显示HP-PRRSV感染激活Notch信号通路,包括上调配体Jagged1、Dll3和Dll4的表达以及下游靶分子Hes1和Hey1的表达。其次,利用DAPT处理以及沉默核内调控分子RBP-J的表达,我们检测了Notch信号通路对炎性因子TNF-α和IL-1β表达影响,我们的结果显示Notch信号通路参与调控HP-PRRSV感染诱导的炎性反应。随后,我们利用RNA干扰技术分析了Jagged1在HP-PRRSV感染诱导炎性反应中的作用,我们的结果显示Jagged1-Notch信号通路调控HP-PRRSV感染诱导的炎性反应。最后,我们利用抑制剂处理和RNA干扰技术对Jagged1上调的表达机制进行了研究,我们研究发现在HP-PRRSV感染的过程中,Jagged1受到NF-κB、MAPK以及Notch信号通路自身的调控。综上所述,我们的结果显示HP-PRRSV感染可通过激活Notch信号通路调控炎性因子的产生。其中HP-PRRSV感染可通过NF-κB、MAPK以及Notch信号通路自身调控配体Jagged1的表达。继而Jagged1-Notch信号通路在HP-PRRSV诱导的炎性反应中起着重要的作用。因此,我们的结果不仅明确了Notch信号通路在HP-PRRSV感染中的作用,而且为进一步揭示HP-PRRSV感染诱导炎性反应的机制奠定了基础。

关键词：高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒猪肺泡巨噬细胞 Notch信号通路炎性反应 Jagged1

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植物寄生线虫效应子研究进展

植物保护学报 2020年第2期47卷 245-254页

作者：赵洁彭德良刘世名中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193

植物寄生线虫是一类专性活体营养寄生物,在植物根部维管束细胞附近诱导形成取食位点,与植物形成稳定的寄生关系,严重影响植物的生长发育,最终导致植物大幅度减产,甚至绝收。为长期、有效地防控植物寄生线虫,对线虫寄生、致病机制及其与... 详细信息

植物寄生线虫是一类专性活体营养寄生物,在植物根部维管束细胞附近诱导形成取食位点,与植物形成稳定的寄生关系,严重影响植物的生长发育,最终导致植物大幅度减产,甚至绝收。为长期、有效地防控植物寄生线虫,对线虫寄生、致病机制及其与植物的相互作用模式进行研究显得尤为重要。效应子在线虫整个寄生阶段中起着关键作用。近些年,线虫效应子的鉴定、功能、线虫效应子与植物相互作用模式等方面的研究取得了重要进展。本文主要针对病原物与寄主植物的相互作用模型、植物寄生线虫效应子鉴定、功能及线虫效应子与寄主植物的相互作用等方面的研究进展进行简单概述。

关键词：寄主植物植物寄生线虫效应子相互作用