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不同水稻基因型花期耐热性鉴定与评价

南方农业学报 2021年第10期52卷 2641-2649页

作者：陈雷王强张晓丽高国庆吕荣华陶伟潘英华江立庚唐茂艳梁天锋广西农业科学院水稻研究所/广西水稻遗传育种重点实验室南宁530007 广西大学农学院南宁530004 广西农业科学院南宁530007

【目的】筛选花期耐热性强、产量水平高的水稻品种,为水稻花期耐热性鉴定与评价及应对高温热害的品种选择提供理论依据和技术参考。【方法】在人工气候室内模拟高温胁迫(高温38℃,每天处理6 h,连续处理3 d),以Y两优1号为对照品种,以相... 详细信息

【目的】筛选花期耐热性强、产量水平高的水稻品种,为水稻花期耐热性鉴定与评价及应对高温热害的品种选择提供理论依据和技术参考。【方法】在人工气候室内模拟高温胁迫(高温38℃,每天处理6 h,连续处理3 d),以Y两优1号为对照品种,以相对耐热指数为评价指标,同时结合产量水平,对100个不同水稻基因型的花期耐热性进行鉴定与评价。【结果】不同水稻基因型的花期耐热性差异明显,高温胁迫下颖花结实率为3.6%~64.3%,相对结实率为9.5%~80.0%。以相对耐热指数为评级标准,耐热性级别达到1(强)、3(较强)、5(中等)、7(较弱)和9(弱)级的水稻品种数量分别为4、13、42、26和15份。采用聚类分析法将100个基因型分为6种不同耐热性和产量水平的水稻类型,其中第一类在高温热害易发区推广种植安全生产性高。相对结实率是不同水稻基因型分类的主要因子,其次为产量,根据相对结实率和产量之间的二维象限分布特征,进一步筛选出耐热性较强、产量水平较高等综合性状好的品种。【结论】通过对100个不同水稻基因型花期耐热性进行鉴定和评价,筛选出特优837、云光14号、Q优8号、国稻7号、Y两优865、汕优63和黄华占等7个耐热性较强且产量水平较高的品种,这些品种可在高温易发区推广应用。

关键词：水稻花期耐热性相对耐热指数鉴定

新城疫病毒溶瘤株SH15全基因组序列的测定及分析

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中国兽医科学 2017年第6期47卷 762-767页

作者：段坦然孟春春车路平廖瑛仇旭升谭磊孙英杰宋翠萍丁铲唐兆新华南农业大学兽医学院广东广州510642 中国农业科学院上海兽医研究所上海200241

以上海某鸡场分离的1株对LoVo细胞及A549细胞具有良好的溶瘤效果且呈时间依赖性的新城疫病毒(Newcastle diseases virus,命名为SH15)为研究对象,依据gen Bank中Mukteswar毒株,设计了10对引物以用于扩增SH15的片段cDNA,并对阳性克隆进行... 详细信息

以上海某鸡场分离的1株对LoVo细胞及A549细胞具有良好的溶瘤效果且呈时间依赖性的新城疫病毒(Newcastle diseases virus,命名为SH15)为研究对象,依据gen Bank中Mukteswar毒株,设计了10对引物以用于扩增SH15的片段cDNA,并对阳性克隆进行菌液PCR鉴定以及测序分析。测序分析比对结果确定,SH15株的全基因组长15 186 bp,在genBank登录号为KY247177,结合生物学试验确定为中等毒力型。与其他毒株序列分析表明:该毒株与JS/9/05/Go、Mukteswar的全基因组同源性为99.8%,属于NDV的ClassⅡ分支中的基因Ⅲ型。推测SH15的溶瘤能力可能与HN蛋白中H203位点变异有关。本研究为了解新发现的溶瘤NDV毒株的生物学特性及全基因序列,以及以NDV为载体进一步开发肿瘤靶向药物奠定了基础。

关键词：新城疫病毒溶瘤全基因测序基因Ⅲ型 HN蛋白

麻疯树JcFATA基因干涉表达载体构建和功能初步分析

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农业生物技术学报 2018年第5期26卷 899-910页

作者：刘颖刘国选黄川腾杨亚利唐家年何春英林诗婉高美芳吴东霖陈建平广东海洋大学农学院海南省林业科学研究所嘉应学院医学院广东海洋大学食品科技学院

植物脂酰-酰基载体蛋白硫酯酶A(fatty acyl-acyl carrier protein thioesterase,FATA)是脂肪酸积累过程中的关键酶,直接调控脂肪酸的含量与组成。目前有关麻疯树(Jatropha curcas)FATA基因(JcFATA)(gen Bank登录号:EU267122.2)的功能研究还未见报道。本研究首先构建JcFATA基因RNA干涉(RNA interference,RNAi)表达载体,进行下调表达研究,以麻疯树叶片cDNA为模板,克隆出JcFATA基因正向片段FATA1(439 bp),然后将其连接到含内含子的干涉表达载体p YLRNAi.2-35S上,构建JcFATA基因RNAi表达载体pYLRNAi.2-35S-FATA1-FATA2;再通过电击法将其转入到根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)EHA105感受态细胞中,然后利用花序侵染法进行拟南芥(Arabidopsis thaliana)遗传转化,最后通过PCR检测和Southern blot验证。对转基因拟南芥植株进行了表型观察、表达量分析和脂肪酸的含量测定,结果显示,JcFATA基因干涉表达的转基因植物生长发育可能受到抑制。本研究结果可为进一步探讨JcFATA基因的功能及该基因在麻疯树遗传改良中的应用提供理论依据。

关键词：麻疯树麻疯树脂酰-酰基载体蛋白硫酯酶A基因(JcFATA) RNA干涉(RNAi) 拟南芥转化脂肪酸

中国儿科医务人员对脉搏血氧饱和度监测的知信行现状调查及相关影响因素分析

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中华实用儿科临床杂志 2022年第23期37卷 1807-1812页

作者：薛凤霞郑跃杰申阿东刘瀚旻陈星钟礼立农光民孙新卢根丁圣刚方元勋潘家华韩志英孙云陈强姜毅朱晓萍唐素萍王秀芳刘长山任少敏陈志敏赵德育殷勇张蓉芳李明尚云晓穆亚平安淑华益西央宗徐佩茹邢燕徐保平赵京陈实向伟李丽红刘恩梅宋瑜欣杨永弘申昆玲国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心首都医科大学附属北京儿童医院呼吸一科北京100045 深圳市儿童医院呼吸科深圳518038 国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所北京100045 四川大学华西第二医院小儿呼吸免疫科成都610041 山东第一医科大学附属省立医院小儿呼吸科济南250021 湖南省人民医院儿童医学中心儿童呼吸病学湖南省重点实验室长沙410005 广西医科大学第一附属医院儿科南宁530021 空军军医大学西京医院儿科西安710032 广州市妇女儿童医疗中心呼吸科广州510623 安徽医科大学第一附属医院儿科合肥230022 安徽黄山首康医院儿科黄山245061 中国科学技术大学附属第一医院儿科合肥230001 山西省儿童医院呼吸科太原030013 银川市妇女儿童保健院普儿科银川750001 江西省儿童医院呼吸内科南昌330006 武汉大学人民医院儿科武汉430060 贵州医科大学附属医院儿科贵阳550004 福建省福州儿童医院变态反应科福州350005 郑州大学第三附属医院小儿呼吸内科郑州450052 天津医科大学第二医院儿科天津300211 内蒙古医科大学附属医院儿科呼和浩特010050 浙江大学医学院附属儿童医院呼吸科杭州310052 南京医科大学附属儿童医院呼吸科南京210008 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心呼吸科上海200127 甘肃省妇幼保健院过敏反应科兰州730050 昆明市儿童医院呼吸内科昆明650034 中国医科大学附属盛京医院小儿呼吸内科沈阳110004 沈阳市儿童医院内科沈阳110032 河北省儿童医院呼吸一科石家庄050031 西藏自治区人民医院儿科拉萨850000 新疆医科大学儿科学院乌鲁木齐830000 北京大学第三医院儿科北京100191 首都儿科研究所附属儿童医院变态反应科北京100020 海南省人民医院海南医学院附属医院儿科海口570102 海南省妇女儿童医学中心海口570312 长春市儿童医院呼吸科长春130051 重庆医科大学附属儿童医院呼吸科重庆400014 哈尔滨市儿童医院变态反应科哈尔滨150010

目的调查中国儿科医务人员对脉搏血氧饱和度监测的知识、态度和行为(简称知信行),并分析其影响因素。方法采用自行设计的问卷,在2022年3月11日至14日对来自中国31个省、自治区、直辖市的11849例儿科医务人员进行线上调查。采用Logistic... 详细信息

目的调查中国儿科医务人员对脉搏血氧饱和度监测的知识、态度和行为(简称知信行),并分析其影响因素。方法采用自行设计的问卷,在2022年3月11日至14日对来自中国31个省、自治区、直辖市的11849例儿科医务人员进行线上调查。采用Logistic回归分析儿科医务人员脉搏血氧饱和度监测知信行的主要影响因素。结果儿科医务人员脉搏血氧饱和度监测知识、态度、行为总得分分别为(5.57±0.96)分、(11.24±1.25)分和(11.19±4.54)分,得分率分别为69.61%、74.95%和55.99%。Logistic回归分析显示,儿科医务人员的年龄、从业年限、所在地区和所在单位是否配置脉搏血氧仪是知识水平的主要影响因素(均P<0.05);知识水平、性别、学历、从业年限、所在地区、所在医院级别和所在单位是否配置脉搏血氧仪是态度水平的主要影响因素(均P<0.05);知识水平、性别、年龄和所在单位是否配置脉搏血氧仪是行为水平的主要影响因素(均P<0.05)。结论中国儿科医务人员对脉搏血氧饱和度监测的知识和态度水平有待进一步提高,脉搏血氧仪的使用存在明显不足。亟须制定相关政策/指南,加强教育培训,提高知信度,增加脉搏血氧仪的配置,普及推广脉搏血氧饱和度监测在临床实践中的应用。

关键词：儿科医务人员脉搏血氧饱和度监测脉搏血氧仪知信行

不同DNA提取方法对肺癌血浆循环DNA抽提效果比较

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教育教学论坛 2018年第11期 274-275页

作者：李旺胜唐一通张楚微王书菲徐洲杜陈金钊湖北文理学院医学院湖北襄阳441053

目的:研究不同DNA抽提方法对肺癌血浆循环DNA的提取效果。方法:选取68例肺癌患者为研究对象,比较gen Mag Bio磁珠法、San Prep柱式PCR产物纯化试剂盒方法、苯酚-氯仿法对肺癌血浆循环DNA的提取效果。结果:几种方法中,磁珠法具有最高的... 详细信息

目的:研究不同DNA抽提方法对肺癌血浆循环DNA的提取效果。方法:选取68例肺癌患者为研究对象,比较gen Mag Bio磁珠法、San Prep柱式PCR产物纯化试剂盒方法、苯酚-氯仿法对肺癌血浆循环DNA的提取效果。结果:几种方法中,磁珠法具有最高的提取效率和最低的CV值。结论:磁珠法对肺癌血浆循环DNA具有最好的抽提效果,适合于对小片段DNA的提取。

关键词：肺癌循环DNA 抽提方法

干酪乳杆菌arat基因的敲除及其对苯乳酸合成代谢的影响

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微生物学杂志 2022年第3期42卷 15-21页

作者：邓廷山宋丽莉孙宇周茂超王翠武国干唐雪明上海海洋大学食品学院上海201306 上海市农业科学院生物技术研究所上海201106 上海市农业科学院上海市农业遗传育种重点实验室上海201106

苯乳酸(PLA)作为一种新型的广谱抑菌物质,在食品行业具有巨大的发展潜力,作为乳酸菌的天然代谢产物之一,对其代谢机理的研究具有非常重要的意义。通过CRISPR/Cas9基因编辑系统对一株干酪乳杆菌(Lactobacillus casei)1.8727的芳香族氨基... 详细信息

苯乳酸(PLA)作为一种新型的广谱抑菌物质,在食品行业具有巨大的发展潜力,作为乳酸菌的天然代谢产物之一,对其代谢机理的研究具有非常重要的意义。通过CRISPR/Cas9基因编辑系统对一株干酪乳杆菌(Lactobacillus casei)1.8727的芳香族氨基转移酶基因arat进行敲除,得到一株arat缺失菌株(***)1.8727Δarat。通过HPLC方法分析其代谢产物,发现发酵72 h时,PLA产量比出发菌株提高约66.7%,而苯丙氨酸(Phe)比出发菌株提高约57.8%。首次在*** 1.8727中成功应用基因编辑手段敲除了arat基因,研究表明该菌株具有自身合成代谢Phe的能力,arat作为PLA代谢途径的关键酶基因,其缺失并未使PLA产量下调,而是促进了PLA与Phe的合成代谢,证明干酪乳杆菌中可能存在其他的代偿途径,arat基因缺失所造成的代谢流的改变最终造成PLA与Phe产量的提高,同时PLA的合成代谢可能涉及多个基因的参与,是一个复杂的代谢网络。研究结果对于深入研究PLA的合成代谢机制具有重要意义,为后续PLA合成代谢途径提供了新的思路及方法。

关键词：苯乳酸苯丙氨酸芳香族氨基转移酶干酪乳杆菌 CRISPR/Cas9

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一株I型犬腺病毒的分离与鉴定

中国动物检疫 2019年第2期36卷 82-87页

作者：易程邓莉唐青海阳坤滕威谢璇杨海王芳宇何丽芳衡阳师范学院生命科学与环境学院衡阳师范学院畜禽养殖生物工程技术研究所衡阳师范学院生物药物研究所湖南衡阳421008

为给I型犬腺病毒(CAV-I)后续研究提供基础材料,采集疑似犬传染性肝炎患犬粪便,用PCR方法进行CAV-I核酸检测,并运用犬肾传代细胞(MDCK)进行病毒分离培养,采用PCR和免疫过氧化物酶单层细胞染色法(IPMA)检测病毒在细胞内的繁殖状态。结果显... 详细信息

为给I型犬腺病毒(CAV-I)后续研究提供基础材料,采集疑似犬传染性肝炎患犬粪便,用PCR方法进行CAV-I核酸检测,并运用犬肾传代细胞(MDCK)进行病毒分离培养,采用PCR和免疫过氧化物酶单层细胞染色法(IPMA)检测病毒在细胞内的繁殖状态。结果显示:患犬粪便样品PCR检测为CAV-I核酸阳性,病料接种MDCK细胞培养24 h后出现明显的"葡萄串样"细胞病变效应(CPE);培养物血清学鉴定为CAV抗原阳性,不同代次病毒培养物均为CAV-I核酸强阳性;第9代病毒核酸序列与gen Bank中CAV-I毒株核苷酸相似性在99.0%以上,与CAV-Ⅱ相似性仅为65.3%;该病毒与CAV-I毒株处于同一遗传分支;病毒接种MDCK后8 h内均无抗原检出,12 h后细胞核中分布大量的CAV抗原,24 h后细胞出现典型的"葡萄串样"病变,抗原在细胞中呈弥散分布。上述结果表明,分离到的毒株为CAV-I,命名为CAV-ZY180711。

关键词：犬腺病毒分离鉴定 PCR 免疫过氧化物酶单层细胞染色法

Pistachio genomes provide insights into nut tree domestication and ZW sex chromosome evolution

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Plant Communications 2023年第3期4卷 80-98页

作者： Salih Kafkas Xiaokai Ma Xingtan Zhang Hayat Topc¸u Rafael Navajas-Pérez Ching Man Wai Haibao tang Xuming Xu Mortaza Khodaeiaminjan Murat Güney Aibibula Paizila Harun Karcı Xiaodan Zhang Jing Lin Han Lin Roberto de la Herrán Carmelo Ruiz Rejón Jerson Alexander García-Zea Francisca Robles Coral del Val Muñoz Agnes Hotz-Wagenblatt Xiangjia Jack Min HakanÖzkan Elmira Ziya Motalebipour Hatice Gozel Nergiz C¸oban Nesibe Ebru Kafkas Andrej Kilian HuaXing Huang Xuanrui Lv Kunpeng Liu Qilin Hu Ewelina Jacygrad William Palmer Richard Michelmore Ray Ming Department of Horticulture Faculty of AgricultureUniversity of C¸ukurovaAdana 01330Turkey Center for genomics and Biotechnology Haixia Institute of Science and TechnologySchool of Future TechnologyFujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhouChina Key Laboratory of Orchid Conservation and Utilization of National Forestry and Grassland Administration Fujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhouChina Departamento de genética Facultad de CienciasCampus de Fuentenueva s/n18071 GranadaSpain Department of Plant Biology University of Illinois at Urbana-ChampaignUrbanaIL 61801USA Key Laboratory of the Ministry of Education for Coastal and Wetland Ecosystems College of the Environment and EcologyXiamen UniversityXiamen 361102China Department of Computer Science University of GranadaGranadaSpain Andalusian Research Institute in Data Science and Computational Intelligence(DaSCI Institute) 18014 GranadaSpain German Cancer Research Center Omics IT and Data Management Core FacilityHeidelbergGermany Department of Biological Sciences Youngstown State UniversityYoungstownOH 44555USA Department of Field Crops Faculty of AgricultureUniversity of C¸ukurovaAdana 01330Turkey Pistachio Research Institute SxahinbeyGaziantep 27060Turkey Diversity Arrays Technology University of CanberraCanberraACTAustralia genome Center University of California Davis451 Health Sciences DriveDavisCA 95616USA

Pistachio is a nut crop domesticated in the Fertile Crescent and a dioecious species with ZW sex *** sequenced the genomes of Pistacia vera cultivar(cv.)Siirt,the female parent,and *** ***,the male *** chromosome-level reference genomes of pistachio were generated,and Z and W chromosomes were *** ZW chromosomes originated from an autosome following the first inversion,which occurred approximately 8.18 *** inversion events in the W chromosome led to the formation of a 12.7-Mb(22.8%of the W chromosome)non-recombining *** W-specific sequences contain several genes of interest that may have played a pivotal role in sex determination and contributed to the initiation and evolution of a ZW sex chromosome system in *** W-specific genes,including defA,defA-like,DYT1,two PTEN1,and two tandem duplications of six VPS13A paralogs,are strong candidates for sex determination or *** history analysis of resequenced genomes suggest that cultivated pistachio underwent severe domestication bottlenecks approximately 7640 years ago,dating the domestication event close to the archeological record of pistachio domestication in *** identified 390,211,and 290 potential selective sweeps in 3 cultivar subgroups that underlie agronomic traits such as nut development and quality,grafting success,flowering time shift,and drought *** findings have improved our understanding of the genomic basis of sex determination/differentiation and horticulturally important traits and will accelerate the improvement of pistachio cultivars and rootstocks.

关键词： Pistacia vera pistachio sequencing reference genome sex chromosome domestication

Antibiotic resistance and molecular characterization of diarrheagenic Escherichia coli and non-typhoidal Salmonella strains isolated from infections in Southwest China

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Infectious Diseases of Poverty 2018年第1期7卷 512-522页

作者： Shun-Xian Zhang Yong-Ming Zhou Li-Guang Tian Jia-Xu Chen Rita Tinoco-Torres Emmanuel Serrano Shi-Zhu Li Shao-Hong Chen Lin Ai Jun-Hu Chen Shang Xia Yan Lu Shan Lv Xue-Jiao Teng Wen Xu Wen-Peng Gu Si-tang Gong Xiao-Nong Zhou Lan-Lan geng Wei Hu Guangzhou Institute of Pediatrics Guangzhou Women and Children’s Medical CenterGuangzhou Medical UniversityGuangzhou 510623People’s Republic of China Department of Gastroenterology Guangzhou Women and Children’s Medical CenterGuangzhou Medical UniversityGuangzhou 510623People’s Republic of China Yunnan Provincial Center for Disease Control and Prevention Kunming 650022People’s Republic of China National Institute of Parasitic Diseases Chinese Center for Disease Control and PreventionShanghai 200025People’s Republic of China Chinese Center for Tropical Diseases Research WHO Collaborating Centre for Tropical DiseasesNational Center for International Research on Tropical DiseasesMinistry of Science and TechnologyKey Laboratory of Parasite and Vector BiologyMinistry of HealthShanghai 200025People’s Republic of China Department of Biology&CESAM University of Aveiro3810-193 AveiroPortugal Wildlife Ecology and Health group and Servei d’Ecopatologia de Fauna Salvatge(SEFaS) Departament de Medicina i Cirurgia AnimalsUniversitat Autònoma de Barcelona(UAB)BellaterraSpain Department of Microbiology and Microbial Engineering School of Life SciencesFudan UniversityShanghai 200433People’s Republic of China

Background:Bacterial diarrhea is one of the most common causes for medical consultations,mortality and morbidity in the *** Escherichia coli(DEC)and non-typhoidal Salmonella(NTS)are major intestinal pathogens in developing countries,and the indiscriminate use of antibiotics has greatly contributed to resistant ***,the aim of the present study is to identify the antimicrobial resistance patterns and the molecular characteristics of DEC and NTS in southwest,***:1121 diarrheal patients and 319 non-diarrheal subjects across all age groups were recruited from four sentinel hospitals from June 2014 to July 2015 in Kunming City,Yunnan *** stool specimen was collected to detect DEC and NTS with standard microbiological and molecular *** resistance testing was performed with the Kirby-Bauer disk diffusion method,and the standards for antimicrobial susceptibility testing complied with the Clinical and Laboratory Standards Institute(CLSI).Molecular characterization of strains was carried out using pulsed-field gel electrophoresis(PFGE).A structured questionnaire was used to record basic epidemiological data(***,age,residence,season,etc.).Data were analyzed using Chi-square or Fisher’s exact ***:DEC was detected in 127(11.33%)diarrhea cases and 9(2.82%)non-diarrheal cases(χ^(2)=20.69,Pgentamicin(gen)and Sulfamethoxazole-Trimethoprim(SXT)of DEC isolated from diarrhea cases were higher than those of NTS isolated from diarrhea patients(37.01%vs 14.29%,χ^(2)=7.57,P=0.006;29.92%vs 11.

关键词： Enterobacterial infections Gastroenteritis Fingerprint typing Kunming Yunnan

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