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Whole-genome sequencing in medicinal plants:current progress and prospect

Science China(life Sciences) 2024年第2期67卷 258-273页

作者： Yifei Pei liang Leng Wei Sun Baocai liu Xue Feng xiwen li Shilin Chen Institute of Chinese Materia Medica China Academy of Chinese Medical SciencesBeijing 100700China Institute of Herbgenomics Chengdu University of Traditional Chinese MedicineChengdu 611137China Innovative Institute of Chinese Medicine and Pharmacy Chengdu University of Traditional Chinese MedicineChengdu 611137China Institute of Agricultural Bioresource Fujian Academy of Agricultural SciencesFuzhou 350003China

Advancements in genomics have dramatically accelerated the research on medicinal plants,and the development of herbgenomics has promoted the“Project of 1K Medicinal Plant Genome”to decipher their genetic ***,it is difficult to obtain their high-quality whole genomes because of the prevalence of polyploidy and/or high genomic *** genomes of 123 medicinal plants were published until September *** published genome sequences were investigated in this review,covering their classification,research teams,ploidy,medicinal functions,and sequencing *** than 1,000 institutes or universities around the world and 50 countries are conducting research on medicinal plant *** species account for a majority of sequenced medicinal *** whole genomes of plants in the Poaceae family are the most *** 40%of the published papers studied species with tonifying,replenishing,and heat-cleaning medicinal *** plants are still in the process of domestication as compared with crops,thereby resulting in unclear genetic backgrounds and the lack of pure lines,thus making their genomes more difficult to *** addition,there is still no clear routine framework for a medicinal plant to obtain a high-quality whole ***,a clear and complete strategy has been originally proposed for creating a high-quality whole genome of medicinal ***,whole genome-based biological studies of medicinal plants,including breeding and biosynthesis,were *** also advocate that a research platform of model medicinal plants should be established to promote the genomics research of medicinal plants.

关键词： herbgenomics whole genome high throughput sequencing research strategy model species application

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Molecular quantification of herbs(Herb-Q):a pyrosequencingbased approach and its application in Pinellia ternata

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Chinese Journal of Natural Medicines 2024年第7期22卷 663-672页

作者： PEI Yifei liU Ziyi YU Dade ZHANG Xiangyu SUN Wei CHEN Xiaofang FENG Xue li xiwen Institute of Chinese Materia Medica China Academy of Chinese Medical SciencesBeijing 100700China Bijie Institute of Traditional Chinese Medicine Bijie 551700China The Key Laboratory for Health Industry of Bijie Bijie Medical CollegeBijie 551700China

Variations in herb dosage due to species adulteration and dosing inaccuracies can substantially affect clinical safety and *** species quantification remains challenging,as current methods often yield inconsistent *** study introduces a novel pyrosequencing-based technique,termed herb molecular quantification(Herb-Q),designed to precisely quantify herbal *** evaluated its effectiveness using Pinellia ternata and five of its ***,we assessed commonly used DNA barcodes with sequences from a public database,identifying two candidate regions,Maturase K(matK)and internal transcribed spacer 2(ITS2),for screening specific single nucleotide polymorphism(SNP)loci,allowing for species-specific *** loci were validated by amplifying and sequencing genomic material from collected *** validation studies showed that Herb-Q demonstrated excellent linearity,accuracy,repeatability,and detection *** established quantitative standard curves with high R^(2)values(>0.99)to enable precise species quantification,which were combined with external standards to provide clear and accurate visual quantification *** average bias in quantifying the tuber of *** was 2.38%,confirming that Herb-Q can accurately identify and quantify herbal product ***,the entire quantification process took less than 4 *** study presents a novel,rapid method for accurately quantifying species in herbal products and advances the application of DNA barcoding from species identification to quantitative detection.

关键词： Quantification Adulterant DNA barcodes Single nucleotide polymorphism

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面向高校师范专业认证的电磁学实验教学改革

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实验室科学 2024年第1期27卷 145-149页

作者：李曦雯惠州学院电子信息与电气工程学院广东惠州516007

师范专业认证的目的是推动师范类专业注重内涵建设,认证对电磁学实验教学提出了新要求。按照专业认证标准和专业办学定位,对照物理师范专业毕业生达成度要求,找出自身存在的问题与差距,并针对这些问题,进行了调整实验室布局、更新实验... 详细信息

师范专业认证的目的是推动师范类专业注重内涵建设,认证对电磁学实验教学提出了新要求。按照专业认证标准和专业办学定位,对照物理师范专业毕业生达成度要求,找出自身存在的问题与差距,并针对这些问题,进行了调整实验室布局、更新实验仪器、优化实验内容、创新教学模式、融入思政教育等系列改革,这些改革措施取得了积极成果,提升了实验教学质量。

关键词：师范专业认证认证标准电磁学实验

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岩藻多糖酶产生菌的筛选及其酶解产物的结构表征、抗氧化研究

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食品与发酵工业 2024年第1期50卷 22-28页

作者：杨柳顾秋亚王聪聪李熙文余晓斌江南大学生物工程学院工业生物技术教育部重点实验室江苏无锡214122

该文以唯一碳源法初筛,并以高效凝胶渗透色谱法(high performance gel permeation chromatography,HPGPC)检测,从茶叶中得到一株具有岩藻多糖酶活性的菌株。利用该菌发酵粗酶液在50℃下酶解岩藻多糖(fucoidan,F)24 h后,产物中低于10 kD... 详细信息

该文以唯一碳源法初筛,并以高效凝胶渗透色谱法(high performance gel permeation chromatography,HPGPC)检测,从茶叶中得到一株具有岩藻多糖酶活性的菌株。利用该菌发酵粗酶液在50℃下酶解岩藻多糖(fucoidan,F)24 h后,产物中低于10 kDa的低分子质量岩藻多糖(low molecular weight fucoidan,LMWF)相对含量为59.4%。基于ITS基因序列的系统发育分析,该菌株被鉴定为Aspergillus amstelodami。后用该菌株的发酵粗酶液酶解制备LMWF,分析F和LMWF的硫酸基团含量、单糖组成、分子质量和糖苷键类型;结果表示,F、LMWF硫酸基团含量分别为(33.0±0.3)%、(32.4±0.9)%;单糖主要由岩藻糖和半乳糖组成,并含有少量的木糖和葡萄糖醛酸;分子质量分别为277 kDa、2997 Da;糖苷键类型均为α-糖苷键。水解前后样品的抗氧化结果显示,LMWF的抗氧化活性明显优于F;表明利用该菌发酵粗酶液酶解制备的LMWF具有较好的生物活性,研究结果为后续岩藻多糖应用于食品与工业化生产奠定了基础。

关键词：筛选鉴定低分子质量岩藻多糖结构表征抗氧化

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粉煤灰堆积体大断面连拱隧道失稳破坏模式及施工力学研究

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岩土工程学报 2024年第9期46卷 1909-1918页

作者：余涛廖杭朱宁波姚志刚方勇李希文田青峰西南交通大学交通隧道工程教育部重点实验室四川成都610031 四川公路桥梁建设集团有限公司四川成都610093 中铁第四勘察设计院集团有限公司湖北武汉430063

国内目前并无在粉煤灰堆积体中采用暗挖法修建大断面连拱隧道的先例,给隧道的设计和施工带来了巨大挑战。依托盐坪坝隧道工程,开展了室内相似模型试验,探讨了该地层下大断面连拱隧道塌落拱演化规律及开挖施工力学行为。研究结果表明:连... 详细信息

国内目前并无在粉煤灰堆积体中采用暗挖法修建大断面连拱隧道的先例,给隧道的设计和施工带来了巨大挑战。依托盐坪坝隧道工程,开展了室内相似模型试验,探讨了该地层下大断面连拱隧道塌落拱演化规律及开挖施工力学行为。研究结果表明:连拱隧道在粉煤灰堆积体中开挖极易发生失稳,将失稳过程划分为4个演化阶段,破坏模式具有突发性、剧烈性、对称性、同步性特征;塌落拱高度约为隧道开挖跨度的40%。采用单侧壁导坑法开挖时粉煤灰堆积体承载力严重不足,根据相似换算关系左、右洞拱顶沉降分别为16.86,14.91cm,需对地层实施注浆加固;地层沉降呈对称“双峰状”,先行洞相较于后行洞受开挖影响较大,中隔墙的承载作用能够有效降低地层位移,单洞压力拱向双洞压力拱转换过程中,中隔墙受到偏压作用容易向先行洞侧偏转,建议在先行洞开挖时中隔墙添加支撑物。

关键词：连拱隧道粉煤灰堆积体模型试验塌落拱单侧壁导坑法

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Physiological and transcriptional responses to heat stress in a typical phenotype of Pinellia ternata

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Chinese Journal of Natural Medicines 2023年第4期21卷 243-252页

作者： WANG Jialu CHEN Jialei ZHANG Xiangyu FENG Xue li xiwen Institute of Chinese Materia Medica China Academy of Chinese Medical SciencesBeijing 100700China College of Medicine Henan University of Chinese MedicineZhengzhou 450046China Bijie Institute of Traditional Chinese Medicine Bijie 551700China

Pinellia ternata is an important medicinal plant,and its growth and development are easily threatened by high *** this study,comprehensive research on physiological,cytological and transcriptional responses to different levels of heat stress were conducted on a typical phenotype of ***,*** exhibited tolerance to the increased temperature,which was supported by normal growing leaves,as well as decreased and sustained photosynthetic *** stress aggravated the damages,and *** displayed an obvious leaf senescence phenotype,with significantly increased SOD and POD activities(46%and 213%).In addition,mesophyll cells were seriously damaged,chloroplast thylakoid was fuzzy,grana lamellae and stroma lamellae were obviously broken,and grana thylakoids were stacked,resulting in a dramatically declined photosynthetic rate(74.6%).Moreover,a total of 16808 genes were significantly differential expressed during this process,most of which were involved in photosynthesis,transmembrane transporter activity and plastid *** number of differentially expressed transcription factors in MYB and bHLH families was the largest,indicating that these genes might participate in heat stress response in *** findings provide insight into the response to high temperature and facilitate the standardized cultivation of ***.

关键词： Pinellia ternata Heat stress SOD and POD activities Photosynthetic rate Chloroplast Transcriptional response

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政府引导基金对企业技术创新的影响分析

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科技管理研究 2024年第3期44卷 46-55页

作者：张慧雪王建业李西文广东财经大学会计学院广东广州510320 广东外语外贸大学会计学院广东广州510006 河北经贸大学会计学院河北石家庄050062

采用2013—2019年我国新三板挂牌企业数据为样本,构建相关变量与模型对政府引导基金对企业技术创新的影响进行基准回归分析,并进一步基于风险投资机构专业化视角、考虑投资企业早期阶段变量以及地理邻近调节变量进行分析与稳健性检验。... 详细信息

采用2013—2019年我国新三板挂牌企业数据为样本,构建相关变量与模型对政府引导基金对企业技术创新的影响进行基准回归分析,并进一步基于风险投资机构专业化视角、考虑投资企业早期阶段变量以及地理邻近调节变量进行分析与稳健性检验。研究发现,与没有引导基金持股的企业相比,有引导基金持股的企业技术创新表现更好;将引导基金委托的风险投资机构专业化因素纳入考察后发现,只有当被投资企业处于企业发展早期阶段时,从事早期阶段专业化投资策略的风险投资机构能显著促进企业技术创新;当被投资企业与风险投资机构地理位置相邻时,从事早期阶段专业化投资策略的风险投资机构更能显著促进企业技术创新,表明风险投资机构阶段专业化与地域专业化能够协同发挥作用。从风险投资机构专业化角度,揭示了引导基金促进企业技术创新的作用机制。为促进企业技术创新,国家应该积极设立政府引导基金,并以市场化的方式参与投资,同时发挥受托管理机构的专业化协同作用。

关键词：政府引导基金技术创新风险投资机构专业化投资新三板

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人参生长过程对外源磷肥的需求规律研究

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世界科学技术-中医药现代化 2024年第5期26卷 1213-1222页

作者：陈莹莹李洁赵贵萍张乃嘦徐福荣于大德李西文云南中医药大学中药学院昆明650500 中国中医科学院中药研究所北京100700 盛实百草药业有限公司天津300301

目的探究农田参对外源磷肥的需求规律,为配方施肥和专用肥研发奠定基础。方法以二年生和三年生人参苗为试验材料,采用过磷酸钙及无磷霍格兰德营养液(Hoagland溶液)为供试肥料,设置P_(2)O_(5)浓度分别为0 mmol·L^(-1)、0.5 mmol·L^(-1)... 详细信息

目的探究农田参对外源磷肥的需求规律,为配方施肥和专用肥研发奠定基础。方法以二年生和三年生人参苗为试验材料,采用过磷酸钙及无磷霍格兰德营养液(Hoagland溶液)为供试肥料,设置P_(2)O_(5)浓度分别为0 mmol·L^(-1)、0.5 mmol·L^(-1)、1.5 mmol·L^(-1)、3 mmol·L^(-1)、6 mmol·L^(-1)、8 mmol·L^(-1),监测不同浓度磷肥对人参农艺指标、光合特性以及对人参皂苷Rg_(1)、Rb_(1)、Re积累的影响。结果外施1.5-3.0 mmol·L^(-1)磷肥对二年生及三年生人参的株高、茎粗、根重、叶面积、叶绿素相对含量及叶片净光合速率、总皂苷含量均有显著的促进作用。其中二年生人参根重较无磷组提高16%,皂苷含量增加24%;三年生人参根重较无磷组可提高89%,皂苷含量可增加132%。P_(2)O_(5)适宜施用量分别为每株26.6 mg、53.3 mg。结论外施适宜浓度磷肥,可提升人参外部形态特征、改善光合生理特性并增加活性成分含量。

关键词：人参磷肥肥料皂苷产量

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政府治理行为对景迈山古茶林村落景观演变的影响

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西南林业大学学报（社会科学） 2024年第1期8卷 113-118页

作者：张优优李皙雯唐雪琼西南林业大学园林园艺学院云南昆明650233 广西壮族自治区林业勘测设计院广西南宁530011 西南林业大学地理与生态旅游学院云南昆明650233

选择云南景迈山古茶林糯干傣族村寨为古茶林村落景观研究地,采用访谈法和观察法相结合,分析村落景观的演变历程。结果表明:糯干古茶林村落景观演变可分为变化基础期、稳定发展期、急剧变化期、现代同化期及恢复保护期等5个阶段;政府治... 详细信息

选择云南景迈山古茶林糯干傣族村寨为古茶林村落景观研究地,采用访谈法和观察法相结合,分析村落景观的演变历程。结果表明:糯干古茶林村落景观演变可分为变化基础期、稳定发展期、急剧变化期、现代同化期及恢复保护期等5个阶段;政府治理与景观演变具有密切关系,对村落生产、生态景观演变和村落整体景观蜕变都有重要影响;地方政府治理强度及治理策略变化,会在古茶林村落景观的潜变、突变及蜕变演化时表现出不同特征。

关键词：古茶林村落政府治理景观景迈山

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Computational and experimental investigation of laminar flow mixing system in a pitched-blade turbine stirred tank

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International Journal of Agricultural and Biological Engineering 2018年第4期11卷 111-117页

作者： Yanyan Cui Huabo Zhang xiwen li Mingjin Yang Zailin Guan State Key Laboratory of Digital Manufacturing Equipment and Technology Huazhong University of Science and TechnologyWuhan 430074China College of Engineering and Technology Southwest UniversityChongqing 400715China

The flow distribution and mixing performance of the laminar flow in the PBT impeller-stirred tank were investigated in this *** variation along with mixing time of the flow distribution and concentration at the selected positions was visualized by means of the CFD and experiment *** CFD simulations results had a good agreement with the experimental *** order to minish the Segregated Regions,the PBT impeller was optimally designed by means of orthogonal factorial experiment with selecting theθ99 mixing time as evaluation *** the aim to increase the mixing efficiency,the optimal design results were obtained with the geometrical parameters of impeller diameter of 0.084 m,discharge angle of 45º,blade width of 0.018 m,and clearance of 0.05 m,and the mixing time of the optimal impeller-stirred flow was about 180 s,so this optimal design PBT impeller is more proper for the agricultural industries.

关键词： mixing laminar flow PBT impeller mixture homogeneity CFD

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