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the actuality of Lamarck: towards the bicentenary of his Philosophie Zoologique

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Integrative Zoology 2006年第1期1卷 48-52页

作者： Francis dov POR Hebrew University of jerusalem JerusalemIsrael

Lamarck,a son of the age of natural philosophy and revolutionary ideas,turned to zoology,the field in which he made his major impact,in his old *** then,the world had already shifted towards a different intellectual atmosphere and,due to this anachronism,he was snubbed and even ridiculed by the mainstream *** his basic ideas about the active role of organisms in and the progressive unraveling of evolution stubbornly survived along the academic fringes and,more importantly,among the humanistic *** developments in genetic inheritance,embryology,immunology and behavioral studies vindicate,at least in part,the 200-year-old vision of Lamarck.

关键词： Lamarck new genetics progressive evolution role of behavior

Implicit pairs for boosting unpaired image-to-image translation

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Visual Informatics 2020年第4期4卷 50-58页

作者： Yiftach Ginger dov Danon Hadar Averbuch-Elor Daniel Cohen-Or tel Aviv University Israel

In image-to-image translation the goal is to learn a mapping from one image domain to *** the case of supervised approaches the mapping is learned from paired ***,collecting large sets of image pairs is often either prohibitively expensive or not *** a result,in recent years more attention has been given to techniques that learn the mapping from unpaired *** our work,we show that injecting implicit pairs into unpaired sets strengthens the mapping between the two domains,improves the compatibility of their distributions,and leads to performance boosting of unsupervised techniques by up to 12%across several *** competence of the implicit pairs is further displayed with the use of pseudo-pairs,i.e.,paired samples which only approximate a real *** demonstrate the effect of the approximated implicit samples on image-to-image translation problems,where such pseudo-pairs may be synthesized in one direction,but not in the *** further show that pseudo-pairs are significantly more effective as implicit pairs in an unpaired setting,than directly using them explicitly in a paired setting.

关键词： Generative adversarial networks Image-to-image translation Data augmentation Synthetic samples

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血管弯曲程度对内源性一氧化氮分布的影响

中国生物医学工程学报 2017年第3期36卷 316-321页

作者：赵红俊韩金涛刘聪 dov jaron 乔惠婷北京航空航天大学生物与医学工程学院北京100191 北京大学第三医院介入血管外科北京100191 德雷塞尔大学生物医学工程理学与健康系统学院美国费城pa19104 中国生物医学工程学会

一氧化氮(NO)在血流调控中起着重要作用,目前关于血管弯曲程度对NO分布的影响尚不明确。建立11个不同弯曲程度的几何模型,利用多物理场耦合建模仿真的方法,对内源性NO在血液、血管壁及周围组织中的浓度分布进行数值模拟。数值结果表明,... 详细信息

一氧化氮(NO)在血流调控中起着重要作用,目前关于血管弯曲程度对NO分布的影响尚不明确。建立11个不同弯曲程度的几何模型,利用多物理场耦合建模仿真的方法,对内源性NO在血液、血管壁及周围组织中的浓度分布进行数值模拟。数值结果表明,在血管弯曲处,NO径向分布不均,内外侧浓度存在差异,且随着弯曲程度的增加,浓度差值呈先上升后缓慢降低的趋势。在血管投影长度为定值20 mm的情况下,当弯曲高度取2 mm、对应曲率为0.04时,NO在内外侧平滑肌区域的浓度差值达到最大,外侧边界比内侧高23.74%。研究揭示弯曲程度对内源性NO分布的影响,所产生的NO浓度分布差异可能是导致血管形态变化以及血管病变的重要因素,为进一步探究发病机理以及患病风险评估提供一定的理论依据。

关键词：一氧化氮弯曲曲率多物理场仿真平滑肌舒张

马铃薯SOD基因家族鉴定及其在损伤块茎中的响应

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农业生物技术学报 2021年第7期29卷 1248-1259页

作者：任映玥姜红马丽李永才 dov Prusky 毕阳甘肃农业大学食品科学与工程学院农业研究组织沃坎尼中心新鲜产品采后科学系

超氧化物歧化酶(superoxide dismutase, SOD)基因家族在马铃薯(Solanum tuberosum)生长发育和逆境胁迫响应中具有重要作用,但是马铃薯SOD基因家族成员的鉴定及其在块茎损伤后的变化鲜有报道。为分析SOD基因家族成员的生物信息学特性,研... 详细信息

超氧化物歧化酶(superoxide dismutase, SOD)基因家族在马铃薯(Solanum tuberosum)生长发育和逆境胁迫响应中具有重要作用,但是马铃薯SOD基因家族成员的鉴定及其在块茎损伤后的变化鲜有报道。为分析SOD基因家族成员的生物信息学特性,研究各家族成员在马铃薯不同器官的表达差异以及在损伤块茎中的响应,本研究使用GSDS 2.0和PLACE分析StSOD基因结构和顺式作用元件,采用ProtParam、ProtComp 9.0、MEGA7.0、MEME4.11.1分析StSOD蛋白的理化性质、亚细胞定位、进化关系及保守基序,利用qRt-PCR技术检测各家族成员在不同组织中的表达差异及块茎损伤24 h内的表达变化,利用生化方法测定SOD抑制剂二乙基二硫代氨基甲酸钠(diethyldithiocarbamate, DDC)处理对损伤块茎SOD活性以及O2·-和H2O2含量的影响。结果表明,共鉴定出8个SOD基因家族成员,分别含有Cu/ZnSOD结构域、Fe/MnSODα-发夹结构域和C末端Fe/MnSOD结构域。马铃薯SOD蛋白含152～312个氨基酸,等电点分布在5.28～7.13,亚细胞定位预测包括细胞质、叶绿体和线粒体。StSOD家族成员不均匀分布于12条染色体中的6条。8个SOD家族成员基于其保守结构域的不同分为Cu/ZnSOD、FeSOD和MnSOD亚家族。8个StSODs启动子上分布大量光、环境胁迫和激素响应元件。马铃薯根、茎、叶、芽和块茎中均有StSODs表达,其中StCSD1和StCSD2在块茎中的表达明显高于其他组织;块茎中StSODs均可被损伤诱导表达,StFSD1和StFSD2在损伤早期表达明显,StCSD3在损伤早期和晚期均上调表达,其他SOD成员均在损伤中期显著表达。DDC处理显著抑制损伤块茎的SOD活性、提高O2·-含量、抑制H2O2积累。本研究为深入开展StSOD基因家族在块茎损伤中的功能研究提供参考依据。

关键词：马铃薯超氧化物歧化酶(SOD)基因家族生物信息学表达分析

一氧化氮对苹果果实愈伤苯丙烷代谢的影响及生理机制分析

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西北植物学报 2022年第4期42卷 619-627页

作者：柴秀伟孔蕊李宝军朱亚同毕阳 dov Prusky 甘肃农业大学食品科学与工程学院兰州730070 Department of Postharvest Science of Fresh Produce Agricultural Research Organization Rishon LeZion 7505101 Israel

以“红星”苹果果实为试材,采用0.5 mmol/L的NO供体硝普钠(SNP)溶液浸泡人工损伤的苹果5 min,考察SNP处理后愈伤期间果实失重率和病情指数,分析伤口处苯丙烷代谢关键酶活性和产物含量,以及H_(2)O_(2)含量和过氧化物酶活性,并探讨其相关... 详细信息

以“红星”苹果果实为试材,采用0.5 mmol/L的NO供体硝普钠(SNP)溶液浸泡人工损伤的苹果5 min,考察SNP处理后愈伤期间果实失重率和病情指数,分析伤口处苯丙烷代谢关键酶活性和产物含量,以及H_(2)O_(2)含量和过氧化物酶活性,并探讨其相关生理机制,为苹果果实采后快速愈伤提供方法及理论依据。结果表明:(1)SNP处理显著降低了愈伤期间损伤苹果果实的失重率和扩展青霉(Penicillium expansum)损伤接种果实的病情指数,处理果实的失重率和病情指数于处理第5天时较对照分别显著降低40.2%和31.4%。(2)SNP处理显著提高了果实伤口处苯丙烷代谢关键酶苯丙氨酸解氨酶、肉桂酸-4-羟化酶和肉桂醇脱氢酶的活性,并提高了肉桂酸、咖啡酸、阿魏酸、芥子酸、总酚、类黄酮、p-香豆醇、松柏醇、芥子醇及木质素的含量水平;SNP处理显著提高了果实伤口处的H_(2)O_(2)含量以及POD活性。研究发现,NO可通过激活苹果果实伤口处苯丙烷代谢,提高H_(2)O_(2)含量以及POD活性来促进苹果果实的愈伤。

关键词：一氧化氮(NO) 苹果果实愈伤苯丙烷代谢

p-香豆酸通过加速伤口处聚酚软木脂和木质素的沉积促进马铃薯块茎愈伤

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中国农业科学 2021年第20期54卷 4434-4445页

作者：梁伟朱亚同柴秀伟孔蕊李斌山李永才毕阳 dov Prusky 甘肃农业大学食品科学与工程学院 Department o fPostharvest Science of Fresh Produce Agricultural Research Organization

【目的】研究p-香豆酸(p-Coumaric acid,p-CA)处理对马铃薯块茎伤口处聚酚软木脂和木质素积累的影响及相关机理。【方法】用0.5 mmol·L-1p-CA浸泡切半‘大西洋’马铃薯块茎10 min,以蒸馏水处理作为对照,于室温条件下避光贮存进行愈伤... 详细信息

【目的】研究p-香豆酸(p-Coumaric acid,p-CA)处理对马铃薯块茎伤口处聚酚软木脂和木质素积累的影响及相关机理。【方法】用0.5 mmol·L-1p-CA浸泡切半‘大西洋’马铃薯块茎10 min,以蒸馏水处理作为对照,于室温条件下避光贮存进行愈伤。测定损伤块茎在愈伤期间的失重率以及损伤接种硫色镰刀菌(Fusarium sulphureum)块茎的病情指数,观察伤口处聚酚软木脂和木质素的积累,测定伤口处苯丙烷代谢关键酶和过氧化物酶活性,以及苯丙烷代谢产物和H2O2含量。【结果】p-CA处理显著降低了损伤块茎的失重率和损伤接种块茎的病情指数,14 d时,处理块茎的失重率和病情指数分别比对照低38.46%和43.18%。p-CA处理加速了块茎伤口处聚酚软木脂和木质素的积累,14 d时,处理块茎的聚酚软木脂和木质素的细胞层厚度分别比对照高26.43%和30.26%。p-CA处理还明显提高了块茎伤口处苯丙氨酸解氨酶、肉桂酸-4-羟化酶、4-香豆酰辅酶A连接酶和肉桂醇脱氢酶的活性,7 d时,处理块茎的酶活性分别比对照高32.17%、23.51%、25.09%和23.08%。14 d时,p-CA处理块茎的肉桂酸、p-香豆酸、咖啡酸和总酚含量分别比对照高34.26、38.29%、19.31%和41.04%;21 d时,处理块茎的阿魏酸、芥子酸含量分别比对照高38.33%和20.47%。此外,p-CA处理促进了块茎伤口处肉桂醇、松柏醇、芥子醇和木质素的积累,14 d时,处理块茎的肉桂醇和木质素含量分别高于对照36.93%和31.66%;21 d时,处理块茎的松柏醇和芥子醇含量分别高于对照41.43%和34.05%。p-CA处理还提高了块茎伤口处H2O2含量和过氧化物酶活性,7 d时,处理块茎的H2O2含量和过氧化物酶活性分别高于对照40.25%和27.01%。【结论】p-CA处理可通过激活苯丙烷代谢,提高H2O2含量和过氧化物酶活性,促进马铃薯块茎伤口处聚酚软木脂和木质素的积累,从而加速块茎愈伤。

关键词： p-CA 马铃薯块茎愈伤苯丙烷代谢

不同浓度壳聚糖对炭黑曲霉和硫色镰刀菌生长和发育的影响

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微生物学通报 2023年第10期50卷 4448-4457页

作者：唐迎博宗元元张学梅张凤龚迪毕阳 dov Prusky 甘肃农业大学食品科学与工程学院甘肃兰州730070 Department of Postharvest Science of Fresh Produce Agricultural Research OrganizationRishon LeZion 7505101Israel

【背景】壳聚糖是广泛存在于甲壳动物的一种多糖,具有广谱的抗真菌活性,但壳聚糖是否影响炭黑曲霉(Aspergillus carbonarius)和硫色镰刀菌(Fusarium sulphureum)生长和发育尚未见报道。【目的】明确不同浓度壳聚糖对***和***生长和发育... 详细信息

【背景】壳聚糖是广泛存在于甲壳动物的一种多糖,具有广谱的抗真菌活性,但壳聚糖是否影响炭黑曲霉(Aspergillus carbonarius)和硫色镰刀菌(Fusarium sulphureum)生长和发育尚未见报道。【目的】明确不同浓度壳聚糖对***和***生长和发育的影响。【方法】通过在PDA培养基中添加不同浓度壳聚糖,测定两种真菌的菌落直径、生物量和菌丝干重,观察产孢量、孢子萌发和芽管长度,比较抑菌的差异。【结果】壳聚糖处理可显著改变两种真菌的菌落形态,处理浓度越高菌落皱缩和变形越明显;壳聚糖还可以有效抑制两种真菌的菌落生长、菌丝干重和菌丝生物量,抑制效果呈明显的浓度依赖,对***的抑制效果更好。壳聚糖可抑制两种真菌的产孢量、孢子萌发和芽管伸长,处理浓度越高抑制效果越好,对***的抑制效果更为明显。壳聚糖对***和***的EC_(50)值分别为0.12 mg/mL和0.075 mg/mL。【结论】壳聚糖可有效抑制***和***的生长发育,抑制效果呈浓度依赖,***对壳聚糖更为敏感。

关键词：壳聚糖炭黑曲霉硫色镰刀菌生长发育 EC_(50)值

扩展青霉erg4的生物信息学、亚细胞定位及表达分析

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生物技术通报 2021年第12期37卷 60-70页

作者：韩占红宗元元张学梅王斌 PRUSKY dov 毕阳甘肃农业大学食品科学与工程学院兰州730070 Department of Postharvest Science of Fresh Produce Agricultural Research OrganizationVolcani CenterBet Dagan 50250Israel

麦角甾醇是真菌细胞质膜的特有组分,在真菌生长发育中具有重要作用。erg4是参与麦角甾醇生物合成最后一步反应的基因,但扩展青霉中该基因的功能未知。本文通过Rt-PCR方法克隆了扩展青霉3个erg4(erg4A、erg4B和erg4C)基因的CDS全长,对基... 详细信息

麦角甾醇是真菌细胞质膜的特有组分,在真菌生长发育中具有重要作用。erg4是参与麦角甾醇生物合成最后一步反应的基因,但扩展青霉中该基因的功能未知。本文通过Rt-PCR方法克隆了扩展青霉3个erg4(erg4A、erg4B和erg4C)基因的CDS全长,对基因结构、编码蛋白的跨膜螺旋和亲疏水性进行了生物信息学分析,通过融合绿色荧光蛋白定位的方法进行了亚细胞定位,测定了3个基因在不同生长发育阶段、不同培养基状态以及黑暗和蓝光条件下的表达差异。扩展青霉erg4A、eerg4B和erg4C的CDS全长分别为1476 bp、1491 bp和1596 bp,分别编码491、496和531个氨基酸;编码蛋白均属于跨膜蛋白,且表现出疏水性。绿色荧光蛋白与内质网红色荧光探针染色共定位结果显示,Erg4A、Erg4B和Erg4C均定位于内质网。erg4A、erg4B和erg4C在孢子阶段、孢子萌发阶段及成熟菌丝阶段的表达水平存在显著差异,其中,erg4A在3个阶段的表达量无明显变化,而erg4B和erg4C的表达量均显著上调,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4A在CY液体和固体培养条件下的表达量无显著变化,erg4B和erg4C在CY液体培养条件下的表达量显著高于固体培养,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4A和erg4B在蓝光条件下的表达量显著高于黑暗条件,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4C对蓝光条件不敏感。扩展青霉Erg4A、Erg4B和Erg4C均定位于内质网,erg4A、erg4B和erg4C在不同生长发育阶段、固体和液体以及黑暗与蓝光培养条件下的表达存在较大差异,其中,以erg4B的响应最为活跃。

关键词：扩展青霉erg4 生物信息学分析亚细胞定位表达差异

A decoy receptor derived from alternative splicing fine-tunes cytokinin signaling in Arabidopsis

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Molecular Plant 2024年第12期17卷 1850-1865页

作者： Michaela Králová Ivona Kubalová jakub Hajný Karolina Kubiasová Karolína Vagaská Zengxiang Ge Michelle Gallei Hana Semerádová Anna Kuchařová Martin Hönig Aline Monzer Martin Kovačik jiříFriml Ondřej Novák Eva Benková Yoshihisa Ikeda David Zalabák Laboratory of Growth Regulators Faculty of Science of PalackýUniversity and Institute of Experimental Botany AS CRŠlechtitelů2778371 OlomoucCzech Republic Department of Molecular Biology Centre of the Region Hanáfor Biotechnological and Agricultural ResearchFaculty of SciencePalackýUniversityŠlechtitelů2778371 OlomoucCzech Republic Institute of Science and technology Austria(IStA) 3400 KlosterneuburgAustria Department of Chemical Biology Faculty of SciencePalackýUniversityŠlechtitelů2778371 OlomoucCzech Republic Institute of Experimental Botany of the Czech Academy of Sciences Centre of Plant Structural and Functional GenomicsŠlechtitelů3177900 OlomoucCzech Republic these authors contributed equally to this article.

Hormone perception and signaling pathways have a fundamental regulatory function in the physiological processes of ***,a class of plant hormones,regulate cell division and meristem *** cytokinin signaling pathway is well established in the model plant *** negative feedback mechanisms,tightly controlling cytokinin signaling output,have been described *** this study,we identified a new feedback mechanism executed through alternative splicing of the cytokinin receptor AHK4/CRE1.A novel splicing variant named CRE1int7 results from seventh intron retention,introducing a premature termination codon in the *** showed that CRE1int7 is translated in planta into a truncated receptor lacking the C-terminal receiver domain essential for signal ***1int7 can bind cytokinin but cannot activate the downstream *** present a novel negative feedback mechanism of the cytokinin signaling pathway,facilitated by a decoy receptor that can inactivate canonical cytokinin receptors via dimerization and compete with them for ligand *** proper plant growth and development requires precise control of the cytokinin signaling pathway at several ***1int7 represents a so-far unknown mechanism for fine-tuning the cytokinin signaling pathway in Arabidopsis.

关键词： splicing Arabidopsis decoy