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Model-based Comparative Prediction of Transcription-Factor Binding Motifs in Anabolic Responses in Bone

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2007年第3期5卷 158-165页

作者： Andy B. Chen kazunori hamamura Guohua Wang Weirong Xing Subburaman Mohan Hiroki Yokota Yunlong Liu Departments of Biomedical Engineering/Anatomy and Cell Biology Indiana University-Purdue University Indianapolis Indianapolis IN 45202 USA Division of Biostatistics Department of Medicine Center for Computational Biology and Bioinformatics Indiana University School of Medicine Indianapolis IN 46202 USA School of Computer Science and Technology Harbin Institute of Technology Harbin 150001 China Musculoskeletal Disease Center JP Pettis Memorial Veterans Administration Medical Center Loma Linda CA 92357 USA

Understanding the regulatory mechanism that controls the alteration of global gene expression patterns continues to be a challenging task in computational biology. We previously developed an ant algorithm, a biologically-inspired computational technique for microarray data, and predicted putative transcription-factor binding motifs （TFBMs） through mimicking interactive behaviors of natural ants. Here we extended the algorithm into a set of web-based software, Ant Modeler, and applied it to investigate the transcriptional mechanism underlying bone formation. Mechanical loading and administration of bone morphogenic proteins （BMPs） are two known treatments to strengthen bone. We addressed a question： Is there any TFBM that stimulates both ＂anabolic responses of mechanical loading＂ and ＂BMP-mediated osteogenic signaling＂？ Although there is no significant overlap among genes in the two responses, a comparative model-based analysis suggests that the two independent osteogenic processes employ common TFBMs, such as a stress responsive element and a motif for peroxisome proliferator-activated receptor （PPAR）. The post-modeling in vitro analysis using mouse osteoblast cells supported involvements of the predicted TFBMs such as PPAR, Ikaros 3, and LMO2 in response to mechanical loading. Taken together, the results would be useful to derive a set of testable hypotheses and examine the role of specific regulators in complex transcriptional control of bone formation.

关键词： microarray transcription-factor binding motif mechanical loading bone morphogenic protein ant algorithm

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新型排列组合高压缩多载波调制系统

通信学报 2007年第1期28卷 69-74页

作者：侯亚飞 hamamura Masanori 张世永复旦大学计算机与信息技术系上海200433 高知工科大学情报信息系

提出一种基于高压缩多载波调制(HC-MCM,high compaction multi-carrier modulation)技术和排列组合正交频分复用(PC-OFDM,parallel combinatory OFDM)技术的新型调制系统,即排列组合高压缩多载波调制(PC/HC-MCM)系统。同PC-OFDM系统相比,PC/HC-MCM能够大幅度提高系统的带宽效率。同时给出了2种PC/HC-MCM系统的仿真性能。PC/HC-MCM系统稍加改造可以应用于不同的多载波系统。

关键词：正交频分复用排列组合正交频分复用带宽效率高压缩多载波调制

ViVi Night in TOKYO 2019 Spring Party Report!

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美眉 2019年第7期 146-147页

作者： Tatsuyo hamamura Tohru Daimon Yurin Yamado

4月18日于新木场Studio Coast举行的ViVi Night的实况report!这次是在以多彩的冰激凌色为主题的舞台上拉开幕布的,众多豪华嘉宾的出场再加上上次就很有人气的粉丝见面会还有麻友子的毕业舞台等等,成为带来很多欢笑和泪水的丰富的舞台?

关键词： Spring ViVi Night in TOKYO 2019 Spring Party Report

Champagne bottle neck sign in a patient with Moyamoya syndrome

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World Journal of Clinical Cases 2014年第9期2卷 474-477页

作者： Takafumi Shimogawa Takato Morioka Tetsuro Sayama Takeshi hamamura Chiharu Yasuda Shuji Arakawa Department of Neurosurgery Kyushu Rosai Hospital Department of Cerebrovascular Disease Kyushu Rosai Hospital

The champagne bottle neck(CBN) sign refers to a reduction in the diameter of the proximal portion of the internal carotid artery that resembles a CBN, and is a characteristic feature of Moyamoya disease. A 43-yearold woman with an infarction of the posterior limb of the left internal capsule was diagnosed with Moyamoya syndrome associated with Graves' disease. The CBN sign was observed bilaterally. Cerebral revascularization surgery was performed, including left-sided superficial temporal artery to middle cerebral artery anastomosis. During four years of follow-up, she maintained a euthyroid state and did not have any further cerebral ischemic events. The CBN signs remained unchanged on both sides during this time. This is the first report of the CBN sign in a patient with Moyamoya syndrome associated with Graves' disease.

关键词： Champagne bottle neck sign Moyamoya disease Moyamoya syndrome Graves’disease Revascularization

Biliary acute pancreatitis:a review

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World Journal of Gastroenterology 2000年第2期6卷 157-168页

作者： Osvaldo M.Tiscomia Susana hamamura Enriqueta S.deLehmann Graciela Otero Hipolito Waisman Patricia Tiscornia-Wasserman Simmy Bank "Programade Estudios Pancreáticos" Hospital de ClínicasUniversidad de Bs.As.Argentina Centro de Investigaciones Pancreáticas"(CIP)Hospital de ClínicasUniv.de Buenos AiresArgentina Research Member of CONICETBuenos AiresArgentina "Programade Estudios Pancreáticos" Hospital de ClínicasUniversidad de Bs.As.Argentina "Centro de Investigaciones Pancreáticas"(CIP)Hospital de ClínicasUniv.de Buenos AiresArgentina "Programa de Estudios Pancreáticos" Hospital de ClínicasUniversidad de Bs.As.Argentina "Centro de Investigaciones Pancreáticas"(CIP)Hospital de ClínicasUniv.de Buenos AiresArgentina Chief of Cytology Department of PathologyLong Island Jewish Medical Center (LIJ) NYUSA Chief Department of Gastroenterology Long Island Jewish Medical Center (LIJ) NYUSA

INTRODUCTIONIt is axiomatic that the most effective and soundlybased plan of treatment of any disorder is one aimedat the mechanism or mechanisms responsible for *** basic notion,coupled withrecent reports in which,su... 详细信息

关键词： cholelithiasis/physiopathology pancreatitis/physiopathology bile reflux common bile duct sphincterotomy endoscopic

采用低热损失燃烧概念的高效率柴油机——丰田直列4缸2.8L ESTEC 1GD-FTV发动机

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汽车与新动力 2017年第2期49卷 9-18页

作者： T.Kogo Y.hamamura K.Nakatani 孙丹红

为了应对柴油机日益增长的需求,并力求在提高扭矩性能的同时实现节能,开发了1款新型高效率2.8L直列4缸柴油机。该发动机以1种创新的燃烧概念为基础,通过减少冷却损失,使发动机效率得到了提高。通过限制缸内气流及改善燃烧室隔热,减少了... 详细信息

为了应对柴油机日益增长的需求,并力求在提高扭矩性能的同时实现节能,开发了1款新型高效率2.8L直列4缸柴油机。该发动机以1种创新的燃烧概念为基础,通过减少冷却损失,使发动机效率得到了提高。通过限制缸内气流及改善燃烧室隔热,减少了冷却损失。为了避免限制气流对排放产生影响,开发了1种能够通过优化缸内燃油分布来提高缸内气体利用率的新燃烧室形状。采用了1种能够根据气体温度改变壁面温度的新型隔热涂层来提高燃烧室的隔热性能,因而减少了冷却损失,并避免了进气加热的协调作用。为了采用这种燃烧概念,并同时提高动力性能,必须着重调整进排气道的高流量特性。通过采用具有独立功能的进气道、优化进气门的直径和布置、以及提高进排气系统的总体效率实现了这种调整。由于优化气道形状需要更大的设计自由度,因此开发了1种具有较高密封性能的新型气缸盖衬垫,这种缸径为92mm的气缸盖衬垫仅采用4个缸盖螺栓。由于整台发动机都贯彻这种燃烧概念,并结合各种减小摩擦的技术,该发动机的CO2排放比原有机型的减少了约15%,最高热效率约达到44%。

关键词：进气道燃烧室螺旋切向柴油机

海水灌溉对Salicornia属两种盐生植物生长及离子吸收的影响

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华北农学报 2007年第S3期22卷 1-4页

作者：韩文军藤山英保滨村邦夫杨劼赵元杰中国农业科学院草原研究所内蒙古呼和浩特010010 日本鸟取大学内蒙古大学内蒙古呼和浩特010021 河北师范大学资源与环境科学学院河北石家庄050016

以 Salicornia 属的两个野生种为实验材料,在海水处理条件下对其地上部的生长状况及无机养分的吸收特性进行了分析。结果表明:随着海水处理浓度的增加,生物量表现出旺盛的生长趋势,100%海水处理区的生产量最高:两个野生种的地上部 Na ... 详细信息

以 Salicornia 属的两个野生种为实验材料,在海水处理条件下对其地上部的生长状况及无机养分的吸收特性进行了分析。结果表明:随着海水处理浓度的增加,生物量表现出旺盛的生长趋势,100%海水处理区的生产量最高:两个野生种的地上部 Na 的含量和海水处理浓度之间有明显的正相关。Na 在 Salicornia 属植物体内的积累阻碍 K 离子的吸收。淡水区 *** 的 Ca 积累高于各盐水处理区,随着海水处理浓度的增加 Ca 的积累呈缓慢下降趋势。*** 的 Ca 的积累呈相与 *** 相反的趋势。Mg 的积累和 Ca 的积累规律基本上相同。海水处理影响 Salicornia 属地上部氮和碳的积累过程。Salicornia 属的两个野生种 *** 和 *** 在海水处理下的生长及养分积累都表现出极高的趋同性。

关键词： S.bigelovii S.herbacea 盐生植物海水处理养分积累

海水灌溉条件下Salicornia bigelovii的种植密度对个体间养分积累及土壤盐分的影响

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草业科学 2008年第11期25卷 36-39页

作者：韩文军濱村邦夫杨劼中国农业科学院草原研究所内蒙古呼和浩特010010 日本鸟取大学干燥地研究中心内蒙古大学内蒙古呼和浩特010021

对海水灌溉下Salicornia bigelovii的不同种植密度及其个体间的养分积累及土壤盐分的影响进行了调查。结果表明:单位面积地上部的干质量随种植密度增加呈平缓增高,符合最终产量恒定法则;个体间竞争株质量随种植密度增加而降低;随***种... 详细信息

对海水灌溉下Salicornia bigelovii的不同种植密度及其个体间的养分积累及土壤盐分的影响进行了调查。结果表明:单位面积地上部的干质量随种植密度增加呈平缓增高,符合最终产量恒定法则;个体间竞争株质量随种植密度增加而降低;随***种植密度的上升,土壤的含盐量和电导率(EC)值明显降低,56株/m2处理区钠的吸收量达261.22g,在336株/m2处理区钠的吸收量高达489.99g;随种植密度的增加,个体间的无机盐含量略有下降,但没有显著差异,相反茎、叶中碳和氮含量呈上升趋势。

关键词：海水灌溉盐角草属种植密度无机盐电导率

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苜蓿沙土盆栽试验的水分生态适应性

草地学报 2007年第3期15卷 227-231页

作者：王龙昌谢小玉滨村邦夫西南大学农学与生物科技学院重庆北碚400715 鸟取大学干燥地研究中心

在温室进行沙土盆栽试验,研究WL-323、Siriver和固原苜蓿在不同土壤水分条件下的耗水特征、生理指标、生物学性状、产草量和水分利用效率的变化。结果表明:苜蓿在生育期的耗水特征因水分条件和品种而异;水分胁迫值(PMS)与土壤含水量呈... 详细信息

在温室进行沙土盆栽试验,研究WL-323、Siriver和固原苜蓿在不同土壤水分条件下的耗水特征、生理指标、生物学性状、产草量和水分利用效率的变化。结果表明:苜蓿在生育期的耗水特征因水分条件和品种而异;水分胁迫值(PMS)与土壤含水量呈显著负相关;供试苜蓿叶绿素含量与土壤含水量相关不显著;株高、分枝数、分枝总长、叶片数、根数、主根长、根颈粗和干根重等性状均随着土壤水分的增加呈上升趋势,而根冠比则呈下降趋势;WL-323的根系发达、植株发育良好,产草量和水分利用效率高,对沙土的适应性最优;Siriver的干根重和根冠比高,抗旱性能较好,产草量和水分利用效率居中;固原苜蓿对沙土的生态适应性最差;研究结果对沙化土地区苜蓿品种的合理布局与水分调控具有科学指导价值。

关键词：紫花苜蓿品种水分生态适应性沙土