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Brain Transcriptome Analysis Reveals Metabolic Changes Adapting to Hyperhaline or Hypohaline Environments in Spotted Scat(Scatophagus argus)

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Journal of Ocean University of China 2024年第3期23卷 755-765页

作者： LIN Ting ZHAI Yi TIAN Changxu jiang dongneng SHI Hongjuan jiang Mouyan LI Guangli DENG Siping Fisheries College Guangdong Ocean UniversityZhanjiang 524088China Guangdong Research Center on Reproductive Control and Breeding Technology of Indigenous Valuable Fish Species Zhanjiang 524088China Guangdong Provincial Key Laboratory of Pathogenic Biology and Epidemiology for Aquatic Economic Animals Zhanjiang 524088China

The fish brain is crucial for adjusting to environmental *** changes play a vital role in the adaptation to salinity change in aquatic ***,few studies have evaluated the responses of the fish brain to salinity *** evaluate the response to various salinities,spotted scat(Scatophagus argus)was cultured in water with salinity levels of 5(low salinity:LS),25(control group:Ctrl),and 35(high salinity group:HS)for 22 *** brain transcriptome was *** total,1698 differentially expressed genes(DEGs)were identified between the HS and Ctrl groups,and 841 DEGs were identified between the LS and Ctrl *** analysis showed that the DEGs in the HS *** comparison were involved in steroid biosynthesis,terpenoid backbone biosynthesis,fatty acid biosynthesis,ascorbate and aldarate metabolism,other types of O-glycan biosynthesis,and fatty acid *** and dicarboxylate metabolism,one carbon pool by folate,steroid biosynthesis,and cysteine and methionine metabolism were significantly enriched in the LS *** ***,the genes related to metabolism(acc,fas,hmgcr,hmgcs1,mvd,soat1,nsdhl,sqle,cel,fdft1,dnmt3a and mtr)were significantly up-regulated in the HS *** *** genes related to metabolism(lipa,sqle,acc,fas,bhmt,mpst,dnmt3a,mtr,hao2,LOC111225351 and hmgcs1)were significantly up-regulated,while hmgcr and soat1 were significantly down-regulated in the LS *** *** results suggest that salinity stress affects signaling pathways and genes’expressions involved in metabolic processes in the brain,and the differences in metabolism play an important role in adaptation to hyperhaline or hypohaline environments in spotted *** research provides a comprehensive overview of transcriptional changes in the brain under hyperhaline or hypohaline conditions,which is helpful to understand the mechanisms underlying salinity adaptation in euryhaline fishes.

关键词： Scatophagus argus brain salinity transcriptome analysis

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DNA甲基化修饰对金钱鱼卵巢Cyp17a1表达水平的影响

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广东海洋大学学报 2024年第2期44卷 46-53页

作者：周一帆江政霆李雨焦开智潘书慧许芮李广丽江东能广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心广东湛江524088

【目的】分析DNA甲基化修饰对金钱鱼(Scatophagus argus)卵巢Cyp17a1表达的影响,进一步认识卵巢发育成熟相关基因表达的调控机制。【方法】分别取卵巢发育III、IV期的金钱鱼,以及投喂添加0(对照)、50、100μg/g雌二醇饲料30 d的2龄雌鱼,... 详细信息

【目的】分析DNA甲基化修饰对金钱鱼(Scatophagus argus)卵巢Cyp17a1表达的影响,进一步认识卵巢发育成熟相关基因表达的调控机制。【方法】分别取卵巢发育III、IV期的金钱鱼,以及投喂添加0(对照)、50、100μg/g雌二醇饲料30 d的2龄雌鱼,用MethPrimer软件分析其Cyp17a1基因CpG二核苷酸位点分布特征,并预测CpG岛;采用亚硫酸氢盐测序法检测不同发育时期卵巢以及投喂雌二醇个体卵巢中的Cyp17a1的DNA甲基化修饰水平,并用实时荧光定量PCR分析Cyp17a1基因表达水平。【结果】金钱鱼Cyp17a1翻译起始位点2000 bp后无CpG岛,取第1外显子含有5个CpG位点(翻译起始位点后106、116、129、148和203 bp处)的区域用于DNA甲基化水平检测。金钱鱼III期卵巢Cyp17a1外显子1的DNA甲基化修饰水平显著高于IV期卵巢(P0.05)。投喂雌二醇后,金钱鱼卵巢Cyp17a1 mRNA表达水平和第1外显子CpG富集区域整体DNA甲基化修饰水平无显著变化(P>0.05),但雌激素处理雌鱼翻译起始位点后148、203 bp处甲基化水平明显上升(P<0.05)。【结论】金钱鱼卵巢Cyp17a1第一个外显子CpG富集区的整体甲基化水平与基因表达呈负相关,饲料E2可上调Cyp17a1第一个外显子148、205 bp处甲基化水平,表明甲基化修饰参与金钱鱼Cyp17a1的表达调控。

关键词：金钱鱼 Cyp17a1 基因表达亚硫酸氢盐测序法 DNA甲基化

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Isolation of Growth Hormone-Releasing Hormone and Its Receptor Genes from Scatophagus argus and Their Expression Analyses

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Journal of Ocean University of China 2019年第6期18卷 1486-1496页

作者： jiang dongneng SHI Hongjuan LIU Qianqing WANG Tuo HUANG Yuanqing HUANG Yang DENG Siping CHEN Huapu TIAN Changxu ZHU Chunhua LI Guangli Guangdong Research Center on Reproductive Control and Breeding Technology of Indigenous Valuable Fish Species Key Laboratory of Marine Ecology and Aquaculture Environment of ZhanjiangKey Laboratory of Aquaculture in South China Sea for Aquatic Economic Animal of Guangdong Higher Education InstitutesFisheries College Guangdong Ocean University

The teleost Scatophagus argus is a species whose females grows faster than *** hormone(gh)mRNA abundance in females pituitary is higher than that in males;however the mechanism underlining such differential is still *** hormone(GH)is tightly associated with GH-releasing hormone(Ghrh)in *** this study,Ghrh gene(ghrh)and its receptor gene,ghrhr,were isolated from *** expression analysis showed that ghrh and ghrhr were mainly expressed in hypothalamus while ghrhr was expressed in pituitary and gh was predominantly expressed in *** cultured *** individuals were used to compare ghrh,ghrhr and gh mRNA abundances,120 g and 181 g average weight for male(n=11)and female(n=9),***-time PCR indicated that the ghrh and ghrhr mRNA abundances in male hypothalamus were significantly higher than those in female hypothalamus while that of gh mRNA abundance was significantly higher in female pituitary than in male *** ghrh and ghrhr mRNA abundances were significantly up-regulated in female hypothalamus 3 h after injection of 0.1 mg kg^-1 body weight Ghrh while pituitary ghrhr and gh mRNA abundances were not *** female hypothalamus,ghrh and ghrhr m RNA abundances were not affected at 6 h post-injection of 4 mg kg^-1 body weight 17α-methyltes-tosterone(17α-MT)or 17β-Estradiol(E2).In female pituitary,ghrhr m RNA abundance was down-regulated by 17α-MT while that of gh m RNA abundance was up-regulated by *** findings indicated that E2,rather than Ghrh,plays an important role in up-regulating the expression of gh in female ***,which should aid to understand the sexual dimorphism of teleost growth.

关键词： Scatophagus argus growth hormone-releasing hormone growth hormone-releasing hormone receptor growth hormone estrogen sexual dimorphism

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1种快速鉴定金钱鱼遗传性别的方法

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中国水产科学 2022年第4期29卷 515-524页

作者：黄洋黄远青邓秋敏 MUSTAPHA Umar Farouk 彭友幸李广丽江东能广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心

金钱鱼(Scatophagus argus)是我国东南沿海名优养殖鱼类,具有XY性别决定系统, Dmrt1是其性别决定候选基因。金钱鱼生长具有性别二态性,雌鱼生长快于雄鱼。目前缺乏快速鉴定金钱鱼遗传性别的分子标记,阻碍了其性别控制育种技术的建立。... 详细信息

金钱鱼(Scatophagus argus)是我国东南沿海名优养殖鱼类,具有XY性别决定系统, Dmrt1是其性别决定候选基因。金钱鱼生长具有性别二态性,雌鱼生长快于雄鱼。目前缺乏快速鉴定金钱鱼遗传性别的分子标记,阻碍了其性别控制育种技术的建立。本研究以公布的金钱鱼基因组数据,在Dmrt1附近设计多对标记引物,并通过PCR扩增验证标记的性别特异性。其中,标记引物Dmrt1-Marker-4-F/R在雌鱼中仅扩增出一条593bpX染色体条带,而在雄鱼中能扩增出593 bp和693 bp两条条带,分别来自X和Y染色体,表明该标记为共显性标记。利用该标记检测我国南海沿岸3个不同地理群体213尾金钱鱼的遗传性别与表型性别完全一致。此外,快速DNA提取试剂盒提取的片段较短DNA样品也可用于该对标记引物准确鉴定遗传性别。本研究建立了一种快速、准确、经济可靠的金钱鱼遗传性别鉴定方法,将旨为促进金钱鱼性别控制育种技术的建立,并为金钱鱼性别决定与分化机制研究提供依据。

关键词：金钱鱼性别鉴定分子标记二代测序

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来曲唑对豹纹鳃棘鲈提前性反转的诱导效果

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广东海洋大学学报 2023年第5期43卷 19-25页

作者：赵灿蒋谋炎江东能张俊鹏侯贤坤朱春华广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心广东湛江524088

【目的】探究来曲唑诱导豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)发生性反转的效果及性反转后性别相关基因的表达变化。【方法】取性腺已分化为II期卵巢的1龄豹纹鳃棘鲈,投喂含200 mg/kg来曲唑的饲料,分别在处理后45、90及120 d通过石蜡切片... 详细信息

【目的】探究来曲唑诱导豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)发生性反转的效果及性反转后性别相关基因的表达变化。【方法】取性腺已分化为II期卵巢的1龄豹纹鳃棘鲈,投喂含200 mg/kg来曲唑的饲料,分别在处理后45、90及120 d通过石蜡切片、HE染色检查性腺发育情况,统计生长指标及性反转比例,采用ELISA及实时定量PCR方法检测来曲唑处理120 d后对照组及处理组血清中11-酮基睾酮(11-Ketotestosterone,11-KT)含量和性腺中性别相关基因的相对表达量。【结果】来曲唑处理45 d时体长显著增长,处理90 d时体质量显著增长。90 d后的样本开始出现含少量精子细胞的间性性腺(55.56%),120 d时33.33%的实验鱼性腺发生性反转,出现大量精母细胞、精子细胞及精子及少量退化的卵母细胞。与对照组相比,处理后120 d性反转个体中血清中11-KT的浓度显著上升,性腺中dmrt1、cyp11b2及gsdf的表达显著高于对照组,cyp19a1a和foxl2的表达显著低于对照组。【结论】来曲唑可通过降低体内雌激素水平诱导性腺已分化为II期卵巢的豹纹鳃棘鲈性腺提前性反转为精巢。

关键词：豹纹鳃棘鲈性反转人工诱导来曲唑芳香化酶抑制剂

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The study of anti-LPS material basis and biological activity within Allium Sativum L.

The study of anti-LPS material basis and biological activity...

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第十五届国际药理学大会

作者： Wu Chong jiang dongneng Zheng jiang . Medical Reseach Center Southwest Hospital Third Military Medical University Chongqing 400038 China

＜正＞ Objective: We screened the active components extreated from Allium Sativum L., and studied their biological activities against ***:（1） The active fractions were isolated by biosensor technique. （2） Observing the inhibition of TNF -α and IL - 6 release in RAW264.7 cells induced by LPS.（3） Observing the protection of the fraction for mice from lethal challenge of LPS.（4） Isolating the active monomes from ASLA. studing their LPS - neutralizing effect. Results : （1） The active fraction with the best affinity was separated and benamed of AlliumSativum L. fraction A （ASLA）.（2） ASLA could markedly inhibite TNF-αand IL-6 release in RAW264.7 cells induced by LPS;It also protected mice from lethal challenge of LPS. （3） There were two main components in ASLA. Both of them had significant biological activities against sepsis. Conclusions: （1） The ASLA had significant activity aganst sepsis.（2） The main components of ASLA were two monomers. And theyhad significant activities against sepsis.

关键词： Allium sativum L. biosensor Lipopolysaccharide Lipid A sepsis

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慢性盐度胁迫下金钱鱼卵巢转录组分析

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中国水产科学 2023年第3期30卷 324-333页

作者：潘巧怡翟毅蔡博生江东能石红娟黄洋李广丽邓思平广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心

为了阐明盐度胁迫对金钱鱼(Scatophagus argus)代谢和生殖的影响,采用RNA-seq技术对低盐组(5)、对照组(25)和高盐组(35)处理40 d后的2龄性成熟金钱鱼卵巢进行转录组分析。结果发现,金钱鱼卵巢转录组测序获得raw reads共398681318,clean ... 详细信息

为了阐明盐度胁迫对金钱鱼(Scatophagus argus)代谢和生殖的影响,采用RNA-seq技术对低盐组(5)、对照组(25)和高盐组(35)处理40 d后的2龄性成熟金钱鱼卵巢进行转录组分析。结果发现,金钱鱼卵巢转录组测序获得raw reads共398681318,clean reads共396910398。从低盐胁迫相对对照组(5 vs 25)和高盐胁迫相对对照组(35 vs 25)中分别筛选到373个和874个差异表达基因(DEGs)。与对照组相比,低盐胁迫后氨基酸代谢相关基因(sds、bhmt)和脂肪酸代谢相关基因(pnpla2)显著下调;高盐胁迫后pgr、cyp17a1和ers1等生殖相关基因显著下调。KEGG通路富集分析发现,低盐胁迫组相对对照组显著富集与代谢相关的通路为半胱氨酸和甲硫氨酸代谢,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成代谢,脂肪酸生物合成,脂肪酸代谢,皮质醇的合成和分泌,醛固酮的合成和分泌,脂肪细胞脂解的调节等;高盐胁迫组相对对照组中显著富集的与生殖相关的通路为雌激素信号传导通路。这些结果表明,氨基酸和脂肪酸的代谢调控可能在金钱鱼卵巢的低渗透压调节中起重要作用,高盐胁迫可能抑制了金钱鱼卵巢中性类固醇激素的合成和延迟卵巢成熟发育时间。

关键词：金钱鱼慢性盐度胁迫转录组测序差异表达基因

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Sequencing, de novo assembly and characterization of the spotted scat Scatophagus argus(Linnaeus 1766) transcriptome for discovery of reproduction related genes and SSRs

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Journal of Oceanology and Limnology 2018年第4期36卷 1329-1341页

作者：杨尉陈华谱崔雪凡张克伟江东能邓思平朱春华李广丽 Zhanjiang City Key Laboratory of Marine Ecology and Environment Fisheries College Guangdong Ocean University Food and Environmental Engineering Department Yangjiang Vocational and Technical College Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology

Spotted scat( Scatophagus argus) is an economically important farmed fish, particularly in East and Southeast Asia. Because there has been little research on reproductive development and regulation in this species, the lack of a mature artificial reproduction technology remains a barrier for the sustainable development of the aquaculture industry. More genetic and genomic background knowledge is urgently needed for an in-depth understanding of the molecular mechanism of reproductive process and identification of functional genes related to sexual differentiation, gonad maturation and gametogenesis. For these reasons, we performed transcriptomic analysis on spotted scat using a multiple tissue sample mixing strategy. The Illumina RNA sequencing generated 118 510 486 raw reads. After trimming, de novo assembly was performed and yielded 99 888 unigenes with an average length of 905.75 bp. A total of 45 015 unigenes were successfully annotated to the Nr, Swiss-Prot, KOG and KEGG databases. Additionally, 23 783 and 27 183 annotated unigenes were assigned to 56 Gene Ontology(GO) functional groups and 228 KEGG pathways, respectively. Subsequently, 2 474 transcripts associated with reproduction were selected using GO term and KEGG pathway assignments, and a number of reproduction-related genes involved in sex differentiation, gonad development and gametogenesis were identified. Furthermore, 22 279 simple sequence repeat(SSR) loci were discovered and characterized. The comprehensive transcript dataset described here greatly increases the genetic information available for spotted scat and contributes valuable sequence resources for functional gene mining and analysis. Candidate transcripts involved in reproduction would make good starting points for future studies on reproductive mechanisms, and the putative sex differentiation-related genes will be helpful for sex-determining gene identification and sex-specific marker isolation. Lastly, the SSRs can serve as marker resource

关键词：斑点鱼海洋生物生物学理论研究

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金钱鱼毒腺基因NeoVTX的基因序列和表达

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海南热带海洋学院学报 2023年第5期30卷 8-14页

作者：曾珍卢嘉仪江东能李广丽樊森黄远青施钢广东海洋大学水产学院广东湛江524088

为了解金钱鱼毒液成分,从其基因组中分离了NeoVTX⁃α和NeoVTX⁃β基因序列,进行生物信息学分析,并研究它们在毒腺及其他组织的表达特征。结果表明,金钱鱼NeoVTX⁃α和NeoVTX⁃β的开放阅读框ORF全长分别为1581 bp和2106 bp,分别编码526和70... 详细信息

为了解金钱鱼毒液成分,从其基因组中分离了NeoVTX⁃α和NeoVTX⁃β基因序列,进行生物信息学分析,并研究它们在毒腺及其他组织的表达特征。结果表明,金钱鱼NeoVTX⁃α和NeoVTX⁃β的开放阅读框ORF全长分别为1581 bp和2106 bp,分别编码526和701个氨基酸。同源性和系统进化分析发现,金钱鱼NeoVTX⁃α与鲉形目的荫平鲉、尖头拟鲉、玫瑰毒鲉、粗毒鲉等鱼类同属一支且同源性较高(67.3%~73.5%)。金钱鱼NeoVTX(α和β亚基)三维结构与粗毒鲉的SNTX(α和β亚基)毒素的三维结构比较相似。qPCR和转录组数据表明,金钱鱼NeoVTX⁃α和NeoVTX⁃β在毒腺组织中高表达,其他组织低表达或不表达。研究表明,NeoVTX可能是金钱鱼中一种与鲉形目毒素相类似的毒素。

关键词：金钱鱼毒腺 NeoVTX 组织表达

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金钱鱼孕激素受体基因的克隆、鉴定与表达研究

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水产科学 2022年第1期41卷 23-34页

作者：石红娟黄健旋朱晨阳吴佳钢何飞祥江东能黄洋朱春华李广丽广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室广东湛江524088 广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心广东湛江524088 湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室广东湛江524088

核受体(Pgr),隶属于核受体超家族,由核受体亚家族3C组成员3基因编码。孕酮通过结合Pgr介导其在脊椎动物繁殖过程中的生理学功能,因此,研究金钱鱼核受体基因(pgr基因)在不同组织及不同发育时期性腺中的表达模式,有助于为金钱鱼的繁殖提... 详细信息

核受体(Pgr),隶属于核受体超家族,由核受体亚家族3C组成员3基因编码。孕酮通过结合Pgr介导其在脊椎动物繁殖过程中的生理学功能,因此,研究金钱鱼核受体基因(pgr基因)在不同组织及不同发育时期性腺中的表达模式,有助于为金钱鱼的繁殖提供理论依据。笔者克隆金钱鱼的pgr基因,用Megalign软件比较Pgr氨基酸同源性,用MEGA 7.0.4软件构建系统进化树,利用反转录PCR和实时荧光定量PCR分别探究pgr mRNA在金钱鱼各组织和性腺发育过程中的表达。金钱鱼pgr基因的开放阅读框(ORF)的长度为2016 bp,共编码671个氨基酸。氨基酸序列相似性分析发现,它与同属一个分支的鲈形目大黄鱼同源性最高。组织分布结果显示,pgr基因在雌、雄金钱鱼各组织中均有表达,且性腺、垂体中的表达最高。在垂体中,外源雌激素17β-雌二醇(E2)能显著升高pgr基因的表达。此外,随着性腺的发育,pgr基因在性成熟金钱鱼精巢、卵巢中的表达量最高。因此,Pgr对金钱鱼的生殖细胞发育成熟可能十分重要。

关键词：金钱鱼孕酮核受体基因表达模式性腺发育

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