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Different developmental potential of pluripotent stem cells generated by different reprogramming strategies

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分子细胞生物学报:英文版 2011年第3期3卷 197-199页

作者： Jing Jiang Guohui Ding Jiangwei Lin Man Zhang Linyu Shi Wenjian Lv Hui Yang huasheng xiao Gang Pei Yixue Li Jiarui Wu Jinsong Li Laboratory of Molecular Cell Biology Institute of Biochemistry and Cell BiologyShanghai Institutes for Biological SciencesChinese Academy of SciencesShanghai 200031China Key Laboratory of Systems Biology Shanghai Institutes for Biological SciencesChinese Academy of SciencesShanghai 200031China National Engineering Center for Biochip at Shanghai Zhangjiang Hi-Tech ParkShanghai 201203China Shanghai Key Laboratory of Signaling and Disease Research School of Life Sciences and TechnologyTongji UniversityShanghai 200092China State Key Laboratory of Molecular Biology Institute of Biochemistry and Cell BiologyShanghai Institutes for Biological SciencesChinese Academy of SciencesShanghai 200031China

Dear Editor,Recent studies show that induced pluripotent stem cells(iPSCs)generated through ectopic expression of transcription factors retain an epigenetic memory of their original somatic cells(Kim et al.,2010;Polo et al.,2010)or aberrant silencing of a single imprinted gene cluster(Liu et al.,2010;Stadtfeld et al.,2010),which affects their developmental and differentiation potentials.

关键词： programming potential

Differential expression analysis and regulatory network reconstruction for genes associated with muscle growth and adipose deposition in obese and lean pigs

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Progress in Natural Science:Materials International 2008年第4期18卷 387-399页

作者： Mingzhou Li a, Xuewei Li a, Li Zhu a, xiaokun Tengb, huasheng xiao b, Surong Shuaia, Lei Chen a, Qiang Li a, Yujiao Guo a a Laboratory of Pork Quality, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, China b National Engineering Center for Biochip at Shanghai, Shanghai 201203, China Laboratory of Pork Quality College of Animal Science and Technology Sichuan Agricultural University Ya’an 625014 China National Engineering Center for Biochip at Shanghai Shanghai 201203 China

During the growth and development of skeletal muscle cells and adipose cells, the regulatory mechanism of micro-effect polygenes determines porcine meat quality, carcass characteristics and other relative quantitative traits. Obese and lean type pig breeds show obvi- ous differences in muscle growth and adipose deposition; however, the molecular mechanism underlying this phenotypic variation remains unknown. We used pathway-focused oligo microarray studies to examine the expression changes of 140 genes associated with muscle growth and adipose deposition in longissimus dorsi muscle at six growth stages (birth, 1, 2, 3, 4 and 5 months) of Landrace (a leaner, Western breed) and Taihu pigs (a fatty, indigenous, Chinese breed). Variance analysis (ANOVA) revealed that differences in the expression of 18 genes in Landrace pigs and three genes in Taihu pigs were very significant (FDR-adjusted permutation, P < 0.01) and di?erences for 22 genes in Landrace pigs and seven genes in Taihu pigs were significant (FDR-adjusted permutation, P < 0.05) among six growth stages. Clustering analysis revealed a high level of signi?cance (FDR-adjusted, P < 0.01) for four gene expression patterns, in which genes that strongly up-regulated were mainly associated with the positive regulation of myofiber formation and fatty acid biogenesis and genes that strongly down-regulated were mainly associated with the inhibition of cell proliferation and positive regulation of fatty acid b-oxidation. Based on a dynamic Bayesian network (DBN) model, gene regulatory networks (GRNs) were reconstructed from time-series data for each pig breed. These two GRNs initially revealed the distinct differences in physiological and biochemical aspects of muscle growth and adipose deposition between the two pig breeds; from these results, some potential key genes could be identified. Quantitative real-time RT-PCR (QRT-PCR) was used to verify the microarray data for five modulated genes, and a good correlation betwee

关键词： Pig Muscle growth Adipose deposition Pathway-focused microarray Differential gene expression Gene regulatory network (GRN)

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宁德市沿海冬季水鸟资源调查与分析

防护林科技 2020年第10期33卷 46-49页

作者：肖华生宁德市林业局福建宁德352000

2016年、2018年和2020年,通过采用定点观察法对宁德市沿海的4个主要河口港湾湿地的越冬水鸟资源进行了调查,结果表明:3次共记录到水鸟37种,隶属7目10科20属,其中国家二级重点保护野生动物2种,分别为岩鹭(Egretta sacra)和黑脸琵鹭(Plata... 详细信息

2016年、2018年和2020年,通过采用定点观察法对宁德市沿海的4个主要河口港湾湿地的越冬水鸟资源进行了调查,结果表明:3次共记录到水鸟37种,隶属7目10科20属,其中国家二级重点保护野生动物2种,分别为岩鹭(Egretta sacra)和黑脸琵鹭(Platalea minor);福建省重点保护野生动物10种。在37种越冬水鸟中优势种为普通鸬鹚(Phalacrocorax carbo)、白鹭(Egretta garzetta)、黑腹滨鹬(Calidris alpina)、白骨顶(Fulica atra)、绿翅鸭(Anas crecca)、斑嘴鸭(Anas poecilorhyncha)和赤颈鸭(Anas penelope)。按居留型划分冬候鸟29种、留鸟8种。2020年1月水鸟群落的Shannon-Wiener多样性指数(H'=3.318)和Margalef丰富度指数(R=5.910)都相对最大;2016年1月水鸟群落的Pielou均匀性指数(J′=0.689)相对最大;2016年1月与2018年1月的水鸟群落相似性指数最高。

关键词：冬季水鸟湿地宁德

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福建省鸟类新记录——丹顶鹤

林业勘察设计 2024年第2期44卷 86-86页

作者：陈建全潘标志肖华生朱梦佳陈林煊福建省林业调查规划院福建福州350003 宁德市林业局福建宁德352000

福建省宁德市霞浦县牙城湾首次发现国家一级保护野生动物丹顶鹤。

关键词：福建省丹顶鹤新记录生境分布

Genome-wide Analysis of Smad Targets Reveals the Role of BMP Signaling in Embryonic Stem Cell Fate Determination

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生物物理学报 2009年第S1期25卷 28-28页

作者： Teng Fei Kai Xia Zhang Chen Hua Chen Zhongwei Li Jianping Zhang Bing Zhou huasheng xiao Jing-Dong JHan Ye-Guang Chen The State Key Laboratory of Biomembrane and Membrane Biotechnology Department of Biological Sciences and BiotechnologyTsinghua UniversityBeijing 100084China CAS Key Laboratory of Molecular Developmental Biology and Center for Molecular Systems Biology Institute of Genetics and Developmental Biologythe Chinese Academy of SciencesBeijing 100101China National Engineering Center for Biochip at Shanghai Zhangjiang Hi-Tech ParkShanghai201203China

Embryonic stem (ES) cells are under precise control of both intrinsic self-renewal gene regulatory network and extrinsic growth factor-triggered signaling cascades.

关键词： Genome-wide Analysis of Smad Targets Reveals the Role of BMP Signaling in Embryonic Stem Cell Fate Determination BMP

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糖尿病大血管病变小鼠模型研究进展

中国实验动物学报 2023年第9期31卷 1194-1205页

作者：杨燕陈正涛肖华胜高泓谢春光成都中医药大学附属医院成都610075 上海伯豪生物技术有限公司成都610075 代谢性疾病中医药调控四川省重点实验室上海201203

动物模型广泛应用于研究疾病的发病机制及药物干预的安全性、疗效、作用机制等研究。选择和制备符合疾病发病规律的动物模型是开展实验研究的基础和前提。糖尿病大血管病变的特征为广泛且进展迅速的血管壁动脉粥样硬化,小鼠是动脉粥样... 详细信息

动物模型广泛应用于研究疾病的发病机制及药物干预的安全性、疗效、作用机制等研究。选择和制备符合疾病发病规律的动物模型是开展实验研究的基础和前提。糖尿病大血管病变的特征为广泛且进展迅速的血管壁动脉粥样硬化,小鼠是动脉粥样硬化实验研究中运用最广泛的动物。本文基于最新研究结果根据1型和2型糖尿病的特征、糖尿病动脉粥样硬化斑块发展规律以及相关评估技术对糖尿病动脉粥样硬化小鼠模型进行系统性综述。

关键词：糖尿病大血管病变动脉粥样硬化小鼠模型

Mature insulin production by engineered non-β cells

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Chinese Medical Journal 2002年第4期115卷 532-535页

作者：沈坤堂秦新裕肖华胜张新许相儒韩泽广复旦大学附属中山医院普外科上海200032 国家人类基因组南方中心上海201203

目的研究在非β细胞中表达成熟胰岛素,探索替代胰岛素注射或胰岛移植治疗1型糖尿病的方法 .方法采用重叠区扩增基因拼接法(gene splicing by overlap extention, gene SOEing)自胰岛素原基因组基因中扩增胰岛素原的cDNA,并于C肽的两端... 详细信息

目的研究在非β细胞中表达成熟胰岛素,探索替代胰岛素注射或胰岛移植治疗1型糖尿病的方法 .方法采用重叠区扩增基因拼接法(gene splicing by overlap extention, gene SOEing)自胰岛素原基因组基因中扩增胰岛素原的cDNA,并于C肽的两端引入蛋白酶furin的识别和切割位点Arg-Xaa-Lys/Arg-Arg.将获得的突变体重组表达载体PcDNA3.1/C,通过脂质体法转染体外培养的Hela,293,和L02细胞,G418筛选L02细胞.同时用放射免疫和免疫荧光的方法监测细胞内外胰岛素的表达水平.结果成功地对胰岛素原cDNA的三个位点进行了突变,空载体转染的细胞无胰岛素表达.而在转染突变后胰岛素原基因cDNA的细胞培养液中胰岛素的表达量各不相同:Hela 和293细胞的暂态表达量分别为8.45～188.00?μIU/2.0×106 cells*d-1和159.88～242.14 ?μIU/2.0×106 cells*d-1, 筛选出的L02各细胞株的表达量为2.56～61. 95?μIU/2.0×106 cells*d-1;免疫荧光显示L02细胞浆内有囊泡状分泌颗粒 .结论突变的胰岛素原cDNA能成功转染非胰岛β细胞并表达胰岛素,为进一步开展糖尿病的基因治疗研究奠定了基础.

关键词：基因工程 β细胞人胰岛素原基因 1型糖尿病基因治疗胰岛

真核生物mRNA选择性剪接体检测方法研究进展

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生命科学仪器 2008年第3期6卷 8-11页

作者：张晓娜肖华胜上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家研究中心

选择性剪接是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA异构体的过程。它是一种在转录后RNA水平调控基因表达的重要机制,也是蛋白质组多样性的重要机制。选择性剪接的鉴定对不同的mRNA异构体的研究... 详细信息

选择性剪接是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA异构体的过程。它是一种在转录后RNA水平调控基因表达的重要机制,也是蛋白质组多样性的重要机制。选择性剪接的鉴定对不同的mRNA异构体的研究具有重要作用。本文简要综述了检测选择性剪接的主要方法:RT-PCR,生物信息学方,以及生物芯片的进展。

关键词：选择性剪接外显子芯片

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异养微生物还原氧化铁的研究

微生物学通报 1997年第3期24卷 156-158页

作者：王银善曹志方肖华胜罗鸿禧中科院武汉病毒研究所武汉430071 中科院武汉岩土力学所武汉430071

所试的民养微生物能在静止状态含蔗糖和氧化铁的培养液中生长。它们在氧化蔗糖到CO2时，伴随着Fe3+还原到Fe2+、Fe2+移动到基质表面与O2接触后，又会氧化为Fe3+培养液Fe3+被还原的适宜pH和温度分别为7.0、25℃。若培养液中加入0．1％硝... 详细信息

所试的民养微生物能在静止状态含蔗糖和氧化铁的培养液中生长。它们在氧化蔗糖到CO2时，伴随着Fe3+还原到Fe2+、Fe2+移动到基质表面与O2接触后，又会氧化为Fe3+培养液Fe3+被还原的适宜pH和温度分别为7.0、25℃。若培养液中加入0．1％硝酸盐时，还原Fe3+的过程会停滞或减慢。

关键词：异养微生物氧化铁还原