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Smart Breeding Platform:A web-based tool for high-throughput population genetics,phenomics,and genomic selection

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Molecular Plant 2024年第5期17卷 677-681页

作者： Huihui Li Xin Li Peng Zhang Yingwei Feng Junri Mi Shang Gao Lele Sheng Mohsin Ali zikun Yang liang Li Wei Fang Wensheng Wang Qian Qian Fei Gu Wenbin Zhou State Key Laboratory of Crop Gene Resources and Breeding Institute of Crop SciencesChinese Academy of Agricultural Sciences(CAAS)Beijing 100081China Nanfan Research Institute CAASSanyaHainan 572024China DAMO Academy Alibaba GroupHangzhou 310023China Hupan Lab Hangzhou 310023China Yazhouwan National Laboratory No.8 Huanjin RoadYazhou DistrictSanya CityHainan Province 572024China State Key Laboratory of Rice Biology China National Rice Research InstituteHangzhouZhejiang 310006China

Dear Editor,In the era of big data and artificial intelligence,"smart breeding"has become a broad conceptual framework encompassing the paradigm shift of crop breeding to relying on analysis of high-throughput population genetics and phenomics data to conduct genomic selection,allowing identification and optimal use of the genetic potential in crop species(Xiao et al.,2022;Xu et al.,2022;Wang et al.,2023).Most existing tools for analyzing high-throughput breeding data require extensive computational power,complex installation processes,and command-line expertise and are therefore challenging and inconvenient for the majority of researchers and breeders(Brandies and Hogg,2021).

关键词： breeding artificial breed

基于Stacking集成学习的车货匹配模型研究与实证分析

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现代计算机 2022年第12期28卷 46-50页

作者：梁紫堃华南理工大学电子商务系广州510006

车货匹配是提高车主和货主信息流通和促进货运交易的关键途径,然而,在实际应用当中,车货匹配需要考虑司机和货主的行为习惯,并且需要根据不平衡数据进行预测。为解决此问题,本文考虑数据不平衡性,结合RUS重抽样方法,整合Logistic Regres... 详细信息

车货匹配是提高车主和货主信息流通和促进货运交易的关键途径,然而,在实际应用当中,车货匹配需要考虑司机和货主的行为习惯,并且需要根据不平衡数据进行预测。为解决此问题,本文考虑数据不平衡性,结合RUS重抽样方法,整合Logistic Regression、朴素贝叶斯以及LightGBM模型,最终得到Stacking集成学习的车货匹配模型RLBL-Stacking。以运满满数据为例,对数据进行预处理,筛选合适特征进行模型训练。结果表明,相较于其他单一的分类模型,集成算法能在不平衡数据中取得更好的预测结果。

关键词：车货匹配不平衡数据集成学习 Stacking算法

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长坑金矿选矿工艺试验研究

黄金 2013年第8期34卷 63-66页

作者：梁自坤佛山明科富湾矿业有限公司

长坑金矿矿石属于以黄铁矿为载体的次显微结构难选难浸金矿石。对该矿矿石进行了浮选、催化预氧化—氰化、焙烧氧化—氰化、碱浸预氧化—氰化等工艺试验研究,为选矿工艺方案的确定指明了方向。

关键词：难选难浸催化预氧化焙烧碱浸氰化

序贯机械通气治疗老年重症肺炎合并呼吸衰竭的临床疗效

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临床医学工程 2021年第11期28卷 1463-1464页

作者：梁子坤吴建辉杨勇茂名市电白区人民医院重症医学科广东茂名525400

目的分析序贯机械通气治疗老年重症肺炎合并呼吸衰竭的临床疗效。方法选取2018年3月至2020年2月我院收治的老年重症肺炎合并呼吸衰竭患者56例,随机分为基础组和研究组各28例。比较两组患者的血气指标、机械通气时间、住院时间及预后。... 详细信息

目的分析序贯机械通气治疗老年重症肺炎合并呼吸衰竭的临床疗效。方法选取2018年3月至2020年2月我院收治的老年重症肺炎合并呼吸衰竭患者56例,随机分为基础组和研究组各28例。比较两组患者的血气指标、机械通气时间、住院时间及预后。结果治疗7 d后,两组的PaO_(2)、pH水平升高,PaCO_(2)水平降低,研究组的PaO_(2)水平高于基础组,PaCO_(2)水平低于基础组(P<0.05)。研究组的机械通气时间、住院时间明显短于基础组(P<0.05)。研究组治疗后好转率为100.00%,明显高于基础组的82.14%(P<0.05)。结论序贯机械通气治疗老年重症肺炎合并呼吸衰竭患者具有显著疗效。

关键词：重症肺炎老年患者呼吸衰竭序贯机械通气

血管生成及血管浸润与Ⅰ期非小细胞肺癌的预后分层

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中国肺癌杂志 2007年第1期10卷 29-33页

作者：周世杰许绍发张海青刘志东梁子昆宋小运姜颖赵丹北京市结核病胸部肿瘤研究所胸外科 101149 北京市结核病胸部肿瘤研究所病理科 101149

背景与目的最新的研究发现Ⅰ期非小细胞肺癌(NSCLC)术后辅助化疗可提高患者生存率,因此通过预后分层筛选高危患者给予辅助治疗,既可改善Ⅰ期NSCLC患者的整体预后,又可避免因过度治疗对低危患者造成损害,是目前临床急需解决的问题。本研... 详细信息

背景与目的最新的研究发现Ⅰ期非小细胞肺癌(NSCLC)术后辅助化疗可提高患者生存率,因此通过预后分层筛选高危患者给予辅助治疗,既可改善Ⅰ期NSCLC患者的整体预后,又可避免因过度治疗对低危患者造成损害,是目前临床急需解决的问题。本研究旨在探讨肿瘤血管生成和血管浸润(BVI)对Ⅰ期NSCLC预后的影响,建立Ⅰ期NSCLC预后模型。方法回顾性分析118例Ⅰ期NSCLC手术患者的临床病理资料,免疫组织化学检测血管内皮生长因子(VEGF)的表达水平,计算肿瘤内微血管密度(MVD)。以CD34标记的血管腔内瘤细胞的存在判定为BVI。结果肺癌组织VEGF低表达44例(37.3%),高表达74例(62.7%)。VEGF高表达组MVD显著高于低表达组(33.4±17.8vs24.7±14.8,P=0.010),VEGF与MVD间存在正相关(r=0.216,P=0.019)。VEGF高表达患者5年生存率显著低于低表达者(36.48% vs 72.20%,P=0.003)。无BVI者86例(72.9%),BVI者32例(27.1%),后者5年生存率显著低于前者(34.38% vs 60.47%,P=0.018)。多因素分析结果表明VEGF高表达(RR=2.96,P=0.001)和BVI(RR=1.95,P=0.020)为Ⅰ期NSCLC的独立预后因素。进一步根据VEGF表达及BVI情况,将患者分为低度危险组:VEGF低表达+BVI(-);中度危险组:VEGF高表达或BVI(+);高度危险组:VEGF高表达+BVI(+)。三组间5年生存率差异有统计学意义(72.28% vs 52.63% vs 28.00%,P=0.001)。结论VEGF表达与BVI的联合检测可能实现对Ⅰ期NSCLC进行预后分层,为术后患者的个性化治疗提供依据。

关键词：肺肿瘤血管生成血管内皮生长因子微血管密度血管浸润

小细胞肺癌患者血清胃泌素释放肽前体检测的临床意义

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国际检验医学杂志 2016年第13期37卷 1765-1766,1769页

作者：梁子坤陈燕荣长利尹颜军时广利首都医科大学附属北京胸科医院北京101149

目的探讨血清肿瘤标志物胃泌素释放肽前体(ProGRP)在小细胞肺癌(SCLC)与非小细胞肺癌(NSCLC)鉴别诊断以及化疗效评估中的临床意义。方法应用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测210例健康人、200例肺部良性疾病患者、260例NSCLC患者和182例SCL... 详细信息

目的探讨血清肿瘤标志物胃泌素释放肽前体(ProGRP)在小细胞肺癌(SCLC)与非小细胞肺癌(NSCLC)鉴别诊断以及化疗效评估中的临床意义。方法应用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测210例健康人、200例肺部良性疾病患者、260例NSCLC患者和182例SCLC患者化疗前后血清中ProGRP水平。结果 SCLC患者血清中ProGRP水平明显高于NSCLC组、健康对照组和肺部良性疾病组(P<0.01)。ProGRP对SCLC检测的敏感性为56.3%,特异性为92.6%;SCLC患者经过2个周期化疗后,ProGRP水平明显低于化疗前(P<0.01)。结论肿瘤标志物ProGRP对于SCLC的辅助诊断、鉴别诊断以及化疗效评估有非常重要的临床指导意义。

关键词：小细胞肺癌胃泌素释放肽前体鉴别诊断疗效评估

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带有齿隙的空间机械臂动力学仿真与试验设计

测试技术学报 2017年第1期31卷 17-23页

作者：李思远陈子坤梁曦石亦琨魏承赵阳哈尔滨工业大学航天学院黑龙江哈尔滨150001 北京航空航天大学航空科学与工程学院北京100191 首都航天机械公司北京100076

本文以带有齿隙的空间机械臂为研究对象,通过气悬浮的方式实现微重力的模拟,用改变一对标准渐开线支持圆柱齿轮中心距的方式,实现关节齿隙的连续可调,设计了试验验证机构的三维模型,并基于ADAMS搭建其动力学模型对多齿隙机械臂的动力学... 详细信息

本文以带有齿隙的空间机械臂为研究对象,通过气悬浮的方式实现微重力的模拟,用改变一对标准渐开线支持圆柱齿轮中心距的方式,实现关节齿隙的连续可调,设计了试验验证机构的三维模型,并基于ADAMS搭建其动力学模型对多齿隙机械臂的动力学模型进行仿真分析.对模型进行加工装配后,设计控制系统、测量系统和供气辅助系统,并设计验证试验,使其能够实现对于不同齿隙情况,反映微重力环境下齿隙对机械臂系统动力学特性的影响,为延长空间机械臂的使用寿命提供理论指导.

关键词：微重力标准渐开线直齿圆柱齿轮动力学模型

肿瘤标志物NSE和Cyfra21-1在肺癌化疗效果评估中的价值

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中国医药导报 2014年第20期11卷 55-58页

作者：梁子坤吴恩东孙勇尹颜军时广利张宝秋首都医科大学附属北京胸科医院外科北京101149 首都医科大学附属北京胸科医院检验科北京101149

目的评价血清肿瘤标志物NSE和Cyfra21-1在肺癌化疗疗效评估中的价值,探讨其作为肺癌化疗效果评价参考指标的临床意义。方法选取2011年8月～2013年6月北京胸科医院收治确诊的肺癌患者124例,其中非小细胞肺癌（NSCLC）患者70例,小细胞肺癌... 详细信息

目的评价血清肿瘤标志物NSE和Cyfra21-1在肺癌化疗疗效评估中的价值,探讨其作为肺癌化疗效果评价参考指标的临床意义。方法选取2011年8月～2013年6月北京胸科医院收治确诊的肺癌患者124例,其中非小细胞肺癌（NSCLC）患者70例,小细胞肺癌（SCLC）患者54例。应用酶联免疫法检测所有肺癌患者化疗前、化疗后1个周期和化疗后2个周期血清中NSE和Cyfra21-1的水平含量。结果 SCLC患者化疗1个周期后与化疗前比较,NSE的水平显著下降[30.9 ng/mL比50.6 ng/mL],差异有高度统计学意义（P〈0.01）;NSCLC患者化疗1个周期后与化疗前比较,血清中Cyfra21-1的水平显著下降[2.67 ng/mL比8.75 ng/mL],差异有高度统计学意义（P〈0.01）。疾病进展患者化疗1个周期后与化疗前比较,血清中NSE和Cyfra21-1的水平显著升高,差异有高度统计学意义（P〈0.01）;化疗1个周期后与化疗前比较,疾病稳定和部分缓解患者血清中NSE和CYFRA21-1的水平显著下降,差异有高度统计学意义（P〈0.01）;化疗2个周期后与化疗1个周期后比较,肺癌患者血清中NSE和CYFRA21-1的水平无明显变化,差异无统计学意义（P〉0.05）。结论肿瘤标志物NSE和CYFRA21-1可作为早期的、费用低廉的肺癌化疗疗效评价参考指标,值得在临床上推广使用。

关键词：肺癌肿瘤标志物疗效评估化疗

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血清肿瘤标志物在肺癌辅助诊断中的应用

中国肺癌杂志 2008年第2期11卷 256-259页

作者：梁子坤许绍发刘志东周世杰宋小运北京市胸部肿瘤结核病研究所胸外科

背景与目的近年来,肺癌肿瘤标志物的研究不断取得进展,并逐步应用到临床上,本研究探讨6种血清肿瘤标志物在肺癌辅助诊断中的应用价值,并选择最理想的血清肿瘤标志物组合。方法应用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测170例肺癌患者、80例健康人... 详细信息

背景与目的近年来,肺癌肿瘤标志物的研究不断取得进展,并逐步应用到临床上,本研究探讨6种血清肿瘤标志物在肺癌辅助诊断中的应用价值,并选择最理想的血清肿瘤标志物组合。方法应用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测170例肺癌患者、80例健康人和80例肺部良性疾病患者血清中神经元特异性烯醇化酶(NSE)、胃泌素释放肽前体(pro-GRP)、细胞角蛋白19(CYFRA21-1)、鳞癌抗原(SCC)、p53抗体和癌抗原199(CA199)的含量。结果肺癌患者的6种血清肿瘤标志物水平均明显高于健康人组和肺部良性疾病组,差异均有统计学意义(P<0.01)。NSE、pro-GRP在小细胞肺癌中的水平明显高于其他类型的肺癌(P<0.01);CYFRA21-1、鳞癌抗原(SCC)在鳞癌中的水平明显高于其他类型的肺癌(P<0.01)。NSE、pro-GRP对小细胞肺癌检测的敏感性明显高于其他类型的肺癌(P<0.01);CYFRA21-1、鳞癌抗原(SCC)对鳞癌检测的敏感性明显高于其他类型的肺癌(P<0.01)。6种血清肿瘤标志物经组合后,敏感性明显高于任一单项肿瘤标志物(P<0.01)。结论6种血清肿瘤标志物对于肺癌的辅助诊断有一定的临床意义。NSE、pro-GRP二者可作为联合检测小细胞肺癌的标志物组合;CYFRA21-1、SCC可作为联合检测肺鳞癌的标志物组合。

关键词：肺肿瘤肿瘤标志物诊断学血清学