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Selective recognition of PTRE1 transcripts mediated by protein-protein interaction between the m^(6)A reader ECT2 and PTRE1

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Plant Communications 2024年第11期5卷 144-156页

作者： Li Yang Bo Wang Duanmu Zhao Xuechun Li Yifei Qin Ning Ouyang zhili xiao Zhibing Zhang Gad Galili Jiayang Li Hadas Peled-Zehavi Jian Wu Guangdong Laboratory for Lingnan Modern Agriculture State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-BioresourcesKey Laboratory of Plant Molecular Breeding of Guangdong ProvinceCollege of AgricultureSouth China Agricultural UniversityGuangzhou 510642China Key Laboratory of Molecular Epigenetics of the Ministry of Education(MOE) Northeast Normal UniversityChangchun 130024China Department of Plant and Environmental Sciences Weizmann Institute of ScienceRehovot 76100Israel State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research Institute of Genetics and Developmental BiologyInnovation Academy for Seed DesignChinese Academy of SciencesBeijing 100101China These authors contributed equally to this article

N^(6)-methyladenosine (m^(6)A) is a prevalent internal post-transcriptional modification in eukaryotic RNAs executed by m^(6)A-binding proteins known as “readers.” Our previous research demonstrated that the Arabidopsis m^(6)A reader ECT2 positively regulates transcript levels of the proteasome regulator PTRE1 and several 20S proteasome subunits, thereby enhancing 26S proteasome activity. However, mechanism underlying the selective recognition of m^(6)A targets by readers, such as ECT2, remains elusive. In this study, we further demonstrate that ECT2 physically interacts with PTRE1 and several 20S proteasome subunits. This interaction, which occurs on the ribosome, involves the N terminus of PTRE1, suggesting that ECT2 might bind to the nascent PTRE1 polypeptide. Deleting ECT2’s protein interaction domain impairs its mRNA-binding ability, whereas mutations in the m^(6)A-RNA-binding site do not affect protein-protein interactions. Moreover, introducing a novel protein-binding domain into ECT2 increases transcript levels of proteins interacting with this domain. Our findings indicate that interaction with the PTRE1 protein enhances ECT2’s binding to PTRE1 m^(6)A mRNAs during translation, thereby regulating PTRE1 mRNA levels.

关键词： ECT2 20S proteasome m^(6)A RNA protein interaction Arabidopsis

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GL9 from Oryza glumaepatula controls grain size and chalkiness in rice

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The Crop Journal 2023年第1期11卷 198-207页

作者： Shaojun Lin Zupei Liu Kui Zhang Weifeng Yang Penglin Zhan Quanya Tan Yajun Gou Shuaipeng Ma Xin Luan Chubing Huang zhili xiao Yuanyuan Liu Bihuang Zhu Ruiqing Liang Wenqi Zhou Haitao Zhu Suhong Bu Guifu Liu Guiquan Zhang Shaokui Wang Guangdong Provincial Key Laboratory of Plant Molecular Breeding State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-BioresourcesSouth China Agricultural UniversityGuangzhou 510642GuangdongChina Guangdong Laboratory for Lingnan Modern Agriculture Guangzhou 510630GuangdongChina

Grain size is a key factor influencing grain yield and appearance quality in *** identified twelve quantitative trait loci(QTL)for grain length(GL),nine for grain width(GW),and nine for 1000-kernel weight(TKW)using GLU-SSSLs,which are single-segment substitution lines with Oryza glumaepatula as donor parent and Huajingxian 74(HJX74)as recipient *** the QTL,qGL1-2,qGL1-4,qGL9-2,qGW2-2,qGW9-1 and qTKW9-2 contributed to high grain ***9 was identified as a candidate gene for qGL9-2 by map-based cloning and sequencing,and is a novel allele of *** kernel of NIL-gl9was slenderer and longer than that of HJX74,and the TKW and grain yield per plant of NIL-gl9 were higher than those of *** proportion of grain chalkiness of NIL-gl9 was much lower than that of ***,gl9 increased grain yield and appearance quality *** pyramid lines,NIL-gs3/gl9,NIL-GW7/gl9 and NIL-gw8/gl9,were developed and the kernel of each was longer than that of the corresponding recipient parent *** gl9 allele may be beneficial for breeding rice varieties with high grain yield and good appearance quality.

关键词： Oryza glumaepatula GL9 Grain size Grain chalkiness Single-segment substitution line

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Natural variations in grain length 10(GL10)regulate rice grain size

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Journal of Genetics and Genomics 2022年第5期49卷 405-413页

作者： Penglin Zhan Shuaipeng Ma zhili xiao Fangping Li Xin Wei Shaojun Lin xiaoling Wang Zhe Ji Yu Fu Jiahao Pan Mi Zhou Yue Liu Zengyuan Chang Lu Li Suhong Bu Zupei Liu Haitao Zhu Guifu Liu Guiquan Zhang Shaokui Wang Guangdong Laboratory for Lingnan Modern Agriculture GuangzhouGuangdong 510642China State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources Guangdong Provincial Key Laboratory of Plant Molecular BreedingSouth China Agricultural UniversityGuangzhouGuangdong 510642China Department of Plant Sciences University of OxfordOxford OX13RBUK

Grain size is an important determinant of grain weight and yield in *** several genes related to grain size have been identified,natural variations in these genes that affect grain size are poorly ***,we describe the grain length QTL GL10,encoding MADS56,which positively regulates grain length and grain weight.A natural allelic variation of NIL-gl10,containing an~1.0-kb deletion in the first exon that abolishes its transcription,results in shorter grain length,lower grain weight and delayed flowering in gl10 *** knockout of GL10 in the HJX74 background leads to grain phenotypes similar to that of NIL-gl10,while overexpression of GL10 results in increased grain length and weight and earlier heading ***10 regulates grain length by promoting greater longitudinal cell growth in the grain ***,GL10 participates in the regulation of gibberellic acid(GA)signaling pathway genes in young panicle *** of GL10 haplotypes shows obvious divergence between the japonica and indica *** findings reveal an allelic variation of GL10 that may explain differences in grain length among modern cultivars and could be used to breed rice varieties with optimized grain shape.

关键词： Rice GL10 OsMADS56 Grain length SSSL GA

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冷压烧结和冷轧工艺制备原位生成石墨烯增强铜基复合材料

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热加工工艺 2023年第20期52卷 71-75页

作者：肖治理杨琳太原理工大学材料科学与工程学院山西太原030024

采用化学气相沉积法在多孔泡沫铜基体表面原位生成石墨烯,然后通过冷压烧结和二次冷轧、退火的工艺制备石墨烯增强铜基复合材料。研究表明,采用化学气相沉积的方法在铜基体表面原位生成石墨烯可以提高制备的复合材料的抗拉强度以及使其... 详细信息

采用化学气相沉积法在多孔泡沫铜基体表面原位生成石墨烯,然后通过冷压烧结和二次冷轧、退火的工艺制备石墨烯增强铜基复合材料。研究表明,采用化学气相沉积的方法在铜基体表面原位生成石墨烯可以提高制备的复合材料的抗拉强度以及使其保持较高的导电率。二次轧制退火后石墨烯增强铜基复合材料的相对密度达到98.96%,经测试复合材料的导电率高达88.7%IACS,其抗拉强度达到了289.5 MPa较同实验条件制备的纯铜提高32.98%。

关键词：石墨烯冷轧铜基复合材料化学气相沉积法

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杂交-杂交瘤技术制备BsMAb的研究进展及其在食品安全检测中的应用

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食品科学 2016年第13期37卷 251-256页

作者：王锋王宇王弘肖治理华南农业大学食品学院广东省食品质量安全重点实验室广东广州510642

双特异性单克隆抗体(bispecific monoclonal antibody,BsMAb)是指具有两个不同特异性抗原结合位点的单克隆抗体分子。杂交-杂交瘤技术因其简便易行、制备周期短,在制备Bs MAb方面有较大优势。基于杂交-杂交瘤技术能制备出可以特异性识... 详细信息

双特异性单克隆抗体(bispecific monoclonal antibody,BsMAb)是指具有两个不同特异性抗原结合位点的单克隆抗体分子。杂交-杂交瘤技术因其简便易行、制备周期短,在制备Bs MAb方面有较大优势。基于杂交-杂交瘤技术能制备出可以特异性识别两种或者两类小分子药物的Bs MAb,在食品安全多残留免疫分析检测中具有较好的应用价值。本文综述了杂交-杂交瘤技术制备Bs MAb的进展,探讨了基于该技术的Bs MAb生成机制,讨论分析了杂交-杂交瘤及Bs MAb筛选制备的关键技术要点,并归纳了Bs MAb在检测食品中小分子污染物方面的应用进展,旨在为食品安全多残留免疫分析技术的发展应用提供参考。

关键词：杂交-杂交瘤技术双特异性单克隆抗体多残留免疫分析

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基于语义相似性的跨模态图文内容筛选存储机制研究

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计算机研究与发展 2021年第2期58卷 338-355页

作者：刘渝郭婵冯树耀周可肖志立华中科技大学武汉光电国家研究中心武汉430074 深圳市腾讯计算机系统有限公司技术工程事业群广东深圳518054

随着多媒体数据的爆发式增长,云端数据呈现出大规模多模态混合并存的特性.服务于数据分析的传统存储系统因为缺乏数据的语义管理而面临读取延时超长的挑战.针对图像和文本2种模态数据,在传统存储系统之上提出一种跨模态图文数据内容筛... 详细信息

随着多媒体数据的爆发式增长,云端数据呈现出大规模多模态混合并存的特性.服务于数据分析的传统存储系统因为缺乏数据的语义管理而面临读取延时超长的挑战.针对图像和文本2种模态数据,在传统存储系统之上提出一种跨模态图文数据内容筛选存储机制(cross-modal image and text content sifting storage,CITCSS),用于提供大规模在线相似性内容筛选服务,从存储系统层面缓解数据分析时必须从存储中读出所有数据的读带宽压力.机制分为离线与在线2个阶段.离线阶段中,引入基于自监督的生成对抗式Hash方法,系统利用这种方法生成语义元数据.然后,将元数据注入独立的元数据空间.最后,根据相似性Hash码间汉明距离能够度量语义距离的特点,利用Neo4j图数据库构建Hash元数据图谱,并在语义图谱中建立Hash码与存储路径之间的映射.在线阶段中,用户发送与分析相关的图像或文本,存储系统首先转化数据为Hash码.然后,在筛选半径内通过Hash元数据图谱寻找相似节点,进而找到相似文件的底层存储路径返回筛选数据.实验结果表明,与传统语义存储系统相比,CITCSS在召回率超过98%的性能下,读取延迟相对降低了99.07%~99.77%.

关键词：语义管理 Hash码元数据元数据图谱存储机制读带宽

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ULTRASONIC STUDIES ON HIGH Tc SUPERCONDUCTOR YBa_(2)Cu_(3)O_(7-x)

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Chinese Physics Letters 1988年第10期5卷 461-464页

作者： DENG Tingzhang ZHANG Liangkun GU Huicheng xiao zhili CHEN Liquan Institute of Physics Academia SinicaBeijing

Ultrasonic attenuation and velocity measurements down to 77K were performed on high Tc superconductor Y-Ba-Cu-O samples with different sintering *** change of sound velocity was found near Tc in two samples which have density of 94% of the theoretical density and excellent *** one of the samples an anomaly related to ultrasonic frequency was observed around Tc in the ultrasonic *** sample also possesses an excellent diamagnetism,but no anomaly in ultrasonic attenuation was found near *** did not observe anomaly in attenuation resulted from electron-phonon interaction in these two samples.

关键词： attenuation magnetism superconductor

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同时检测玉米中黄曲霉毒素B_(1)和赭曲霉毒素A的时间分辨荧光免疫层析试纸条的研制

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食品科学 2022年第2期43卷 346-354页

作者：卢迪莎王序杨金易罗林肖治理广东省食品质量安全重点实验室华南农业大学食品学院广东广州510642

研究制备了一种可同时快速定量检测黄曲霉毒素B_(1)(aflatoxin B_(1),AFB_(1))和赭曲霉毒素A(ochratoxin A,OTA)的二联时间分辨荧光免疫层析试纸条。采用铕系时间分辨荧光微球分别标记AFB_(1)和OTA单克隆抗体,优化荧光微球活化pH值、标... 详细信息

研究制备了一种可同时快速定量检测黄曲霉毒素B_(1)(aflatoxin B_(1),AFB_(1))和赭曲霉毒素A(ochratoxin A,OTA)的二联时间分辨荧光免疫层析试纸条。采用铕系时间分辨荧光微球分别标记AFB_(1)和OTA单克隆抗体,优化荧光微球活化pH值、标记的抗体浓度、荧光探针使用量、检测线包被原浓度、质控线羊抗鼠IgG浓度、样品前处理条件等因素。结果表明:检测AFB_(1)和OTA的IC_(50)分别为1.58、3.91μg/kg,线性范围分别为0.26~9.73、1.14~13.29μg/kg,肉眼检测限分别为3.70、5.55μg/kg;与黄曲霉毒素类似物交叉率为12%~62%,与赭曲霉毒素B交叉率为58%,与其他真菌毒素无明显交叉反应;选择玉米样品进行添加回收实验,2种毒素回收率在92%~103%之间,变异系数小于15%;对实际样品的检测与高效液相色谱法和市售胶体金试纸检测结果一致;且该试纸条可在4℃稳定保存5个月以上,稳定性较好。本研究所制备的时间分辨荧光免疫层析试纸条具有灵敏、准确、快速和简便等特点,非常适用于玉米等食品和农产品中AFB_(1)和OTA的现场快速筛查。

关键词：黄曲霉毒素B_(1) 赭曲霉毒素A 时间分辨荧光免疫层析试纸条

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石墨烯增强铜基复合材料的制备及性能研究

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热加工工艺 2024年第17期53卷 69-72页

作者：白伟伟杨琳肖治理太原理工大学材料科学与工程学院山西太原030024

以三维泡沫铜为基体,采用化学气相沉积得到石墨烯铜复合体,同时解决了石墨烯在铜基体中分散性和界面结合问题,再用铜粉填充泡沫铜孔隙,然后真空热压制备石墨烯增强铜基复合材料。探究了石墨烯对铜基体复合材料导电性及拉伸性能的增强效... 详细信息

以三维泡沫铜为基体,采用化学气相沉积得到石墨烯铜复合体,同时解决了石墨烯在铜基体中分散性和界面结合问题,再用铜粉填充泡沫铜孔隙,然后真空热压制备石墨烯增强铜基复合材料。探究了石墨烯对铜基体复合材料导电性及拉伸性能的增强效果。研究发现,石墨烯对铜基体性能有明显增强作用,在50 sccm甲烷通量下15 min时沉积的石墨烯性能增强效果最佳。热压制备的石墨烯增强铜基复合材料的导电性能达到86.2%IACS,抗拉强度提高到338 MPa,屈服强度也达到214 MPa。

关键词：泡沫铜化学气相沉积石墨烯铜基复合材料导电性拉伸性能

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腹腔镜袖状胃切除术治疗肥胖症相关非酒精性脂肪性肝病的临床疗效

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中华消化外科杂志 2021年第9期20卷 988-993页

作者：肖志立郑文彬杨钧秦鸿雁季刚空军军医大学西京消化病医院胃肠外科西安710032 空军军医大学医学遗传学与发育生物学教研室西安710032

目的探讨腹腔镜袖状胃切除术(LSG)治疗肥胖症相关非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的临床疗效。方法采用回顾性描述性研究方法。收集2018年1月至2019年6月空军军医大学西京消化病医院收治的40例肥胖症相关NAFLD病人的临床资料;男19例,女21例;... 详细信息

目的探讨腹腔镜袖状胃切除术(LSG)治疗肥胖症相关非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的临床疗效。方法采用回顾性描述性研究方法。收集2018年1月至2019年6月空军军医大学西京消化病医院收治的40例肥胖症相关NAFLD病人的临床资料;男19例,女21例;年龄为(27±8)岁。病人完成术前检查和评估后均行LSG。观察指标:(1)手术及术后情况。(2)随访情况。采用电话、微信、门诊复查方式进行随访,了解术后6个月和12个月病人肝功能、糖脂代谢相关情况以及合并症缓解情况。随访时间截至2020年6月。正态分布的计量资料以x±s表示,重复测量数据采用重复测量方差分析。计数资料以绝对数表示,组间比较采用χ2检验。结果 (1)手术及术后情况:40例病人均顺利施行LSG,无中转开腹及死亡病例,手术时间为(83±12)min,术中出血量为(19±7)mL,术后住院时间为(3.7±0.7)d。40例病人中,1例术后发生脂肪液化,2例术后1个月发生腹胀,经对症支持治疗后均好转。(2)随访情况:40例病人均完成术后6个月和12个月随访。40例病人术前、术后6个月、术后12个月体质量分别为(112±17)kg、(85±16)kg、(73±11)kg,体质量指数分别为(39.7±4.2)kg/m2、(30.0±4.5)kg/m2、(25.9±2.9)kg/m2,丙氨酸氨基转移酶分别为(56.40±39.51)U/L、(30.15±17.93)U/L、(26.45±9.44)U/L,天冬氨酸氨基转移酶分别为(34.03±19.62)U/L、(28.20±10.27)U/L、(24.90±8.44)U/L,γ-谷氨酰转移酶分别为(48.68±28.45)U/L、(43.30±18.56)U/L、(32.80±12.09)U/L,空腹血糖分别为(6.51±2.38)mmol/L、(5.64±1.51)mmol/L、(4.98±0.91)mmol/L,甘油三酯分别为(1.81±0.95)mmol/L、(1.48±0.57)mmol/L、(1.17±0.44)mmol/L,总胆固醇分别为(4.77±0.98)mmol/L、(4.58±0.75)mmol/L、(4.10±0.68)mmol/L,低密度脂蛋白胆固醇分别为(2.99±0.81)mmol/L、(2.79±0.54)mmol/L、(2.48±0.40)mmol/L,高密度脂蛋白胆固醇分别为(1.08±0.20)mmol/L、(1.15±0.18)mmol/L、(1.45±0.21)mmol/L。体质量、体质量指数、丙氨酸氨基转移酶、天冬氨酸氨基转移酶、γ-谷氨酰转移酶、空腹血糖、甘油三酯、总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇术前与术后比较,差异均有统计学意义(F=472.439,533.730,26.791,11.029,25.545,27.994,27.534,36.220,18.596,P<0.05),均呈下降趋势;高密度脂蛋白胆固醇术前与术后比较,差异有统计学意义(F=68.974,P<0.05),呈上升趋势。40例病人术后6个月和12个月多余体质量减少率分别为61%±18%和85%±15%。40例病人术前B超检查结果显示:无、轻度、中度、重度脂肪肝分别为0、2、15、23例;术后6个月上述指标分别为8、9、12、11例;术后12个月上述指标分别为23、11、6、0例。术前与术后NAFLD程度比较,差异有统计学意义(χ2=68.210,P<0.05)。结论 LSG治疗肥胖症相关NAFLD的短期临床疗效确切,可降低病人体质量和改善肝功能,缓解糖脂代谢紊乱及中、重度脂肪肝。

关键词：肥胖症非酒精性脂肪性肝病腹腔镜袖状胃切除术减重与代谢手术疗效

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