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Sex biased expression of hormone related genes at early stage of sex differentiation in papaya flowers

Horticulture Research 2021年第1期8卷 2082-2094页

作者： Juan Liu Li-Yu Chen Ping Zhou zhenyang liao Hai Lin Qingyi Yu Ray Ming FAFU and UIUC Joint Center for Genomics and Biotechnology Key Laboratory of GeneticsBreeding and Multiple Utilization of CropsMinistry of EducationFujian Provincial Key Laboratory of Haixia Applied Plant Systems BiologyCollege of Life ScienceFujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhou 350002 FujianChina Key Laboratory of Plant Germplasm Enhancement and Specialty Agriculture Chinese Academy of SciencesWuhan Botanical GardenWuhan 430074China Texas A&M AgriLife Research Center at Dallas Texas A&M University SystemDallasTX 75252USA Department of Plant Pathology&Microbiology Texas A&M UniversityCollege StationTX 77843USA Department of Plant Biology School of Integrative BiologyUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignUrbanaIL 61801USA

Sex types of papaya are controlled by a pair of nascent sex chromosomes,but molecular genetic mechanisms of sex determination and sex differentiation in papaya are still *** performed comparative analysis of transcriptomic profiles of male and female floral buds at the early development stage before the initiation of reproductive organ primordia at which there is no morphological difference between male and female flowers.A total of 1734 differentially expressed genes(DEGs)were identified,of which 923 showed female-biased expression and 811 showed male-biased *** annotation revealed that genes related to plant hormone biosynthesis and signaling pathways,especially in abscisic acid and auxin pathways,were overrepresented in the *** factor binding motifs,such as MYB2,GAMYB,and AP2/EREBP,were enriched in the promoters of the hormone-related DEGs,and transcription factors with those motifs also exhibited differential expression between sex *** these DEGs,we also identified 11 genes in the non-recombining region of the papaya sex chromosomes and 9 genes involved in stamen and carpel *** results suggested that sex differentiation in papaya may be regulated by multiple layers of regulation and coordination and involved transcriptional,epigenetic,and phytohormone ***,especially ABA and auxin,transcription factors,and genes in the non-recombination region of the sex chromosome could be involved in this *** findings may facilitate the elucidation of signal transduction and gene interaction in sex differentiation of unisexual flowers in papaya.

关键词： expression flowers papaya

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Whole-genome Duplication Reshaped Adaptive Evolution in A Relict Plant Species,Cyclocarya paliurus

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2023年第3期21卷 455-469页

作者： Yinquan Qu Xulan Shang Ziyan Zeng Yanhao Yu Guoliang Bian Wenling Wang Li Liu Li Tian Shengcheng Zhang Qian Wang Dejin Xie Xuequn Chen zhenyang liao Yibin Wang Jian Qin Wanxia Yang Caowen Sun Xiangxiang Fu Xingtan Zhang Shengzuo Fang Nanjing Forestry University Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern ChinaNanjing 210037China Shenzhen Branch Guangdong Laboratory for Lingnan Modern AgricultureGenome Analysis Laboratory of the Ministry of AgricultureAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518120China Center for Genomics and Biotechnology Fujian Provincial Key Laboratory of Haixia Applied Plant Systems BiologyKey Laboratory of GeneticsBreeding and Multiple Utilization of CropsMinistry of EducationFujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhou 350002China

Cyclocarya paliurus is a relict plant species that survived the last glacial period and shows a population expansion *** leaves have been traditionally used to treat obesity and diabetes with the well-known active ingredient cyclocaric acid ***,we presented three *** genomes from two diploids with different flower morphs and one haplotype-resolved tetraploid *** genomic analysis revealed two rounds of recent whole-genome duplication events and identified 691 genes with dosage effects that likely contribute to adaptive evolution through enhanced photosynthesis and increased accumulation of *** analysis of 45 *** individuals uncovered two bottlenecks,consistent with the known events of environmental changes,and many selectively swept genes involved in critical biological functions,including plant defense and secondary metabolite *** also proposed the biosynthesis pathway of cyclocaric acid B based on multi-omics data and identified key genes,in particular gibberellinrelated genes,associated with the heterodichogamy in *** *** study sheds light on evolutionary history of *** and provides genomic resources to study the medicinal herbs.

关键词： Cyclocarya paliurus Genomics Whole-genome duplication Triterpenoid Resequencing

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Evolutionary genomics of structural variation in the tea plant,Camellia sinensis

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Tropical Plants 2022年第1期1卷 2-12页

作者： Shuai Chen Jingping Fang Yibin Wang Pengjie Wang Shengcheng Zhang zhenyang liao Hong Lu Xingtan Zhang Shenzhen Branch Guangdong Laboratory for Lingnan Modern AgricultureGenome Analysis Laboratory of the Ministry of AgricultureAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518120China College of Life Science Center of Engineering Technology Research for Microalgae Germplasm Improvement of FujianSouthern Institute of OceanographyFujian Normal UniversityFuzhou 350117FujianChina

Structural variants(SVs)are a type of genetic variation that contribute substantially to phenotypic diversity and *** study of SVs will help us understand the influence of SVs associated with tea quality and stress resistance and provide new insight into tea plant breeding improvement and genetic ***,SVs have not been thoroughly discovered in the tea plant ***,we constructed a large-scale SV map across a population of 107 resequenced genomes,including both ancient and cultivated tea plants.A total of 44,240 highconfident SVs were identified,including 34,124 DEL(deletions),4,448 DUP(duplications),2,503 INV(inversions),544 INS(insertions)and 2,621 TRA(translocations).In total,12,400 protein-coding genes were overlapped with SVs,of which 49.5%were expressed in all five tea *** analysis of phylogenetic relationships and population structure in tea plants showed a consistent evolutionary history with the SNP-based *** also identified SVs subject to artificial selection and found that genes under domestication were enriched in metabolic pathways involving theanine and purine alkaloids,biosynthesis of monoterpenoid,phenylpropanoid,fatty acid,and isoflavonoid,contributing to traits of agronomic interest in tea *** addition,a total of 27 terpene synthase(TPS)family genes were selected during *** results indicate that these SVs could provide extensive genomic information for tea quality improvement.

关键词： structural thoroughly plant

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列管式烟气–烟气换热器烟道系统优化设计

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中国电机工程学报 2019年第8期39卷 2384-2393页

作者：阳君刘俊刘小华谢田廖振阳上海理工大学能源与动力工程学院上海市杨浦区200093 上海交通大学能源与动力工程学院上海市杨浦区200093

烟气管道换热器入口流场分布不均会引起严重的噪声污染,同时制约其安全性,因此对其入口流场的优化具有非常重要的工程意义。以某燃烧电厂列管式GGH换热器为研究对象对其入口流场进行优化,探究不同导流装置的设计对其内流场的影响。基于F... 详细信息

烟气管道换热器入口流场分布不均会引起严重的噪声污染,同时制约其安全性,因此对其入口流场的优化具有非常重要的工程意义。以某燃烧电厂列管式GGH换热器为研究对象对其入口流场进行优化,探究不同导流装置的设计对其内流场的影响。基于Fluent软件对GGH烟道系统进行数值模拟,GGH换热器结构复杂,按照原型设计并划分网格较困难,为简化模型考虑采用多孔介质模型替代,并通过加装导流装置对烟道系统结构进行优化。结果发现:数值模拟中原烟道、净烟道换热器压降数值与实验数据吻合。通过加装导流板和布风板,可以保证系统内原烟道、净烟道换热器入口烟气速度均匀度与偏态系数均低于20%。合理的设计导流板、布风板能够起到抑制90??弯管以及变截面引起的流场分离现象,消除大涡流的产生,使烟气更均匀地进入换热器。

关键词：变截面烟道优化设计导流板布风板数值模拟

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跨越第二宇宙速度的膨胀管风洞研制

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航空学报 2022年第S02期43卷 141-154页

作者：吕治国龚红明常雨廖振洋钟涌中国空气动力研究与发展中心超高速空气动力研究所绵阳621000 中国空气动力研究与发展中心跨流域空气动力学重点实验室绵阳621000

为了解决再入飞行器涉及到的高焓真实气体效应、辐射传热等关键气动问题,满足中国下一代航天飞行器研制对高焓环境模拟的需求,中国空气动力研究与发展中心建成了一座工程应用型的高焓膨胀管风洞。重点介绍了风洞的一些关键技术及解决途... 详细信息

为了解决再入飞行器涉及到的高焓真实气体效应、辐射传热等关键气动问题,满足中国下一代航天飞行器研制对高焓环境模拟的需求,中国空气动力研究与发展中心建成了一座工程应用型的高焓膨胀管风洞。重点介绍了风洞的一些关键技术及解决途径,包括气动设计、活塞驱动、大口径耐冲击夹膜机构设计、双滚动浮动支撑运行、配套高焓瞬态测试技术,风洞流场调试的初步结果及测试技术验证等情况。流场调试结果表明:高焓膨胀管风洞实现的关键技术指标气流速度、焓值和有效试验时间范围分别是1.63~11.50 km/s、1.5~71.7 MJ/kg和0.1~1.1 ms,该风洞具备了进行高焓真实气体效应问题研究的地面试验模拟能力。

关键词：膨胀管风洞活塞驱动高焓真实气体效应轻质气体驱动流场调试

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咖啡遗传育种研究进展

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中国科学：生命科学 2024年第10期54卷 1874-1884页

作者：王曦奥廖振阳闫林胡丽松中国热带农业科学院香料饮料研究所农业农村部香辛饮料作物遗传资源利用重点实验室万宁571533 热带作物生物育种全国重点实验室三亚572024

咖啡被誉为“世界三大无酒精饮料”之一,是重要的经济作物.咖啡产业的发展经历全球化、速食化、精品化三个重要的阶段,品种的不断驯化改良是支撑其风靡全球的重要因素.本文以世界咖啡发展历程为主线,归纳总结不同发展阶段咖啡遗传育种... 详细信息

咖啡被誉为“世界三大无酒精饮料”之一,是重要的经济作物.咖啡产业的发展经历全球化、速食化、精品化三个重要的阶段,品种的不断驯化改良是支撑其风靡全球的重要因素.本文以世界咖啡发展历程为主线,归纳总结不同发展阶段咖啡遗传育种的特征,并结合当前精品咖啡品种改良存在的问题和世界咖啡产业的发展趋势,提出重点研究方向.

关键词：咖啡产业发展遗传育种

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甘蔗花穗ScRS31基因的克隆与初步表达分析

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热带作物学报 2013年第10期34卷 1935-1940页

作者：刘娟廖振阳吴嘉云邓祖湖农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福建福州350002

应用RT-PCR法从甘蔗(Saccharum L.)花穗中克隆了1个丝氨酸精氨酸丰富蛋白(Serine/Arginine-rich proteins,SR proteins)家族基因ScRS31,属于RS亚家族成员。该序列全长1 120 bp,包含编码285个氨基酸的完整开放读码框,具有典型的RS亚家族... 详细信息

应用RT-PCR法从甘蔗(Saccharum L.)花穗中克隆了1个丝氨酸精氨酸丰富蛋白(Serine/Arginine-rich proteins,SR proteins)家族基因ScRS31,属于RS亚家族成员。该序列全长1 120 bp,包含编码285个氨基酸的完整开放读码框,具有典型的RS亚家族结构特征。生物信息学分析显示,ScRS31编码蛋白是一个不稳定蛋白,表现亲水性;含有41个潜在丝氨酸磷酸化位点,推测通过磷酸化和去磷酸化实现功能调控;与高粱、玉米中的SR蛋白氨基酸序列的同源性最高,分别为97.5%、96.1%。实时荧光定量分析发现,ScRS31在根、花和芽中的表达量远高于其它组织中该基因的表达量。

关键词：甘蔗 ScRS31 克隆表达分析

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“21.7”河南暴雨暖湿季风输送带加强及关键天气流型的准地转位涡反演

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大气科学 2022年第5期46卷 1147-1166页

作者：谢作威布和朝鲁诸葛安然连汝续廖振杨阎洁林大伟中国科学院大气物理研究所国际气候与环境科学中心北京100029 杭州市萧山区气象局杭州311200 新能源电力系统国家重点实验室(华北电力大学) 北京102206 中国气象局人工影响天气中心北京100081 中国气象局云降水物理与人工影响天气重点开放实验室北京100081

本文使用站点降水资料和欧洲中期天气预报中心第五代再分析数据,利用准地转位涡分部反演,重点分析了2021年7月18~21日(简称“21.7”)河南极端暴雨中暖湿季风输送带加强的机理及其关键环流特征。结果表明:副热带高压持续西伸至中国东部地... 详细信息

本文使用站点降水资料和欧洲中期天气预报中心第五代再分析数据,利用准地转位涡分部反演,重点分析了2021年7月18~21日(简称“21.7”)河南极端暴雨中暖湿季风输送带加强的机理及其关键环流特征。结果表明:副热带高压持续西伸至中国东部地区,其西南部宽广的东南风将暖湿气流和河南地区高位涡输送至西北地区;同时,西北地区阿拉善高原热低压受感热加热而加强,在近地面层及其东侧的河套地区对流层中低层(750~650 hPa)产生正位涡异常,与河南地区低压环流形成大范围高位涡异常,从而与副热带高压形成较大范围的对峙。准地转位涡反演结果表明,对流层中低层这一天气流型导致河南南部南风的加强,有效地将暖湿输送带中高温高湿的气块输送至河南地区,成为7月20日极端暴雨发生的关键因子之一。对于7月20日河南地区的南风,主要来自于副热带高压的贡献,其次是河套地区对流层中低层高位涡异常,而河南局地低压环流的贡献略小。

关键词：河南暴雨暖湿输送带位涡反演副热带高压热低压

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超高压临氢环境用抗氢钢研究进展

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钢铁研究学报 2023年第9期35卷 1053-1064页

作者：廖振洋张继舜赵吉庆杨钢孔荣宗中国空气动力研究与发展中心超高速空气动力研究所四川绵阳621000 钢铁研究总院有限公司特殊钢研究院北京100081

激波风洞在超高压氢环境下工作,面临着严重的氢损伤风险,对临氢材料提出了苛刻的条件,现阶段常规抗氢钢可能难以满足设备需求,因此,为保证超压临氢环境设备的安全运行,研究超高压环境用钢的氢损伤具有重要意义。以国内外的研究成果为基... 详细信息

激波风洞在超高压氢环境下工作,面临着严重的氢损伤风险,对临氢材料提出了苛刻的条件,现阶段常规抗氢钢可能难以满足设备需求,因此,为保证超压临氢环境设备的安全运行,研究超高压环境用钢的氢损伤具有重要意义。以国内外的研究成果为基础,首先简要介绍了氢损伤机制及其影响因素,其次归纳总结了铬钼钢、单相奥氏体不锈钢、沉淀强化奥氏体合金及镍基合金的抗氢性能以及发展现状,最后展望了未来研究重点。

关键词：超高压临氢环境氢损伤铬钼钢奥氏不锈钢沉淀强化奥氏体合金镍基合金

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Inconel625合金的热变形行为及热加工图

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金属热处理 2023年第8期48卷 52-57页

作者：张继舜廖振洋杨钢唐正焮陈其为孔荣宗钢铁研究总院有限公司特殊钢研究院北京100081 中国空气动力研究与发展中心超高速空气动力研究所四川绵阳621000

采用Gleeble-3800热模拟试验机开展了Inconel625合金变形温度为950~1200℃、应变速率为0.001~10 s^(-1)的热压缩试验,分析了其热变形行为和不同变形条件下的微观组织演化,构建了Inconel625合金的热加工图。结果表明,Inconel625合金的流... 详细信息

采用Gleeble-3800热模拟试验机开展了Inconel625合金变形温度为950~1200℃、应变速率为0.001~10 s^(-1)的热压缩试验,分析了其热变形行为和不同变形条件下的微观组织演化,构建了Inconel625合金的热加工图。结果表明,Inconel625合金的流变应力随应变速率增加而升高,随变形温度升高而降低;变形温度越高、压缩应变速率越低,越容易发生动态再结晶。Inconel625合金最佳热加工工艺参数范围为变形温度1010~1050℃,应变速率0.01~0.13 s^(-1)。

关键词： Inconel625合金热变形再结晶热加工图

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