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Telomere-to-telomere pear (Pyrus pyrifolia) reference genome reveals segmental and whole genome duplication driving genome evolution

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Horticulture Research 2023年第11期10卷 106-119页

作者： Manyi Sun chenjie Yao Qun Shu Yingyun He Guosong chen Guangyan Yang Shaozhuo Xu Yueyuan Liu zhaolong Xue Jun Wu College of Horticulture State Key Laboratory of Crop Genetics&Germplasm Enhancement and UtilizationNanjing Agricultural UniversityNanjingJiangsu 210095China Zhongshan Biological Breeding Laboratory No.50 Zhongling StreetNanjingJiangsu 210014China Institute of Horticulture Yunnan Academy of Agricultural SciencesKunming 650205China

Previously released pear genomes contain a plethora of gaps and unanchored genetic ***,we report a telomere-to-telomere(T2T)gap-free genome for the red-skinned pear,‘Yunhong No.1’(YH1;Pyrus pyrifolia),which is mainly cultivated in Yunnan Province(southwest China),the pear’s primary region of *** YH1 genome is 501.20 Mb long with a contig N50 length of 29.26 *** 17 chromosomes were assembled to the T2T level with 34 characterized *** 17 centromeres were predicted and mainly consist of centromeric-specific monomers(CEN198)and long terminal repeat(LTR)Gypsy elements(≥74.73%).By filling all unclosed gaps,the integrity of YH1 is markedly improved over previous *** genomes(‘Cuiguan’and‘Nijisseiki’).A total of 1531 segmental duplication(SD)driven duplicated genes were identified and enriched in stress response *** SDs drove the expansion of disease resistance genes,suggesting the potential of SDs in adaptive pear evolution.A large proportion of duplicated gene pairs exhibit dosage effects or sub-/neo-functionalization,whichmay affect agronomic traits like stone cell content,sugar content,and fruit skin ***,as core regulators of anthocyanin biosynthesis,we found that MYB10 and MYB114 underwent various gene duplication *** copies of MYB10 and MYB114 displayed obvious dosage effects,indicating role differentiation in the formation of red-skinned pear *** summary,the T2T gap-free pear genome provides invaluable resources for genome evolution and functional genomics.

关键词： dosage evolution driving

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基于复合手术室的内镜逆行胰胆管造影术联合腹腔镜胆囊切除术同期治疗胆囊结石合并胆总管结石的效果

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中国内镜杂志 2024年第8期30卷 85-88页

作者：许兆龙陈正民孙发缔李乃树姚超蚌埠医科大学第二附属医院普通外科安徽蚌埠233020

目的探讨在复合手术室中运用内镜逆行胰胆管造影术(ERCP)联合腹腔镜胆囊切除术(LC)同期治疗胆囊结石合并胆总管结石的临床疗效。方法回顾性分析该院21例胆囊结石合并胆总管结石患者的临床资料,先在全凭静脉麻醉或静脉-吸入复合麻醉下完... 详细信息

目的探讨在复合手术室中运用内镜逆行胰胆管造影术(ERCP)联合腹腔镜胆囊切除术(LC)同期治疗胆囊结石合并胆总管结石的临床疗效。方法回顾性分析该院21例胆囊结石合并胆总管结石患者的临床资料,先在全凭静脉麻醉或静脉-吸入复合麻醉下完成ERCP胆管取石,接着完成LC。结果18例顺利完成ERCP联合LC同期治疗,3例改行腹腔镜下胆总管切开探查术(LCBDE),无中转剖腹手术,术后并发高淀粉酶血症8例,无胰腺炎、消化道出血和穿孔等严重并发症。结论复合手术室中运用ERCP联合LC同期治疗胆囊结石合并胆总管结石,简化了手术流程,是安全、可行的。

关键词：胆囊结石胆总管结石内镜逆行胰胆管造影术(ERCP) 腹腔镜胆囊切除术(LC) 复合手术室

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校外生产实习的管理与考核

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科技创新导报 2014年第3期11卷 190-191页

作者：刘丽陈兆龙张迪凡巢湖学院电子工程与电气自动化学院安徽巢湖238000

作为应用型本科院校,生产实习是人才培养过程中不可缺少的重要的实践教学环节。提出了校外生产实习的管理模式,管理机构的组成、担负的任务和职责,并详细阐述了生产实习的考核方式,提出了采用多元化的考核模式,公平、公正地全面考核,该... 详细信息

作为应用型本科院校,生产实习是人才培养过程中不可缺少的重要的实践教学环节。提出了校外生产实习的管理模式,管理机构的组成、担负的任务和职责,并详细阐述了生产实习的考核方式,提出了采用多元化的考核模式,公平、公正地全面考核,该考核方式有助于提高学生生产实习的积极性,使学生更加重视这一实践教学环节,保证生产实习的教学质量。

关键词：生产实习实践教学考核方式

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The E3 ligase RNF5 restricts SARS-CoV-2 replication by targeting its envelope protein for degradation

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2023年第3期8卷 1175-1185页

作者： zhaolong Li Pengfei Hao Zhilei Zhao Wenying Gao chen Huan Letian Li Xiang chen Hong Wang Ningyi Jin Zhao-Qing Luo Chang Li Wenyan Zhang Departement of Infectious Diseases Infectious Diseases and Pathogen Biology CenterInstitute of Virology and AIDS ResearchKey Laboratory of Organ Regeneration and Transplantation of The Ministry of EducationThe First Hospital of Jilin UniversityChangchunChina Research Unit of Key Technologies for Prevention and Control of Virus Zoonoses Chinese Academy of Medical SciencesChangchun Veterinary Research InstituteChinese Academy of Agricultural SciencesChangchun 130000 JilinChina

The coronavirus disease 2019(COVID-19)pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)has caused a severe global health crisis;its structural protein envelope(E)is critical for viral entry,budding,production,and induction of pathology which makes it a potential target for therapeutics against ***,we find that the E3 ligase RNF5 interacts with and catalyzes ubiquitination of E on the 63rd lysine,leading to its degradation by the ubiquitin-proteasome system(UPS).Importantly,RNF5-induced degradation of E inhibits SARS-CoV-2 replication and the RNF5 pharmacological activator Analog-1 alleviates disease development in a mouse infection *** also found that RNF5 is distinctively expressed in different age groups and in patients displaying different disease severity,which may be exploited as a prognostic marker for ***,RNF5 recognized the E protein from various SARS-CoV-2 strains and SARS-CoV,suggesting that targeting RNF5 is a broad-spectrum antiviral *** findings provide novel insights into the role of UPS in antagonizing SARS-CoV-2 replication,which opens new avenues for therapeutic intervention to combat the COVID-19 pandemic.

关键词： envelope acute respiratory

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许氏平鲉蛋白激酶B(SsAkt)基因的克隆及其mRNA在细菌胁迫后的表达规律

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渔业科学进展 2024年第1期45卷 47-59页

作者：李兆龙王腾腾韩慧宗陈钰臻王斐张明亮孙硕解维俊姜海滨上海海洋大学水产与生命学院上海201306 山东省海洋资源与环境研究院山东烟台264006

为研究蛋白激酶B(Akt)在许氏平鲉(Sebastes schlegelii)应答细菌胁迫过程中的作用,本研究应用PCR技术对许氏平鲉Akt基因(SsAkt)的编码区序列进行了克隆和特征分析,并应用实时荧光定量PCR技术检测了健康许氏平鲉各组织和细菌胁迫后肾脏... 详细信息

为研究蛋白激酶B(Akt)在许氏平鲉(Sebastes schlegelii)应答细菌胁迫过程中的作用,本研究应用PCR技术对许氏平鲉Akt基因(SsAkt)的编码区序列进行了克隆和特征分析,并应用实时荧光定量PCR技术检测了健康许氏平鲉各组织和细菌胁迫后肾脏、血液和肝脏中SsAktm RNA的表达规律。结果显示,SsAkt的开放阅读框(ORF)的长度为1440 bp,编码479个氨基酸,预测其蛋白的相对分子质量为55.80 k Da,理论等电点(p I)为5.64。SMART分析显示,Ss Akt蛋白含有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族的3个特征性保守结构域和2个磷酸化位点。同源比对发现,Ss Akt与鱼类的同源性较高,与尖嘴鲈(Lates calcarifer)的相似度最高,为99.37%。组织表达分析显示,SsAkt在许氏平鲉健康组织(血液、鳃、肝脏、肌肉、肾脏、脾脏、肠、脑和心脏)中均有表达,在肾脏、脑和血液中的相对表达量较高。许氏平鲉响应细菌胁迫的表达结果显示,藤黄微球菌(Micrococcus luteus)感染后,SsAkt在3种组织中的表达明显上调,呈先上升后下降的趋势;鳗弧菌(Vibrio anguillarum)感染后,SsAkt在3种组织中呈现不同的表达趋势:在肾脏中,SsAkt的表达趋势为先上升后下降又上升再下降,而在血液和肝脏中的表达趋势为先上升后下降。以上研究表明,SsAkt响应了外源微生物对许氏平鲉的胁迫,在抵御外源微生物免疫应答过程中发挥重要作用。本研究结果为许氏平鲉的免疫机理研究奠定了基础。

关键词：许氏平鲉蛋白激酶B Akt 基因克隆表达规律

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中医药在新冠肺炎康复治疗应用中的思考与探索

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中国中医急症 2020年第10期29卷 1693-1695,1701页

作者：陈勇陈照龙谢晓梅王洁罗玲任毅贵州中医药大学贵州贵阳550002 重庆市中医院重庆400021

随着对新冠肺炎的临床救治和科学研究的开展,治愈出院人数日渐增加。对于新冠肺炎患者,由于其肺脏受到损伤,肺功能下降,与之相应的劳动能力和运动耐量亦会下降,严重影响生活质量。对于治愈出院的新冠肺炎患者,后期的康复治疗至关重要。... 详细信息

随着对新冠肺炎的临床救治和科学研究的开展,治愈出院人数日渐增加。对于新冠肺炎患者,由于其肺脏受到损伤,肺功能下降,与之相应的劳动能力和运动耐量亦会下降,严重影响生活质量。对于治愈出院的新冠肺炎患者,后期的康复治疗至关重要。本研究就中医药对新冠肺炎患者的康复治疗进行思考与探索。

关键词：新冠肺炎中医药康复治疗

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3D pCASL不同标记后延迟时间评估急性缺血性脑卒中缺血半暗带体积时相对脑血流量阈值的选择

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山东医药 2024年第2期64卷 18-21页

作者：黄川胜郑召龙李芹谢福才陈永升于海童牛庆亮山东中医药大学第一临床医学院济南250014 潍坊市中医院影像中心山东第二医科大学医学影像学院潍坊市第二人民医院影像科

目的探讨三维伪连续动脉自旋标记(3D pCASL)不同标记后延迟时间(PLD)评估急性缺血性脑卒中(AIS)缺血半暗带体积时相对脑血流量(rCBF)阈值的选择。方法对42例AIS患者进行磁共振(MRI)常规序列成像、3D pCASL及动态磁敏感对比增强—磁共... 详细信息

目的探讨三维伪连续动脉自旋标记(3D pCASL)不同标记后延迟时间(PLD)评估急性缺血性脑卒中(AIS)缺血半暗带体积时相对脑血流量(rCBF)阈值的选择。方法对42例AIS患者进行磁共振(MRI)常规序列成像、3D pCASL及动态磁敏感对比增强—磁共振灌注成像(DSC-PWI),将磁共振弥散成像、3D pCASL和DSC-PWI影像数据导入F-stroke软件自动分析,生成3D pCASL和DSC-PWI的缺血半暗带体积。以DSC-PWI的缺血半暗带体积作为参考标准,采用组内相关系数(ICC)分析PLD分别为1 525、2 525 ms时,rCBF0.05)。结论在3D pCASL中,1 525 ms和2 525 ms的PLD均可用于定量评估缺血半暗带,并且不同PLD时的rCBF阈值不同:短PLD(1 525 ms)应选择较高的rCBF阈值(<50%),而长PLD(2 525 ms)的rCBF阈值则要高于短PLD(1 525 ms)。

关键词：三维伪连续动脉自旋标记急性缺血性脑卒中缺血半暗带相对脑血流量

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Genetic Diversity,Population Structure,and Genome-Wide Association Study of Seven Agronomic Traits in 273 Diverse Upload Cotton Accessions

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Phyton-International Journal of Experimental Botany 2023年第12期92卷 3345-3357页

作者： Yajun Liang Juyun Zheng Junduo Wang zhaolong Gong Zhiqiang Li Ling Min Zeliang Zhang Zhiwei Sang Yanying Qu Xueyuan Li Quanjia chen Cash Crops Research Institute of Xinjiang Academy of Agricultural Science(XAAS) UrumqiChina Engineering Research Centre of Cotton of Ministry of Education Xinjiang Agricultural UniversityUrumqiChina R&D Department Adsen Biotechnology CorporationUrumqiChina National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement Huazhong Agricultural UniversityWuhanChina

Upland cotton(Gossypium hirsutum)is the most important plant producing natural fibers for the textile *** this study,we first investigated the phenotypic variation of seven agronomic traits of 273 diverse cotton accessions in the years 2017 and 2018,which were from 18 geographical *** found large variations among the traits in different geographical regions and only half of the traits in either years 2017 or 2018 followed a normal *** then genotyped the collection with 81,612 high quality *** tree and population structure revealed a diverse genetic structure of the core collection,and geographical diversification was an important factor,but account for part of the variances of genetic *** then performed genome-wide association study for the seven traits in the years 2017 and 2018,and the average values of each trait in the two years,*** identified a total of 19 significant marker-trait associations and found that Pollen Ole e 1 allergen/extension could be the candidate gene associated with the fall-off cotton bolls from the last three *** addition,large variations were observed for the heritability of traits in the years 2017 and *** results provide new potential candidate genes for further functional validation,which could be useful for genetic improvement and breeding of new cotton cultivars with better agronomic performances.

关键词： Upland cotton agronomic trait genetic diversity population structure genome-wide association study

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42例合霉素药物疹的初步分析

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中华皮肤科杂志 1963年第3期9卷 168-168页

作者：陈照龙包钢职工医院皮肤科

合霉素药物疹的发生率;1388例接受合霉素治疗的阴静或住院的患者(其中男性973例女性415例男女之比为2.3:1)分析,有42例发生药物疹,占3.3%.

关键词：疹

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寻常痤疮之病因及治疗的近代文献探讨

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中华皮肤科杂志 1958年第1期6卷 55-58页

作者：陈照龙北京中国协和医学院皮肤科

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