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A telomere-to-telomere genome assembly of Zhonghuang 13,a widely-grown soybean variety from the original center of Glycine max

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The Crop Journal 2024年第1期12卷 142-153页

作者： Anqi zhang Tangchao Kong Baiquan Sun Shizheng Qiu Jiahe Guo Shuyong Ruan Yu Guo Jirui Guo zhishuai zhang Yue Liu Zheng Hu Tao Jiang Yadong Liu Shuqi Cao Shi Sun Tingting Wu Huilong Hong Bingjun Jiang Maoxiang Yang Xiangyu Yao Yang Hu Bo Liu Tianfu Han Yadong Wang Center for Bioinformatics School of Computer Science and TechnologyHarbin Institute of TechnologyHarbin 150001HeilongjiangChina Ministry of Agriculture Key Laboratory of Soybean Biology(Beijing) Institute of Crop SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement Institute of Crop SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

Soybean(Glycine max)stands as a globally significant agricultural crop,and the comprehensive assembly of its genome is of paramount importance for unraveling its biological characteristics and evolutionary ***,previous soybean genome assemblies have harbored gaps and incompleteness,which have constrained in-depth investigations into ***,we present Telomere-to-Telomere(T2T)assembly of the Chinese soybean cultivar Zhonghuang 13(ZH13)genome,termed ZH13-T2T,utilizing PacBio Hifi and ONT ultralong *** employed a multi-assembler approach,integrating Hifiasm,NextDenovo,and Canu,to minimize biases and enhance assembly *** assembly spans 1,015,024,879 bp,effectively resolving all 393 gaps that previously plagued the reference *** annotation efforts identified 50,564 high-confidence protein-coding genes,707 of which are ***13-T2T revealed longer chromosomes,421 not-aligned regions(NARs),112 structure variations(SVs),and a substantial expansion of repetitive element compared to earlier ***,we identified 25.67 Mb of tandem repeats,an enrichment of 5S and 48S rDNAs,and characterized their genotypic *** summary,we deliver the first complete Chinese soybean cultivar T2T *** comprehensive annotation,along with precise centromere and telomere characterization,as well as insights into structural variations,further enhance our understanding of soybean genetics and evolution.

关键词： Soybean Telomere-to-Telomere assembly Zhonghuang 13 Structure variations

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血清Irisin、IL-1β及TNF-α对重症肌无力患者危象预测价值

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脑与神经疾病杂志 2024年第1期32卷 22-25页

作者：牟艳春赵雅婷张执帅中国人民解放军联勤保障部队第九七○医院神经内科山东264200

目的探讨血清鸢尾素(Irisin)、白细胞介素-1β (IL-1β)及肿瘤坏死因子-α (TNF-α)对重症肌无力(MG)危象的预测价值。方法选取2019年1月至2022年12月中国人民解放军联勤保障部队第九七〇医院神经内科收治入院的98例MG患者为MG组,根... 详细信息

目的探讨血清鸢尾素(Irisin)、白细胞介素-1β (IL-1β)及肿瘤坏死因子-α (TNF-α)对重症肌无力(MG)危象的预测价值。方法选取2019年1月至2022年12月中国人民解放军联勤保障部队第九七〇医院神经内科收治入院的98例MG患者为MG组,根据是否发生MG危象分为危象组(12例)和非危象组(86例),另选取同期46例健康体检者为对照组。对比各组血清Irisin、IL-1 β、TNF-α水平,分析其与MG病情的相关性。观察血清Irisin、IL-1 β及TNF-α对MG危象的预测价值。结果 MG组血清Irisin水平显著低于对照组,血清IL-1 β及TNF-α水平高于对照组(P<0.05)。Spearman相关性分析显示,血清Irisin水平与MG病情呈负相关,而血清IL-1 β、TNF-α水平与病情严重程度呈正相关(P<0.05)。危象组血清Irisin水平低于非危象组,血清IL-1β、TNF-α水平则高于非危象组(P<0.05)。血清Irisin、IL-1 β及TNF-α联合预测MG危象的曲线下面积为0.895,敏感度为91.7%,特异度为76.7%。结论血清Irisin、IL-1 β及TNF-α水平与MG病情严重程度有关,可作为早期预测MG危象的参考指标。

关键词：重症肌无力危象鸢尾素白细胞介素-1β 肿瘤坏死因子-α

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基于Python爬虫技术的动物检疫信息预警系统

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中国动物检疫 2024年第8期41卷 49-52页

作者：郭家鹏张志帅张栓玲徐霄妍王芳河南省动物检疫总站河南郑州450008 中国动物疫病预防控制中心北京100125

2016年,河南省动物检疫电子出证平台(简称“省平台”)已完成与国家动物检疫大数据平台(简称“国家平台”)的检疫数据对接。然而在指定通道制度实施后,国家平台检疫数据作为畜禽运输车辆查验的最终判定依据,如果省平台与国家平台间数据... 详细信息

2016年,河南省动物检疫电子出证平台(简称“省平台”)已完成与国家动物检疫大数据平台(简称“国家平台”)的检疫数据对接。然而在指定通道制度实施后,国家平台检疫数据作为畜禽运输车辆查验的最终判定依据,如果省平台与国家平台间数据传输延迟,将严重影响指定通道的查验工作。为及时发现数据传输延迟的问题,基于Python爬虫技术开发了动物检疫信息预警系统,系统建成后取得了良好的应用效果,多次成功发挥预警作用,在一定程度上解决了数据传输延迟问题。同时,在辅助执法方面也起到了预警效果。本文介绍了该系统建设的背景、设计思路、系统框架,以及其在辅助执法方面的扩展应用,仅供同行参考。

关键词：兽医动物检疫 python 爬虫预警辅助执法

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Representatives of Chinese NGOs Participated in the 2020 BRICS Civil Society Forum

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International Understanding 2020年第3期 61-62页

作者： zhang zhishuai 无不详 China NGO Network for International Exchanges

The 2020 BRICS Civil Society Forum was held in Moscow,Russia,from September 23 to *** forum is hosted by the Russian BRICS National Committee for Research,with the theme"Promoting BRICS People-to-People Exchanges towa... 详细信息

关键词： BRICS Sustainable Forum

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A telomere-to-telomere genome assembly of Zhonghuang 13,a widely-grown soybean variety from the original center of Glycine max

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The Crop Journal 2024年第1期

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资源保护对景区内农户生计策略选择的影响机制——以广东丹霞山为例

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经济地理 2024年第7期44卷 206-213页

作者：张朝枝李子帅复旦大学旅游学系中国上海200433 中山大学旅游学院中国广东广州510275

文章以广东丹霞山风景区内6个村落为研究对象,通过现场观察和对88位农户的访谈,分析了资源保护背景下农户生计策略选择的影响因素及其作用机制。研究发现:①资源保护对旅游地农户生计策略选择产生显著影响。主要表现为资源保护加强时,... 详细信息

文章以广东丹霞山风景区内6个村落为研究对象,通过现场观察和对88位农户的访谈,分析了资源保护背景下农户生计策略选择的影响因素及其作用机制。研究发现:①资源保护对旅游地农户生计策略选择产生显著影响。主要表现为资源保护加强时,旅游生计策略选择减少,外出务工生计策略选择增加;当资源保护适中时,农户生计相对多元化,传统生计策略选择相对较高。②在资源保护背景下,由于可供选择生计资本有限,家户的生计策略选择更容易受资源保护政策执行程度和农户的个人与家庭情感因素、社会资本等因素影响。③在资源保护背景下,农户的生计策略选择机制与以往DFID的分析框架相比,应该更注重对农户个体及家庭的情感因素、社会资本等因素的考虑。同时,文章关注到脆弱性背景的异质性以及农户生计策略选择影响因素的多样性与动态性,将个人—家庭—社会的关系纳入生计策略分析框架中,有利于更全面地分析居民的生计策略选择机制和指导自然保护地的社区管理实践。

关键词：自然保护地资源保护生计策略情感社会资本

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安钢2~#烧结机降低固体单耗的实践

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冶金丛刊 2014年第6期 30-34页

作者：张志帅安阳钢铁股份有限公司烧结厂河南安阳455004

本次生产实践主要介绍了安钢2#烧结机针对固体单耗较高的突出问题,做出的分析、制定的措施及取得的效果,并对今后的努力方向进行了设想。

关键词：烧结固体单耗降低实践

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供应链视角下电商客户端信息呈现对用户购买意向效应研究

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全国流通经济 2023年第21期 44-47页

作者：张志帅天津理工大学管理学院天津300382

网络用户评价(Online consumer review,OCR)指用户在选择商品或服务项目时,在网上发表的关于公司或产品积极、中性或负面的评价。成为消费者网上购买获得商品资讯的主要途径,网上评论对顾客购买决策有很大作用。和卖家给出的商品信息不... 详细信息

网络用户评价(Online consumer review,OCR)指用户在选择商品或服务项目时,在网上发表的关于公司或产品积极、中性或负面的评价。成为消费者网上购买获得商品资讯的主要途径,网上评论对顾客购买决策有很大作用。和卖家给出的商品信息不同,买家给出的在线评价涵盖了买家对商品属性特点和商品使用感受的描述,具有吸引力和参考价值;购买者通过主动分享消费体验,有效降低了信息不对称、认知风险和不确定性。本文主要检测了在线消费者评论中图片特性对图片有用性影响效应。研究探讨了图片感知吸引力,感知可信赖性,以及感知专长性对图片有用性的影响。研究发现,在线消费者评论中,感知吸引力强的图片被认为用户购买意向更强;感知可信赖性强的图片被认为用户购买意向更强;感知专长性强的图片被认为用户购买意向更强。

关键词：图片评论来源可信度模型购买意向

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多浪羊CNP基因克隆及其在初情期组织表达特性分析

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中国畜牧兽医 2022年第4期49卷 1402-1412页

作者：张志帅隋志远张继虎李庆瑾邢凤塔里木大学动物科学学院阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室阿拉尔843300

【目的】克隆多浪羊C型利钠肽(CNP)基因,并进行生物信息学分析,探讨其在多浪羊初情期启动前后下丘脑、垂体、输卵管、卵巢、子宫中的表达规律,以期为研究CNP基因在多浪羊初情期启动过程中的作用机制提供参考。【方法】参考GeneBank中绵... 详细信息

【目的】克隆多浪羊C型利钠肽(CNP)基因,并进行生物信息学分析,探讨其在多浪羊初情期启动前后下丘脑、垂体、输卵管、卵巢、子宫中的表达规律,以期为研究CNP基因在多浪羊初情期启动过程中的作用机制提供参考。【方法】参考GeneBank中绵羊CNP基因的序列(登录号:XM_027974523.1)设计引物,以初情期前、初情期、初情期后的多浪羊为试验对象,采用RT-PCR技术扩增多浪羊CNP基因并进行克隆测序;用DNAMAN软件同其他物种进行相似性比对,并使用Mega 5.0构建系统发育树。用生物信息学软件分析CNP基因的核苷酸序列及其编码蛋白的疏水性、信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域等理化性质和二级结构、三级结构信息;用实时荧光定量PCR技术检测多浪羊下丘脑、垂体、输卵管、卵巢、子宫中CNP基因的表达量。【结果】多浪羊CNP基因序列大小为2227 bp,其中包括5′-UTR 50 bp、3′-UTR 914 bp和CDS区1263 bp。相似性比对和系统发育树结果显示,多浪羊与山羊的亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远;多浪羊CNP基因共编码420个氨基酸,其编码蛋白是亲水性蛋白质,无跨膜结构域和信号肽。多浪羊CNP蛋白的二级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲;三级结构预测显示CNP蛋白无配体结构;实时荧光定量PCR结果显示,在初情期启动的3个发育阶段,下丘脑中CNP基因表达量显著高于其他组织(P<0.05);初情期下丘脑中CNP基因的表达量显著低于初情期前(P<0.05);子宫中初情期前CNP基因的表达量显著高于初情期和初情期后(P<0.05)。【结论】本研究成功克隆了多浪羊CNP基因,其主要在下丘脑和子宫中表达;在初情期前、初情期、初情期后的发育过程中,下丘脑组织中CNP基因的表达量先降低再升高,提示CNP基因可能在初情期的启动过程中参与调控。

关键词：多浪羊 C型利钠肽基因克隆

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和田羊Lin28B基因启动子区的克隆及序列分析

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四川农业大学学报 2022年第5期40卷 649-655页

作者：隋志远张继虎李庆瑾张志帅张永杰邢凤塔里木大学动物科学与技术学院/新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

【目的】分析和田羊Lin28B基因的启动子序列与结构,为进一步解析其转录调控机制奠定基础。【方法】根据Ensembl数据库中绵羊Lin28B基因5’侧翼区序列,设计PCR引物进行扩增、克隆测序及序列鉴定,得到和田羊Lin28B基因启动子区序列,并利... 详细信息

【目的】分析和田羊Lin28B基因的启动子序列与结构,为进一步解析其转录调控机制奠定基础。【方法】根据Ensembl数据库中绵羊Lin28B基因5’侧翼区序列,设计PCR引物进行扩增、克隆测序及序列鉴定,得到和田羊Lin28B基因启动子区序列,并利用相关生物信息学软件对其进行预测分析。【结果】试验成功获得2 993 bp的和田羊Lin28B基因启动子区序列,GC含量为39.33%;预测了其核心启动子区域,发现在启动子区存在7个潜在的转录起始位点,同时发现了2个TATA-box、2个CpG岛,但未发现CAAT-box;该序列还包含AP-1、Oct-1、p53、Pax-4、STAT3、TGIF等转录因子结合位点。【结论】运用生物信息学软件预测分析和田羊Lin28B基因启动子序列,可为更深入研究Lin28B基因对绵羊初情期的调控机制提供理论基础。

关键词：和田羊 Lin28B基因启动子区序列分析结构预测

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