和田羊Lin28B基因启动子区的克隆及序列分析

作     者：隋志远 张继虎 李庆瑾 张志帅 张永杰 邢凤 SUI Zhiyuan;ZHANG Jihu;LI Qingjin;ZHANG Zhishuai;ZHANG Yongjie;XING Feng

作者机构：塔里木大学动物科学与技术学院/新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 

出 版 物：《四川农业大学学报》 (Journal of Sichuan Agricultural University)

年 卷 期：2022年第40卷第5期

页      面：649-655页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31960655) 

主　　题：和田羊 Lin28B基因 启动子区 序列分析 结构预测 

摘      要：【目的】分析和田羊Lin28B基因的启动子序列与结构,为进一步解析其转录调控机制奠定基础。【方法】根据Ensembl数据库中绵羊Lin28B基因5’侧翼区序列,设计PCR引物进行扩增、克隆测序及序列鉴定,得到和田羊Lin28B基因启动子区序列,并利用相关生物信息学软件对其进行预测分析。【结果】试验成功获得2 993 bp的和田羊Lin28B基因启动子区序列,GC含量为39.33%;预测了其核心启动子区域,发现在启动子区存在7个潜在的转录起始位点,同时发现了2个TATA-box、2个CpG岛,但未发现CAAT-box;该序列还包含AP-1、Oct-1、p53、Pax-4、STAT3、TGIF等转录因子结合位点。【结论】运用生物信息学软件预测分析和田羊Lin28B基因启动子序列,可为更深入研究Lin28B基因对绵羊初情期的调控机制提供理论基础。