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Haplotype-resolved genome assembly and allele- specific gene expression in cultivated ginger

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Horticulture research 2021年第1期8卷 2531-2545页

作者： Shi-Ping Cheng Kai-hua Jia Hui Liu Ren-Gang zhang Zhi-Chao Li Shan-Shan Zhou Tian-Le Shi Ai-Chu Ma Cong-Wen Yu Chan Gao Guang-Lei Cao {2. Zhao Shuai Nie Jing-Fang Guo Si-Qian Jiao Xue-Chan Tian Xue-Mei Yan Yu-Tao Bao Quan-zheng Yun Xin-Zhu Wang Ilga Porth Yousry AEl-Kassaby Xiao-Ru Wang Zhen Li Yves Van de Peer Jian-Feng Mao Pingdingshan University Henan Province Key Laboratory of Germplasm Innovation and Utilization of Eco-economic Woody PlantPingdingshan 467000 HenanChina Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design National Engineering Laboratory for Tree BreedingKey Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental PlantsMinistry of EducationCollege of Biological Sciences and TechnologyBeijing Forestry UniversityBeijing 100083China Ori(Shandong)Gene Science and Technology Co. LtdWeifang 261000 ShandongChina Pingdingshan academy of Agricultural sciences Pingdingshan 467000 HenanChina Department of Ecology and Environmental Science UPSCUmea UniversityUmeaSweden Departement des sciences du Bois et de la Foret Facultede Foresteriede Geographie et GéomatiqueUniversite Laval QuebecQuebecQC G1V 0A6Canada Department of Forest and Conservation sciences Faculty of ForestryUniversity of British ColumbiaVancouverBC V6T 1Z4Canada Department of Plant Biotechnology and Bioinformatics Ghent UniversityGhentBelgium VIB Center for Plant Systems Biology 9052 GhentBelgium Centre for Microbial Ecology and Genomics Department of BiochemistryGenetics and Microbiology GeneticsUniversity of PretoriaPrivate Bag X20Pretoria 0028South Africa College of Horticulture Academy for Advanced Interdisciplinary StudiesNanjing Agricultural UniversityNanjing 210095China

Ginger(Zingiber officinale)is one of the most valued spice plants worldwide;it is prized for its culinary and folk medicinal applications and is therefore of high economic and cultural ***,we present a haplotype-resolved,chromosome-scale assembly for diploid ginger anchored to 11 pseudochromosome pairs with a total length of 3.1 *** structural variation was identified between haplotypes,and two inversions larger than 15Mb on chromosome 4 may be associated with ginger *** performed a comprehensive,spatiotemporal,genome-wide analysis of allelic expression patterns,revealing that most alleles are coordinately *** alleles that exhibited the largest differences in expression showed closer proximity to transposable elements,greater coding sequence divergence,more relaxed selection pressure,and more transcription factor binding site *** also predicted the transcription factors potentially regulating 6-gingerol *** allele-aware assembly provides a powerful platform for future functional genomics,molecular breeding,and genome editing in ginger.

关键词： resolved closer breeding

基于种子植物区系分析的滇中地区路域生态保护研究

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云南民族大学学报（自然科学版） 2021年第3期30卷 224-230页

作者：钱正富江洁侯建伟张伟甄晓云云南楚姚高速公路有限公司云南楚雄675000 楚雄彝族自治州生态环境科学研究所云南楚雄675000 云南利鲁环境建设有限公司云南昆明650041

植物区系的研究是认识和保护区域植物的重要手段之一.通过2.19年对在建楚姚(楚雄至大姚)高速公路红线外延1 000 m范围的植物资源进行实地调查,在系统地整理出评价区维管束植物名录的基础上,开展该高速公路所在区域沿线的植物种类组成及... 详细信息

植物区系的研究是认识和保护区域植物的重要手段之一.通过2.19年对在建楚姚(楚雄至大姚)高速公路红线外延1 000 m范围的植物资源进行实地调查,在系统地整理出评价区维管束植物名录的基础上,开展该高速公路所在区域沿线的植物种类组成及区系特征的统计分析和研究.结果表明:楚姚高速公路沿线共有种子植物118科384属649种,其中裸子植物2.3属4种,被子植物116科3.1属645种;种子植物区系中热带性质科、属占优势,其中热带分布50科、166属,分别占总科数、总属数(不含世界分布科)的68.49%、50.15%,显示了该路域具有区系地理成分复杂多样及与热带区系关系密切的特点.在此基础上,提出了楚姚高速路域植物保护和生态重建的相关建议措施.

关键词：种子植物区系分析地理成分滇中地区

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肾移植大鼠慢性排斥反应模型的建立

南京医科大学学报（自然科学版） 2005年第11期25卷 796-798页

作者：冯宁翰钱立新华立新夏国伟吴军贺伟峰宋宁宏乔迪徐正铨张炜吴宏飞眭元庚南京医科大学第一附属医院泌尿外科肾移植中心江苏南京210029 第三军医大学西南医院全军烧伤研究所重庆400038

目的:建立一种方便、实用的慢性器官移植排斥反应模型,为研究器官移植后慢性排斥反应的发病机制、预防和治疗提供平台。方法:以近交系F344大鼠和近交系Lewis大鼠作为供、受体,取供体的双肾作为供肾,借助静脉支架管,行供体的静脉与受体... 详细信息

目的:建立一种方便、实用的慢性器官移植排斥反应模型,为研究器官移植后慢性排斥反应的发病机制、预防和治疗提供平台。方法:以近交系F344大鼠和近交系Lewis大鼠作为供、受体,取供体的双肾作为供肾,借助静脉支架管,行供体的静脉与受体肾静脉的端端吻合,肾动脉与腹主动脉行端侧吻合。施行原位异体肾移植。移植后即给与环孢素腹腔注射。并于术后4周后行病理检查。结果:所有手术均于60min内完成。所有的受体均存活超过60天,围手术期死亡数为零。受体无急性排斥反应发生。4周后可见典型的慢性排斥反应发生。结论:建立了大鼠慢性排斥反应肾移植模型。为研究慢性排斥反应的发生、进展和干预治疗提供了良好的平台。

关键词：大鼠肾移植模型排斥反应

Analysis of Amino Acids in Houttuynia Cordata Thunb. by High Performance Liquid Chromatography-Diode Array Detector (HPLC-DAD)

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Medicinal Plant 2019年第2期10卷 28-34页

作者： Xuan FENG Zhannan YANG Zhu zheng Juan HU Xiaofang wei Honghao HUO Cheng ZHAO Quling {2. Key Laboratory for Information System of Mountainous Areas and Protection of Ecological Environment of Guizhou Province Guizhou Normal University School of Life sciences Guizhou Normal University

[Objectives] The biologically active compounds of Houttuynia cordata Thunb. as a medicinal and edible plant are well documented. However, amino acid as an important indicator of the value of H. cordata is little reported. [Methods] Amino acids of the H. cordata were analysed by pre-column derivatization with 2.4-dinitrochlorobenzne(CDNB) coupled to HPLC/DAD. The optimized conditions of the amino acids derivatized by CDNB were followed: 110 ℃ of hydrolysis temperature, 1∶12.of the equivalent proportion between amino acid and CDNB, 80 min of derivatization reaction time and 80 ℃ of derivatization reaction temperature. The method was used to determine the amino acids of H. cordata samples from 11 different geographical sites in Guizhou. [Results] The results suggested that the contents of 17 amino acids were quite variable at different H. cordata samples. [Conclusions] This study will provide a basis for the quality evaluation of H. cordata nutrition.

关键词： Houttuynia cordata Thunb. Amino acid High performance liquid chromatography Medicinal plant

“国土空间”内涵辨析与国土空间规划编制建议

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自然资源学报 2021年第9期36卷 2219-2247页

作者：郝庆彭建魏冶王丰龙姚华松李禕王伟张书海邓玲赵雲泰马学广戈大专戴俊骋朱鹤张茂鑫中国社会科学院生态文明研究所北京100006 北京大学城市与环境学院北京100871 东北师范大学地理科学学院长春130024 华南师范大学地理科学学院广州510631 广州大学公共管理学院广州510006 河海大学公共管理学院南京211000 中央财经大学政府管理学院北京100081 中国人民大学公共管理学院北京100872 中国自然资源经济研究院北京101149 中国国土勘测规划院北京100035 中国海洋大学国际事务与公共管理学院青岛266100 南京师范大学地理科学学院南京210023 中央财经大学文化经济研究院北京100081 中国科学院地理科学与资源研究所北京100101 浙江大学土地与国家发展研究院杭州310058

科学辨析"国土空间"概念内涵是推进国土空间规划编制、完善国土空间规划理论的前提。应根据国土空间治理需求变化和学科理论发展需要,及时更新完善对"国土空间"的理解。本刊邀请15位青年学者研讨"国土空间"的概念内涵及国土空间规划编... 详细信息

科学辨析"国土空间"概念内涵是推进国土空间规划编制、完善国土空间规划理论的前提。应根据国土空间治理需求变化和学科理论发展需要,及时更新完善对"国土空间"的理解。本刊邀请15位青年学者研讨"国土空间"的概念内涵及国土空间规划编制建议,主要观点如下:(1)国土空间是复杂的人地耦合系统,具有构成要素多元性、时空尺度嵌套性等特征。需要用山水林田湖草沙是一个生命共同体的思维,进行国土空间的综合开发利用与系统修复保护,提出基于自然的空间治理方案。(2.国土空间是"流"所构建的网络空间,是不同利益主体组成的关系空间和为精细化治理服务的可计算领域。需要通过"流空间"进行国土空间的整合,推动区域之间资源和要素的共享,实现协同发展;也需要重视人地关系和人际关系的重构,协调多元主体的利益诉求,实现和谐发展;还需要完善国土空间开发管控的技术手段,平衡国土空间规划中的灵活性与统一性矛盾。(3)国土空间是有温度的空间。需要充分感知国土空间的风险性、适宜性、约束性、可达性,编制"以人民为中心"的国土空间规划,提升国土空间的人文关怀、生态功能和美学价值。(4)国土空间是国土空间规划和空间治理的对象,是具体的海洋空间、乡村空间、文化空间等,具有载体属性、资产属性、权利属性等,需要在国土空间规划中实现资源资产统一管理,彰显其经济价值、社会价值和生态价值,满足高质量发展和高品质生活对国土空间的多样化需求。

关键词：国土空间国土空间规划空间治理人地耦合系统

水分和CO_2.度对冬小麦气孔特征、气体交换参数和生物量的影响

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作物学报 2018年第10期44卷 1570-1576页

作者：武海霞郭丽丽郝立华张浩王清涛程东娟彭正萍李菲张茜茜李树彬徐明郑云普河北工程大学水利水电学院河北邯郸056038 邯郸学院生命科学与技术学院河北邯郸056005 河北工程大学园林与生态工程学院河北邯郸056038 河北农业大学资源与环境科学学院河北保定071001 邯郸市漳滏河灌溉供水管理处河北邯郸056002 中国科学院地理科学与资源研究所生态系统网络观测与模拟重点实验室北京100101 中国科学院大学环境与资源学院北京100039

利用可精准控制CO_2.度([CO_2.)的大型人工气候室,研究了水分亏缺和[CO_2.升高对冬小麦气孔特征、气体交换参数及生物量的影响。结果表明,水分亏缺导致冬小麦气孔开度减小和气孔空间分布的规则程度降低,提高[CO_2.能够减缓水分亏缺时... 详细信息

利用可精准控制CO_2.度([CO_2.)的大型人工气候室,研究了水分亏缺和[CO_2.升高对冬小麦气孔特征、气体交换参数及生物量的影响。结果表明,水分亏缺导致冬小麦气孔开度减小和气孔空间分布的规则程度降低,提高[CO_2.能够减缓水分亏缺时气孔开度和气孔分布规则程度的下降幅度。与充分灌溉相比,不同水分亏缺条件下冬小麦的净光合速率、气孔导度和蒸腾速率均显著降低(P2.仅可缓解轻度亏水对气体交换过程的影响,该缓解能力随水分亏缺程度的加剧而降低。水分亏缺降低冬小麦生物量,但[CO_2.升高对水分亏缺时生物量产生的影响不显著(P>0.05)。水分亏缺条件下,冬小麦通过调整气孔开度和气孔空间分布格局改变叶片的气体交换效率,[CO_2.升高对冬小麦产生的"施肥效应"受土壤水分条件的限制。

关键词： CO2.度倍增水分亏缺冬小麦生物量气孔特征气体交换参数

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不同施肥措施对天然生胶性能的影响

中国土壤与肥料 2023年第12期 158-164页

作者：张凌霄李云赵家连茶正早杨红竹林清火郭澎涛黄艳艳罗微刘海林陈培花海南大学生态与环境学院海南儋州571700 中国热带农业科学院橡胶研究所海南海口570101 勐腊金色橡胶有限公司云南勐腊666303 云南农业大学热带作物学院云南普洱665099

施肥是影响天然橡胶性能的重要因素之一,研究不同施肥措施调控天然生胶性能对于指导生产具有重要意义。选用成龄橡胶树,设置不施肥对照以及氮磷钾肥、有机肥、氮磷钾肥+有机肥、氮磷钾肥+有机肥+镁锌硼肥4种不同的施肥措施,通过探讨不... 详细信息

施肥是影响天然橡胶性能的重要因素之一,研究不同施肥措施调控天然生胶性能对于指导生产具有重要意义。选用成龄橡胶树,设置不施肥对照以及氮磷钾肥、有机肥、氮磷钾肥+有机肥、氮磷钾肥+有机肥+镁锌硼肥4种不同的施肥措施,通过探讨不同施肥措施对天然橡胶生胶特性的影响,为天然橡胶生产提供参考依据。研究结果表明,4种施肥措施均能提升生胶中的氮含量(12.)、塑性保持率(7%)和可塑性;氮磷钾肥在施肥初期降低了门尼黏度(17%),提高了生胶的可塑性;有机肥在施肥初期的门尼黏度高于对照2.%,即提高了生胶分子量;氮磷钾肥+有机肥利于维持氮含量和杂质含量的稳定性;氮磷钾肥+有机肥+镁锌硼肥有利于保持生胶氮含量、挥发分含量、灰分含量以及塑性初值的一致性。综上所述,4种施肥措施中有机肥、氮磷钾肥+有机肥较为优秀,其次为氮磷钾肥,而氮磷钾肥+有机肥+镁锌硼肥则较差。

关键词：天然橡胶施肥措施有机肥塑性保持率塑性初值

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作物野生近缘种的原生境保护

植物遗传资源学报 2019年第5期20卷 1103-1109页

作者：郑晓明陈宝雄宋玥李飞王君瑞乔卫华张丽芳程云连孙玉芳杨庆文中国农业科学院作物科学研究所北京100081 农业农村部农业生态与资源保护总站北京100125

作物野生近缘种是作物种质创新和品种改良的天然基因库,全球30%的作物增产得益于野生近缘种在作物育种中的利用。然而,由于生境破坏和污染、资源过度利用、盲目引种和气候变化等导致大量自然群体消失和群体遗传多样性丧失,对作物野生近... 详细信息

作物野生近缘种是作物种质创新和品种改良的天然基因库,全球30%的作物增产得益于野生近缘种在作物育种中的利用。然而,由于生境破坏和污染、资源过度利用、盲目引种和气候变化等导致大量自然群体消失和群体遗传多样性丧失,对作物野生近缘种的繁衍和进化形成了严重威胁。原生境保护是在自然条件下对作物野生近缘种及其生态环境进行保护,维持其进化潜力,保护物种与环境互作的进化过程,是保护作物野生近缘种的重要途径之一。本文在分析国内外原生境保护政策和技术手段的基础上总结了作物野生近缘种原生境保护技术路线,综述了国内外对作物野生近缘种的原生境保护进展,并基于中国国情提出了作物野生近缘种存在的问题,探讨了未来作物野生近缘种原生境保护和野生近缘种可持续利用的发展方向和工作重点,强调把基因组、表型组和环境因子相关大数据与作物野生近缘种保护、研究和利用紧密结合,为作物野生近缘种的有效保护和高效利用提供强有力的理论和信息支撑。

关键词：作物野生近缘种原生境保护多样性

Charge-changing cross section measurements of 300 MeV/nucleon^(2.)Si on carbon and data analysis

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中国物理C:英文版 2023年第8期47卷 13-21页

作者：王长建郭戈王惠仁宋雨楠孙保华谷畑勇夫寺嶋知魏秀琳徐俊瑶徐晓栋张寂潮郑勇竺礼华曹勇樊广伟高丙水韩加星李光帅鲁辰桂齐浩天秦赟孙志宇万鲁平王凯龙王世陶王昕旭张湄雪张文文张小彬章学恒周子铖 School of Physics Beihang UniversityBeijing 100191China institute of Modern Physics Chinese Academy of SciencesLanzhou 730000China School of Nuclear Science and Technology University of Chinese Academy of SciencesBeijing 100049China School of Chemical Engineering Anhui University of Science and TechnologyHuainan 232001China

Charge-changing cross section(σcc)measurements via the transmission method have recently seen significant progress with the aim of determining the charge radii of exotic *** this work,we report a newσcc measurement of 304(9)MeV/nucleon^(2.)Si on carbon at the second Radioactive Ion Beam Line in Lanzhou(RIBLL2.and describe the data analysis procedure in *** procedure is essential for evaluating the systematic uncertainty in the transmission *** determinedσcc of 112.(11)mb is found to be consistent with the existing data at similar *** present work will serve as a reference forσcc determinations at RIBLL2.

关键词： projectile fragmentation transmission method charge-changing cross section particle identi-fication