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Analysis of Synonymous Codon Usage Bias in Chlamydia

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Acta Biochimica et Biophysica Sinica 2005年第1期37卷 1-10页

作者： Hui L(?) Wei-Ming ZHAO~* Yan zheng hong WANG mei QI Xiu-Ping YU Department of Medical Microbiology,School of Medicine,Shangdong University,Jinan 250012,China Department of Medical Microbiology School of Medicine Shandong University Jinan 250012 China.

Chlamydiae are obligate intracellular bacterial pathogens that cause ocular and sexuallytransmitted diseases,and are associated with cardiovascular *** analysis of codon usage mayimprove our understanding of the evolution and pathogenesis of Chlamydia and allow reengineering of targetgenes to improve their expression for gene ***,we analyzed the codon usage of ***,***(here indicating biovar trachoma and LGV),***,and *** using the codonusage database and the CUSP(Create a codon usage table)program of EMBOSS(The European MolecularBiology Open Software Suite).The results show that the four genomes have similar codon usage patterns,with a strong bias towards the codons with A and T at the third codon *** with Homosapiens,the four chlamydial species show discordant seven or eight preferred *** ENC(effectivenumber of codons used in a gene)-plot reveals that the genetic heterogeneity in Chlamydia is constrained bythe G+C content,while translational selection and gene length exert relatively weaker ***,mutational pressure appears to be the major determinant of the codon usage variation among the *** addition,we compared the codon preferences of *** with those of ***,yeast,adenovirus and Homo *** are 23 codons showing distinct usage differences between *** ***,24 between *** and adenovirus,21 between *** and Homo sapiens,butonly six codons between *** and ***,the yeast system may be more suitable for theexpression of chlamydial ***,we compared the codon preferences of *** with those ofsix eukaryotes,eight prokaryotes and 23 *** is a strong positive correlation between the differ-ences in coding GC content and the variations in codon bias(r=0.905,P<0,001).We conclude that thevariation of codon bias between *** and other organisms is much less influenced b

关键词： Chlamydia codon usage bias GC content gene expression

Expression and semi-quantification of hepatitis B virus reverse transcriptase protein in a prokaryotic system

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Journal of Microbiology and Immunology 2006年第3期4卷 189-193页

作者： CHAO ZHAO YONG XIANG WANG zheng hong YUAN YU mei WEN Key Laboratory of Medical Molecular Virology Institute of Medical Microbiology Shanghai Medical College Fudan University Shanghai P. R. China

The reverse transcriptase （RT） protein of hepatitis B virus （HBV） has been successfully expressed by recombinant technology in Eschericahia coli （ E. coli ）. In this study we aimed to develop a semi-quantitative assay for the study of HBV RT protein using this system. Complete HBV polymerase gene from a wild type virus （rt306P） and the polymerase gene from a mutant, with rt306P substituted by serine （rtP306S） were separately fused to the maltose binding protein （MBP） gene and expressed in E. coli respectively. The expression levels of HBV polymerase genes from the wild type virus and its counterpart mutant at rt306 were compared. When these proteins were semi-quantified by Westem blotting using rabbit anti-TP serum, the rtP306S mutant showed decreased expression of MBP-HBV polymerase. By this method, we have shown that the expression level of HBV RT could be affected by substitutions in its amino acid sequences, and this method could be used to study the characteristics of HBV RT protein.

关键词： Hepatitis B virus DNA polymerase expression Mutants

Effect of a Carbon Fibre-steel Fibre-graphite Conductive Filler on the Electrothermal Properties of Cementitious Materials

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Journal of Wuhan University of Technology(Materials Science) 2025年第1期40卷 141-151页

作者： FAN Yanan WEI hong zheng hongyong DU hongxiu Department of Architecture and Environmental Engineering Taiyuan UniversityTaiyuan 030032China College of Civil Engineering Taiyuan University of TechnologyTaiyuan 030032China

Carbon fibre,steel fibre and graphite were used as conductive fillers to prepare cementitious materials with excellent electrothermal *** electrically conductive cementitious materials with different volume dosages were analysed through compressive and flexural strength,electrochemical impedance spectroscopy and temperature rise *** equivalent circuit model was established to study the electrically conductive heat generation mechanism in the electrically conductive cementitious *** results indicate that the mechanical properties of cementitious composite materials with a ternary conductive phase are better than those of pristine cementitious materials because the fibrous filler improves their mechanical ***,the incorporation of graphite in the material reduces its *** fibrous and point-like conductive phase materials into the cementitious material enhances the overall conductive pathway and considerably reduces the electrical resistance of the cementitious material,enhancing its conductive *** volume ratios of carbon fibre,steel fibre and graphite that achieve an optimal complex doping in the cementitious material were 0.35%,0.6%and 6%,*** was determined using the mutation point of each circuit element parameter as the percolation *** addition,at a certain safety voltage,there is a uniform change between the internal and surface temperatures of the conductive cementitious material,and the heating effect in this materialis is considerably better than that in the pristine cementitious material.

关键词： cementitious composites conductive fillers electrothermal properties electrochemical impedance spectroscopy

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美国OTC多层次市场的发展和借鉴

特区经济 2007年第8期 120-121页

作者：郑红梅深圳职业技术学院经济系广东深圳518055

美国OTC资本市场数量众多、层次多样,为不同规模、不同需求的企业提供了利用资本市场进行股权融资,获得发展的机会。本文介绍了美国OTC资本市场发展和分层现状,从上市范围、上市标准、信息披露、监管、交易制度以及上市成本等方面对美... 详细信息

美国OTC资本市场数量众多、层次多样,为不同规模、不同需求的企业提供了利用资本市场进行股权融资,获得发展的机会。本文介绍了美国OTC资本市场发展和分层现状,从上市范围、上市标准、信息披露、监管、交易制度以及上市成本等方面对美国不同层次的OTC市场进行了比较分析,最后总结了美国OTC资本市场的一些共性特点和启发。

关键词：场外市场粉红单市场场外电子公告板纳斯达克

深圳农村城市化探析——农民、准市民、市民的角色转换

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特区经济 2005年第6期 145-146页

作者：郑红梅深圳职业技术学院经济系

深圳经过20多年的发展,工业化程度较高,农村城市化进程很快.1980年刚建立深圳经济特区时,城市人口仅1万人,农村人口为30万人,城市和农村的人口比例为1:30,城区面积也仅3km2.随着深圳经济社会的发展,工业化水平得到提高,经济结构已经基... 详细信息

深圳经过20多年的发展,工业化程度较高,农村城市化进程很快.1980年刚建立深圳经济特区时,城市人口仅1万人,农村人口为30万人,城市和农村的人口比例为1:30,城区面积也仅3km2.随着深圳经济社会的发展,工业化水平得到提高,经济结构已经基本实现了由第一产业为主转变为以第二产业和第三产业为主.2003年底,深圳城镇人口比重为92.46%,三大产业产值比重为0.6:58.9:40.5,从业人员数量比例为1:57:42.1992年,特区内的罗湖、福田、南山的173个自然村的4万农民改变身份成为城镇居民,完成了深圳的第一次城市化进程.2003年10月,深圳市第二次城市化进程全面提速,到2004年底,宝安、龙岗两地的18个镇218个村27万农民全部改变农民身份,深圳率先在全国成为'无农民无农村'的城市.深圳农民的市民化改革速度惊人,效果显著,表现出许多不同于其他省市城市化的特征.特别是第二次农民市民化只用了短短的一年时间,这种惊人的速度给人一种无法借鉴和效仿的感觉.本文拟通过对深圳农民市民化角色转变的特征分析,探求深圳城市化进程高效性的内在动因,从而为我国其他地方的农民市民化提供借鉴和启迪.

关键词：深圳市农村城市化市民准市民农民生活方式

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碳交易背景下中国华北地区碳代谢格局变化

环境科学 2024年第2期45卷 732-743页

作者：郑宏媚沈方许光耀关欣唐山师范学院资源管理系唐山市城市生态系统低碳转型仿真模拟及监测重点实验室唐山063000 华北理工大学艺术学院唐山063000

碳排放权交易市场作为推进美丽中国建设、实现降碳减污绿色发展的重要手段,成为当前研究的热点问题.为探究碳交易背景下华北地区试点区域及非试点区域碳代谢过程,以城市碳代谢理论为依据,采取投入产出分析和生态网络分析相结合的研究方... 详细信息

碳排放权交易市场作为推进美丽中国建设、实现降碳减污绿色发展的重要手段,成为当前研究的热点问题.为探究碳交易背景下华北地区试点区域及非试点区域碳代谢过程,以城市碳代谢理论为依据,采取投入产出分析和生态网络分析相结合的研究方法.结果表明,北京和天津作为早期交易试点区域,区域从2012年后呈现直接碳排放量稳步下降、隐含碳排放量缓慢增加趋势.试点产业部门直接排放量与隐含排放量变化趋势一致,其中煤炭开采和洗选业、石油和天然气开采业和非金属矿物制品业减排效应明显,而排放量较高的电力、热力的生产和供应业表现为增加趋势.部门隐含碳排放强度与隐含碳排放量变化趋势相似证实部门隐含增加值在交易过程中并未增加.高碳排放部门的隐含碳排放量主要由长度小于6的代谢路径所贡献,因此应重点关注部门间较短路径传递的商品或服务的“清洁化”.在交易政策实施以前,区域产业部门间跨区域贸易较少,表现为低碳排放产品交换;2012年以后,随着京津冀城市群协同发展以及华北地区不断构筑的区域经济发展新格局,促使区域间跨区域和跨部门贸易增加.以碳排放权交易制度为背景,构建识别系统内关键参与者及关键路径的方法体系,可为区域性政策实施及可持续发展提供科学的发展建议.

关键词：城市生态学碳代谢碳交易时空格局华北地区

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射血分数保存心力衰竭的诊治进展

中国实用内科杂志 2017年第10期37卷 929-933页

作者：郑红梅崔炜河北医科大学第二医院心内一科河北石家庄050000

射血分数保存的心力衰竭（HFpEF）又称为舒张性心力衰竭，目前认为本病是由于左心室舒张期主动松弛能力受损和心室顺应性减低，导致左心室舒张期充盈受损、心搏量减少及左心室舒张末压增高而发生的心力衰竭。本文综述了HFpEF的特点、诊... 详细信息

射血分数保存的心力衰竭（HFpEF）又称为舒张性心力衰竭，目前认为本病是由于左心室舒张期主动松弛能力受损和心室顺应性减低，导致左心室舒张期充盈受损、心搏量减少及左心室舒张末压增高而发生的心力衰竭。本文综述了HFpEF的特点、诊断新标识及治疗进展。

关键词：射血分数保存的心力衰竭诊断治疗

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余弦光栅硅薄膜太阳能电池光吸收分析

光子学报 2017年第4期46卷 41-47页

作者：陈科吴睿郑红梅汪园园合肥工业大学机械工程学院安徽省数字化设计与制造重点实验室合肥230009

设计了一维双层余弦共形光栅结构的单晶硅薄膜太阳能电池.利用时域有限差分法模拟计算了双层余弦共形光栅结构和对照组结构的吸收光谱;利用归一化光吸收密度的概念,定量分析了300~700nm和700~1 100nm两个波段的光吸收效率.结果表明双层... 详细信息

设计了一维双层余弦共形光栅结构的单晶硅薄膜太阳能电池.利用时域有限差分法模拟计算了双层余弦共形光栅结构和对照组结构的吸收光谱;利用归一化光吸收密度的概念,定量分析了300~700nm和700~1 100nm两个波段的光吸收效率.结果表明双层共形光栅结构具有更好的全波段吸收效率,且在长波段余弦光栅比矩形光栅具有更好的光捕获和吸收作用.利用光吸收增强谱和电磁场强度分布图,分析了余弦光栅在长波段的吸收增强机理.通过计算短路电流密度,发现双层余弦共形光栅结构比平板结构太阳能电池的短路电流密度提高了79.5%,余弦光栅结构比矩形光栅结构的短路电流密度提高了8.5%.

关键词：光电子学光吸收时域有限差分法余弦光栅硅薄膜太阳能电池短路电流密度

机器人六维腕力传感器标定方法和标定装置的研究

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计量学报 2005年第1期26卷 43-45,85页

作者：郑红梅刘正士王勇合肥工业大学机械与汽车工程学院安徽合肥230009

通过对机器人六维腕力传感器系统的各种标定方法的分析讨论,说明了应采用阶跃响应的方法来对它的动态性能进行标定。从矩形脉冲频谱对系统传递函数影响的角度,说明了为减少矩形脉冲频谱对传递函数标定曲线的干扰,应使阶跃激励开始时刻... 详细信息

通过对机器人六维腕力传感器系统的各种标定方法的分析讨论,说明了应采用阶跃响应的方法来对它的动态性能进行标定。从矩形脉冲频谱对系统传递函数影响的角度,说明了为减少矩形脉冲频谱对传递函数标定曲线的干扰,应使阶跃激励开始时刻前的采样点数为零。新设计的实验方法和实验装置便于测出标定中使用的激励信号,通过数据采样系统的"软触发"功能,准确抓取到阶跃开始时刻,减少了干扰。同时,在该实验台上加载所使用的定滑轮数量较少,也有效地减小了标定误差。

关键词：计量学六维腕力传感器动态标定阶跃响应软触发