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REDH:A database of RNA editome in hematopoietic differentiation and malignancy

Chinese Medical Journal 2024年第3期137卷 283-293页

作者： Jiayue Xu Jiahuan He Jiabin Yang Fengjiao Wang Yue Huo yuehong guo Yanmin Si Yufeng Gao Fang Wang Hui Cheng Tao Cheng Jia Yu Xiaoshuang Wang Yanni Ma State Key Laboratory of Common Mechanism Research for Major Diseases Haihe Laboratory of Cell EcosystemInstitute of Basic Medical SciencesChinese Academy of Medical SciencesBeijing 100005China Key Laboratory of RNA and Hematopoietic Regulation Chinese Academy of Medical SciencesBeijing 100005China Department of Biochemistry and Molecular Biology Chinese Academy of Medical SciencesSchool of Basic Medicine Peking Union Medical CollegeBeijing 100005China State Key Laboratory of Experimental Hematology National Clinical Research Center for Blood DiseasesInstitute of Hematology and Blood Diseases HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeTianjin 300020China Institute of Blood Transfusion Chinese Academy of Medical SciencesChengduSichuan 610052China

Background:The conversion of adenosine(A)to inosine(I)through deamination is the prevailing form of RNA editing,impacting numerous nuclear and cytoplasmic transcripts across various eukaryotic *** of high-confidence RNA editing sites have been identified and integrated into various RNA databases,providing a convenient platform for the rapid identification of key drivers of cancer and potential therapeutic ***,the available database for integration of RNA editing in hematopoietic cells and hematopoietic malignancies is still ***:We downloaded RNA sequencing(RNA-seq)data of 29 leukemia patients and 19 healthy donors from National Center for Biotechnology Information(NCBI)Gene Expression Omnibus(GEO)database,and RNA-seq data of 12 mouse hematopoietic cell populations obtained from our previous research were also *** performed sequence alignment,identified RNA editing sites,and obtained characteristic editing sites related to normal hematopoietic development and abnormal editing sites associated with hematologic ***:We established a new database,"REDH",represents RNA editome in hematopoietic differentiation and *** is a curated database of associations between RNA editome and *** integrates 30,796 editing sites from 12 murine adult hematopoietic cell populations and systematically characterizes more than 400,000 edited events in malignant hematopoietic samples from 48 cohorts(human).Through the Differentiation,Disease,Enrichment,and knowledge modules,each A-to-I editing site is systematically integrated,including its distribution throughout the genome,its clinical information(human sample),and functional editing sites under physiological and pathological ***,REDH compares the similarities and differences of editing sites between different hematologic malignancies and healthy ***:REDH is accessible at http://***/.This user-friendly database

关键词： RNA editing Hematopoietic differentiation Hematopoietic malignancy Database management systems

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疑诊原发性甲状旁腺功能亢进症的患者术前^(99m)Tc-MIBI SPECT/CT显像结果的影响因素分析

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首都医科大学学报 2024年第1期45卷 31-35页

作者：郭月红黄京伟张腾杨敏福首都医科大学附属北京朝阳医院核医学科北京100020

目的探讨疑诊原发性甲状旁腺功能亢进症(primary hyperparathyroidism,PHPT)的患者术前^(99m)Tc-甲氧基异丁基异腈(methoxyisobutylisonitrile,MIBI)单光子发射计算机断层扫描/计算机断层扫描(single-photon emission computed tomography/computed tomography,SPECT/CT)(以下简称MIBI SPECT/CT)显像结果的影响因素。方法将2019年1月至2023年8月于首都医科大学附属北京朝阳医院疑诊PHPT并在术前完善甲状旁腺MIBI SPECT/CT显像的257例患者作为研究对象。比较MIBI SPECT/CT显像阳性组和阴性组的实验室检查、病理特征及影像特征。采用多因素Logistic回归分析MIBI SPECT/CT显像结果的影响因素。结果单因素分析显示,与阴性组相比,血清总钙、血清甲状旁腺激素(parathyroid hormone,PTH)、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)水平在阳性组显著升高(P<0.05);病灶的病理类型、最大径、体积及位置在两组间差异有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,术前血清PTH水平、病灶病理类型、位置及最大径与MIBI SPECT/CT显像结果阳性显著相关(P<0.05)。结论疑诊PHPT患者术前MIBI SPECT/CT显像结果受多重因素影响,术前血清PTH水平、病灶病理类型、位置及最大径是MIBI SPECT/CT显像结果的独立影响因素。

关键词：原发性甲状旁腺功能亢进症(PHPT) ^(99m)Tc-甲氧基异丁基异腈(MIBI) SPECT/CT

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效率医疗背景下的全程护理模式对前列腺癌根治术患者的影响

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国际医药卫生导报 2024年第9期30卷 1570-1574页

作者：金荷莲冯宁翰过月红无锡市第二人民医院(江南大学附属中心医院)南院A6泌尿外科无锡214000

目的探讨效率医疗背景下的全程护理模式对前列腺癌根治术患者并发症和生理功能的影响。方法开展前瞻性随机对照试验。选取2021年3月至2022年3月于无锡市第二人民医院接受前列腺癌根治术的126例患者作为研究对象,按照随机数字表法分为两... 详细信息

目的探讨效率医疗背景下的全程护理模式对前列腺癌根治术患者并发症和生理功能的影响。方法开展前瞻性随机对照试验。选取2021年3月至2022年3月于无锡市第二人民医院接受前列腺癌根治术的126例患者作为研究对象,按照随机数字表法分为两组,各63例。对照组年龄(52.34±4.47)岁,病程(8.56±3.46)个月,采用常规护理模式;观察组年龄(50.78±5.25)岁,病程(8.14±3.62)个月,采用以效率医疗为背景的全程护理模式。对比两组患者康复指标、并发症发生率、生理功能[采用国际勃起功能问卷表-5(IIEF-5)对患者术前、术后1个月及3个月勃起功能进行评估]及护理前后生活质量[采用健康调查量表36(SF-36)评估]。统计学方法采用t检验、χ^(2)检验。结果观察组首次排气时间、首次进食时间、首次下床时间以及住院时间均短于对照组[(22.87±4.62)d比(37.58±4.24)d、(4.65±1.68)d比(6.88±1.03)d、(2.53±1.09)d比(5.36±1.23)d、(8.65±2.15)d比(15.78±2.68)d],差异均有统计学意义(t=18.619、8.982、13.668、16.471,均P0.05);术后1个月、3个月,观察组IIEF-5评分均高于对照组[(13.14±3.68)分比(9.98±4.25)分、(18.22±4.31)分比(11.54±3.93)分],差异均有统计学意义(t=4.461、9.090,均P0.05);护理后,观察组身体功能、情感角色、社会功能、心理健康、身体角色、一般健康、身体疼痛、活力评分均高于对照组[(61.67±10.36)分比(55.98±11.68)分、(73.24±12.38)分比(66.20±14.36)分、(67.29±16.46)分比(61.01±12.23)分、(79.13±9.41)分比(72.01±9.10)分、(66.85±13.15)分比(59.42±15.48)分、(63.78±11.42)分比(57.21±9.16)分、(73.45±11.40)分比(63.21±15.46)分、(81.97±12.46)分比(74.43±14.14)分],差异均有统计学意义(t=2.639、2.947、2.431、4.317、2.903、3.562、4.231、3.100,均P<0.05)。结论采用以效率医疗为背景的全程护理模式,前列腺癌根治术患者恢复期缩短,并发症发生率减少,术后勃起功能有所改善,同时提高患者生活质量。

关键词：前列腺癌全程护理模式效率医疗并发症生理功能

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Studies on biomechanics of skeletal muscle based on the working mechanism of myosin motors:An overview

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Chinese Science Bulletin 2012年第30期57卷 4533-4544页

作者： YIN yuehong guo Zhao CHEN Xing FAN YuanJie State Key Laboratory of Mechanism System and Vibration Institute of RoboticsShanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China

Skeletal muscle is the source of human body *** scholars have been studying in this field to reveal its contraction mechanism,and relevant achievements have been awarded the Nobel *** paper reviewed the current researches on biomechanics of skeletal muscle,and concluded two strategies(top-down and bottom-up methods) for the biomechanical research of skeletal ***,this paper generalized two major aspects of muscle research:(1) the multi-force coupling mechanism and the collective operation mechanism of molecular motors;(2) the bioelectrochemical driving and control principium of muscle *** discussed the solution for experimental verification and induced a novel idea to study the biomechanics of skeletal muscle based on the microscopic working mechanism of molecular motor,which is the origin of muscle *** we analyzed the disadvantages in existent researches and explored future directions that need further studies.

关键词：工作机制生物力学分子马达骨骼肌肌球蛋白诺贝尔文学奖收缩原理生物电化学

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KHSRP combines transcriptional and posttranscriptional mechanisms to regulate monocytic differentiation

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Blood Science 2022年第3期4卷 103-115页

作者： Jiayue Xu Dongsheng Wang Hongliu Ma Xueying Zhai Yue Huo Yue Ren Weiqian Li Le Chang Dongxu Lu yuehong guo Yanmin Si Yufeng Gao Xiaoshuang Wang Yanni Ma Fang Wang Jia Yu State Key Laboratory of Medical Molecular Biology Haihe Laboratory of Cell EcosystemInstitute of Basic Medical SciencesChinese Academy of Medical SciencesSchool of Basic Medicine Peking Union Medical CollegeBeijing 100005China Key Laboratory of RNA and Hematopoietic Regulation Chinese Academy of Medical SciencesBeijing 100005China Department of Clinical Laboratory Sichuan Cancer Hospital and InstituteSichuan Cancer CenterSchool of MedicineUniversity of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu 610041China Department of Gynecology Dian Jiang People’s Hospital of Chong QingChongqing 408300China Medical Epigenetic Research Center Chinese Academy of Medical SciencesBeijing 100005China

RNA-binding proteins(RBPs)are widely involved in the transcriptional and posttranscriptional regulation of multiple biological *** transcriptional regulatory ability of RBPs was indicated by the identification of chromatin-enriched RBPs(Che-RBPs).One of these proteins,KH-type splicing regulatory protein(KHSRP),is a multifunctional RBP that has been implicated in mRNA decay,alternative splicing,and miRNA biogenesis and plays an essential role in myeloid differentiation by facilitating the maturation of *** this study,we revealed that KHSRP regulates monocytic differentiation by regulating gene transcription and RNA ***-occupied specific genomic sites in promoter and enhancer regions to regulate the expression of several hematopoietic genes through transcriptional activation and bound to pre-mRNA intronic regions to modulate alternative splicing during monocytic *** note,KHSRP had co-regulatory effects at both the transcriptional and posttranscriptional levels on MOGOH and *** together,our analyses revealed the dual DNA-and RNA-binding activities of KHSRP and have provided a paradigm to guide the analysis of other functional Che-RBPs in different biological systems.

关键词： KHSRP Monocytic differentiation RNA-binding proteins Transcriptional regulation

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基于PDCA循环的核医学系青年人才培养研究

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医学教育管理 2024年第1期10卷 1-5页

作者：袁磊磊郭月红王凯吕琍杨敏福艾林首都医科大学附属北京天坛医院核医学科北京100070 首都医科大学核医学系北京100070 首都医科大学核医学联合教研室北京100020 首都医科大学附属北京朝阳医院核医学科北京100020 首都医科大学医院事务管理处北京100069

核医学具有独特的学科特点,首都医科大学核医学系作为联系各个附属医院专科教学的枢纽,单纯依靠传统教学管理模式,不能够充分发挥其在现代医学教育所提倡的培养复合型青年人才工作中的作用。在2021-2023年期间,学系以青年人才培养问题... 详细信息

核医学具有独特的学科特点,首都医科大学核医学系作为联系各个附属医院专科教学的枢纽,单纯依靠传统教学管理模式,不能够充分发挥其在现代医学教育所提倡的培养复合型青年人才工作中的作用。在2021-2023年期间,学系以青年人才培养问题为切入点,探索性将PDCA(plan-do-check-act)循环应用于学系青年人才的教育培养实践中,通过持续的计划和执行、对结果的检查和行动,根据评估结果调整培养计划和目标,持续改进学系组织针对青年医生教育实践活动的方案、更好地设计和组织教学活动,为学系(院)青年人才培养工作提供了新的思路参考和一定的实证经验。

关键词： PDCA循环核医学青年人才培养

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^(99m)Tc-MIBI平面显像及断层显像诊断原发性甲状旁腺功能亢进的效能评价

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首都医科大学学报 2022年第6期43卷 873-879页

作者：郭月红黄京伟常玉婷杨敏福首都医科大学附属北京朝阳医院核医学科北京100020

目的探讨^(99m)Tc-甲氧基异丁基异腈(Tc-99m methoxyisobutylisonitrile,MIBI)平面显像及断层显像诊断原发性甲状旁腺功能亢进(primary hyperparathyroidism,PHPT)的效能。方法回顾性分析2019年1月至2021年1月于首都医科大学附属北京朝阳医院疑诊PHPT并在术前完善甲状旁腺^(99m)Tc-MIBI平面显像及断层显像的78例患者的临床及影像资料。分别计算^(99m)Tc-MIBI早期平面显像、延迟平面显像及延迟断层显像的诊断效能,采用χ^(2)检验进行比较。结果78例患者术后病理证实PHPT 75例。从患者水平分析,早期平面显像的灵敏度为60.00%(45/75),特异度为66.67%(2/3),准确率为60.26%(47/78);延迟平面显像的灵敏度为81.33%(61/75),特异度为0%(0/3),准确率为78.21%(61/78);延迟断层显像的灵敏度为89.33%(67/75),特异度为66.67%(2/3),准确率为88.46%(69/78);延迟平面显像及断层显像的灵敏度、准确率均显著高于早期平面显像(χ^(2)=8.233,P=0.004;χ^(2)=17.058,P<0.001和χ^(2)=5.898,P=0.015;χ^(2)=16.272,P<0.001)。从病灶水平分析,早期平面显像的灵敏度、特异度和准确率分别为55.42%(46/83),83.33%(5/6)和57.30%(51/89),延迟平面显像的灵敏度、特异度和准确率分别为73.49%(61/83),16.67%(1/6)和69.66%(62/89),延迟断层显像的灵敏度、特异度和准确率分别为90.36%(75/83),66.67%(4/6)和88.76%(79/89);延迟平面显像的灵敏度显著高于早期平面显像(χ^(2)=5.916,P=0.015);延迟断层显像的灵敏度及准确率均显著高于早期平面显像和延迟平面显像(χ^(2)=25.639,P<0.001;χ^(2)=22.364,P<0.001和χ^(2)=7.975,P=0.005;χ^(2)=9.860,P=0.002)。结论^(99m)Tc-MIBI延迟平面显像在原发性甲状旁腺功能亢进术前的诊断效能明显优于早期显像,延迟断层显像可进一步提高诊断的灵敏度和准确率。

关键词：原发性甲状旁腺功能亢进(PHPT) ^(99m)Tc-甲氧基异丁基异腈(MIBI) 单光子发射计算机断层显像/电子计算机断层显像(SPECT/CT)

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基于620 nm藻蓝蛋白特征吸收峰提取蓝藻水华光谱指数的方法研究

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环境科学研究 2024年第8期37卷 1736-1748页

作者：胡月红周丽芸张屹郭晶周芸陈琛李濠生态环境部土壤与农业农村生态环境监管技术中心北京100012 湖南省地质调查所湖南长沙410116 湖南省洞庭湖生态环境监测中心湖南岳阳414000 益阳市生态环境局大通湖分局湖南益阳413000 湖南省生态环境监测中心湖南长沙410014

湖库蓝藻水华为全球性水生态环境问题之一,藻蓝蛋白是蓝藻水华的特征标志物,在620 nm处具有明显吸收的特性,为此利用620 nm波段开展湖库蓝藻水华提取方法研究具有重大意义。本研究基于Sentinel-3数据,利用余弦定理计算光谱曲线上第7波段... 详细信息

湖库蓝藻水华为全球性水生态环境问题之一,藻蓝蛋白是蓝藻水华的特征标志物,在620 nm处具有明显吸收的特性,为此利用620 nm波段开展湖库蓝藻水华提取方法研究具有重大意义。本研究基于Sentinel-3数据,利用余弦定理计算光谱曲线上第7波段(中心波长为620 nm)与相邻波段反射率的夹角,构建出新型蓝藻水华光谱指数-PCAI(Phycocyanin Angle Index),并应用于太湖和大通湖蓝藻水华的提取,同时与NDVI、PCI、MCI等指数法的蓝藻水华提取结果、藻密度实测浓度、藻蓝蛋白反演浓度进行比对,研究PCAI指数法提取蓝藻水华的可行性和适用性。结果表明:①本研究构建的光谱指数PCAI,能够准确表征藻蓝蛋白的生物量和水华程度,以角度的形式表示水华程度,较其他指数更加形象、直观。②从太湖和大通湖水华分布、强度和面积来看,PCAI指数法与PCI指数法的蓝藻水华提取结果基本相当,与NDVI指数法仅部分甚至极少部分结果相当或接近,与MCI指数法较为接近,但其非水华区域MCI值相对较高。③采用PCAI指数法提取蓝藻水华,克服了NDVI指数法对较重水华过饱和、对轻度或轻微水华识别极不灵敏的问题,避免了MCI指数法易受富营养化水体中叶绿素a影响的问题,较PCI指数法更易于判定蓝藻水华程度。④PCAI与藻密度、蓝藻密度的相关性最强,因其不受叶绿素a影响在水华定性方面较NDVI、PCI和MCI指数法更具优势。研究显示,PCAI构建原理简单,方法独特,提取蓝藻水华的结果较为可信,可推广使用。

关键词：藻蓝蛋白 Sentinel-3数据蓝藻水华

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