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Phylogenetic and Structural Analysis of Major Surface Proteins Hemagglutinin and Neuraminidase of Novel Avian Influenza Virus A H7N9 from Chinese Patient

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Chemical Research in Chinese Universities 2013年第5期29卷 934-940页

作者： yuan xiao-hui WANG Ying-chen QU Zhang-yi REN Jia-yi WU xiao-min WANG Jing-fei Department of Microbiology Public Health College Harbin Medical University Harbin 150081 P. R. China Institute of Pathogen Biology Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College Beijing 100176 P R. China Key Laboratory of Resource and Plant Biology of Anhui Province College of Life Science Huaibei Normal University Huaibei 235000 P. R. China Harbin Veterinary Research Institute Chinese Academy of Agricultural Sciences Harbin 150081 P R. China

This research reveals the phylogenetic history and structural information of the hemagglutinin（HA） and neuraminidase（NA） from novel avian influenza virus A/Hangzhou/1/2013（HTN9_2013） strain from human infected in China. Strains closely related to the HTN9 2013 strain were obtained from Nation Center for Biotechnology Information（USA）-basic local alignment search tool（NCBI-BLAST） searching, and the phylogenetic trees were con- structed. The 3D structures of HA and NA from H7N9 2013 strain were built by homology modeling technology, and molecular dynamics（MD） simulations were performed on the high-performance computer cluster. Characteristic amino acid sites were then screened from multiple sequence alignment（MSA） via home-made Python script and mapped onto the 3D structures. The thermodynamic characteristic root-mean-square-fluctuation （RMSF） of these sites in the structure was also analyzed with MD trajectories. The HA of HTN9_2013 strain is closely related to the A/duck/Zhejiang/12/2011 strain isolated in China, while the NA of HTN9 2013 strain is mostly related to the A/mallard/Czech Republic/13438-29K/2010 strain isolated in Europe. The 3D structures of HA and NA from H7N9 2013 stain are mostly identical to the existing structure of H7 and N9. A total of 11 and 14 characteristic ami- no acid sites were identified in HA and NA, respectively, in HTN9_2013. Structural analysis indicates that certain sites in the top region of HA are important, at which the mutation of some amino acids can impact the receptor bin- ding that may be related to its infection of human beings.

关键词： Avian influenza virus Hemagglutinin Neuraminidase Homology modeling Phylogenetic

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Identification of additional QTLs for flowering time by removing the effect of the maturity gene E1 in soybean

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Journal of Integrative Agriculture 2016年第1期15卷 42-49页

作者： LU Si-jia LI Ying WANG Jia-lin NAN Hai-yang CAO Dong LI xiao-ming SHI Dan-ning FANG Chao SHI Xin-yi yuan xiao-hui Jun Abe LIU Bao-hui KONG Fan-jiang Key Laboratory of Soybean Molecular Design Breeding Northeast Institute of Geography and Agroecology Chinese Academy of Sciences Harbin 150081 P.R.China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049 P.R. China State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding Northeast Forestry University Harbin 150040 P.R.China Research Faculty of Agriculture Hokkaido University Sapporo 060-8589 Japan

The adaptability of soybean to be grown at a wide range of latitudes is attributed to natural variation in the major genes and quantitative trait loci （QTLs） that control flowering time and maturity. Thus, the identification of genes controlling flowering time and maturity and the understanding of their molecular basis are critical for improving soybean productivity. However, due to the great effect of the major maturity gene E1 on flowering time, it is difficult to detect other small-effect QTLs. In this study, aiming to reduce the effect of the QTL, associated with the E1 gene, on the detection of other QTLs, we divided a population of 96 recombinant inbred lines （RILs） into two sub-populations： one with the E1 allele and another with the elns allele. Compared with the results of using all 96 recombinant inbred lines, additional QTLs for flowering time were identified in the sub-populations, two （qFT-B1 and qFT-H） in RILs with the E1 allele and one （qFT-J-2） in the RILs with the elnl allele, respectively. The three QTLs, qFT-B1, qFT-H and qFT-J-2 were true QTLs and played an important role in the regulation of growth period. Our data provides valuable information for the genetic mapping and gene cloning of traits controlling flowering time and maturity and will help a better understanding of the mechanism of photoperiod-regulated flowering and molecular breeding in soybean.

关键词： multiple QTL model (MQM) mixed model-based composite interval mapping (MCIM) photoperiod maturity,productivity

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一种基于电力线路布局优化的城市供电数据可视分析方法

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图学学报 2019年第1期40卷 24-31页

作者：路强张海波 yuan xiao-hui 陈晨合肥工业大学计算机与信息学院VCC研究室安徽合肥230601 合肥市电力大数据应用工程技术研究中心安徽合肥230031 北得克萨斯大学计算机科学与工程学院丹顿tx76201 国网安徽省电力公司合肥供电公司安徽合肥230031

电力数据可视化可以实现海量电力设备在线监测数据中各种属性、运行状态等电力特征信息以图形、图像化直观呈现,为设备运行状态的及时、有效监控分析提供有力保障。基于城市供电数据,提出一种城市供电态势的可视分析方法。首先根据供电... 详细信息

电力数据可视化可以实现海量电力设备在线监测数据中各种属性、运行状态等电力特征信息以图形、图像化直观呈现,为设备运行状态的及时、有效监控分析提供有力保障。基于城市供电数据,提出一种城市供电态势的可视分析方法。首先根据供电系统中的变电站数据对总体供电态势进行可视化,然后根据供电线路数据对线路进行基于多标准约束的布局优化并对其进行可视化编码,最后根据线路的附属关系对线路下挂载的用户进行可视化编码。设计了一套可视分析系统,旨在方便用户探索分析某一区域的供电态势。基于上海市城市供电数据的案例分析表明,该方法可以有效地反映某一区域内的总体供电态势和具体供电细节。

关键词：城市供电数据可视化供电态势线路布局优化可视化编码

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基于体素特征重组网络的三维物体识别

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图学学报 2019年第2期40卷 240-247页

作者：路强张春元陈超余烨 yuan xiao-hui 合肥工业大学计算机与信息学院VCC研究室安徽合肥230601 工业安全与应急技术安徽省重点实验室(合肥工业大学) 安徽合肥230009 北德克萨斯大学计算机科学与工程学院德克萨斯丹顿76201

三维物体识别是计算机视觉领域近年来的研究热点,其在自动驾驶、医学影像处理等方面具有重要的应用前景。针对三维物体的体素表达形式,特征重组卷积神经网络VFRN使用了直接连接同一单元中不相邻的卷积层的短连接结构。网络通过独特的特... 详细信息

三维物体识别是计算机视觉领域近年来的研究热点,其在自动驾驶、医学影像处理等方面具有重要的应用前景。针对三维物体的体素表达形式,特征重组卷积神经网络VFRN使用了直接连接同一单元中不相邻的卷积层的短连接结构。网络通过独特的特征重组方式,复用并融合多维特征,提高特征表达能力,以充分提取物体结构特征。同时,网络的短连接结构有利于梯度信息的传播,加之小卷积核和全局均值池化的使用,进一步提高了网络的泛化能力,降低了网络模型的参数量和训练难度。ModelNet数据集上的实验表明,VFRN克服了体素数据分辨率低和纹理缺失的问题,使用较少的参数取得了优于现有方法的识别准确率。

关键词：物体识别体素卷积神经网络特征重组短连接

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盾尾注浆硬性浆液固结变形数值计算模型构建

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岩土力学 2012年第3期33卷 925-932页

作者：袁小会韩月旺钟小春华北水利水电学院土木与交通学院郑州450011 郑州市轨道交通有限公司郑州450046 河海大学土木学院南京210098

为了更为合理地评价盾构壁后注浆控制地层变形机制,采用自制的硬性浆液固结变形试验装置,对水泥胶结作用影响硬性浆液的固结过程进行了试验研究。在此基础上,分析并建立了能够反映水泥胶结作用的硬性浆液固结变形模型,编制了相应的数值... 详细信息

为了更为合理地评价盾构壁后注浆控制地层变形机制,采用自制的硬性浆液固结变形试验装置,对水泥胶结作用影响硬性浆液的固结过程进行了试验研究。在此基础上,分析并建立了能够反映水泥胶结作用的硬性浆液固结变形模型,编制了相应的数值计算程序,并通过试验验证了该模型的合理性。硬性浆液固结变形数值计算模型的构建对于提高盾构施工模拟精细度将起到一定的推动作用。

关键词：盾构隧道盾尾注浆硬性浆液胶结作用固结模型数值计算

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三峡工程两坝联合通航调度的混合模拟退火算法

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控制理论与应用 2008年第4期25卷 708-710,716页

作者：张晓盼齐欢袁晓辉华中科技大学系统工程研究所湖北武汉430074 华中科技大学水电与数字化工程学院湖北武汉430074

对三峡大坝和葛洲坝的一共5座船闸进行统一的船舶通航调度管理,是提高长江三峡水域航运能力的关键,然而其优化调度算法还缺乏必要的研究.本文首先提出了该问题的混合整数非线性规划模型,在实际通航调度环境中,该模型属于强NP-hard复杂... 详细信息

对三峡大坝和葛洲坝的一共5座船闸进行统一的船舶通航调度管理,是提高长江三峡水域航运能力的关键,然而其优化调度算法还缺乏必要的研究.本文首先提出了该问题的混合整数非线性规划模型,在实际通航调度环境中,该模型属于强NP-hard复杂度的大规模组合优化问题,因此设计了一种混合模拟退火算法来搜索次优化调度方案,该算法将解分解为闸次时间表和船舶调度计划两部分,在搜索过程中用启发式规则对闸次时间表进行调整,然后用深度优先搜索(DFS)算法根据闸次时间表求解船舶调度计划,最后根据Metropolis规则对当前解进行更新.针对实际通航数据的测试结果表明其优化效果明显优于原有的启发式算法.目前该算法已经成功地应用于实际的两坝联合通航调度系统中.

关键词：三峡工程联合通航调度多目标规划模拟退火

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农民家庭经营性收入与科技水平的相关性研究:以南京市为例

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中国软科学 2010年第1期 67-77页

作者：范金任会袁小慧江苏省行政学院江苏应用经济研究中心江苏南京210004

本文采用动态经济计量方法研究了南京市农民家庭经营性收入与科技水平之间的相关性。研究发现:第一,提高科技水平与增加农民家庭经营性收入之间互为因果关系;第二,在提升家庭经营性收入方面,技术效率优于科技进步,但二者结合效果更加显... 详细信息

本文采用动态经济计量方法研究了南京市农民家庭经营性收入与科技水平之间的相关性。研究发现:第一,提高科技水平与增加农民家庭经营性收入之间互为因果关系;第二,在提升家庭经营性收入方面,技术效率优于科技进步,但二者结合效果更加显著;第三,提高农业科技水平对增加农民家庭经营性收入影响呈现出先抑后扬特征,且长期具有持续稳定的高效显著性正效应;第四,农民家庭经营性收入波动性在农业生产前期主要源于科技三项费投入,而后期则是农业机械化水平。

关键词：农民家庭经营性收入科技水平科技进步技术效率

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江苏农村居民收入差距、消费差异与消费潜力研究——基于江苏农村细化SAM的乘数分析

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系统工程理论与实践 2006年第11期26卷 53-62,72页

作者：范金袁小慧徐浩然江苏省行政学院江苏应用经济研究中心南京210004 南京航天航空大学经济管理学院南京210016

在所建立的2002年江苏农村居民消费细化社会核算矩阵(Social Accounting Matrix,SAM)的基础上,通过SAM乘数的分解,从不同商品及服务消费和不同收入分组两方面对江苏农村居民消费净开放效应进行分析,并将账户乘数和固定价格乘数效应进行... 详细信息

在所建立的2002年江苏农村居民消费细化社会核算矩阵(Social Accounting Matrix,SAM)的基础上,通过SAM乘数的分解,从不同商品及服务消费和不同收入分组两方面对江苏农村居民消费净开放效应进行分析,并将账户乘数和固定价格乘数效应进行了比较分析.主要研究结论:第一,居住、食品和交通通讯是目前江苏农村居民的消费热点,但教育文化娱乐、衣着和医疗保健消费重视程度不足;第二,除最高收入户外,江苏各收入阶层对家庭设备及服务具有较大的消费欲望,消费潜力巨大;第三,中低收入及以下收入阶层对医疗保健和教育文化娱乐消费欲望非常强烈,政府应该在相关福利政策上给予一定支持,以促进这两类消费的良性发展;最后,为继续保持江苏农村居民交通通讯的发展,政府仍然有必要加强农村交通通讯基础设施建设,从而改变居民消费行为.

关键词：江苏农村居民 SAM乘数收入差距消费潜力

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盾构隧道壁后注浆体固结变形特性试验研究

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上海交通大学学报 2011年第4期45卷 446-450页

作者：袁小会韩月旺钟小春华北水利水电学院土木与交通学院郑州450011 郑州市轨道交通有限公司郑州450046 河海大学土木工程学院南京210098

为了研究浆液在盾尾空隙中的固结变形特性，采用自制的壁后注浆体固结变形试验装置，对不同注浆材料、不同固结压力、不同土质条件和地下水压力条件下的浆液固结变形特性进行了试验研究．结果表明：随固结压力的增大，浆液的固结变形速... 详细信息

为了研究浆液在盾尾空隙中的固结变形特性，采用自制的壁后注浆体固结变形试验装置，对不同注浆材料、不同固结压力、不同土质条件和地下水压力条件下的浆液固结变形特性进行了试验研究．结果表明：随固结压力的增大，浆液的固结变形速率加快，最终的变形量也相应增大，且浆液的田结应变处于4％～12％；在砂土条件下的固结变形速率要远快子黏土条件，在砂土条件下1h内变形即可趋于稳定，而黏土条件则需要5～6h；随地下水压力的增大，浆液的排水速率减缓，最终的固结变形量也相应减小．

关键词：盾构隧道壁后注浆固结变形

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碱激发矿渣混凝土的补偿收缩性能试验研究

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硅酸盐通报 2017年第9期36卷 2987-2993页

作者：袁晓辉申晓伟信阳师范学院建筑与土木工程学院信阳464000

以硫铝酸钙-氧化钙类膨胀剂(EA)作为掺合料,通过改变EA的掺量(0%,2%,4%,6%和8%),采用自制收缩架对自由条件下和半密封约束条件下的碱激发矿渣混凝土的收缩性能进行测试。在此基础上,对EA分别与水,NaOH溶液及水玻璃溶液反应净浆及不同EA... 详细信息

以硫铝酸钙-氧化钙类膨胀剂(EA)作为掺合料,通过改变EA的掺量(0%,2%,4%,6%和8%),采用自制收缩架对自由条件下和半密封约束条件下的碱激发矿渣混凝土的收缩性能进行测试。在此基础上,对EA分别与水,NaOH溶液及水玻璃溶液反应净浆及不同EA掺量碱激发矿渣净浆进行微观分析。收缩性能测试结果显示:两种不同养护制度条件下的试件掺入EA后干缩量均有所降低,且降低程度随EA掺量的增加而增大。当EA掺量达8%时,自由条件养护下的试件补偿收缩量约为3.0×10^(-4)με,而半密封约束条件下的试件补偿收缩量可达4.0×10^(-4)με。表明:该类EA对碱激发矿渣混凝土具有较好的补偿收缩性能,且在半密封约束条件下补偿收缩效果更为显著。微观分析显示:EA分别与水,NaOH溶液及水玻璃溶液反应净浆中均检出钙矾石与氢氧化钙两种水化产物,但在掺EA碱激发矿渣净浆中仅检出氢氧化钙一种水化产物。表明:EA在碱激发矿渣混凝土中起到补偿收缩作用的主要是水化产物氢氧化钙。

关键词：碱激发矿渣混凝土膨胀剂补偿收缩微观结构分析

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