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基于病毒-宿主交互网络的加味芦根方治疗流行性感冒的生物信息学分析

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中药新药与临床药理 2024年第3期35卷 358-367页

作者：吴鹏江勇李莎吴文玉纪丽纯洪海都张高黄慧婷刘小虹詹少锋赖艳妮广州中医药大学第一临床医学院广东广州510405 深圳市中西医结合医院广东深圳518104 广州中医药大学科技创新中心广东广州510405 广州中医药大学第三临床医学院广东广州510405 广州中医药大学基础医学院广东广州510006 顺德职业技术学院医药卫生学院广东佛山528300

目的从病毒-宿主交互界面探讨加味芦根方(芦根、全蝉蜕、僵蚕、金银花、生甘草、薄荷、羌活、葛根、柴胡)治疗流行性感冒的分子机制。方法从本草组鉴数据库收集复方的化学成分,经里宾斯基五原则筛选潜在的活性成分后,进一步在瑞士靶点... 详细信息

目的从病毒-宿主交互界面探讨加味芦根方(芦根、全蝉蜕、僵蚕、金银花、生甘草、薄荷、羌活、葛根、柴胡)治疗流行性感冒的分子机制。方法从本草组鉴数据库收集复方的化学成分,经里宾斯基五原则筛选潜在的活性成分后,进一步在瑞士靶点预测网站预测活性成分的作用靶点;从GEO数据库挖掘人类流感芯片GSE90732的差异表达基因;从病毒-宿主相互作用搜索工具检索H1N1流感-智人蛋白交互组;整合上述生物信息集,通过Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用网络和加味芦根方-病毒-宿主交互网络,使用R软件对交集基因进行功能富集分析,最后对关键活性成分及靶点进行分子对接验证。结果获得1252个活性成分,1415个作用靶点,951个流感差异表达基因和10142对H1N1-智人蛋白互作信息。加味芦根方与流感的交集靶点有72个,功能富集显示这些靶点与宿主防御和程序性细胞死亡密切相关。交互网络拓扑分析表明,加味芦根方通过齐墩果酸、γ-十一碳酸内酯、长棘素等多种活性成分调控病毒M2、NA、NS1和HA蛋白和/或宿主HSP90AA1、NRAS和ITGB1等多个关键靶标发挥治疗作用,分子对接结果表明活性成分与靶点具有较好的结合能力。结论加味芦根方通过多种活性成分直接靶向流感病毒蛋白和/或宿主因子,从抑制病毒复制、调节宿主防御和细胞死亡等多个维度发挥抗击流感的作用。该研究为进一步实验解析加味芦根方治疗流感的分子机制提供了理论基础。

关键词：加味芦根方流行性感冒病毒-宿主交互网络 HSP90AA1 齐墩果酸生物信息学

Nonlinearity-Compensation-Free Optical Frequency Domain Reflectometry Based on Electrically-Controlled Optical Frequency Sweep

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Journal of Electronic Science and Technology 2021年第1期19卷 89-96页

作者： Fan Yang Ling-Jie Zhang Zhi-Yao Zhang Xiao-jun Zhou yong Liu the School of Optoelectronic Science and Engineering University of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu 610054

A nonlinearity-compensation-free optical frequency domain reflectometry(OFDR)scheme is proposed and experimentally demonstrated based on the electrically-controlled optical frequency *** the proposed scheme,the linear frequency sweep light is generated by propagating an ultra-narrow-linewidth continuous-wave(CW)light through an electro-optic frequency shifter which consists of a dual-parallel Mach-Zehnder modulator(DPMZM)and an electronic 90°hybrid,where the electro-optic frequency shifter is driven by a linear frequency modulated signal generated by a direct digital synthesizer(DDS).Experimental results show that the spatial resolution and signal-to-noise ratio(SNR)of the proposed OFDR scheme without the nonlinear phase compensation are comparable to those of OFDR employing a commercial tunable laser source(TLS),an auxiliary interferometer,and a software-based nonlinear phase compensation *** proposed OFDR scheme is helpful to reduce the complexity of the optical structure and eliminate the difficulty of developing the nonlinear phase compensation algorithm.

关键词： Dual-parallel Mach-Zehnder modulator(DPMZM) electro-optic frequency shifter optical fiber sensor optical frequency domain reflectometry(OFDR)

Lattice Boltzmann method for consolidation analysis of saturated clay

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Journal of Ocean Engineering and Science 2019年第3期4卷 193-202页

作者： Pyol Kim yong-Gun Kim Chung-Hyok Paek jun Ma Faculty of Geology Kim Il Sung UniversityPyongyang 999093Democratic People’s Republic of Korea Faculty of Global Environmental Science Kim Il Sung UniversityPyongyang 999093Democratic People’s Republic of Korea

The lattice Boltzmann method(LBM)has been widely employed in various areas of practical engineering to solve non-linear problems,due to such advantages as the simplicity of programming and the numerical *** this paper,a new numerical method for onedimensional(1D)consolidation analysis of saturated clay is proposed on the basis of the lattice Boltzmann *** first,the lattice Bhatnagar-Gross-Krook(LBGK)model is used for 1D consolidation problem of saturated clay subjected to time-dependent loading under different types of initial and boundary *** addition,the multiscale Chapman-Enskog expansion is applied to recover mesoscopic lattice Boltzmann equation to macroscopic consolidation *** a result of the numerical simulation for verification,the numerical results are proved to be in good agreement with the analytical solutions available in previous *** the evaluation of convergence and accuracy,it is demonstrated that the proposed method is more accurate and reliable than the finite difference method(FDM)for 1D consolidation analysis of saturated clay.

关键词： Saturated clay Lattice Boltzmann method Consolidation Time-dependent loading

2017—2022年新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州棘球蚴病监测

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第1期36卷 79-82页

作者：张月吴军阿迪力·司马义王蒴张海亭史光忠赵江山新疆医科大学公共卫生学院新疆乌鲁木齐830000 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心新疆乌鲁木齐830000

目的分析2017—2022年新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州棘球蚴病监测结果,为该地区制定棘球蚴病防治措施提供参考依据。方法2017—2022年,在巴音郭楞蒙古自治州棘球蚴病Ⅰ、Ⅱ类流行县(市)采用多阶段抽样法随机抽取村民进行棘球蚴病... 详细信息

目的分析2017—2022年新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州棘球蚴病监测结果,为该地区制定棘球蚴病防治措施提供参考依据。方法2017—2022年,在巴音郭楞蒙古自治州棘球蚴病Ⅰ、Ⅱ类流行县(市)采用多阶段抽样法随机抽取村民进行棘球蚴病查病,对在Ⅲ类流行县(市)医疗机构接受超声检查的所有就诊患者进行棘球蚴病主动筛查;于集中屠宰场或屠宰点,采用触检、剖检法对羊和牛等家畜进行棘球蚴病筛查;于各行政村随机抽取养犬户,收集新鲜家犬粪便,检测家犬棘球绦虫粪抗原。分析2017—2022年巴音郭楞蒙古自治州人群和家畜棘球蚴病检出率、人群棘球蚴病新发现病例检出率及家犬棘球绦虫粪抗原检出率等指标变化。结果2017—2022年,巴音郭楞蒙古自治州人群棘球蚴病平均检出率为0.13%(540/407803),呈逐年下降趋势(χ_(趋势)^(2)=1217.21,P<0.001),其中和静县人群棘球蚴病新发现病例检出率最高(0.28%,191/67865);家畜棘球蚴病检出率呈逐年下降趋势(χ_(趋势)^(2)=147.02,P<0.001),其中和静县家畜棘球蚴病检出率最高(3.44%,86/2500);家犬棘球绦虫粪抗原检出率呈逐年下降趋势(χ_(趋势)^(2)=302.46,P<0.001),其中且末县家犬棘球绦虫粪抗原检出率最高(2.74%,118/4313)。结论2017—2022年,新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州人群棘球蚴病检出率、家畜棘球蚴病检出率及犬棘球绦虫粪抗原检出率均呈下降趋势;但棘球蚴病在局部地区仍然存在较高传播风险,需持续开展棘球蚴病综合防治。

关键词：棘球蚴病监测流行病学特征巴音郭楞蒙古自治州

Synthetic studies towards(-)-deserpidine:Total synthesis of the stereoisomer and derivative of (-)-deserpidine

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Chinese Chemical Letters 2021年第1期32卷 401-404页

作者： Pingzhou wu Qilong Zhou Xiao-Yu Liu Fei Xue yong Qin Key Laboratory of Drug-Targeting and Drug Delivery System of the Education Ministry Sichuan Engineering Laboratory for Plant-Sourced Drug and Sichuan Research Center for Drug Precision Industrial TechnologyWest China School of PharmacySichuan UniversityChengdu 610041China School of Pharmaceutical Sciences and the Innovative Drug Research Centre Chongqing UniversityChongqing 401331China

The asymmetric synthesis of 16,17,20-epi-deserpidine and a derivative of(-)-deserpidine has been *** feature s in the assembly of the pentacyclic framework include a visible-light photocatalytic intra-/inter-/intramolecular radical cascade reaction to construct the tetracyclic ABCD ring system in one-pot and an intramolecularaldol reaction to forge the cyclohexane E ring.

关键词： Yohimbine alkaloids Deserpidine Photoredox catalytic radical cascade reaction Total synthesis

Spectral-domain optical coherence tomography finding in cytomegalovirus retinitis in AIDS patients

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International Journal of Ophthalmology(English edition) 2020年第11期13卷 1800-1807页

作者： Yan Sheng yong-Zheng Guo Li-jun Xu Biao Zhu Department of Ophthalmology the First Affiliated HospitalCollege of MedicineZhejiang UniversityHangzhou 310003Zhejiang ProvinceChina Department of Infectious Disease the First Affiliated HospitalCollege of MedicineZhejiang UniversityHangzhou 310003Zhejiang ProvinceChina

AIM:To observe the findings of spectral domain optical coherence tomography(SD-OCT)scan in cytomegalovirus retinitis(CMVR).METHODS:Forty-six eyes of 33 patients with acquired immunodeficiency syndrome and CMVR were enrolled in the *** ophthalmologic examinations,color fundus photography,SD-OCT and fundus autofluorescence(FAF)were performed for all patients at the first visit and each follow-up *** necrosis in CMVR was analyzed on SD-OCT and classified into two types,the typical type and the atypical ***:Forty-one eyes of active CMVR and 4 eyes of recurrent CMVR were classified into typical type,and 4 eyes with graying retinal lesion without hemorrhage or only punctate hemorrhage were classified into atypical *** active stage of CMVR,the retina in typical type was significant thickened with hyperreflective lesion and fullthickness disruption of retinal architecture with enlarged vessel;while in atypical type,the retina was also destroyed in all layers but without thickening or slightly *** choroid,vitreous and retinal vessels were not significantly *** healed stage,the retina was thin with destroyed layers in both *** typical type,FAF showed mottled hypofluorescence mixed with punctuate *** atypical type,the retina showed some"cavity"in outer nuclear layer,and FAF showed mild ***:SD-OCT show different changes in the retina in typical type and atypical type of CMVR,which should be useful in assisting diagnosis and follow-up management of the disease.

关键词： cytomegalovirus retinitis optical coherence tomography fundus autofluorescence

儿童急性T淋巴细胞白血病的临床特征及预后——福建地区多中心数据分析

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中国实验血液学杂志 2024年第1期32卷 6-13页

作者：吴椿萍郑湧智李健温红翁开枝庄树铨吴兴国华雪玲郑浩陈再生乐少华福建医科大学附属协和医院小儿血液科福建省血液病研究所福建省血液病学重点实验室福建福州350001 厦门大学附属第一医院儿科福建厦门361000 福建医科大学附属漳州市医院儿童血液风湿肾科福建漳州363000 福建医科大学附属泉州第一医院儿科福建泉州362000 福建省南平市第一医院儿科福建南平353000

目的:评估儿童急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)的疗效,并探讨影响预后的危险因素。方法:回顾性分析2011年4月至2020年12月福建地区5家医院收治的127例初诊T-ALL患儿的临床资料,与同期急性前体B淋巴细胞白血病(B-ALL)患儿相比较,并采用Kaplan... 详细信息

目的:评估儿童急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)的疗效,并探讨影响预后的危险因素。方法:回顾性分析2011年4月至2020年12月福建地区5家医院收治的127例初诊T-ALL患儿的临床资料,与同期急性前体B淋巴细胞白血病(B-ALL)患儿相比较,并采用Kaplan-Meier法分析评估患儿总生存率(OS)和无事件生存率(EFS),COX比例风险回归模型分析预后影响因素。116例规范治疗的T-ALL患儿中,78例接受CCLG-ALL 2008方案治疗,38例接受CCCG-ALL 2015方案治疗,对比两组的疗效及严重不良事件发生率。结果:T-ALL患儿中男性、年龄≥10岁、初诊白细胞数≥50×10^(9)/L、合并中枢神经系统白血病、诱导治疗中微小残留病≥1%、诱导结束时微小残留病≥0.01%的患儿比例均显著高于B-ALL患儿(P<0.05)。T-ALL患儿预期10年EFS及OS分别为59.7%和66.0%,均显著低于B-ALL患儿(P<0.001)。COX分析显示,初诊白细胞数≥100×10^(9)/L、诱导结束时未达完全缓解是更差预后的独立危险因素。CCCG-ALL 2015组与CCLG-ALL 2008组相比,感染相关严重不良事件发生率更低(15.8%vs 34.6%,P=0.042),而EFS及OS更高(73.9%vs 57.2%,PEFS=0.090;86.5%vs 62.3%,POS=0.023)。结论:T-ALL较B-ALL预后差,初诊白细胞数≥100×10^(9)/L、诱导结束时未达完全缓解(尤其是纵隔肿物未消失)为其预后不良危险因素。CCCG-ALL 2015方案可能降低感染相关严重不良事件发生率并提高疗效。

关键词：急性T淋巴细胞白血病儿童不良事件疗效

基于16S rDNA高通量测序技术的重度低龄儿童龋患者口腔微生物及肠道菌群群落分析

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上海口腔医学 2024年第2期33卷 164-169页

作者：李杨赵梦珺卢红巧刘建国刘云坤吴家媛遵义医科大学附属口腔医院贵州遵义563000 贵州省普通高等学校口腔疾病研究特色重点实验室贵州遵义563000 无锡口腔医院江苏无锡214000 口腔疾病研究国家重点实验室国家口腔疾病临床医学研究中心四川大学华西口腔医院四川成都610041

目的:应用16S rDNA高通量测序,分析高龋及无龋儿童口腔和肠道微生物群落构成特征。方法:从本团队前期流行病学调查的431名遵义市3~5岁儿童中,随机抽取高龋和无龋儿童各25名,采集其唾液及粪便样本。采用16S rDNA测序技术分析样本菌群结构... 详细信息

目的:应用16S rDNA高通量测序,分析高龋及无龋儿童口腔和肠道微生物群落构成特征。方法:从本团队前期流行病学调查的431名遵义市3~5岁儿童中,随机抽取高龋和无龋儿童各25名,采集其唾液及粪便样本。采用16S rDNA测序技术分析样本菌群结构,比较口腔和肠道微生物菌群的构成差异。采用SPSS 18.0软件包对结果进行统计学分析。结果:高龋组儿童肠道菌群多样性显著高于无龋组(P0.05)。在门水平上,高龋组和无龋组儿童的肠道及口腔菌群物种差异无显著性。在属水平上,无龋组肠道中的Blautia、[Eubacterium]hallii group、[Eubacterium]eligens group显著高于高龋组(P<0.05),Parasutterella、Christensenellaceae R-7 group显著低于高龋组(P<0.05);无龋组唾液中的Peptostreptococcus显著高于高龋组(P<0.05);无龋组唾液中的Dialister、Kingella、Escherichia-Shigella、Treponema显著低于高龋组(P<0.05)。结论:高龋儿童肠道菌群中物种多样性高于无龋儿童。高龋儿童和无龋儿童的口腔和肠道微生物组成在属水平上存在显著差异性菌种。

关键词：高通量测序低龄儿童龋微生物群落肠道菌群失衡

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高氮含能材料H_(4)TTP合成工艺优化

火炸药学报 2024年第1期47卷 29-34页

作者：丁倩楠刘文东王小军徐子帅李子扬刘继开李永祥申帆帆中北大学化学与化工学院山西太原030051 甘肃银光化学工业集团有限公司甘肃白银730900

为了寻求新型高氮含能材料,以2,3-二氨基-2-丁烯二腈(DAMN)为原料,经过氧化缩合、叠氮反应两步法合成了2,3,5,6-四(1H-四唑-5-基)吡嗪(H_(4)TTP);通过傅里叶变换红外光谱(FTIR)、核磁共振、质谱、元素分析对H_(4)TTP进行了表征。在原工... 详细信息

为了寻求新型高氮含能材料,以2,3-二氨基-2-丁烯二腈(DAMN)为原料,经过氧化缩合、叠氮反应两步法合成了2,3,5,6-四(1H-四唑-5-基)吡嗪(H_(4)TTP);通过傅里叶变换红外光谱(FTIR)、核磁共振、质谱、元素分析对H_(4)TTP进行了表征。在原工艺基础上,以添加稳定剂四丁基溴化铵(TBAB)、改变最终酸度值的方法对原工艺进行改进,在单因素试验基础上,以H_(4)TTP的得率为响应值,用响应面法优化其反应条件,研究了反应温度、反应时间、吡嗪四腈(TCP)与叠氮化钠(NaN_(3))的摩尔比3个因素对叠氮反应的影响,建立了H_(4)TTP的得率与3个相关因素的回归方程,所得模型的R^(2)值为0.9992,证明该回归方程高度拟合。结果表明,叠氮反应较佳工艺条件为:以二甲基亚砜(DMSO)为溶剂,TBAB为稳定剂,2,3,5,6-吡嗪四腈(TCP)与叠氮化钠的摩尔比为1∶4.4,反应温度124℃,反应时间42h、搅拌速率400r/min,H_(4)TTP的得率为89.73%,与模型预测值90.61%基本相符,进一步验证了所选模型的合理性。与原工艺相比,工艺优化后的目标产物H_(4)TTP得率提高7%左右。

关键词：有机化学 2,3,5,6-四(1H-四唑-5-基)吡嗪(H_(4)TTP) DAMN 响应面法高氮含能材料