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基于最短依存路径和集成学习的化学物蛋白质关系抽取

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中文信息学报 2021年第4期35卷 58-65页

作者：程威邵一帆钱龙华周国栋苏州大学计算机科学与技术学院自然语言处理实验室江苏苏州215006

化学物与蛋白质之间的相互作用关系抽取对精准医学和药物发现等方面的研究有着重要作用。该文提出了一种基于最短依存路径和注意力机制的双向LSTM模型,并将其应用于化学物蛋白质关系抽取。在特征上综合考虑了最短依存路径上的词性、位... 详细信息

化学物与蛋白质之间的相互作用关系抽取对精准医学和药物发现等方面的研究有着重要作用。该文提出了一种基于最短依存路径和注意力机制的双向LSTM模型,并将其应用于化学物蛋白质关系抽取。在特征上综合考虑了最短依存路径上的词性、位置和依存关系类型等。在BioCreative VI CHEMPROT任务上的实验表明,该方法在基于依存信息的系统中获得了较好的F1值性能。同时,集成学习也进一步提高了化学物蛋白质关系抽取性能。

关键词：实体关系抽取化学物蛋白质关系抽取最短依存路径注意力机制

Ni对Pt/γ-Al_2O_3催化甲基环己烷脱氢性能的影响

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化工进展 2016年第B11期35卷 183-186页

作者：童凤丫孙清邵一凡缪长喜王仰东谢在库中国石油化工股份有限公司上海石油化工研究院上海201208 中国石油化工股份有限公司北京100027

采用饱和浸渍法制备了γ-Al_2O_3负载的Pt单金属和Pt-Ni双金属催化剂,用固定床反应器评价了催化剂的甲基环己烷脱氢反应性能,以考察Ni对Pt/γ-Al_2O_3催化甲基环己烷脱氢性能的影响。结果表明,与单金属催化剂相比,Pt-Ni双金属催化剂具... 详细信息

采用饱和浸渍法制备了γ-Al_2O_3负载的Pt单金属和Pt-Ni双金属催化剂,用固定床反应器评价了催化剂的甲基环己烷脱氢反应性能,以考察Ni对Pt/γ-Al_2O_3催化甲基环己烷脱氢性能的影响。结果表明,与单金属催化剂相比,Pt-Ni双金属催化剂具有更好的脱氢活性和稳定性。氢氧滴定分析结果表明加入Ni后Pt的分散性能变好,TEM分析表明加入Ni后金属颗粒尺寸变大,结合氢氧滴定与TEM数据,认为掺入Ni之后形成了Pt-Ni新的体系,此体系提高了催化剂表面上氢的结合能,最终提高了Pt-Ni双金属催化剂的脱氢活性和稳定性。此结果为开发适用于有机液体储氢材料脱氢的高效催化剂提供了思路。

关键词：甲基环己烷脱氢稳定性活性

真性红细胞增多症患者静脉血栓栓塞危险因素分析及预测模型的建立

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中华医学杂志 2024年第25期104卷 2336-2341页

作者：马金玉张宇卉滕广帅杜晨霄张会勤王艳李艳旗段依璠周圆邵宗鸿白洁天津医科大学第二医院血液科天津中国医学科学院血液病医院中国医学科学院血液学研究所实验血液学国家重点实验室国家血液系统疾病临床医学研究中心细胞生态海河实验室天津

目的探讨真性红细胞增多症(PV)患者发生静脉血栓的危险因素, 并建立静脉血栓预测模型。方法回顾性纳入2017年9月至2023年11月天津医科大学第二医院JAK2V617F基因突变阳性的PV患者, 根据患者是否发生静脉血栓进行分组, 采用倾向性评分匹... 详细信息

目的探讨真性红细胞增多症(PV)患者发生静脉血栓的危险因素, 并建立静脉血栓预测模型。方法回顾性纳入2017年9月至2023年11月天津医科大学第二医院JAK2V617F基因突变阳性的PV患者, 根据患者是否发生静脉血栓进行分组, 采用倾向性评分匹配年龄、性别因素后, 最终静脉血栓组纳入102例[男46例, 女56例, 年龄M(Q1, Q3)为52(44, 60)岁], 无静脉血栓组纳入204例[男92例, 女112例, 年龄为52(44, 59)岁]。比较两组PV患者的临床及实验室特征、疾病进展、基因突变发生率等。随访截止日期为2023年11月20日, 中位随访时间[M(Q1, Q3)]为11(1, 53)年。采用多因素Cox风险模型对PV患者发生静脉血栓的影响因素进行分析, 建立PV患者静脉血栓危险因素预测模型评分系统。采用受试者工作特征(ROC)曲线对该模型进行预测效能评估。结果静脉血栓组血红蛋白浓度、红细胞压积≥55%比例、中性粒细胞与淋巴细胞比率≥5比例、高血压比例、脾肋下≥5 cm比例、继发骨髓纤维化比例均高于无静脉血栓组(均P<0.05)。且静脉血栓组发生既往血栓栓塞史比例、JAK2V617F基因突变负荷≥50%比例、糖尿病比例、携带ASXL1突变比例、继发网状纤维银染色≥3级比例均高于无静脉血栓组(均P<0.05)。静脉血栓组PV患者发生3个及以上基因突变比例为44.1%(45/102), 高于无静脉血栓组的29.9%(61/204)(P=0.014)。静脉血栓组发生ASXL1基因突变比例为17.6%(18/102), 高于无静脉血栓组的4.9%(10/204)(P<0.001)。多因素Cox风险模型分析结果表明, 既往血栓栓塞史(HR=2.031, 95%CI:1.297～3.179, P=0.002)、JAK2V617F基因突变负荷≥50%(HR=2.141, 95%CI:1.370～3.347, P=0.001)、ASXL1突变(HR=4.632, 95%CI:1.497～14.336, P=0.008)、脾肋下≥5 cm(HR=1.771, 95%CI:1.047～2.996, P=0.033)是PV患者发生静脉血栓栓塞的危险因素。建立PV患者静脉血栓危险因素预测模型评分系统:既往血栓栓塞史、JAK2V617F基因突变负荷≥50%、脾肋下≥5 cm分别赋值1分, ASXL1突变赋值2分。低危组:评分为0分, 中危组:评分为1～2分, 高危组:评分≥3分。该模型预测PV患者发生静脉血栓的ROC曲线分析结果显示:曲线下面积(AUC)为0.807(95%CI:0.755～0.860), 当约登指数为0.48时, 灵敏度为88.2%, 特异度为59.8%。结论既往血栓栓塞史、JAK2V617F基因突变负荷≥50%、ASXL1突变、脾肋下≥5 cm是PV患者发生静脉血栓栓塞的危险因素。建立的预测模型具有较好的预测效能。

关键词：红细胞增多症, 真性静脉血栓栓塞危险因素预测模型

2003—2019年上海市嘉定区结直肠癌流行趋势研究

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中国全科医学 2024年第10期27卷 1261-1266页

作者：陈单王亚伟黄芳徐一凡张一英邵月琴复旦大学公共卫生学院上海市200032 上海市嘉定区疾病预防控制中心 201800

背景结直肠癌已成为上海市嘉定区发病率排名第三的恶性肿瘤,其疾病负担仍在加重。目的分析2003—2019年上海市嘉定区结直肠癌流行趋势,为结直肠癌防治提供科学依据。方法基于2003—2019年上海市嘉定区肿瘤登记资料,计算粗发病率、粗死... 详细信息

背景结直肠癌已成为上海市嘉定区发病率排名第三的恶性肿瘤,其疾病负担仍在加重。目的分析2003—2019年上海市嘉定区结直肠癌流行趋势,为结直肠癌防治提供科学依据。方法基于2003—2019年上海市嘉定区肿瘤登记资料,计算粗发病率、粗死亡率、标化发病率、标化死亡率等统计指标(以2010年中国标准人口构成进行标化调整),利用Joinpoint Regression Program 4.***.1.0软件分析发病率和死亡率的变化趋势。结果2003—2019年上海市嘉定区结直肠癌新发病例5020例,粗发病率52.12/10万,标化发病率26.27/10万,死亡病例2419例,粗死亡率25.12/10万,标化死亡率11.16/10万,男性的粗发病率和粗死亡率均高于女性(P<0.05);总人群标化发病率总体呈现上升趋势(APC=2.63%,P<0.05),其中男性标化发病率呈上升趋势(APC=3.48%,P<0.05),女性标化发病率无明显变化趋势(APC=1.39%,P=0.119),均未发现转折点;总人群标化死亡率无明显变化趋势(APC=-0.49%,P=0.250),其中男性标化死亡率无明显变化趋势(APC=0.34%,P=0.545),女性标化死亡率呈现下降趋势(APC=-1.94%,P<0.05)。结论2003—2019年上海市嘉定区结直肠癌总体发病率总体仍有上升,其中男性呈上升趋势,女性无明显变化趋势;总体死亡率无明显变化趋势,其中男性无明显变化,女性呈下降趋势,应继续加强结直肠癌的防控工作,重点关注男性人群。

关键词：结直肠肿瘤发病率死亡率趋势 Joinpoint回归模型上海市

动脉粥样硬化斑块内新生血管与斑块稳定性的相关性

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中医药临床杂志 2024年第2期36卷 295-300页

作者：张一帆李芳李启玉邵醒贵州中医药大学贵州贵阳550022 贵州中医药大学第二附属医院贵州贵阳550002

目的:探讨动脉粥样硬化内新生血管与斑块稳定性的相关性。方法:建立AS实验兔模型,将模型实验兔随机分为空白对照组、模型组、高脂饮食组、中药复方组、阿托伐他汀组。观察空白对照组、高脂饮食组第4周、8周、12周时血脂变化情况、用荧... 详细信息

目的:探讨动脉粥样硬化内新生血管与斑块稳定性的相关性。方法:建立AS实验兔模型,将模型实验兔随机分为空白对照组、模型组、高脂饮食组、中药复方组、阿托伐他汀组。观察空白对照组、高脂饮食组第4周、8周、12周时血脂变化情况、用荧光定量聚合酶链式反应法检测组织标本中CD34的mRNA表达量、胸主动脉HE染色结果及新生血管内皮细胞标志物CD34水平的变化差异。结果:与空白组比较,高脂饮食组总胆固醇、甘油三酯、低密脂蛋白升高明显,高密度脂蛋白降低明显(P1,且增长明显(P<0.05);HE染色显示,高脂饮食组内膜下可见大量泡沫细胞形成纤维斑块病变;免疫组化显示,高脂饮食组有内膜改变,CD34染色呈阳性表达,且随时间的推移,阳性表达逐渐增强,内膜下可见大量蓝紫色细胞核聚集,为CD34标记的新生血管,高脂饮食组的实验兔斑块内新生血管在不断生长。结论:脂质代谢紊乱,低密脂蛋白、高密度脂蛋白水平与斑块内新生血管相关,新生血管为AS进展过程中重要的伴随现象,AS斑块不稳定性与斑块内新生血管密切相关,且呈正相关性。

关键词：动脉硬化斑块新生血管 CD34

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校企联合下大学生创业资本培育研究

科技资讯 2021年第12期19卷 209-211页

作者：邵一帆孙贵英临沂大学体育与健康学院山东临沂276005

在"大众创业,万众创新"的社会背景下,大学生创业成为大学生新型就业模式,高校开展创业教育的热情高涨,其中创业资本培育是创业实践的基础,也影响着创业绩效,其独特性作用在创业活动中表现更为显著。该文以"校企联合"为主要思路,探讨一... 详细信息

在"大众创业,万众创新"的社会背景下,大学生创业成为大学生新型就业模式,高校开展创业教育的热情高涨,其中创业资本培育是创业实践的基础,也影响着创业绩效,其独特性作用在创业活动中表现更为显著。该文以"校企联合"为主要思路,探讨一种高效的大学生创业资本培育模式,实现项目的研发、过程孵化、一体化指导与资金保障等。这对于完善创业理论和提高创业绩效具有重要理论价值和现实意义。

关键词：校企联合大学生创业创新现状

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基于烈度差的云南省城市地区建筑易损性研究

建筑结构 2019年第8期49卷 33-36,36页

作者：林皓鋆潘文张健邵一凡何俊宏昆明理工大学工程抗震研究所昆明650500

云南省地处南北地震带上,是我国地震活动最为频繁的省份之一。根据云南省地震局提供的资料,统计了自1993年1月27日云南普洱6.3级地震起的1993～2015年间云南省地区共70次5.0级及以上的地震,其中波及城市地区的地震共17次。并基于谢礼立... 详细信息

云南省地处南北地震带上,是我国地震活动最为频繁的省份之一。根据云南省地震局提供的资料,统计了自1993年1月27日云南普洱6.3级地震起的1993～2015年间云南省地区共70次5.0级及以上的地震,其中波及城市地区的地震共17次。并基于谢礼立院士在《城市防震减灾能力的定义及评估方法》的研究,提出了采用烈度差来研究地震灾害城市地区建筑物易损性的方法,通过收集的资料统计了地震中不同结构类型房屋基于烈度差的破坏比,使用MATLAB软件拟合了上述房屋的易损性曲线,并对其易损性进行分析研究。结果显示,烈度差的概念与"三水准"设防要求相符,对城市地区房屋易损性研究有一定帮助。

关键词：烈度差破坏比易损性

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考虑三维地震动作用下振动台试验隔震层简化

土木建筑与环境工程 2017年第2期39卷 65-74页

作者：邵一凡赖正聪潘文吴克川兰香于诗歌马健昆明理工大学工程抗震研究所昆明650500

基于等效原则、相似理论,考虑三维地震动作用下振动台试验中原型结构隔震层的简化,并对模型结构隔震层进行系统研究。针对不同高宽比隔震结构,提出完全等效简化方法和部分等效简化方法,包括隔震垫等效、模型支座参数及坐标确定、相似关... 详细信息

基于等效原则、相似理论,考虑三维地震动作用下振动台试验中原型结构隔震层的简化,并对模型结构隔震层进行系统研究。针对不同高宽比隔震结构,提出完全等效简化方法和部分等效简化方法,包括隔震垫等效、模型支座参数及坐标确定、相似关系确定等。利用不同高宽比隔震结构振动台试验,结合有限元数值模拟,进行方法验证。理论推导与数值模拟证明简化方法具有良好的准确性,且在误差允许范围内,简化后的隔震层所获得的加速度、速度、位移等动力特性与简化前相同,可以用于振动台试验模型设计。

关键词：等效原则隔震层简化相似理论振动台

Changes in Florets’Vertical Direction within Inflorescence Affects Pollinator Behavior,and Fitness in Trifolium repens

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Phyton-International Journal of Experimental Botany 2022年第8期91卷 1617-1628页

作者： Qinzheng Hou Wenjuan shao Nurbiye Ehmet Taihong Wang yifan Xu Kun Sun College of Life Sciences Northwest Normal UniversityLanzhou730070China

interactions,many flowers are known to display their attractive qualities,such as scent emission,flower rewards and floral vertical direction,in a rhythmic fashion.However,less is known about how plants regulate the relationship between these flower traits to adapt to pollinator visiting behavior and increase reproduction success.Here we investigated the adaptive significance of the flower bending from erect to downward in Trifolium repens.We observed the flowering dynamic characteristics(changes of vertical direction of florets,flowering number,pollen grain numbers,pollen viability and stigma receptivity over time after blossom)and the factors affecting the rate of flower bending in T.repens.Then we altered the vertical direction of florets in inflorescence of different types(upright and downward),and compared the pollinator behaviors and female reproductive success.Our results showed that florets opened sequentially in inflorescence,and then bend downwards slowly after flowering.The bending speed of florets was mainly influenced by pollination,and bending angle increased with the prolongation of flowering time,while the pollen germination rate,stigma receptivity and nectar secretion has a rhythm of“lowhigh-low”during the whole period with the time going.The visiting frequency of all the four species of pollinators on upward flowers was significantly higher than that of downward flowers,and they especially prefer to visit flowers with a bending angle of 30°–60°,when the flowers was exactly of the highest flower rewards(nectar secretion and number of pollen grains),stigma receptivity and pollen germination rate.The seed set ratio and fruit set ratio of upward flowers were significantly higher than downward flowers,but significantly lower than unmanipulated flowers.Our results indicated that the T.repens could increase female and male fitness by accurate pollination.The most suitable flower angle saves pollinators’visiting energy and enables them to obtain the highest nectar rewards.This coordination between plant

关键词： Trifolium repens floral vertical direction adaptive significances fitness