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1株海洋真菌Penicillium sp.的次级代谢产物及抗细菌活性研究

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中国抗生素杂志 2024年第1期49卷 35-40页

作者：章宝丹任晋玮翟亚楠贾佳蔡磊刘玲中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101 中国科学院大学北京100049 南京医科大学基础医学院南京211166

目的研究1株海洋真菌Penicillium ***23的次级代谢产物及其抗细菌活性。方法采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析及半制备高效液相色谱等方法,对该菌株发酵产物进行分离纯化;通过核磁共振波谱(NMR)和质谱(MS)等方法并比对相关文献... 详细信息

目的研究1株海洋真菌Penicillium ***23的次级代谢产物及其抗细菌活性。方法采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析及半制备高效液相色谱等方法,对该菌株发酵产物进行分离纯化;通过核磁共振波谱(NMR)和质谱(MS)等方法并比对相关文献,鉴定化合物结构;采用微量肉汤稀释法评价其体外抗菌活性。结果从菌株发酵的乙酸乙酯粗提物中分离鉴定了6个化合物,分别为methyl penicyrone(1)、penicyrone(2)、verrucosidin(3)、deoxyverrucosidin(4)、peniquinone A(5)和penipratynolene(6)。结论海洋真菌***23能产生具有抗细菌活性的化合物。化合物3和4对幽门螺杆菌Helicobacter pylori G27和三重耐药菌*** BHKS159具有中等抑菌活性;化合物5对野油菜黄单孢菌、青枯雷尔菌、枯草芽胞杆菌和耻垢分枝杆菌均具有一定程度的抑菌活性。

关键词：海洋真菌青霉属次级代谢产物抗菌活性抗幽门螺杆菌

无创性超声指标预测慢性血栓栓塞性肺动脉高压肺血管阻力的价值

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中华超声影像学杂志 2024年第2期33卷 134-141页

作者：翟亚楠李爱莉谢万木黄强高倩张郁陈爱红吕广洁雷洁萍翟振国中日友好医院心脏科北京100029 中日友好医院呼吸与危重症医学二部北京100029 中日友好医院临床医学研究所北京100029

目的探讨超声二维及三维参数预测慢性肺血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)肺血管阻力(PVR)的价值。方法回顾性及前瞻性纳入2015年11月至2022年12月在中日友好医院确诊CTEPH的患者141例。根据PVR计算公式构建反映PVR的二维超声指标:超声估测... 详细信息

目的探讨超声二维及三维参数预测慢性肺血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)肺血管阻力(PVR)的价值。方法回顾性及前瞻性纳入2015年11月至2022年12月在中日友好医院确诊CTEPH的患者141例。根据PVR计算公式构建反映PVR的二维超声指标:超声估测肺动脉收缩压(sPAPEcho)/左心室舒张末期内径(LVIDd)、肺动脉平均压(mPAPEcho)/LVIDd;三维超声指标:sPAPEcho/左心室舒张末期容积(LVEDV)、sPAPEcho/左心室心输出量(LVCO)。采用Spearman相关分析法分析二维及三维超声指标与右心导管所测PVR的相关性。采用ROC曲线分析超声心动图参数预测PVR>1000 dyn·s-1·cm-5的曲线下面积(AUC)及临界值。分析54例进行肺动脉血栓内膜剥脱术(PEA)患者术前、术后的超声及血流动力学参数的变化,以及超声指标降低率与PVR降低率的相关性。结果sPAPEcho/LVIDd、sPAPEcho/LVEDV、sPAPEcho/LVCO与PVR呈中度相关(rs=0.62、0.52、0.63,均P1000 dyn·s-1·cm-5的AUC为0.860,最佳截断值为≥1.41,敏感性为0.800,特异性为0.933。sPAPEcho/LVIDd预测PVR>1000 dyn·s-1·cm-5的AUC为0.830,最佳截断值为≥2.14,敏感性为0.647,特异性为0.861。与术前相比,PEA术后sPAPEcho/LVIDd和mPAPEcho/LVIDd显著降低(均P1000 dyn·s-1·cm-5)。

关键词：超声心动描记术慢性血栓栓塞性肺动脉高压肺血管阻力肺动脉血栓内膜剥脱术

有机磷水解酶异源表达纯化及抗乙基对氧磷中毒能力初步评价

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中国药理学与毒理学杂志 2024年第9期38卷 672-680页

作者：马铭翟亚楠王顺业张中华李前高静军事医学研究院北京100850 中国人民解放军联勤保障部队第988医院药剂科河南郑州450042

目的异源表达纯化有机磷水解酶(OPH),初步评价其动物体内抗乙基对氧磷中毒能力。方法构建OPH的大肠杆菌表达菌株,采用镍柱亲和色谱及凝胶过滤色谱进行纯化,对纯化产物进行蛋白质谱鉴定;以乙基对氧磷为底物测定酶活力及其动力学常数K_(m)... 详细信息

目的异源表达纯化有机磷水解酶(OPH),初步评价其动物体内抗乙基对氧磷中毒能力。方法构建OPH的大肠杆菌表达菌株,采用镍柱亲和色谱及凝胶过滤色谱进行纯化,对纯化产物进行蛋白质谱鉴定;以乙基对氧磷为底物测定酶活力及其动力学常数K_(m),V_(max),k_(cat)和k_(cat)/K_(m);12只SD大鼠随机分为OPH组和溶剂对照组,OPH组按1 mg·kg^(-1)剂量iv给予OPH溶液,对照组给予等体积生理盐水,给药后2组立刻sc给予2倍半数致死量(LD_(50))乙基对氧磷(0.86 mg·kg^(-1))染毒,观察大鼠状态,对中毒症状进行评分。对存活大鼠每隔24 h重复sc给予2倍LD_(50)乙基对氧磷,根据大鼠存活情况与中毒症状分别绘制生存曲线与症状评分图,评价OPH的抗有机磷中毒能力。结果成功构建了OPH的大肠杆菌表达菌株,经过两步纯化后由十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳表征得单一条带,OPH纯度较高,经蛋白质谱测定制备蛋白与目标蛋白序列一致;以乙基对氧磷为底物时,OPH的Km=7.5×10^(-5)mol·L^(-1),V_(max)=2.2×10^(-7)mol·L^(-1)·s^(-1),k_(cat)=158.4 s^(-1),k_(cat)/K_(m)=2.1×10^(6) L·mol^(-1)·s^(-1);对照组大鼠sc给予2倍LD_(50)乙基对氧磷后,出现严重中毒症状,15 min内全部死亡,实验组大鼠在首次染毒后均未出现中毒症状,连续染毒后中毒症状逐渐加重直至第4天全部死亡。结论成功制备高纯度OPH,且OPH在大鼠体内能有效对抗乙基对氧磷中毒。

关键词：有机磷化合物生物清除剂有机磷水解酶乙基对氧磷酶动力学参数

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MRI评估肝细胞癌消融治疗疗效的研究进展

磁共振成像 2024年第10期15卷 200-204页

作者：庞雅萱殷亮张静翟亚楠王寅中郭顺林兰州大学第一临床医学院兰州大学第一医院放射科

肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）是全世界第六大癌症，在中国发病率位居恶性肿瘤第四位。消融治疗具有对肝功能影响小、创伤小和并发症少等优点，已广泛应用于HCC。精准评估消融治疗后肿瘤的存活状态、局部复发及转移情况对... 详细信息

肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）是全世界第六大癌症，在中国发病率位居恶性肿瘤第四位。消融治疗具有对肝功能影响小、创伤小和并发症少等优点，已广泛应用于HCC。精准评估消融治疗后肿瘤的存活状态、局部复发及转移情况对于后续治疗至关重要。MRI是评价HCC消融疗效的重要影像手段。近年来，人工智能（artificial intelligence, AI）在肝癌MRI领域的研究日渐增多，并在消融治疗的预后预测方面展现出巨大潜力。利用AI技术整合多模态数据，如将基因数据与影像数据相结合，是未来研究的关键突破之一。本文全面综述多模态MRI及基于MRI的AI技术在评估HCC消融治疗方面的研究进展，旨在精准评估肿瘤残余及预测早期复发，为HCC个体化治疗提供参考依据。

关键词：肝细胞癌射频消融磁共振成像人工智能疗效评估

Comparison of the In Vitro and In Vivo Toxic Effects of Three Sizes of Zinc Oxide(ZnO)Particles Using Flounder Gill(FG)Cells and Zebrafish Embryos

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中国海洋大学学报：英文版 2017年第1期16卷 93-106页

作者： HAN Li zhai yanan LIU Yang HAO Linhua GUO Huarong Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding(Ocean University of China) Ministry of EducationCollege of Marine Life SciencesQingdao 266003P.R.China Institute of Evolution and Marine Biodiversity Ocean University of ChinaQingdao 266003P.R.China First Institute of Oceanography State Oceanic AdministrationQingdao 266061P.R.China

Nano-sized zinc oxide(n ZnO) particles are one kind of the most commonly used metal oxide nanoparticles(NPs). This study compared the cytotoxic and embryotoxic effects of three increasing sized ZnO particles(φ30 nm, 80-150 nm and 2 μm) in the flounder gill(FG) cells and zebrafish embryos, and analyzed the contribution of size, agglomeration and released Zn^(2+) to the toxic effects. All the tested ZnO particles were found to be highly toxic to both FG cells and zebrafish embryos. They induced growth inhibition, LDH release, morphological changes and apoptosis in FG cells in a concentration-, size-and time-dependent manner. Moreover, the release of LDH from the exposed FG cells into the medium occurred before the observable morphological changes happened. The ultrasonication treatment and addition of serum favored the dispersion of ZnO particles and alleviated the agglomeration, thus significantly increased the corresponding cytotoxicity. The released Zn^(2+) ions from ZnO particles into the extracellular medium only partially contributed to the cytotoxicity. All the three sizes of ZnO particles tested induced developmental malformations, decrease of hatching rates and lethality in zebrafish embryos, but size-and concentration-dependent toxic effects were not so obvious as in FG cells possibly due to the easy aggregation of ZnO particles in freshwater. In conclusion, both FG cells and zebrafish embryos are sensitive bioassay systems for safety assessment of ZnO particles and the environmental release of ZnO particles should be closely monitored as far as the safety of aquatic organisms is concerned.

关键词： zinc oxide (ZnO) nanoparticles cytotoxicity embryotoxicity zebrafish fish cells

支气管哮喘患儿血清miR-125a表达与气道重塑的相关性

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检验医学 2024年第9期39卷 847-852页

作者：翟亚南杜云广王敏郭庆生李茜张家口市第四医院药剂科河北张家口075000 张家口市市场监督管理综合执法局河北张家口075000 唐县人民医院儿科河北保定072350 张家口市第四医院耳鼻喉科河北张家口075000

目的探讨支气管哮喘患儿血清miR-125a表达与气道重塑的相关性。方法选取2020年1月—2022年12月张家口市第四医院支气管哮喘患儿231例(哮喘组)和体检健康儿童231名(正常对照组)。检测所有研究对象血清miR-125a相对表达量和肺功能指标[第... 详细信息

目的探讨支气管哮喘患儿血清miR-125a表达与气道重塑的相关性。方法选取2020年1月—2022年12月张家口市第四医院支气管哮喘患儿231例(哮喘组)和体检健康儿童231名(正常对照组)。检测所有研究对象血清miR-125a相对表达量和肺功能指标[第1秒用力呼气容积(FEV1)、用力肺活量(FVC)、FEV1占FVC的百分比(FEV1/FVC%)]、气道重塑指标[气道内径(L)、气道外径(D)、气道总面积(Ao)、气道腔面积(Ai)、支气管管壁厚度(T)/D比值、气道壁面积占气道总截面积的百分比(WA%)]、气道重塑相关血清学指标[转化生长因子-β1(TGF-β1)、骨桥蛋白(OPN)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)]。采用Pearson相关分析评估各项指标之间的相关性。采用受试者工作特征(ROC)曲线评价miR-125a判断支气管哮喘患儿病情的效能。采用Logistic回归分析评估支气管哮喘患儿病情加重的危险因素。结果与正常对照组比较,哮喘组血清miR-125a相对表达量和FEV1、FVC、FEV1/FVC%均降低(P0.05)。哮喘组miR-125a与FEV1、FVC、FEV1/FVC%均呈正相关(r值分别为0.342、0.373、0.465,P0.05)。正常对照组miR-125a与其他指标均无相关性(P>0.05)。急性发作期组miR-125a相对表达量显著低于临床缓解期组(P<0.001),TGF-β1、OPN、MMP-9水平显著高于临床缓解期组(P<0.001)。轻度组、中度组、重度组miR-125a相对表达量依次降低(P<0.001),TGF-β1、OPN、MMP-9水平依次升高(P<0.001)。miR-125a诊断重度支气管哮喘的ROC曲线下面积(AUC)为0.831。TGF-β1≥367.20 ng·L^(–1)、MMP-9≥123.19μg·L^(–1)、miR-125a≤0.34是患儿支气管哮喘急性发作的危险因素(P<0.05)。结论支气管哮喘患儿血清miR-125a水平显著降低,且与患儿肺功能和气道重塑密切相关,或可作为支气管哮喘患儿病情评估的指标。

关键词： miR-125a 支气管哮喘肺功能气道重塑

Efficient inversions and duplications of mammalian regulatory DNA elements and gene clusters by CRISPR/Cas9

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分子细胞生物学报:英文版 2015年第4期7卷 284-298页

作者： Jinhuan Li Jia Shou YaGuo Yuanxiao Tang YonghuWu Zhilian Jia yanan zhai Zhifeng Chen Quan Xu Qiang Wu Key Laboratory of Systems Biomedicine(Ministry of Education) Center for Comparative BiomedicineInstitute of Systems BiomedicineShanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China State Key Laboratory of Oncogenes and Related Genes Shanghai Cancer InstituteRenji HospitalSchool of MedicineShanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China Key Laboratory for the Genetics of Developmental and Neuropsychiatric Disorders Ministry of EducationBio-X CenterSchool of Life Sciences and BiotechnologyShanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine Shanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 200240China

The human genome contains millions of DNA regulatory elements and a large number of gene clusters,most of which have not been tested *** clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated nuclease 9(Cas9)programed with a synthetic single-guide RNA(sgRNA)emerges as a method for genome editing in virtually any *** we report that targeted DNA fragment inversions and duplications could easily be achieved in human and mouse genomes by CRISPR with two ***,we found that,in cultured human cells and mice,efficient precise inversions of DNA fragments ranging in size froma few tens of bp to hundreds of kb could be *** addition,DNA fragment duplications and deletions could also be generated by CRISPR through trans-allelic recombination between the Cas9-induced double-strand breaks(DSBs)on two homologous chromosomes(chromatids).Moreover,junctions of combinatorial inversions and duplications of the protocadherin(Pcdh)gene clusters induced by Cas9 with four sgRNAs could be *** mice,we obtained founders with alleles of precise inversions,duplications,and deletions of DNA fragments of variable sizes by ***,we found that very efficient inversions were mediated by microhomology-mediated end joining(MMEJ)through short inverted *** showed for the first time that DNA fragment inversions could be transmitted through germlines in ***,we applied this CRISPR method to a regulatory element of the Pcdha cluster and found a new role in the regulation of members of the Pcdhg *** simple and efficient method should be useful in manipulating mammalian genomes to study millions of regulatory DNA elements as well as vast numbers of gene clusters.

关键词： DNA regulatory element inversion duplication deletion CRISPR/Cas9 enhancer genome manipulation gene cluster

基于ICP-MS对三七血伤宁散中16种无机元素的分析及质量评价

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特产研究 2024年第3期46卷 129-136,143页

作者：翟雅南廖海琳高美美蒋凌风李建华广西中医药大学科学实验中心广西南宁530200 桂林三金药业股份有限公司广西桂林541004

采用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)对三七血伤宁散(SQXSNP)中无机元素组成进行分析并建立相关指纹图谱,为产品质量均一性和安全性评价提供参考。以HNO_(3)为消解溶剂,采用ICP-MS法定量测定三七血伤宁散中无机元素的含量,通过无机元素特... 详细信息

采用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)对三七血伤宁散(SQXSNP)中无机元素组成进行分析并建立相关指纹图谱,为产品质量均一性和安全性评价提供参考。以HNO_(3)为消解溶剂,采用ICP-MS法定量测定三七血伤宁散中无机元素的含量,通过无机元素特征图谱,Pearson相关系数对结果进行分析;通过聚类分析结合主成分分析(PCA)对质量均一性进行评价。三七血伤宁散中无机元素以Mg、Fe、Al、Mn和Zn为主,且不同元素含量之间具有一定相关性。Cu和As这两种重金属元素的限量符合药典相关限度规定。不同批次的样品谱图均有相似的峰形。指纹图谱、聚类分析及主成分分析结果表明,三七血伤宁散中无机元素的质量均一性较好,主要特征元素为Li、Ga、Fe、Mg、V、Ni和Sr。本研究操作方法简便、分析速度快、准确度高,适用于三七血伤宁散中无机元素的测定,可为三七血伤宁散的质量评价和综合利用提供理论依据。

关键词：三七血伤宁散电感耦合等离子体质谱法无机元素主成分分析

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Molecular Cloning and Expression of PoIR2,a Novel Gene Involved in Immune Response in Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus)

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Journal of Ocean University of China 2010年第1期9卷 59-64页

作者： LI Shuo LI Chunmei WANG Xubo WANG yanan LIU Zhipeng zhai Teng ZHANG Quanqi College of Marine Life Sciences Ocean University of China Qingdao 266003 P. R. China

A novel immune-related gene was expressed in Japanese flounder （Paralichthys olivaceus） injected with Vibrio anguillarum. The complete cDNA contained a 169 bp 5＇UTR, a 336 bp open reading frame （ORF） encoding 111 amino acids and a 556bp 3＇UTR. Six exons and five introns were identified in the PoIR2 gene. Blastp similarity comparison showed its encoding protein had 50% similarity to Danio rerio neuromedin S （NMS）, but further alignment indicated they did not have NMS C-terminal conservational signature domain. So it was not defined as an NMS homologue. Protein structure analysis indicated it had a 26aa sig- nal peptide and was a secretory pathway protein. RT-PCR demonstrated that the expression of PoIR2 was quickly induced and drastically increased in liver, kidney, spleen, gills, intestine, heart, and skeletal muscle after infected with V. anguillarurn. These results indicated that the PolR2 might play some important role in Japanese flounder immune response system. This gene was named PolR2 （*** immune-related gene 2, GenBank accession number： EU224372）. The mature PoIR2 peptide was expressed in BL21 （DE3） pLysS using pET-32a（＋） vector and a great part of the recombinant mature peptide existed as soluble type.

关键词： Paralichthys olivaceus Vibrio anguillarum immune-related gene (PoIR2) tissue expression prokaryotic expression