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High-dimensional immune profiling by mass cytometry revealed immunosuppression and dysfunction of immunity in COVID-19 patients

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Cellular & Molecular Immunology 2020年第6期17卷 650-652页

作者： Wenjing Wang Bin Su Lijun Pang Luxin Qiao Yingmei Feng yabo ouyang Xianghua Guo Hongbo Shi Feili Wei Xiaogang Su Jiming Yin Ronghua Jin Dexi Chen Beijing Institute of Hepatology Beijing Youan HospitalCapital Medical University100069 BeijingChina Beijing Precision Medicine and Transformation Engineering Technology Research Center of Hepatitis and Liver Cancer 100069 BeijingChina Center for Infectious Diseases Beijing Youan HospitalCapital Medical University100069 BeijingChina

The outbreak of coronavirus disease 2019(COVID-19)caused by the new virus SARS-CoV-2 has been announced as a public health emergency of international concern.1–3 The clinical features of patients with COVID-19 range from common fever and cough to other rare symptoms,such as diarrhea and *** disease can progress quickly,and 2–3%of patients die within a short time,which is generally due to multiple organ failure.4–7 Clinically,COVID-19 patients are classified into mild,moderate,severe,and critical cases.5–7 The immune response against SARS-CoV-2 is probably linked to the severity of ***,Zheng et al.8 showed that elevated levels of T-cell exhaustion and reduced functional diversity of T cells in peripheral blood may predict severe progression in COVID-19 patients;however,a more comprehensive understanding of the pathology of SARS-CoV-2 infection remains to be ***,we profiled immune cellular components using mass cytometry(CyTOF)to analyze the peripheral blood mononuclear cells(PBMCs)from patients with differences in disease progression by comparing with the PBMCs from healthy donors(HDs).

关键词： patients immunity elevated

Advances in artificial intelligence techniques drive the application of radiomics in the clinical research of hepatocellular carcinoma

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iLIVER 2022年第1期1卷 49-54页

作者： Jingwei Wei Meng Niu ouyang yabo Yu Zhou Xiaoke Ma Xue Yang Hanyu Jiang Hui Hui Hongyi Cao Binwei Duan Hongjun Li Dawei Ding Jie Tian Key Laboratory of Molecular Imaging Institute of AutomationChinese Academy of SciencesBeijing 100190China Beijing Key Laboratory of Molecular Imaging Beijing 100190China Department of Interventional Radiology The First Affiliated Hospital of China Medical UniversityShenyangLiaoning110000China Beijing YouAn Hospital Capital Medical UniversityBeijing Institute of HepatologyBeijing100069China School of Life Science and Technology Xidian UniversityXi'anChina School of Computer Science and Technology Xidian UniversityXi'anShaanxiChina Department of Radiology Beijing Youan HospitalCapital Medical UniverstiyBeijing100069China Department of Radiology West China HospitalSichuan UniversityChengduSichuan 610041China Department of Pathology College of Basic Medical ScienceChina Medical UniversityShenyangLiaoning110000China The Department of General Surgery Center Beijing YouAn HospitalCapital Medical UniversityChina School of Bioengineering Beihang UniversityBeijing100191China School of Automation and Electrical Engineering University of Science and Technology BeijingBeijing 100083China Beijing Advanced Innovation Center for Big Data-Based Precision Medicine School of Medicine Beihang UniversityBeijing100191China Engineering Research Center of Molecular and Neuro Imaging of Ministry of Education School of Life Science and TechnologyXidian UniversityXi'anShaanxi710126China

Hepatocellular carcinoma(HCC)remains the most common malignancy to threaten public health *** advances in artificial intelligence techniques,radiomics for HCC management provides a novel perspective to solve unmet needs in clinical settings,and reveals pixel-level radiological information for medical imaging big data,correlating the radiological phenotype with targeted clinical *** radiomics pipelines depend on handcrafted engineering features,and further deep learning-based radiomics pipelines are supplemented with deep features calculated via self-learning *** the past decade,radiomics has been widely applied in accurate diagnoses and pathological or biological behavior evaluation,as well as in prognosis *** this review,we systematically introduce the main pipelines of artificial intelligence-based radiomics and their efficacy in the clinical studies of HCC.

关键词： Artificial intelligence Diagnosis Hepatocellular carcinoma Prognosis Radiomics

Plasma sCD40L,a most hopeful protein biomarker,for the early diagnosis of hepatocellular carcinoma(screen early HCC from liver cirrhosis patients)

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Plasma sCD40L,a most hopeful protein biomarker,for the early...

浅谈跨学科培养对医学研究生综合素质提升的重要性

2019年中国肿瘤标志物学术大会暨第十三届肿瘤标志物青年科学家论坛

作者： Yin,Jiming Pang,Lijun ouyang,yabo Chen,Dexi Wei,Feili Beijing Institute of Hepatology.Beijing Youan Hospital Capital Medical University Beijing Precision Medicine and Transformation Engineering Technology Research Center of Hepatitis and Liver Cancer

Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most prevalent cancers *** tons of studies revealed cirrhosis was associated with development of primary HCC,earlier detection of primary HCC among patients with cirrhosis or other high risk population is clinical *** current work identified sCD40L as biomarker in plasma for earlier detection of HCC among patients with ***,

关键词：

来源： cnki会议评论

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继续医学教育 2020年第4期34卷 50-51页

作者：潘兴富欧阳雅博首都医科大学附属北京佑安医院北京市肝病研究所北京100069 北京市化工职业病防治院检测研究中心北京100093

伴随前沿科学技术的出现、快速发展和推广应用,医学领域研究由纵深研究逐渐向跨学科跨专业横向拓展研究方向发展。医学研究生在学习培养过程中,建立跨学科跨专业的交叉思维,对今后拓展科研广度及提升综合素质至关重要。文章充分分析了... 详细信息

伴随前沿科学技术的出现、快速发展和推广应用,医学领域研究由纵深研究逐渐向跨学科跨专业横向拓展研究方向发展。医学研究生在学习培养过程中,建立跨学科跨专业的交叉思维,对今后拓展科研广度及提升综合素质至关重要。文章充分分析了医学跨学科培养在满足医学科学创新与发展需求方面、培养复合型医学人才方面、培养医学研究生突破性创新方面、为医学研究生提供持续创新动力方面的必要性;同时,明确阐述了医学跨学科培养对医学研究生的跨学科思维方式、综合能力提升、科研创新、课题方向等方面的重要意义;并对医学研究生跨学科培养的方式进行初步探讨和分析。

关键词：医学研究生跨学科培养综合素质科研创新跨学科思维创新动力

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射频消融亚致死性温度对肝癌干细胞的影响

介入放射学杂志 2017年第7期26卷 636-640页

作者：郝美君刘凯郭向华欧阳雅博乔录新石英陈德喜郑加生首都医科大学附属北京佑安医院北京市肝病研究所

目的研究亚致死温度射频消融(RFA)对肝癌干细胞(LCSC)产生及其相关转录因子表达的影响。方法利用小鼠Hep1-6肝癌细胞株和肝细胞癌(HCC)患者临床样品,检测LCSC相关标志物和转录因子的表达。结果不同温度分别刺激Hep1-6细胞后发现,45℃是... 详细信息

目的研究亚致死温度射频消融(RFA)对肝癌干细胞(LCSC)产生及其相关转录因子表达的影响。方法利用小鼠Hep1-6肝癌细胞株和肝细胞癌(HCC)患者临床样品,检测LCSC相关标志物和转录因子的表达。结果不同温度分别刺激Hep1-6细胞后发现,45℃是不能诱导细胞死亡的亚致死性温度。流式细胞仪(FCM)检测显示45℃处理可引起CD13^+、CD44^+、CD90^+、CD133^+Hep1-6细胞水平明显上调,提示45℃温度导致Hep1-6细胞中以上各型LCSC产生增加;实时定量聚合酶链反应(RT-q PCR)检测显示45℃温度导致CD13、CD90、CD133 m RNA水平明显上调。CD13 m RNA水平在5例HCC患者复发肝癌组织中均明显上调,CD133 m RNA在4例复发肝癌中上调,CD90 m RNA仅在1例复发肝癌中上调;FCM检测显示CD13^+LCSC水平在4例复发肝癌中明显上调,CD133^+LCSC水平仅在1例复发肝癌中上调,提示CD13^+LCSC水平上调与45℃温度关系更密切。RT-q PCR检测显示4例CD13^+LCSC上调的复发肝癌患者13个LCSC相关转录因子中Sox2、Stat1明显上调,FCM检测显示45℃处理Hep1-6细胞后Sox2、Stat1 m RNA明显上调。用Sox2、Stat1 si RNA分别沉默了Sox2、Stat1基因,表明Sox2、Stat1均参与了45℃温度诱导的CD13^+LCSC产生。结论 RFA治疗中45℃亚致死性温度所致CD13^+LCSC水平增高与Sox2、Stat1表达有关。该结果对肝癌复发研究有一定借鉴意义。

关键词：肝细胞癌射频消融亚致死温度肝癌干细胞

HIV-1CRF_07BC重组型逆转录酶区耐药进化通路分析

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中华预防医学杂志 2014年第4期48卷 301-306页

作者：李臻鹏黄洋欧阳雅博邢辉廖玲洁邵一鸣马丽英中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心传染病预防控制国家重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心北京102206

目的探讨HIV-1的CRF_07BC重组型在药物压力下的进化通路,并与B亚型进行比较.方法病毒样本来自2007-2011年新疆维吾尔自治区和四川省参加艾滋病多中心队列研究的共862例AIDS患者.根据未治疗的588例和治疗的274例AIDS患者病毒样本的逆... 详细信息

目的探讨HIV-1的CRF_07BC重组型在药物压力下的进化通路,并与B亚型进行比较.方法病毒样本来自2007-2011年新疆维吾尔自治区和四川省参加艾滋病多中心队列研究的共862例AIDS患者.根据未治疗的588例和治疗的274例AIDS患者病毒样本的逆转录酶区序列,采用选择压力的方法识别耐药相关位点,使用贝叶斯网络法构建CRF 07BC重组型在抗病毒治疗下的耐药进化通路,同时利用国际HIV耐药数据库中的数据构建B亚型在相同治疗方案下耐药进化通路,并与CRF_07BC重组型进行比较.结果预测的CRF_07BC重组型主要耐药位点为K103N、Q197K、V179D和Y188L.预测的B亚型主要耐药位点为M184V、K103N、Y181C、T69N、G190A、K238T、Y188H和P225H.两者重叠较小,但经典的TAM1（41L、210W和215Y）和TAM2（67N、70R和219E/Q）通路均存在于两个病毒类型中.不同于B亚型的是,预测的CRF_07BC重组型的主要耐药位点中不包含TAM相关突变,并且在核苷类药物相关突变与非核苷类药物相关突变之间存在强的依赖关系.结论 HIV-1 CRF_07BC重组型形成了以K103N、Q197K、V179D和Y188L为主要耐药位点的独特耐药进化通路,并与B亚型的耐药进化通路有较大差异.

关键词：生物进化耐药进化通路耐药位点

乙肝相关慢加急性肝衰竭患者肝移植术后影响生存的危险因素分析

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国际外科学杂志 2022年第1期49卷 40-46,F0004页

作者：段斌炜李娟张宫铭欧阳雅博栗光明首都医科大学附属北京佑安医院普通外科中心 100069 首都医科大学附属北京佑安医院呼吸与感染疾病科 100069 北京市肝病研究所 100069

目的探讨影响乙肝相关慢加急性肝衰竭患者实施肝移植后短期病死率与长期生存的危险因素。方法本研究通过前瞻性收集自2018年8月—2021年7月在首都医科大学附属北京佑安医院因乙肝相关慢加急性肝衰竭实施肝移植的患者40例,其中男性36例... 详细信息

目的探讨影响乙肝相关慢加急性肝衰竭患者实施肝移植后短期病死率与长期生存的危险因素。方法本研究通过前瞻性收集自2018年8月—2021年7月在首都医科大学附属北京佑安医院因乙肝相关慢加急性肝衰竭实施肝移植的患者40例,其中男性36例、女性4例,年龄为(44.5±8.79)岁。统计患者的基本资料、发病情况、肝移植前48 h内的肝肾功能、血常规、凝血功能、乳酸、感染指标等以及MELD评分、MELD-Na评分、CLIF-C ACLFs评分、CLIF OFs评分、CLIF分级等指标,观察术后90 d内死亡及长期生存情况,并根据肝移植术后3个月内存活情况,分为存活组(n=34)与死亡组(n=6)。符合正态分布的计量资料采用均数±标准差(±s)表示,组间比较采用t检验;偏态分布的计量资料采用M(Q_(1),Q_(3))表示,组间比较采用秩和检验。计数资料采用χ^(2)检验或Fisher确切概率法检验值。通过单因素与多因素分析方法以及生存分析,发现影响肝移植术后短期死亡与长期存活的危险因素,并利用ROC曲线计算敏感度与特异度以及cut-off值。以CLIF-C ACLFs评分48.5分为临界值,把患者分为≥48.5分组(n=10)与<48.5分组(n=30),采用Kaplan-Meier进行生存分析比较。结果40例患者肝移植前48 h内的总胆红素、肌酐、血小板计数、国际标准化比值、乳酸、中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)分别为24.30(13.45,33.95)mg/dL、0.68(0.53,1.11)mg/dL、56(39,82)×109/L、3.12(2.33,4.46)、2.14(1.59,4.14)mmol/L、4.06(2.12,9.13),MELD、MELD-Na、CLIF OFs、CLIF-C ACLFs、AARC评分分别是(32.1±6.3)、(33.2±5.3)、(11.2±2.6)、(43.8±8.8)、(10.6±2.4)分。在40例患者中,有26例患者并发了肝性脑病,17例患者移植前存在可以控制的全身感染,10例患者合并肾功能损伤,6例患者行呼吸机辅助通气(气管插管),2例患者合并上消化道出血。40例患者均实施了紧急的同种异体原位肝移植术,术后并发症的发生率为47.5%,最常见的为移植后感染(27.5%),其次为肾功能不全(17.5%)。肝移植术后3个月内共有6例患者死亡,病死率为14.5%。存活组与死亡组的移植前临床资料比较,显示两组患者在中性粒细胞淋巴细胞比值(NLR)、乳酸、MELD评分、MELD-Na评分、CLIF-C ACLFs评分、CLIF OF评分、CLIF分级、肝性脑病、感染、肾功能损伤等均有显著差异(P<0.05)。单因素Logistic回归分析显示,肝移植前48 h内的NLR、MELD-Na评分、CLIF-C ACLFs评分、CLIF OF评分是影响肝移植术后短期死亡的危险因素(P<0.05),进一步多因素回归分析显示,CLIF-C ACLFs评分是影响肝移植术后3个月病死率的独立危险因素。采用ROC曲线显示,CLIF-C ACLFs评分的曲线下面积为0.895(95%CI:0.779~1.000,P=0.002),cut-off值为48.5分时诊断敏感度和特异度最高,分别为83.3%和85.3%。同时,CLIF-C ACLFs评分≥48.5分组与<48.5分组的生存分析比较,显示两组在长期生存率上有显著差异(P=0.001)。结论移植前48 h内的NLR、MELD-Na评分、CLIF-C ACLFs评分、CLIF OF评分是影响乙肝相关慢加急性肝衰竭患者实施肝移植术后短期死亡的危险因素,而CLIF-C ACLFs评分是乙肝相关慢加急性肝衰竭患者实施肝移植术后3个月病死率和长期生存的独立危险因素。

关键词：乙型肝炎慢加急性肝衰竭病死率生存 CLIF-C ACLFs评分

PD-1抑制剂联合TKIs治疗中晚期肝细胞癌后实施肝移植的可行性探讨

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中华肝胆外科杂志 2022年第1期28卷 28-32页

作者：段斌炜李文磊曹俊宁张雯雯胡丙洋武聚山张宫铭欧阳雅博卢实春栗光明首都医科大学附属北京佑安医院普通外科中心&器官移植中心北京100069 青岛大学附属医院器官移植中心青岛266100 解放军总医院肝胆胰外科医学部北京100853 北京市肝病研究所北京100069

目的:探讨中晚期肝细胞癌患者接受程序性死亡蛋白-1(PD-1)抑制剂联合酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)治疗后实施肝移植的安全性及有效性。方法:回顾性分析首都医科大学附属北京佑安医院与解放军总医院第一医学中心2019年1月至2020年12月中晚期... 详细信息

目的:探讨中晚期肝细胞癌患者接受程序性死亡蛋白-1(PD-1)抑制剂联合酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)治疗后实施肝移植的安全性及有效性。方法:回顾性分析首都医科大学附属北京佑安医院与解放军总医院第一医学中心2019年1月至2020年12月中晚期肝细胞癌实施肝移植的6例患者资料,均为男性,年龄(57.5±4.3)岁。分析移植前肿瘤分期、PD-1抑制剂使用情况、移植时PD-1抑制剂停用时长,以及术后肝功能恢复、并发症等情况。门诊复查随访肿瘤复发、无瘤生存情况等。结果:6例中晚期肝细胞癌患者移植前接受了PD-1抑制剂联合TKIs治疗,其中4例肿瘤为巴塞罗那临床肝癌分期(BCLC)C期或中国肝癌分期(CNLC)Ⅲa期,2例为BCLC-B期或CNLC-Ⅱb期。6例患者使用PD-1抑制剂1~20个周期,平均5.5个周期,停用PD-1抑制剂至肝移植时间间隔12~45 d,平均19.5 d。6例患者经PD-1抑制剂联合TKIs治疗后达到肝移植标准,均成功实施了同种异体原位肝移植,术后肝功能恢复良好,无急性排斥反应和其他严重并发症发生。随访时间范围8.2~27.3个月,中位时间11.9个月。随访结束时无患者死亡,2例肿瘤复发。4例患者无肿瘤复发,无瘤生存期2.9~27.3个月,平均10.9个月。结论:肝移植前使用PD-1抑制剂联合TKIs治疗有可能使中晚期肝细胞癌患者获益,并且不会增加移植后急性排斥反应与其他并发症的发生。

关键词：癌,肝细胞肝移植程序性死亡蛋白-1抑制剂酪氨酸激酶抑制剂

肝癌细胞中AFP与RAR相互作用的实验研究

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北京医学 2017年第12期39卷 1258-1260,I0002页

作者：王珊珊庞丽君欧阳雅博乔录新陈德喜李刚首都医科大学附属北京佑安医院北京市肝病研究所北京市肝炎与肝癌精准医疗及转化工程技术研究中心100069 北京大学医学部基础医学院生物化学与分子生物学系

目的探讨甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)与维甲酸受体(retinoic acid receptor,RAR)之间的相互作用。方法采用免疫荧光、荧光能量共振转移(fluorescence resonance energy transfer,Fret)及免疫共沉淀实验验证肝癌细胞系Hep G2和SMMC-7721胞质中AFP与RAR之间的相互关系。结果在胞质中AFP与RAR存在共定位现象,Fret结果显示,两者之间存在很高的能量转移效率,分别为21%和19%。免疫共沉淀实验结果显示,胞质中AFP与RAR存在相互作用。结论 AFP与RAR存在相互作用,为后续研究AFP的生物学功能,以及维甲酸的药物疗效提供实验基础。

关键词：甲胎蛋白维甲酸受体免疫共沉淀