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Defective mitochondrial function by mutation in THICK ALEURONE 1 encoding a mitochondrion-targeted single-stranded DNA-binding protein leads to increased aleurone cell layers and improved nutrition in rice

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Molecular Plant 2021年第8期14卷 1343-1361页

作者： Dong-Qi Li Xiao-Ba Wu Hai-feng Wang xue feng Shi-Juan Yan Sheng-Yang Wu Jin-Xin Liu xue-feng yao Ai-Ning Bai Heng Zhao Xiu-Fen Song Lin Guo Shi-Yong Zhang Chun-Ming Liu Key Laboratory of Plant Molecular Physiology Institute of BotanyChinese Academy of SciencesBeijing 100093China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100864China Rice Research Institute Shandong Academy of Agricultural SciencesJinan 250100China Guangdong Key Laboratory for Crop Germplasm Resources Preservation and Utilization Agro-biological Gene Research CenterGuangdong Academy of Agricultural SciencesGuangzhou 510640China lnstitute of Crop Sciences Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China School of Advanced Agricultural Sciences Peking UniversityBeijing 100871China Innovative Academy of Seed Design Chinese Academy of SciencesBeijing 100101China

Cereal endosperm comprises an outer aleurone and an inner starchy *** these two tissues have the same developmental origin,they differ in morphology,cell fate,and storage product accumulation,with the mechanism largely ***,we report the identification and characterization of rice thick aleurone 1(ta1)mutant that shows an increased number of aleurone cell layers and increased contents of nutritional factors including proteins,lipids,vitamins,dietary fibers,and *** identified that the TA1 gene,which is expressed in embryo,aleurone,and subaleurone in caryopses,encodes a mitochondrion-targeted protein with single-stranded DNA-binding activity named *** analyses revealed that the increased aleurone cell layers in ta1 originate from a developmental switch of subaleurone toward aleurone instead of starchy endosperm in the wild *** found that TA1/OsmtSSB1 interacts with mitochondrial DNA recombinase RECA3 and DNA helicase TWINKLE,and downregulation of REC A3 or TWINKLE also leads to ta1-like *** further showed that mutation in TA1/OsmtSSB1 causes elevated illegitimate recombinations in the mitochondrial genome,altered mitochondrial morphology,and compromised energy supply,suggesting that the OsmtSSB1-mediated mitochondrial function plays a critical role in subaleur one cell-fate determination in rice.

关键词： rice thick aleurone cell-fate determination nutritional improvement mitochondria

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Molecular Plant 2022年第10期15卷 1638-1639页

作者： Dong-Qi Li Xiao-Ba Wu Hai-feng Wang xue feng Shi-Juan Yan Sheng-Yang Wu Jin-Xin Liu xue-feng yao Ai-Ning Bai Heng Zhao Xiu-Fen Song Lin Guo Shi-Yong Zhang Chun-Ming Liu 不详

(Molecular Plant 14,1343–1361;August 22021)During the revision of the manuscript above,we inadvertently duplicated the picture of ta1 complementation transgenic seed from Figure 3D8 into Figure 1B5 and incorrectly specified that it was a picture of the wild *** picture of Figure 1B5 was correct in the original submission,and no comments or suggestions were made from either the editors or the reviewers regarding the pictures *** image correction does not affect the figure legends,results,or any of the *** 1B5 has thus been rectified in the corrected picture *** authors apologize for the error.

关键词： Figure correction specified

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An efficient TILLING platform for cultivated tobacco

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Journal of Integrative Plant Biology 2020年第2期62卷 165-180页

作者： Yu-Long Gao xue-feng yao Wen-Zheng Li Zhong-Bang Song Bing-Wu Wang Yu-Ping Wu Jun-Li Shi Guan-Shan Liu Yong-Ping Li Chun-Ming Liu Key Laboratory of Tobacco Biotechnological Breeding National Tobacco Genetic Engineering Research CenterYunnan Academy of Tobacco Agricultural SciencesKunming 650021China Key Laboratory of Plant Molecular Physiology Institute of Botanythe Chinese Academy of SciencesBeijing 100093China The University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Tobacco Research Institute the Chinese Agriculture Academy of SciencesQingdao 266101China Institute of Crop Sciences the Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

Targeting-induced local lesions in genomes(TILLING)is a powerful reverse-genetics tool that enables high-throughput screening of genomic variations in *** TILLING has been developed for many diploid plants,the technology has been used in very few polyploid species due to their genomic ***,we established an efficient capillary electrophoresis-based TILLING platform for allotetraploid cultivated tobacco(Nicotiana tabacum L.)using an ethyl methanesulfonate(EMS)-mutagenized population of 1,536 *** optimized the procedures for endonuclease preparation,leaf tissue sampling,DNA extraction,normalization,pooling,PCR amplification,heteroduplex formation,and capillary *** a test screen using seven target genes with eight PCR fragments,we obtained 118 *** mutation density was estimated to be approximately one mutation per 106kb on *** analyses showed that mutations in two heavy metal transporter genes,HMA2S and HMA4T,led to reduced accumulation of cadmium and zinc,which was confirmed independently using CRISPR/Cas9 to generate knockout *** results demonstrate that this powerful TILLING platform(available at http://***)can be used in tobacco to facilitate functional genomics applications.

关键词： An efficient TILLING platform cultivated tobacco HMA

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抗生素发酵过程优化调度模型的研究

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化工自动化及仪表 2005年第4期32卷 15-17页

作者：薛耀锋袁景淇上海交通大学自动化系上海200030

对抗生素多罐并行发酵过程进行了分析,将任务、设备和事件之间的分配关系表达为两类0-1变量,建立了一个基于连续时间的抗生素多罐并行发酵过程优化调度的M ILP(混合整数线性规划)模型。该模型整数变量少,求解速度快,并给出了最短生产时... 详细信息

对抗生素多罐并行发酵过程进行了分析,将任务、设备和事件之间的分配关系表达为两类0-1变量,建立了一个基于连续时间的抗生素多罐并行发酵过程优化调度的M ILP(混合整数线性规划)模型。该模型整数变量少,求解速度快,并给出了最短生产时间和罐批最优生产序列。最后以头孢菌素发酵过程为例证明了此调度模型的可行性和有效性。

关键词：发酵过程优化调度混合整数线性规划

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面向自适应学习的不同认知风格学习者眼动模型研究

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现代教育技术 2020年第8期30卷 91-97页

作者：薛耀锋曾志通华东师范大学教育信息技术学系上海200062 华东师范大学上海数字化教育装备工程技术研究中心上海200062

基于生理数据的自适应学习系统能够识别学习者的情感与认知,对于提升系统的个性化服务能力和学习者的使用体验意义重大。基于此,文章首先提出了基于眼动追踪的自适应学习框架,根据已有的认知风格理论,此框架可分析不同认知风格学习者的... 详细信息

基于生理数据的自适应学习系统能够识别学习者的情感与认知,对于提升系统的个性化服务能力和学习者的使用体验意义重大。基于此,文章首先提出了基于眼动追踪的自适应学习框架,根据已有的认知风格理论,此框架可分析不同认知风格学习者的眼动模式差异。在此基础上,考虑眼动行为中注视总持续时间和注视点数量,文章构建了基于眼动追踪的在线学习者认知风格识别模型,并通过眼动实验验证了此模型的可行性和有效性,为自适应学习系统的设计与开发提供了新的解决方案。

关键词：自适应学习智能学习系统认知风格眼动模型

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基于眼动追踪技术的在线学习认知负荷量化模型研究

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现代教育技术 2019年第7期29卷 59-65页

作者：薛耀锋李卓玮华东师范大学教育信息技术学系上海200062 华东师范大学上海数字化教育装备工程技术研究中心上海200062

与传统课堂学习相比,在线学习具有信息量大、复杂度高的特点,对在线学习者的学习效果具有一定的负面影响。在分析认知负荷与眼动追踪技术的基础上,文章结合注视时间、注视点个数、瞳孔直径等三项眼动指标,构建了基于眼动追踪技术的在线... 详细信息

与传统课堂学习相比,在线学习具有信息量大、复杂度高的特点,对在线学习者的学习效果具有一定的负面影响。在分析认知负荷与眼动追踪技术的基础上,文章结合注视时间、注视点个数、瞳孔直径等三项眼动指标,构建了基于眼动追踪技术的在线学习认知负荷量化模型。随后,文章通过在线学习环境下的学习者认知负荷测试实验,结合大量眼动实验数据,验证了量化模型的可行性和准确性。基于眼动追踪技术的在线学习认知负荷量化模型的提出,可为生理指标测试工具应用于在线学习提供有价值的理论参考。

关键词：眼动追踪技术在线学习认知负荷

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带容量约束的多车调度暂态混沌神经网络算法

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上海交通大学学报 2006年第7期40卷 1148-1151页

作者：孙华丽谢剑英薛耀锋上海交通大学自动化系上海200030

带容量约束的多车调度问题是典型的NP-hard问题,利用模糊C均值聚类算法的相似性分类原理及混沌神经网络的全局搜索能力和高搜索效率,提出了一种快速且易于实现的新的混合启发式算法.该算法分为用模糊C均值聚类算法将所有客户按车容量要... 详细信息

带容量约束的多车调度问题是典型的NP-hard问题,利用模糊C均值聚类算法的相似性分类原理及混沌神经网络的全局搜索能力和高搜索效率,提出了一种快速且易于实现的新的混合启发式算法.该算法分为用模糊C均值聚类算法将所有客户按车容量要求装车和用暂态混沌神经网络方法对每条路线排序两个阶段.实例计算以及与其他算法比较表明,该算法是一种求解多车调度问题的可行且高效的方法.

关键词：车辆调度模糊C均值聚类暂态混沌神经网络混合优化算法

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基于支持向量机的物流服务顾客满意度评价模型

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上海交通大学学报 2006年第4期40卷 684-688页

作者：孙华丽谢剑英薛耀锋上海交通大学自动化系上海200240

提出了一种新的基于支持向量机(SVM)的物流服务顾客满意度(CSD)评价方法.归纳了物流服务CSD指标体系的设计原则,给出了具体的评价指标体系并采用模糊隶属函数和二元对比排序法对其进行量化.将量化后的指标因素集作为SVM的训练集,采用一... 详细信息

提出了一种新的基于支持向量机(SVM)的物流服务顾客满意度(CSD)评价方法.归纳了物流服务CSD指标体系的设计原则,给出了具体的评价指标体系并采用模糊隶属函数和二元对比排序法对其进行量化.将量化后的指标因素集作为SVM的训练集,采用一对一的分类策略建立了CSD的评价模型.最后通过仿真实验指出了基于SVM的CSD评价方法比以往的模糊综合评价法和神经网络评价法测试正确率高,实用性强.

关键词：物流评价模型模糊隶属函数二元对比排序法支持向量机顾客满意度

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基于支持向量机的机械传动方案决策模型

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上海交通大学学报 2005年第6期39卷 975-978页

作者：孙华丽谢剑英薛耀锋上海交通大学自动化系上海200030

分析了机械传动系统的特点和方案选择的要求,给出了机械传动系统特征因素的模糊量化方法.在此基础上,通过对系统特征因素集和决策方案非线性关系的辨识,建立了基于支持向量机的一对一判别策略的机械传动方案决策模型.仿真实例验证了利... 详细信息

分析了机械传动系统的特点和方案选择的要求,给出了机械传动系统特征因素的模糊量化方法.在此基础上,通过对系统特征因素集和决策方案非线性关系的辨识,建立了基于支持向量机的一对一判别策略的机械传动方案决策模型.仿真实例验证了利用支持向量机建立其决策模型的可行性和实用性.

关键词：支持向量机机械传动系统特征因素模糊隶属函数建模

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基于预排序的并行批处理过程调度模型

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上海交通大学学报 2007年第8期41卷 1330-1333页

作者：薛耀锋袁景淇上海交通大学自动化系上海200240

针对并行批处理调度过程,以总提前完成时间最小化为目标函数,建立了一个基于交货期的调度模型.该模型考虑了订单的交货期等约束条件,将订单和设备之间的分配关系表达为0-1变量,采用预排序方法确定订单的处理顺序.采用分支定界法对模型... 详细信息

针对并行批处理调度过程,以总提前完成时间最小化为目标函数,建立了一个基于交货期的调度模型.该模型考虑了订单的交货期等约束条件,将订单和设备之间的分配关系表达为0-1变量,采用预排序方法确定订单的处理顺序.采用分支定界法对模型进行求解,并与已有模型的计算结果比较,证明所提出的模型整数变量少且容易求解.

关键词：批处理过程交货期预排序调度模型

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