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The ubiquitin codes in cellular stress responses

Protein & Cell 2024年第3期15卷 157-190页

作者： xiangpeng sheng Zhixiong Xia Hanting Yang Ronggui Hu Key Laboratory of Systems Health Science of Zhejiang Province School of Life ScienceHangzhou Institute for Advanced StudyUniversity of Chinese Academy of SciencesHangzhou 310024China State Key Laboratory of Molecular Biology Shanghai Institute of Biochemistry and Cell BiologyCenter for Excellence in Molecular Cell ScienceChinese Academy of SciencesShanghai 200031China State Key Laboratory of Animal Disease Control Harbin Veterinary Research InstituteChinese Academy of Agricultural SciencesHarbin 150069China Department of Neurology State Key Laboratory of Medical NeurobiologyInstitute for Translational Brain ResearchMOE Frontiers Center for Brain ScienceZhongshan HospitalFudan UniversityShanghai 200032China

Ubiquitination/ubiquitylation,one of the most fundamental post-translational modifications,regulates almost every critical cellular process in *** evidence has shown that essential components of numerous biological processes undergo ubiquitination in mammalian cells upon exposure to diverse stresses,from exogenous factors to cellular reactions,causing a dazzling variety of functional *** forms of ubiquitin sig-nals generated by ubiquitylation events in specific milieus,known as ubiquitin codes,constitute an intrinsic part of myriad cellular stress *** ubiquitination events,leading to proteolytic turnover of the substrates or just switch in functionality,initiate,regulate,or supervise multiple cellular stress-associated responses,supporting adaptation,homeostasis recovery,and survival of the stressed *** this review,we attempted to summarize the crucial roles of ubiquitination in response to different environmental and intracellular stresses,while discussing how stresses modulate the ubiquitin *** review also updates the most recent advances in understanding ubiquitination machinery as well as different stress responses and discusses some important questions that may warrant future investigation.

关键词： ubiquitin E3 ligase environmental stresses intercellular stresses stress response homeostasis

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Host cyclophilin A facilitates SARS-CoV-2 infection by binding and stabilizing spike on virions

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2024年第1期9卷 36-39页

作者： xiangpeng sheng Fang Zhu Hong Peng Fan Yang Yi Yang Cong Yang Zhen Wang Wei Chen Deyin Guo Ronggui Hu State Key Laboratory of Molecular Biology Center for Excellence in Molecular Cell ScienceShanghai Institute of Biochemistry and Cell BiologyUniversity of Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesShanghaiChina MOE Key Laboratory of Tropical Disease Control Centre for Infection and Immunity StudySchool of MedicineSun Yat-sen UniversityShenzhenChina ICU Longhua Hospital Shanghai University of Traditional Chinese MedicineShanghaiChina

Dear Editor,The novel coronavirus SARS-CoV-2 rapidly evolutes to increase its infectivity and transmissibility,facilitates its immune escape,impairs vaccine efficacy,and currently causes repeated infections in human,which is mainly determined by the accumulated mutations in spike(S).1 Transmembrane S is a heavily glycosylated protein on the surface of the virion as homotrimer,responsible for binding to human angiotensin-converting enzyme 2(hACE2)receptor.2 While the architecture of S trimers has been well studied,how the stability of S is regulated by potential host factors remains unknown.

关键词： ACE2 vaccine infection

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Non-proteolytic ubiquitination of HBx controls HBV replication

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Virologica Sinica 2024年第2期39卷 338-342页

作者： xiangpeng sheng Yi Yang Min Zhu Linlin Zhou Fang Zhu Yuanfei Zhu Siying Dong Hui Kong Honghua Wang Ji Jiang Mingyue Wan Mingyang Feng Qiang Deng Yumin Xu Qing You Ronggui Hu State Key Laboratory for Animal Disease Control and Prevention Harbin Veterinary Research InstituteChinese Academy of Agricultural SciencesHarbin 150069China State Key Laboratory of Molecular Biology Shanghai Institute of Biochemistry and Cell BiologyCenter for Excellence in Molecular Cell ScienceChinese Academy of SciencesShanghai 200031China Key Laboratory of Systems Health Science of Zhejiang Province School of Life ScienceHangzhou Institute for Advanced StudyUniversity of Chinese Academy of SciencesHangzhou 310024China Department of Thoracic Surgery Ruijin HospitalShanghai Jiaotong University School of MedicineShanghai 200025China Shanghai Key Laboratory of Plant Molecular Sciences College of Life SciencesShanghai Normal UniversityShanghai 200234China Department of Pathogenic Biology West China School of Basic Medical Sciences&Forensic MedicineSichuan UniversityChengdu 610041China School of Medicine Guizhou UniversityGuiyang 550025China Key Laboratory of Medical Molecular Virology(MOE&MOH) School of Basic Medical SciencesFudan UniversityShanghai 200032China Department of Hospital Infection Management Department of Infectious DiseasesRuijin HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 200025China School of Biomedical Engineering Shanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China

Dear Editor,Although effective vaccines and antiviral therapies are available,hepatitis B virus(HBV)infection is still a serious global health *** HBV infection remains the principal cause of liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma(HCC).HBV is a small DNA virus,owning a~3.2 kb genome that encodes several proteins:viral DNA polymerase,core antigen(HBcAg),E antigen(HBeAg),three surface antigens(PreS1/PreS2/HBsAg),and a regulatory X protein(HBx)(Lamontagne et al.,2016).X protein,named for its lack of homology with any known proteins,is a 154 aa protein that plays an essential role in HBV biology and regulates the development of HCC(Yang et al.,2022).Although previous studies have strongly expanded our understanding of HBx,the regulation of HBx is not completely elucidated.

关键词： infection cirrhosis

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Enterohemorrhagic *** effector NleL disrupts host NF-κB signaling by targeting multiple host proteins

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Journal of Molecular Cell Biology 2020年第4期12卷 318-321页

作者： xiangpeng sheng Qing You Hongnian Zhu Qingrun Li Hong Gao Haifeng Wang Chunping You Qing Meng Yingjie Nie Xiangyan Zhang Ronggui Hu State Key Laboratory of Molecular Biology CAS Center for Excellence in Molecular Cell ScienceShanghai Institute of Biochemistry and Cell BiologyChinese Academy of SciencesShanghai 200031China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China College of Chemistry Chem ical Engineering and BiotechnologyDonghua UniversityShanghai 201620China Department of Gastroenterology and Hepatology Zhongshan HospitalFudan UniversityShanghai 200032China State Key Laboratory of Dairy Biotechnology Dairy Research InstituteBright Dairy&Food Co.LtdShanghai 200436China NHC Key Laboratory of Pulmonary Immune-related Diseases Guizhou Provincial People’s HospitalGuiyang550002China Present address:Department of Molecular Biosciences The Wenner-Gren InstituteStockholm UniversityStockholmSweden

Dear Editor,Enterohemorrhagic Escherichia coli(EHEC)0157:H7,a major diarrheagenic pathogen,can cause bloody diarrhea,hemorrhagic colitis,and>90%of hemolytic uremic syndrome in humans(Mead and Griffin,1998).Many previous studies have demonstrated that 0157:H7 could disrupt host ubiquitin(Ub)system by delivering virulence effectors into host cells with the type III secretion system(T3SS).NleL(also named EspX7)emerged as one of such effectors,whose E3-like activity was first identified in vitro in 2011(Lin et al.,2011).

关键词： hemorrhagic diarrhea E.coli

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非经典泛素化的研究进展

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生命的化学 2023年第3期43卷 355-359页

作者：杨昱鸽张文阳李振斐盛相鹏胡荣贵中国科学院分子细胞科学卓越创新中心上海200032 中国科学院大学杭州高等研究院杭州310024

泛素化是真核生物最普遍最重要的翻译后修饰之一,控制基因转录表达、细胞生长死亡、分子运输、代谢、发育和免疫反应等大多数生理过程。经典泛素系统的通路和机制越来越明晰,同时非经典的泛素化也逐渐被发现。本文将对经典泛素系统进行... 详细信息

泛素化是真核生物最普遍最重要的翻译后修饰之一,控制基因转录表达、细胞生长死亡、分子运输、代谢、发育和免疫反应等大多数生理过程。经典泛素系统的通路和机制越来越明晰,同时非经典的泛素化也逐渐被发现。本文将对经典泛素系统进行简单回顾,并且对非蛋白底物泛素化、非赖氨酸位点泛素化、非经典E3泛素连接酶等最新非经典泛素化进行阐述。

关键词：泛素泛素化 E3泛素连接酶

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Large-diameter indium antimonide microwire based broadband and robust optical switch

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2023年第2期66卷 68-78页

作者： Fei Lou xiangpeng Cui Xinyue sheng Chunyan Jia Shuaiyi Zhang Xia Wang Vladislav Khayrudinov Baitao Zhang Shande Liu Wing Yim Tam Harri Lipsanen He Yang Jingliang He Shandong Advanced Optoelectronic Materials and Technologies Engineering Laboratory of Qingdao School of Mathematics and PhysicsQingdaoUniversityof Scienceand TechnologyQingdao266061China School of Instrumenation and Optoeletronic Engineering Beihang University Beijing 100191China Department of Electronics and Nanoengineering Aalto Universiy EspooFl-0o076Finland State Key Laboratory of Crystal Materials Institute of Novel Semiconductors Shandong University.Jinan 250100China College of Electronic and Information Engineering Shandong University of Science and TechnologyQingdao 266590China Depariment of Physics and Wiliam Mong Institute of Nano Science and Technology Hong Kong University of Science and Technology.HongKongChina

Various nanophotonic devices based on semiconductor wires with a diameter of several ten nanometers have been ***,studying the optoelectronics properties and performance of such devices based on large-diameter wires is interesting and ***,we successfully grew the micronsized indium antimonide(InSb) wires,and examined their nonlinear optical properties by Z-scan and I-scan(power-dependent) methods within the wavelength range of 0.8-2.8 μ***,we demonstrated InSb micro wires(MWs) working as an effective and robust optical switch within 1-2.8 μm *** findings can open possibilities for research on more large-diameter MWs made from other semiconductor materials for photonic and electronic devices.

关键词： optical antimonide InSb

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大直径盾构隧道双层衬砌横向抗震性能研究

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现代隧道技术 2023年第1期60卷 130-139页

作者：曹翔鹏封坤薛皓匀毛升喻波中铁第四勘察设计院集团有限公司武汉430063 西南交通大学交通隧道工程教育部重点实验室成都610031 中铁二院工程集团有限责任公司成都610031

为探明有无双层衬砌、双层衬砌不同施作方式(复合式、叠合式)对盾构隧道横向抗震性能的影响,以甬舟铁路金塘海底铁路隧道为工程依托,建立盾构隧道双层衬砌三维精细化模型的同时考虑了隧道材料与接触的非线性行为,采用隐式动力时程法进... 详细信息

为探明有无双层衬砌、双层衬砌不同施作方式(复合式、叠合式)对盾构隧道横向抗震性能的影响,以甬舟铁路金塘海底铁路隧道为工程依托,建立盾构隧道双层衬砌三维精细化模型的同时考虑了隧道材料与接触的非线性行为,采用隐式动力时程法进行了抗震性能研究。结果表明:(1)双层衬砌与管片的连接刚度越大,隧道变形越小;(2)复合式衬砌对隧道环向抗震性能提升有限,其变形、损伤及应力规律与单层衬砌基本一致;(3)叠合式衬砌能有效提升隧道抗震性能,充分利用材料力学特性,但需要重点关注隧道的损伤情况;(4)抗震设防等级要求较高的区段建议采用叠合式双层衬砌,防水、防火要求较高的特殊区段建议采用复合式双层衬砌。

关键词：大直径盾构隧道双层衬砌地震响应数值模型接合面

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可变剪接在小鼠早期胚胎发育中的作用研究进展

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中国兽医学报 2023年第4期43卷 831-835页

作者：魏嘉瑞代相鹏张胜李子义吉林大学第一医院人类疾病动物模型国家地方联合工程实验室吉林长春130021

小鼠的早期胚胎发育是一个极为复杂而又受到精细调控的生命过程,包括卵母细胞成熟、受精和胚胎发育等顺序发生事件。可变剪接(alternative splicing,AS)是指将一个前体mRNA通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同mRNA剪接... 详细信息

小鼠的早期胚胎发育是一个极为复杂而又受到精细调控的生命过程,包括卵母细胞成熟、受精和胚胎发育等顺序发生事件。可变剪接(alternative splicing,AS)是指将一个前体mRNA通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同mRNA剪接异构体的过程。AS作为提高基因转录组复杂性和蛋白质多样性的关键因素,对于调控个体和胚胎的生长发育至关重要。现已有大量研究表明,AS在小鼠早期胚胎发育中起着至关重要的作用。本研究对AS在小鼠早期胚胎发育过程中作用的研究进展进行了综述,并着重介绍了相关剪接因子及其敲除影响胚胎发育的事件。

关键词：可变剪接小鼠早期胚胎发育剪接因子

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基于磁流变半主动悬架的整车姿态补偿控制

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江苏大学学报（自然科学版） 2022年第5期43卷 524-532页

作者：汪若尘盛富鹏丁仁凯孟祥鹏孙泽宇江苏大学汽车与交通工程学院江苏镇江212013 江苏大学汽车工程研究院江苏镇江212013

针对车辆行驶工况及路面不平引起的车身姿态变化和垂向振动问题,基于磁流变半主动悬架系统,设计了一种整车半主动悬架控制方法,其主要包括姿态补偿控制算法、磁流变减振器控制算法与精确状态观测器设计方法.姿态补偿控制算法综合考虑整... 详细信息

针对车辆行驶工况及路面不平引起的车身姿态变化和垂向振动问题,基于磁流变半主动悬架系统,设计了一种整车半主动悬架控制方法,其主要包括姿态补偿控制算法、磁流变减振器控制算法与精确状态观测器设计方法.姿态补偿控制算法综合考虑整车姿态控制和悬架垂向振动控制,并通过磁流变减振器控制算法对半主动悬架系统进行等效阻尼控制,以实现车身姿态优化和车辆乘坐舒适性改善.为了更为精确地估计所需速度信号,利用实际等效阻尼实时更新观测器中参数矩阵,设计了精确状态观测器.仿真和试验结果表明:在该控制算法下,悬架系统的质心、俯仰角以及侧倾角加速度均得以改善,其均方根值分别降低了14.03%、18.26%和21.39%,验证了所设计控制算法的有效性.

关键词：磁流变半主动悬架姿态补偿控制磁流变减振器控制状态观测器等效阻尼控制

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桥梁自然特征点的快速精确跟踪算法

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测绘通报 2023年第5期 101-106,163页

作者：何雨薇诸葛盛徐祥鹏钟立军杨夏张小虎中山大学航空航天学院广东深圳518107

特征点跟踪作为无人机对桥梁挠度进行视觉测量的关键技术,跟踪算法的速度和精度直接影响测量的实时性和有效性。本文首先通过加速稳健特征(SURF)匹配得到图像序列特征点的初步定位结果,然后使用相位相关法对特征点进行精确配准,并提出... 详细信息

特征点跟踪作为无人机对桥梁挠度进行视觉测量的关键技术,跟踪算法的速度和精度直接影响测量的实时性和有效性。本文首先通过加速稳健特征(SURF)匹配得到图像序列特征点的初步定位结果,然后使用相位相关法对特征点进行精确配准,并提出了一种基于无人机运动连续性的加速策略,用于桥梁自然特征点跟踪。利用无人机采集的4 K桥梁视频数据对本文算法进行测试,结果表明,本文算法对于桥梁自然特征点能够实现稳定跟踪,跟踪速度为25 FPS,跟踪精度达到亚像素级别,满足测量要求,能够为视觉测量提供技术支撑。

关键词：自然特征点跟踪视觉测量精确配准无人机运动连续性加速策略

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