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Tiaobu Feishen therapy inhibits inflammation induced by cigarette smoke extracts in a human monocyte/macrophage cell line

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Journal of Traditional Chinese Medicine 2021年第3期41卷 360-366页

作者： QIN Yanqin CHEN Yulong ZHAO Peng FENG Suxiang wu yaosong LIU Xuefang DONG Haoran ZHENG Wanchun MAO Xiaoning LI Jiansheng Henan Key Laboratory of Chinese Medicine for Respiratory Disease Henan University of Chinese MedicineZhengzhou 450046China Co-construction Collaborative Innovation Center for Chinese Medicine and Respiratory Diseases by Henan&Education Ministry of China Henan University of Chinese MedicineZhengzhou 450046China

OBJECTIVE: To study the mechanistic effects of Tiaobu Feishen therapy(TBFS) on inflammation induced by cigarette smoke extract(CSE) in a human monocyte/macrophage cell line.METHODS: The human monocyte/macrophage cell line THP-1 was stimulated with 10% CSE in the presence or absence of Bufei Yishen formula(BYF),Bufei Jianpi formula(BJF) and Yiqi Zishen formula(YZF). All formulations contained serum. Pro-inflammatory cytokines were measured in the supernatants using enzyme-linked immunosorbent assay.The activity of STAT3 DNA binding was detected using electrophoretic mobility shift assay and janus kinase/signal transducer and activator of transcription(JAK/STAT) pathway activation was assessed using Western blotting.RESULTS: The results showed that BYF, BJF and YZF treatment strongly decreased the CSE-induced secretion of interleukin(IL)-6, IL-8, tumor necrosis factor-α and matrix metalloproteinase-9 by THP-1 cells. Furthermore, BYF, BJF and YZF treatment attenuated STAT3 DNA binding capacity and JAK2 and STAT3 were shown to be phosphorylated.CONCLUSION: The data revealed that BYF, BJF and YZF effectively inhibited a CSE-induced inflammatory response in THP-1 cells by limiting activation of the JAK2/STAT3 pathway.

关键词： cigarette smoking janus kinase 2 STAT3 transcription factor THP-1 cells matrix metalloproteinases Tiaobu Feishen therapy

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Three Tiaobu Feishen formulae reduces cigarette smoke-induced inflammation in human airway epithelial cells

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Journal of Traditional Chinese Medicine 2020年第3期40卷 386-392页

作者： Dong Haoran Liu Xuefang Zheng Wanchun Feng Suxiang Li Jiansheng Qin Yanqin wu yaosong Chen Yulong Yin Sugai Zhao Peng Henan Key Laboratory of Chinese Medicine for Respiratory Disease Henan University of Chinese MedicineZhengzhou 450046China Collaborative Innovation Center for Respiratory Disease Diagnosis and Treatment&Chinese Medicine Development of Henan Province Henan University of Chinese MedicineZhengzhou 450046China

OBJECTIVE: To investigate the therapeutic efficacy of Tiaobu Feishen formulae(TBFS) on cigarette smoke-induced inflammation in vitro using lipopolysaccharide(LPS)-induced and cigarette smoke extract(CSE)-induced NCI-H292 cells.METHODS: We evaluated the inhibitory effects of Bufei Jianpi formula(BJF), Bufei Yishen formula(BYF), and Yiqi Zishen formula(YZF) on the expressions of inflammatory cytokines including tumor necrosis factor(TNF)-α and interleukin(IL)-8, matrix metalloproteinase(MMP)-9, tissue inhibitor of matrix metalloprotease(TIMP)-1, and superoxide dismutase(SOD) in H292 cells stimulated with LPS or CSE. Their related transcription factors and signaling pathways were also analyzed.RESULTS: BJF, BYF, and YZF significantly inhibited the LPS-or CSE-induced expressions of TNF-α, IL-8,MMP-9, TIMP-1, and SOD in H292 cells, and suppressed the activation of transcription factors including nuclear transcription factor(NF)-κB, activator protein(AP)-1, and signal transducers and activators of transcription(STAT) 3 and their corresponding pathways, including NF-κB, mitogen-activated protein kinase(MAPK), STAT3, and peroxisome proliferator-activated receptor(PPAR).CONCLUSION: BJF, BYF, and YZF effectively suppressed inflammatory responses, protease-antiprotease imbalance, and oxidative stress induced by LPS and CSE, an effect that was closely associated with the inhibition of the NF-κB, MAPK, STAT3, and PPAR pathways.

关键词： Pulmonary disease chronic obstructive Lipopolysaccharides Cigarette smoking Inflammation Epithelial cells Tiaobu Feishen formulae

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Three Tiaobu Feishen therapies protect human alveolar epithelial cells against cigarette smoking and tumor necrosis factor-mlear factor-kappa B pathwayα-induced inflamation by nuc

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Journal of Traditional Chinese Medicine 2019年第1期39卷 45-49页

作者： Chen Yulong wu yaosong Li Jiansheng Feng Suxiang Hao Lili Liu Xuefang Zheng Wanchun Dong Haoran Qin Yanqin Yin Sugai Zhao Peng Henan Key Laboratory of Chinese Medicine for Respiratory Disease Henan University of Chinese MedicineZhengzhou 450046China Collaborative Innovation Center for Respiratory Disease Diagnosis and Treatment&Chinese Medicine Development of Henan Province Henan University of Chinese MedicineZhengzhou 450046China

OBJECTIVE: To investigate the efficacy of Tiaobu Feishen formulae(TBFS), including Bufei Jianpi formula(BJF), Bufei Yishen formula(BYF), and Yiqi Zishen formula(YZF), on inflammatory response, protease-anti-protease imbalance and collagen deposition in rats.METHODS: In present work, we used an in vitro model of cigarette smoking extract(CSE)-and tumor necrosis factor-α(TNF-α)-induced A549 cellsto examine the efficacy of BJF, BYF and YZF on the production of inflammatory cytokines, including TNF-α and interleukin(IL)-8, IL-6, matrix metalloproteinases(MMP)-9, and IL-10 in CSE or TNF-ls. And their related transcripα-induced A549 celtion factors and signaling pathway were also analyzed.RESULTS: The results showed that BJF, BYF and YZF could significantly decrease the expression levels of the pro-inflammatory cytokines induced by CSE or TNF-α. Furthermore, BJF, BYF and YZF could suppress CSE-or TNF-α-induced activation of nuclear factor-kappa B(NF-κB) transcription factors and its corresponding pathways. Taken together, these data implied that BJF, BYF and YZF effectively inhibited CSE-or TNF-α-induced inflammatory response in alveolar epithelial cell, which was due to their inhibition effect on NF-κB pathways.CONCLUSION: Our findings suggest that the Tiaobu Feishen therapies may protect human alveolar epithelial cells against cigarette smoking and TNF-α-induced inflammation. NF-κB pathway may involve in the actions.

关键词： Chinese medical formula Cigarette smoking Tumor necrosis factor-alpha A549 cells

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基于Rac1信号通路研究淫羊藿苷对慢性阻塞性肺疾病模型小鼠肺泡巨噬细胞胞葬及吞噬功能的影响

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中草药 2024年第1期55卷 159-170页

作者：周哲旭王省唐洲陈星吴耀松刘洋菅佳宁胡啸博刘娅茹陈玉龙河南中医药大学河南省中医方证信号传导重点实验室河南省中医方证信号传导国际联合实验室河南郑州450046

目的探讨淫羊藿苷基于Rac1信号通路改善慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)模型小鼠肺泡巨噬细胞胞葬及吞噬功能障碍的作用机制。方法40只C57BL/6小鼠随机分为空白组、模型组、Rac1抑制剂(2.5 mg/kg)组和淫... 详细信息

目的探讨淫羊藿苷基于Rac1信号通路改善慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)模型小鼠肺泡巨噬细胞胞葬及吞噬功能障碍的作用机制。方法40只C57BL/6小鼠随机分为空白组、模型组、Rac1抑制剂(2.5 mg/kg)组和淫羊藿苷低、高剂量(40、80 mg/kg)组,每组8只,除空白组外其余各组小鼠采用香烟烟雾熏吸8周的方法制备COPD模型,造模后ip Rac1抑制剂或ig淫羊藿苷,1次/d,每周给药6次,连续4周。检测小鼠体质量、肺功能指标;ELISA法检测肺组织中肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白细胞介素-4(interleukin-4,IL-4)、IL-6、乳脂球表皮生长因子8(milk fat globule EGF factor 8,MFG-E8)和生长停滞特异性蛋白6(growth arrest specific protein 6,GAS6)含量;流式细胞术检测肺泡巨噬细胞胞葬及吞噬能力、小鼠全血巨噬细胞M1/M2分型;苏木素-伊红染色(hematoxylineosin staining,HE)观察肺组织病理变化及肺泡平均截距(mean linear intercept,MLI)、单位面积平均肺泡数(mean alveolar numbers,MAN);qRT-PCR和Western blotting分别检测肺组织Rac1、P21蛋白激活激酶(P21 activated kinase,PAK)m RNA和蛋白表达;激光共聚焦显微镜观察巨噬细胞吞噬及骨架结构变化。结果与空白组比较,模型组小鼠体质量、肺功能指标、吞噬及胞葬功能降低(P<0.05、0.01),MLI上升(P<0.01),MAN降低(P<0.01),肺组织中炎症因子IL-4、IL-6、TNF-α水平上升(P<0.05、0.01),胞葬辅助因子MFG-E8、GAS6水平降低(P<0.05),M1型巨噬细胞增多(P<0.05),肺组织Rac1、PAK mRNA及蛋白表达上调(P<0.05、0.01);与模型组比较,Rac1抑制剂及淫羊藿苷干预后小鼠肺功能指标好转(P<0.05、0.01),吞噬及胞葬功能均有改善(P<0.05、0.01),炎症因子水平降低(P<0.05、0.01),胞葬辅助因子水平增加(P<0.05),M2型巨噬细胞增多(P<0.05、0.01),肺组织Rac1、PAK m RNA及蛋白表达降低(P<0.05、0.01)。结论淫羊藿苷可以调控Rac1信号通路介导巨噬细胞骨架重排,改善COPD小鼠肺泡巨噬细胞吞噬及胞葬功能障碍。

关键词：慢性阻塞性肺疾病淫羊藿苷巨噬细胞胞葬功能吞噬功能 Rac1信号通路细胞骨架

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4T1乳腺癌细胞株接种联合慢性束缚应激诱导乳腺癌合并抑郁小鼠模型构建探索

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中国比较医学杂志 2024年第3期34卷 36-44,50页

作者：刘燕彭梦薇刘高源杨铁柱张文娴吴耀松陈玉龙河南中医药大学中医学院(仲景学院) 河南省中医方证信号传导重点实验室郑州450046 河南省洛阳正骨医院(河南省骨科医院)重症医学科郑州450000 河南中医药大学河南省豫药全产业链研发协同创新中心郑州450046

目的研究4T1乳腺癌细胞株接种联合慢性束缚应激方法构建乳腺癌合并抑郁症小鼠模型核心行为症状、生物学指标、病理学等改变。方法BABL/c小鼠随机分为正常(Control)组、束缚(Stress)组、移植瘤(Tumor)组和束缚移植瘤(Stress+Tumor,S+T)组... 详细信息

目的研究4T1乳腺癌细胞株接种联合慢性束缚应激方法构建乳腺癌合并抑郁症小鼠模型核心行为症状、生物学指标、病理学等改变。方法BABL/c小鼠随机分为正常(Control)组、束缚(Stress)组、移植瘤(Tumor)组和束缚移植瘤(Stress+Tumor,S+T)组,将4T1细胞株接种于Tumor和S+T组小鼠腋下,待成瘤后,给予Stress和S+T组小鼠束缚应激21 d。造模期间监测各组小鼠体重、摄食量。实验结束后,采用糖水偏好、旷场、高架十字迷宫、强迫游泳等试验评价各组小鼠抑郁样行为。小鼠处死后,测量小鼠瘤体重量和体积;采用ELISA方法检测各组小鼠血清肿瘤标志物糖类抗原(CA199)、癌胚抗原(CEA)、血管内皮生长因子(VEGF)以及相关神经递质5-羟色胺(5-HT)、去甲肾上腺素(NE)、皮质酮(CORT)的含量;运用HE染色法观察小鼠肿瘤和海马组织病理学改变。结果S+T组小鼠体重、摄食量显著降低,瘤体重量和体积明显增大,血清肿瘤标志物(CA199、CEA、VEGF)水平显著升高,快感和对新环境的探索欲望减弱,紧张和绝望行为显著增强,血清神经递质5-HT和NE水平显著降低,CORT水平显著升高;另外肿瘤组织细胞排列松散,间质减少,病理性核分裂象增多,海马CA3区神经元细胞排列和形态紊乱,核内空泡化样改变明显。结论4T1乳腺癌细胞株接种联合慢性束缚应激诱导的乳腺癌合并抑郁小鼠模型出现了乳腺癌和抑郁症双重典型症状和生物学指标改变,可为乳腺癌合并抑郁实验研究提供较好的模型参考。

关键词：乳腺癌合并抑郁移植瘤慢性束缚应激肿瘤标志物神经递质行为学

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基于EGFR/PI3K/AKT/mTOR通路探讨表没食子儿茶素-3-没食子酸酯调控非小细胞肺癌细胞周期和凋亡的机制

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中医学报 2024年第6期39卷 1280-1288页

作者：任闪闪刘燕尚艺婉吴耀松刘俊陈玉龙河南中医药大学中医药科学院河南郑州450046

目的:基于表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)/磷脂酰肌醇激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)通路探讨表没食子儿茶素-3-没食子酸酯(epigallocatechin-3-gallate,EGCG)调控非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)A549细胞周期和凋亡的作用机制。方法:将A549细胞随机分为空白对照组、模型组、EGCG组、吉非替尼组、EGCG+吉非替尼组。采用MTT法检测A549细胞的增殖情况,流式细胞术检测细胞周期和凋亡情况。通过分子对接和细胞热力学迁移实验(cellular thermal shift assay,CETSA)检测EGCG与EGFR的靶向结合情况。采用Western blot检测细胞周期蛋白依赖性激酶4(cyclin-dependent kinase 4,CDK4)、B-细胞淋巴瘤-2(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2-associated X protein,Bax)、p-EGFR/EGFR、p-PI3K/PI3K、p-AKT/AKT和p-mTOR/mTOR表达水平。结果:与模型组比较,EGCG和吉非替尼均对细胞表现出显著的抑制作用。与空白对照组比较,模型组在G1/G0期细胞百分比降低,在G2/M期细胞百分比升高(P<0.01);与模型组比较,EGCG组、吉非替尼组和EGCG+吉非替尼组在G1/G0期细胞百分比升高(P<0.01),吉非替尼组和EGCG+吉非替尼组在G2/M期细胞百分比降低(P<0.01)。与空白对照组比较,模型组细胞凋亡率降低(P<0.01);与模型组比较,EGCG组、吉非替尼组和EGCG+吉非替尼组的细胞凋亡率升高(P<0.05)。与空白对照组比较,模型组细胞CDK4、Bcl-2、Bcl-2/Bax蛋白表达水平升高(P<0.01),Bax蛋白表达水平降低(P<0.01);与模型组比较,EGCG组、吉非替尼组和EGCG+吉非替尼组细胞CDK4、Bcl-2、Bcl-2/Bax蛋白表达水平降低(P<0.01),Bax蛋白表达水平增加(P<0.05)。分子对接结果显示,EGCG和吉非替尼与EGFR的结合能均小于-5.0 kcal·mol^(-1)。CETSA结果显示,与RPMI 1640组比较,EGCG组细胞EGFR蛋白的CETSA曲线向右漂移。与空白对照组比较,模型组细胞p-EGFR/EGFR、p-PI3K/PI3K、p-AKT/AKT和p-mTOR/mTOR蛋白表达水平升高(P<0.05);与模型组比较,EGCG组、吉非替尼组、EGCG+吉非替尼组细胞的p-EGFR/EGFR、p-PI3K/PI3K、p-AKT/AKT和p-mTOR/mTOR蛋白表达水平降低(P<0.01)。结论:EGCG可能通过靶向调控EGFR/PI3K/AKT/mTOR信号通路,诱导A549细胞周期阻滞和凋亡,从而发挥抗癌作用。

关键词：表没食子儿茶素-3-没食子酸酯非小细胞肺癌 A549细胞 EGFR/PI3K/AKT/mTOR通路细胞周期细胞凋亡

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基于机器学习的调度操作行为挖掘与推荐技术研究及应用

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电力系统自动化 2022年第8期46卷 181-188页

作者：吴自博王波陈清郭耀松赵京虎闪鑫南瑞集团有限公司(国网电力科学研究院有限公司) 江苏省南京市211106 国电南瑞科技股份有限公司江苏省南京市211106 智能电网保护和运行控制国家重点实验室江苏省南京市211106

受互联网用户推荐技术的启发,基于调度系统中运行人员的历史操作记录,结合数据分析与机器学习算法提出了一种有效的调度操作行为模式挖掘与推荐技术。首先,所提技术采集记录调度员日常操作数据,并通过页面类型划分、会话识别、事务识别... 详细信息

受互联网用户推荐技术的启发,基于调度系统中运行人员的历史操作记录,结合数据分析与机器学习算法提出了一种有效的调度操作行为模式挖掘与推荐技术。首先,所提技术采集记录调度员日常操作数据,并通过页面类型划分、会话识别、事务识别等过程实现数据预处理。然后,利用模式分析和聚类分析完成调度员行为模式挖掘,并结合关联规则将模式数据压缩至频繁模式树(FP-tree)。最后,利用基于模式树结构的实时推荐系统为调度员提供操作推荐服务。在实际调度系统上进行验证和应用,结果表明所提技术能有效识别出调度员的操作行为模式并为调度员提供较为精准的操作推荐,进而提高调度员与调度系统的交互效率,减少调度员的工作量。

关键词：电网调度机器学习行为模式操作日志聚类挖掘操作推荐

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永磁体对磁致伸缩位移传感器波导丝扭转应变的影响分析

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仪器仪表学报 2021年第4期42卷 10-23页

作者：孙英武泽航张耀松翁玲河北工业大学省部共建电工装备可靠性与智能化国家重点实验室天津300130 河北工业大学河北省电磁场与电器可靠性重点实验室天津300130

为提高磁致伸缩位移传感器输出电压幅值,对波导丝的扭转应变进行研究。基于电磁学与理论力学相关理论建立了波导丝扭转应变的数学模型及三维有限元仿真模型,对波导丝扭转应变的影响因素进行分析。并进行实验,得出相对应的传感器输出电... 详细信息

为提高磁致伸缩位移传感器输出电压幅值,对波导丝的扭转应变进行研究。基于电磁学与理论力学相关理论建立了波导丝扭转应变的数学模型及三维有限元仿真模型,对波导丝扭转应变的影响因素进行分析。并进行实验,得出相对应的传感器输出电压变化情况。结果表明,传感器输出电压与波导丝发生的扭转应变量最大值变化趋势一致,两者均随着永磁体充磁、几何参数、放置角度的增大而增大;随着永磁体与波导丝间距离的增大,呈现出先增大后减小的变化趋势。最终确定永磁体长度15 mm,宽度10 mm,高度5 mm,长度方向充磁1T且充磁方向垂直于波导丝放置,且永磁体与波导丝间距离调整为25.5 mm,此时波导丝扭转应变量达到最大3.84×10^(-4) mm,传感器输出电压也达到最大0.109 V。该研究结果对永磁体充磁方向、充磁大小、几何参数、放置方式以及永磁体与波导丝之间距离合理的选择提供了指导。

关键词：波导丝有限元永磁体扭转应变输出电压

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基于NF-κB/miR-494信号调控MUC5AC和CFTR研究小青龙汤与清气化痰丸改善病理性气道黏液的机制

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中华危重病急救医学 2022年第8期34卷 831-836页

作者：彭梦薇刘燕陈玉龙张艳桑亚洲郝羚伦吴耀松河南中医药大学中医药科学研究院河南省中医方证信号传导重点实验室郑州450046

目的观察小青龙汤和清气化痰丸对白细胞介素-1β(IL-1β)诱导的人肺癌细胞H292黏液高分泌模型及核转录因子-κB/微小RNA-494(NF-κB/miR-494)信号通路相关分子的影响,探讨两者改善病理性气道黏液的作用机制。方法采用四甲基偶氮唑盐比色... 详细信息

目的观察小青龙汤和清气化痰丸对白细胞介素-1β(IL-1β)诱导的人肺癌细胞H292黏液高分泌模型及核转录因子-κB/微小RNA-494(NF-κB/miR-494)信号通路相关分子的影响,探讨两者改善病理性气道黏液的作用机制。方法采用四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测不同浓度小青龙汤、清气化痰丸对IL-1β诱导的H292细胞活性的影响并选择合适浓度进行后续实验。将细胞随机分为空白组、模型组(5μg/L IL-1β)、NF-κB抑制剂吡咯烷二硫代氨基甲酸铵(PDTC)组(5μg/L IL-1β+100μmol/L PDTC)、小青龙汤组(5μg/L IL-1β+1000 mg/L小青龙汤)和清气化痰丸组(5μg/L IL-1β+1000 mg/L清气化痰丸);采用5μg/L IL-1β诱导H292细胞24 h建立气道上皮黏液高分泌细胞模型。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测细胞分泌黏蛋白5AC(MUC5AC)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、IL-8水平及细胞内MUC5AC和囊性纤维化跨膜转导调节因子(CFTR)蛋白含量;采用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(RT-qPCR)检测MUC5AC mRNA、CFTR mRNA和miR-494的表达;采用蛋白质免疫印迹试验(Western blotting)检测NF-κB信号通路关键蛋白p65和NF-κB抑制因子(IκB)的蛋白表达。结果选择浓度为1000 mg/L的小青龙汤和清气化痰丸进行后续实验。与空白组比较,模型组细胞分泌MUC5AC、TNF-α和IL-8水平显著升高,细胞内MUC5AC蛋白含量和mRNA表达也显著升高,细胞内CFTR蛋白含量和mRNA表达均显著降低,且细胞内p65蛋白表达显著上调,IκB蛋白表达显著下调,miR-494表达显著升高。与模型组相比,PDTC组、小青龙汤组和清气化痰丸组细胞分泌MUC5AC、TNF-α、IL-8水平显著降低,细胞内MUC5AC蛋白含量和mRNA表达也显著降低,且细胞内p65蛋白表达均显著下调,IκB蛋白表达均显著上调,miR-494表达均显著降低;PDTC组和清气化痰丸组细胞内CFTR蛋白含量和mRNA表达均显著升高。与PDTC组相比,小青龙汤组细胞分泌TNF-α水平显著升高(ng/L:22.77±3.14比11.09±3.37,P<0.05),细胞内CFTR蛋白含量和mRNA表达、IκB蛋白表达均显著降低〔CFTR蛋白(ng/L):97.38±6.62比227.04±19.48,CFTR mRNA(2^(-ΔΔCt)):0.99±0.08比1.21±0.08,IκB/β-actin:1.69±0.11比2.00±0.18,均P<0.05〕;清气化痰丸组细胞分泌TNF-α水平显著升高(ng/L:19.08±3.71比11.09±3.37,P<0.05)。与小青龙汤组相比,清气化痰丸组细胞内CFTR蛋白含量和mRNA表达、IκB蛋白表达均显著升高〔CFTR蛋白(ng/L):235.01±22.71比97.38±6.62,CFTR mRNA(2^(-ΔΔCt)):1.32±0.15比0.99±0.08,IκB/β-actin:1.94±0.16比1.69±0.11,均P<0.05〕。结论小青龙汤改善气道上皮黏液高分泌炎症的机制可能与抑制NF-κB/miR-494炎症信号介导的MUC5AC高分泌有关,而清气化痰丸则可能与抑制NF-κB/miR-494炎症信号介导的MUC5AC高分泌及CFTR功能障碍有关,因此,二者治疗病理性气道黏液的机制差异主要在对CFTR基因和蛋白的调控上。

关键词：小青龙汤清气化痰丸黏蛋白5AC 囊性纤维化跨膜转导调节因子核转录因子-κB/微小RNA-494信号通路

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杜仲CONSTANS-like全基因组鉴定、系统进化及表达模式分析

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浙江农林大学学报 2022年第3期39卷 475-485页

作者：刘俊李龙陈玉龙刘燕吴耀松任闪闪河南中医药大学中医药科学院河南省中医方证信号传导重点实验室河南郑州450046 国际竹藤中心国家林业和草原局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102 国际竹藤中心安徽太平试验中心安徽黄山245700 西北农林科技大学林学院陕西杨凌712100

【目的】揭示CONSTANS-like在杜仲Eucommia ulmoides基因组中的分布、结构特征及表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对杜仲CONSTANS-like基因家族进行鉴定及理化性质、进化关系、基因结构、启动子元件和表达模式分析。【结果】杜仲... 详细信息

【目的】揭示CONSTANS-like在杜仲Eucommia ulmoides基因组中的分布、结构特征及表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对杜仲CONSTANS-like基因家族进行鉴定及理化性质、进化关系、基因结构、启动子元件和表达模式分析。【结果】杜仲基因组中共鉴定到8个EuCOLs基因,分别命名为EuCOL1~EuCOL8,氨基酸数目为315~469,理论等电点分布范围为5.10~6.47,分子量为35.21~52.65 kDa。亚细胞定位预测均定位在细胞核中,为亲水性蛋白,分布于8条染色体。系统进化分为2个亚家族(群组Ⅰ和群组Ⅲ),分别包含2和6个EuCOLs蛋白,同一亚家族基序具有相似性。EuCOLs基因结构简单,启动子中含有多个光周期响应元件。表达模式分析显示:EuCOLs在杜仲叶片发育中表达水平相对较低,EuCOL7在杜仲胶形成中表达量最高,各家族成员表达特征存在差异。蛋白互作预测显示:EuCOL7可与多个光周期响应蛋白互作。【结论】杜仲CONSTANS-like基因家族含有典型的CCT和B-box结构域,可能参与叶片发育及杜仲胶的形成。

关键词：杜仲 CONSTANS-like 生物信息学表达模式分析

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