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Landscape of global urban environmental resistome and its association with local socioeconomic and medical status

Science China(Life Sciences) 2024年第6期67卷 1292-1301页

作者： jun wu Yige Hu Michael H Perlin David Danko jun Lu Manuela Oliveira Johannes Werner Maria M Zambrano Maria A Sierra Olayinka O Osuolale PawełŁabaj Nicolás Rascovan Nur Hazlin Hazrin-Chong Soojin Jang Haruo Suzuki Marina Nieto-Caballero Bharath Prithiviraj Patrick K H Lee Agnieszka Chmielarczyk Anna Różańska Yongxiang Zhao Lan Wang Christopher E Mason Tieliu Shi Center for Bioinformatics and Computational Biology and the Institute of Biomedical SciencesSchool of Life SciencesEast China Normal UniversityShanghai 200241China Department of Biology Program on Disease EvolutionUniversity of LouisvilleLouisville 40292USA Weill Cornell Medicine New York 10065USA The Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud Institute for Computational Biomedicine New York 10065USA Department of Pulmonary Medicine Shanghai Chest HospitalShanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200025China i3S-Instituto de Investiga玢o e Inova玢o em Saúde Universidade do PortoPorto 4050-290Portugal Ipatimup-Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto Porto 4200-465Portugal Departamento de Biologia Faculdade de CiênciasUniversidade do PortoPorto 4050-290Portugal High Performance and Cloud Computing Group Zentrum für Datenverarbeitung(ZDV)Eberhard Karls University of TübingenW鋍hterstra遝7672074TübingenGermany Corporación Corpogen Research Center Bogotá110311Colombia Applied Environmental Metagenomics and Infectious Diseases Research(AEMIDR) Department of Biological SciencesElizade UniversityIlara-Mokin 340271Nigeria Maopolska Centre of Biotechnology Jagiellonian UniversityKraków 30-005Poland Aix-Marseille Université Mediterranean Institute of OceanologyUniversitéde ToulonCNRSIRDUM 110Marseille 83041France Department of Biological Sciences and Biotechnology Faculty of Science and TechnologyUniversiti Kebangsaan Malaysia43600 UKM BangiSelangor Institut Pasteur Korea Seoul 13488Republic of Korea Faculty of Environment and Information Studies Keio UniversityFujisawaKanagawa 252-0882Japan University of Colorado at Boulder CivilEnvironmental and Architectural DepartmentBoulder 80303USA Brooklyn College of the City University of New York Brooklyn 11210USA School of Energy and Environment City University of Hong KongHong Kong 999077China Department of Microbiology Faculty of MedicineJagiellonian UniversityKraków 30-005Poland Biological Targeting Diagnosis and The

Antimicrobial resistance(AMR)poses a critical threat to global health and development,with environmental factors—particularly in urban areas—contributing significantly to the spread of antibiotic resistance genes(ARGs).However,most research to date has been conducted at a local level,leaving significant gaps in our understanding of the global status of antibiotic resistance in urban environments.To address this issue,we thoroughly analyzed a total of 86,213 ARGs detected within 4,728 metagenome samples,which were collected by the Meta SUB International Consortium involving diverse urban environments in 60 cities of 27 countries,utilizing a deep-learning based methodology.Our findings demonstrated the strong geographical specificity of urban environmental resistome,and their correlation with various local socioeconomic and medical conditions.We also identified distinctive evolutionary patterns of ARG-related biosynthetic gene clusters(BGCs)across different countries,and discovered that the urban environment represents a rich source of novel antibiotics.Our study provides a comprehensive overview of the global urban environmental resistome,and fills a significant gap in our knowledge of large-scale urban antibiotic resistome analysis.

关键词： urban environment metagenome antibiotic resistance resistance diversity biosynthetic gene clusters

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商业银行净息差、资产负债期限错配与利率期限结构

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经济学家 2024年第3期 66-76页

作者：吴隽豪上海社会科学院应用经济研究所浦发银行总行资产负债管理部

美国快速加息形成利率曲线倒挂诱发银行业危机,利率风险管理引起高度关注。本文从商业银行资产负债配置的微观视角出发,分别从期限错配程度和利率期限结构分析净息差的变化机理,通过手工采集数据构建微观层面期限错配程度对我国上市银行... 详细信息

美国快速加息形成利率曲线倒挂诱发银行业危机,利率风险管理引起高度关注。本文从商业银行资产负债配置的微观视角出发,分别从期限错配程度和利率期限结构分析净息差的变化机理,通过手工采集数据构建微观层面期限错配程度对我国上市银行2015—2022年数据进行实证检验。研究发现:净息差与期限错配程度呈现相反关系,出现“期限错配之谜”,信用风险承担渠道和主动资产负债管理倾向则是可能的解释;利率期限结构对净息差影响的短期效应与长期效应方向相反,本质上与资产负债利率重定价周期错位有关;期限错配程度较高的银行利率风险敏感性更小,并非是其利率风险主动管理能力较强的结果,反而暴露出我国银行业利率风险管理能力较差的现状;全国性银行相较地方性银行利率风险敏感性也更高,短期“船大难调头”特征明显。为牢牢守住我国金融体系不发生系统性风险底线,应当提高跨周期风险管理能力、重视资产质量和资产负债主动管理以及坚持稳健的货币政策不动摇。

关键词：利率风险管理净息差资产负债期限错配利率期限结构

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城市轨道交通高精度装配式轨道关键技术及应用成效

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城市轨道交通研究 2024年第3期27卷 248-252页

作者：吴俊中铁上海设计院集团有限公司上海200070

[目的]为深入贯彻国家交通强国战略与标准化、智慧化和精细化等低碳装配建造理念,针对当前城市轨道交通轨道结构以现浇道床为主带来的施工精度不足、施工装备落后、维修手段欠缺及全寿命周期系统性差等问题,需对城市轨道交通高精度装配... 详细信息

[目的]为深入贯彻国家交通强国战略与标准化、智慧化和精细化等低碳装配建造理念,针对当前城市轨道交通轨道结构以现浇道床为主带来的施工精度不足、施工装备落后、维修手段欠缺及全寿命周期系统性差等问题,需对城市轨道交通高精度装配式轨道技术进行研究。[方法]按照标准化设计、工厂化制作、机械化施工、高精度控制、全寿命管理的总体研发技术路线,依托上海轨道交通二期、三期建设项目,对装配式轨道理论研究以及方案设计、效果试验和验证、轨道状态在线监测等进行了研究,并简述了高精度装配式轨道技术的应用成效。[结果及结论]形成了高精度预制装配技术、节能施工装备技术、绿色建造技术和智能监测技术等城市轨道交通装配式轨道关键技术,显著提升了轨道建设与运维品质。高精度装配式轨道技术的应用,有效提高了轨道结构的建造精度;较大幅度提高了轨道结构的优良几何形位状态以及稳定性、平顺性等指标;无轨系列施工装备节省了施工期间的大量人力、物力及时间成本;轨道状态在线监测系统及管理平台的应用,使得人工巡检工作量减少30%~40%,维保工作效率提升20%~30%,设备病害检出率提高30%~40%;减少了城市轨道交通列车运行的环境影响。

关键词：城市轨道交通高精度装配式轨道关键技术应用成效

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改进的局部最值分段多项式拟合算法精确校正拉曼光谱基线

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光谱学与光谱分析 2024年第4期44卷 1073-1080页

作者：田超凡李剑君翁国军朱键赵军武西安交通大学生命科学与技术学院教育部生物医学信息工程重点实验室陕西西安710049

基线校正作为拉曼光谱预处理极为关键的步骤之一,对进一步拉曼光谱数据分析和实现拉曼成像等有重要意义。目前,最常用的基线校正算法基于多项式拟合,由于其采用手动或半手动的形式,因此依赖人工经验,对用户的专业性要求较高,处理过程繁... 详细信息

基线校正作为拉曼光谱预处理极为关键的步骤之一,对进一步拉曼光谱数据分析和实现拉曼成像等有重要意义。目前,最常用的基线校正算法基于多项式拟合,由于其采用手动或半手动的形式,因此依赖人工经验,对用户的专业性要求较高,处理过程繁琐,处理结果差异较大。同时,在使用过程中,多项式阶数及移动分段窗口难以选择确定,因此处理的结果常出现欠拟合或过拟合现象。针对传统多项式拟合算法的此类局限性,改进了局部最值分段多项式拟合(NPPF)算法用于精确校正拉曼光谱基线。首先采用了改进的基于分段的局部最值算法,选取光谱中最宽峰底部轮廓的近似横向宽度作为背景点窗口宽度,依次选取窗口内的最小两个值作为需要拟合的背景基线点,避免直接比较或者人工选取导致的背景点选取困难,实现更准确地选取每个背景轮廓基线点。然后通过每个窗口三次拟合迭代覆盖的方式,得到三个拟合曲线函数,选取窗口内每个点对应三个曲线函数值,分别计算与前一拟合值的差值绝对值,取绝对值最小的曲线函数值作为此点拟合曲线值,从而较好地避免了传统分段多项式拟合(PPF)算法中的欠拟合和过拟合现象,同时也确定了拟合过程中的阶数和分段窗口。模拟了两种不同背景类型的拉曼光谱,将NPPF与PPF算法分别对两种模拟光谱进行处理比较,发现NPPF处理结果均方根误差(RMSE)小,证实NPPF较于PPF的优越性。最后,对实际样品(烯啶虫胺、罗丹明6G)的拉曼光谱进行了NPPF和PPF对比处理,发现NPPF的拟合基线较为准确,证实该算法NPPF在拉曼光谱基线校正预处理中具有广泛的实际应用价值和前景。

关键词：拉曼光谱多项式拟合基线校正局部最值

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On the Feasibility of the Chinese County-Level Convergence Media Centers in Participating in International Communication:Evidence from CDHT’s First-Hand Communication Practice

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Contemporary Social Sciences 2023年第1期8卷 75-88页

作者： wu jun Southwestern University of Finance and Economics

With the advent of new technologies,China is faced with the practical need to enhance its international communication capacity and address reforms in the modes,content,and channels of international communication.Therefore,more efforts should be made to further enrich the participants in international communication by optimizing China’s four-level journalism communication system and crafting a“great external publicity pattern.”Guiding and promoting county-level convergence media centers to participate in international communication is conducive to promoting the building of a vertical international communication system and a multi-level integrated communication matrix and facilitating the resource alignment and information sharing between domestic and international communication.In practice,some county-level convergence media centers in China have achieved certain results in international communication.A good example is the Chengdu Hi-tech Industrial Development Zone(CDHT),a pioneer in the reform of Chinese county-level convergence media.Therefore,this paper has used CDHT as an example to discuss the reality and basic conditions for Chinese county-level convergence media centers to participate in international communication and put forward general paths for county-level convergence media centers to engage in international communication.

关键词： International communication county-level convergence media centers media convergence Chengdu Hitech Industrial Development Zone

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金属螯合蛋白异源表达提高E.coli对镉的生物吸附能力:修复潜力和潜在机制

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Journal of Central South University 2024年第4期31卷 1265-1275页

作者：武晨吴玉俊易盛炜李峰 College of Environment and Resources Xiangtan UniversityXiangtan 411105China Hunan Provincial University Key Laboratory for Environmental and Ecological Health Xiangtan UniversityXiangtan 411105China Hunan Provincial University Key Laboratory for Environmental Behavior and Control Principle of New Pollutants Xiangtan UniversityXiangtan 411105China

镉(Cd)作为一种生物非必需的有毒重金属,通过自然排放或人类活动进入环境,对人类健康构成威胁。在微生物中高效表达金属螯合蛋白(MCP)可以增强生物对Cd的吸附能力。本研究构建了mcp基因编码的MCP的异源表达体系(GEM01),探究了其对Cd的... 详细信息

镉(Cd)作为一种生物非必需的有毒重金属,通过自然排放或人类活动进入环境,对人类健康构成威胁。在微生物中高效表达金属螯合蛋白(MCP)可以增强生物对Cd的吸附能力。本研究构建了mcp基因编码的MCP的异源表达体系(GEM01),探究了其对Cd的吸附效果和潜在机制。结果表明,Cd^(2+)调控GEM01中mcp基因丰度,mcp基因的表达增加了Cd^(2+)的生物吸附能力(8.09 mg/g,比对照组高2.32倍)。在GEM01自溶过程中Cd^(2+)的保留率为87.87%。荧光光谱和分子动力学模拟表明了Cd^(2+)与MCP之间存在较强的相互作用且Cd^(2+)影响了MCP的二级结构。FT-IR证明了MCP中的官能团(如羧基、甲基和亚甲基)参与了MCP与Cd^(2+)的相互作用。分子对接进一步表明MCP蛋白表面的一些极性和亲水残基(如天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸和组氨酸)通过静电引力与Cd^(2+)结合。本研究为MCP介导的Cd^(2+)生物修复提供了新的见解,为微生物修复重金属污染提供了基因资源。

关键词：镉 mcp基因金属螯合蛋白相互作用微生物修复

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再生康复:物理因子对再生的作用

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中华烧伤与创面修复杂志 2024年第4期40卷 301-306页

作者：吴军魏亚婷深圳大学第一附属医院烧伤整形创面修复科深圳518035

创面再生修复是烧伤与创面修复外科主要的研究领域之一。近年来,随着康复治疗理念和技术的不断进步,康复治疗与创面再生修复的联系更加紧密,并由此催生出"再生康复"理念。该文对再生康复概念的形成和发展现状以及再生康复领域未来的发... 详细信息

创面再生修复是烧伤与创面修复外科主要的研究领域之一。近年来,随着康复治疗理念和技术的不断进步,康复治疗与创面再生修复的联系更加紧密,并由此催生出"再生康复"理念。该文对再生康复概念的形成和发展现状以及再生康复领域未来的发展和引领价值进行探讨。

关键词：再生医学康复干细胞组织工程

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The PcHY5 methylation is associated with anthocyanin biosynthesis and transport in ‘Max Red Bartlett' and ‘Bartlett' pears

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Journal of Integrative Agriculture 2023年第11期22卷 3256-3268页

作者： WEI Wei-lin JIANG Fu-dong LIU Hai-nan SUN Man-yi LI Qing-yu CHANG Wen-jing LI Yuan-jun LI Jia-ming wu jun College of Horticulture/State Key Laboratory of Crop Genetics&Germplasm Enhancement and Utilization Nanjing Agricultural UniversityNanjing 210095P.R.China Yantai Academy of Agricultural Sciences Yantai 264000P.R.China College of Horticulture and Plant Protection Henan University of Science and TechnologyLuoyang 471023P.R.China

The red coloring of pear fruits is mainly caused by anthocyanin accumulation. Red sport, represented by the green pear cultivar ‘Bartlett’(BL) and the red-skinned derivative ‘Max Red Bartlett’(MRB), is an ideal material for studying the molecular mechanism of anthocyanin accumulation in pear. Genetic analysis has previously revealed a quantitative trait locus(QTL) associated with red skin color in MRB. However, the key gene in the QTL and the associated regulatory mechanism remain unknown. In the present study, transcriptomic and methylomic analyses were performed using pear skin for comparisons between BL and MRB. These analyses revealed differential PcHY5 DNA methylation levels between the two cultivars;MRB had lower PcHY5 methylation than BL during fruit development, and PcHY5 was more highly expressed in MRB than in BL. These results indicated that PcHY5 is involved in the variations in skin color between BL and MRB. We further used dual luciferase assays to verify that PcHY5 activates the promoters of the anthocyanin biosynthesis and transport genes PcUFGT, PcGST, PcMYB10 and PcMYB114, confirming that PcHY5 not only regulates anthocyanin biosynthesis but also anthocyanin transport. Furthermore, we analyzed a key differentially methylated site between MRB and BL, and found that it was located in an intronic region of PcHY5. The lower methylation levels in this PcHY5 intron in MRB were associated with red fruit color during development, whereas the higher methylation levels at the same site in BL were associated with green fruit color. Based on the differential expression and methylation patterns in PcHY5 and gene functional verification, we hypothesize that PcHY5, which is regulated by methylation levels, affects anthocyanin biosynthesis and transport to cause the variations in skin color between BL and MRB.

关键词： pear PcHY5 DNA methylation anthocyanin biosynthesis and transport

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“非完美性”反思及工程实践非完美现象的分析

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自然辩证法通讯 2024年第5期46卷 18-24页

作者：伍军中国中铁股份有限公司北京100039

在推进中国的现代化进程中,工程现代化发挥举足轻重的作用,但工程活动的“非完美性”现象贯穿了工程的全生命周期,这样的反差与张力,亟待哲学理论的解释与消弭。由此,从对完美的概念性批判发轫,全面论述了七种“非完美”现象,同时基于... 详细信息

在推进中国的现代化进程中,工程现代化发挥举足轻重的作用,但工程活动的“非完美性”现象贯穿了工程的全生命周期,这样的反差与张力,亟待哲学理论的解释与消弭。由此,从对完美的概念性批判发轫,全面论述了七种“非完美”现象,同时基于工程的哲学反思,从四个方面对工程实践的“非完美性”进行了分析,并总结指出:完美是相对的,非完美是绝对的;非完美性的实践本质就是践行实事求是的原则,提倡扎根于不完美的现实,不完美探索并遵循不完备的规律,追求可实现的局限美,事实上的整体最美。基于此,对中国工程实践中的非完美现象进行了相关分析。

关键词：完美主义与非完美性工程实践的非完美性工程哲学

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Research on the Collaborative Innovation Model in Regional Social Governance

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Contemporary Social Sciences 2022年第1期7卷 44-61页

作者： Tang jun wu jun Research Institute of Law Sichuan Academy of Social SciencesChengdu

Reforms in social governance are promoted by changes in social environments.Social governance models cannot be constant,and the rise of every innovative governance model is inseparable from an ever-changing society.The theoretical connotation of the collaborative innovation model in regional social governance is mainly reflected in its agents,actions,and processes.The fundamental requirements of the collaborative innovation model in regional social governance are de-administration and market-based.The key elements of the collaborative regional social governance model include:delegating power from central authorities,transferring selected social governance affairs,enhancing the development of governance capabilities in social governance agents,diversifying these agents by giving full play to the agency to strengthen the concept of collaborative governance for social governance agents,strengthening the establishment of the governance system,and ensuring the normal progress of the governance processes.The collaborative innovation model in regional social governance should be built in three aspects:a system of institutional norms,an evaluation indicator system,and law-based collaborative governance.

关键词： regional social governance collaboration innovation model

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