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Assembly of a parts list ofthe human mitotic cell cycle machinery

Journal of Molecular Cell Biology 2019年第8期11卷 703-718页

作者： Bruno Giott sz-Hau Chen Mark W.Barnett Tim Regan Tony Ly Stefan Wiemann David A.Hume tom C.Freeman The Roslin Institute University of Edinburgh Easter Bush Midlothian EH25 9RG Scotland UK Biosciences and Biotechnology Institute EDyP Department CEA Grenoble 17 rue des Martyrs 38054 Grenoble France Wellcome Centre for Cell Biology University of Edinburgh Swann Building Edinburgh EH9 3BF Scotland UK Molecular Genome Analysis (B050) Deutsches Krebsforschungszentrum Im Neuenheimer Feld 580 69120 Heidelberg Germany Mater Research Institute University of Queensland Level 3 Aubigny Place Raymond Terrace South Brisbane Qld 4101 Australia

The set of proteins required for mitotic division remains poorly characterized. Here, an extensive series of correlation analyses of human and mouse transcriptomics data were performed to identify genes strongly and reproducibly associated with cells undergoing S/G2-M phases of the cell cycle. In so doing, 701 cell cycle-associated genes were defined and while it was shown that many are only expressed during these phases, the expression of others is also driven by alternative promoters. Of this list, 496 genes have known cell cycle functions, whereas 205 were assigned as putative cell cycle genes, 53 of which are functionally uncharacterized. Among these, 27 were screened for subcellular localization revealing many to be nuclear localized and at least three to be novel centrosomal proteins. Furthermore, 10 others inhibited cell proliferation upon siRNA knockdown. This study presents the first comprehensive list of human cell cycle proteins, identifying many new candidate proteins.

关键词： cell cycle systems biology gene expression transcriptome network analysis

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A method of quantitatively calculating amount of allochthonous organic carbon in lake sediments

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Chinese Science Bulletin 1997年第21期42卷 1821-1823页

作者： Qian, JL Wang, SM Xue, B Chen, RS Ke, sz Nanjing Inst Geog & Limnol Nanjing 210093 Peoples R China

TOTAL organic matter(tom) or total organic carbon(TOC) is often treated as an importantindicator of lake environment. As a matter of fact, TOC is of multi-origin, and can simply bedivided into two parts: autochthonous and allochthonous organic carbon. The autochthonousorganic carbon is mainly controlled by the production of the plankton of lake itse1f; and the al-lochthonous one by climate and environment in the catchment area, e. g. more precipitationand runoff and densely developed vegetation will give rise to more allochthonous organic com-

关键词： lake sediment allochthonous organic carbon C/N.

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ANUDEM和TIN两种建立DEM方法的对比研究

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水土保持通报 2006年第6期26卷 84-88页

作者：杨勤科 Tim R.McVicar tom G.VanNiel 李领涛中国科学院水利部水土保持研究所澳大利亚联邦科工组织水土资源研究所

针对流域水文和土壤侵蚀定量模拟分析需要,对基于TIN和Hutchinson方法建立的DEM表现地形形态和起伏的能力进行了对比研究。结果表明,基于TIN建立的DEM始终存在一些平顶现象,一些较小的侵蚀沟被忽略,其上提取的河流不完全连续,多处出现... 详细信息

针对流域水文和土壤侵蚀定量模拟分析需要,对基于TIN和Hutchinson方法建立的DEM表现地形形态和起伏的能力进行了对比研究。结果表明,基于TIN建立的DEM始终存在一些平顶现象,一些较小的侵蚀沟被忽略,其上提取的河流不完全连续,多处出现多重线条河流,因而不能如实地反映地形起伏的细部特征。而基于ANUDEM建立的DEM,其派生等高线的形状与输入等高线吻合较好,较好地表现了地形的形态和起伏,对地形和坡度的反映更加连续和光滑,其上提取的河流信息基本与地形图上的河流一致。

关键词：黄土高原数字高程模型(DEM) ANUDEM

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Adaptive evolution to the natural and anthropogenic environment in a global invasive crop pest,the cotton bollworm

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The Innovation 2023年第4期4卷 91-101页

作者： Minghui Jin Henry L.North Yan Peng Hangwei Liu Bo Liu Ruiqing Pan Yan Zhou Weigang Zheng Kaiyu Liu Bo Yang Lei Zhang Qi Xu Samia Elfekih Wendy A.Valencia-Montoya tom Walsh Peng Cui Yongfeng Zhou Kenneth Wilson Chris Jiggins Kongming Wu Yutao Xiao Shenzhen Branch Guangdong Laboratory of Lingnan Modern AgricultureKey Laboratory of Gene Editing Technologies(Hainan)Ministry of Agriculture and Rural AffairsAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518116China The State Key Laboratory for Biology of Plant Disease and Insect Pests Institute of Plant ProtectionChinese Academy of Agricultural SciencesWest Yuanmingyuan RoadBeijing 100193China Department of Zoology University of CambridgeCambridge CB21SZUK College of Plant Science and Technology Huazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China Lancaster Environment Centre Lancaster UniversityLancaster LA14YWUK Berry Genomics Corporation Beijing 102200China Institute of Entomology School of Life SciencesCentral China Normal UniversityWuhan 430079China Australian Centre for Disease Preparedness(ACDP) CSIRO Health&BiosecurityEast GeelongVIC 3169Australia Bio21 Institute and the School of Biosciences The University of MelbourneMelbourneVIC 3010Australia Department of Organismic and Evolutionary Biology and Museum of Comparative Zoology Harvard UniversityCambridgeMA 02138USA CSIRO Land and Water Black Mountain LaboratoriesCanberraACT 2601Australia

The cotton bollworm,Helicoverpa armigera,is set to become the most economically devastating crop pest in the world,threatening food security and biosafety as its range expands across the *** to understanding the eco-evolutionary dynamics of ***,and thus its management,is an understanding of population connectivity and the adaptations that allow the pest to establish in unique *** assembled a chromosome-scale reference genome and re-sequenced 503 individuals spanning the species range to delineate global patterns of connectivity,uncovering a previously cryptic population structure.

关键词： connectivity cotton evolution

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水文地貌关系正确DEM的建立方法

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中国水土保持科学 2007年第4期5卷 1-6,21页

作者：杨勤科师维娟 Tim R．McVicar tom G．Van Niel Lingtao Li 中国科学院水利部水土保持研究所陕西杨凌712100 澳大利亚联邦科工组织水土资源研究所堪培拉澳大利亚2601

水文地貌关系正确DEM(hydrologically correct DEMs,Hc-DEM),是指符合水文地貌学基本原理,正确反映水文要素(水流方向、水流路径、水系网络、流域界线等)与地貌特征发生和位置关系的DEM。区域尺度水文和土壤侵蚀等研究中,地形因子参数... 详细信息

水文地貌关系正确DEM(hydrologically correct DEMs,Hc-DEM),是指符合水文地貌学基本原理,正确反映水文要素(水流方向、水流路径、水系网络、流域界线等)与地貌特征发生和位置关系的DEM。区域尺度水文和土壤侵蚀等研究中,地形因子参数只能利用DEM来提取,为了准确反映地面形态,有效提取地貌和水文特征因子,建立Hc-DEM是必需的。笔者对Hc-DEM的概念、建立方法进行了讨论和介绍;以黄土高原为例,提出了利用多种比例尺数字地形图和ANUDEM软件建立DEM的关键参数;通过与TIN方法建立的DEM的比较,对所建立的DEM进行了简要评价。研究表明,利用我国已有的数字地形图和ANUDEM软件,可以建立Hc-DEM,为流域水文和区域尺度水土流失定量分析模拟、区域尺度植被适宜性评价等研究提供更加直接的数据支持。

关键词：数字高程模型水文地貌黄土高原

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