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单核苷酸多态性(SNP)及其在作物中的研究与应用

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分子植物育种 2024年第9期22卷 2987-2995页

作者：甘斌田宇豪熊兴耀胡新喜秦玉芝湖南农业大学园艺学院园艺作物种质创新与品种选育教育部工程研究中心长沙410128 中国农业科学院深圳农业基因组研究所深圳518120

单核苷酸多态性(SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。因密度高、遗传稳定性好、易实现分析的自动化等特点,SNP作为一类遗传标记在作物遗传学分析中广泛应用。SNP通过直接影响生物内部相关基因的表达,... 详细信息

单核苷酸多态性(SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。因密度高、遗传稳定性好、易实现分析的自动化等特点,SNP作为一类遗传标记在作物遗传学分析中广泛应用。SNP通过直接影响生物内部相关基因的表达,以及蛋白结构的变化导致遗传变异的发生,在研究生物形态或性状变化以及适应性进化上具有根本性的优势。本研究综述了第三代分子标记技术—单核苷酸多态性(SNP)在植物基因图谱的开发、植物遗传多样性与亲缘关系研究、基因定位和分子标记辅助选择等方面的研究与应用进展。

关键词：作物单核苷酸多态性遗传标记

高温下基质湿度对马铃薯种薯组织结构和苗期生长生理的影响

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江西农业大学学报 2024年第3期46卷 625-637页

作者：雷紫芊田宇豪张幸媛尹燕熊兴耀秦玉芝湖南农业大学园艺学院/湖南省马铃薯工程技术研究中心/蔬菜生物学湖南省重点实验室湖南长沙410128 中国农业科学院深圳农业基因组研究所广东深圳440307

【目的】探究在高温下不同栽培湿度、种薯状态对马铃薯的种薯活力、萌发与成苗情况的影响。【方法】选择马铃薯品种“兴佳2号”为供试材料,在高温(30℃)胁迫下,以30%、60%、80%3种不同栽培的基质湿度模拟干旱、正常、高湿情况,以及“健... 详细信息

【目的】探究在高温下不同栽培湿度、种薯状态对马铃薯的种薯活力、萌发与成苗情况的影响。【方法】选择马铃薯品种“兴佳2号”为供试材料,在高温(30℃)胁迫下,以30%、60%、80%3种不同栽培的基质湿度模拟干旱、正常、高湿情况,以及“健康整薯”、“局部受损整薯”和“切薯”3种种薯状态进行播种。在播种后萌芽期分析不同处理种薯细胞活力和组织结构的动态变化,苗期对各处理植株生长与生理状态进行综合评价。【结果】萌发期种薯生命活动旺盛,其体内的可溶性糖与可溶性蛋白含量、SOD活性与呼吸强度均有不同程度提高,而丙二醛含量与种薯硬度降低;种薯损伤程度越大,高温下块茎细胞空腔的形成、维管束解体越快,其中切薯从心髓部开始变化,损伤程度最大,变化速度也是最快,损伤薯则是从维管束最开始变化,再同时向上顶芽和向下心髓部扩散,向下扩散速度更快,损伤严重,而整薯开始是芽点变黑,输导组织逐渐破损,损伤程度相对最轻,种薯的完整性较好;高温下基质湿度越大种薯出苗越快,但基质湿度越大出苗速率越快,但出苗率和成苗率越低;同一湿度下不同种薯状态比较,整薯出苗慢但整齐,而损伤薯和切薯出苗相对较快但出苗率和成苗率低。【结论】高温高湿复合胁迫对马铃薯种薯的影响大于单一高温胁迫,在高温逆境下种薯块出现裂纹,后细胞壁破裂,细胞膜收缩,形成空腔,影响出苗率和成苗率,所以在马铃薯秋作中应该播种前2~3 d灌水,忌高温天气播种后大水漫灌,避免高温天气下大雨前播种,选择萌发期小整薯播种,可以快速出苗并获得高成苗率,确保秋作马铃薯稳产。该研究解析了秋播马铃薯种薯的组织细胞学和生理变化,为通过运用有效农艺措施减少秋作种薯烂薯,促进农民增收提供理论参考。

关键词：马铃薯高温基质湿度种薯组织结构生长生理

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种植方式对马铃薯生长及根区土壤细菌群落结构的影响

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湖南农业大学学报（自然科学版） 2024年第3期50卷 17-26,40页

作者：张慧菊田敏杨明愈刘海怡林原柳蓉秦玉芝熊兴耀胡新喜湖南农业大学园艺学院湖南长沙410128 湖南省马铃薯工程技术研究中心湖南长沙410128 蔬菜生物学湖南省重点实验室湖南长沙410128 中国农业科学院深圳农业基因组研究所广东深圳518120

以‘华薯5号’为材料,于2022、2023年在湖南省株洲市开展大田栽培试验,研究不同种植方式对马铃薯生长、土壤化学性质及细菌群落结构的影响。结果表明:高产高效方式(种植密度为82500株/hm^(2),施硫酸钾复合肥1125 kg/hm^(2)、有机肥1500 ... 详细信息

以‘华薯5号’为材料,于2022、2023年在湖南省株洲市开展大田栽培试验,研究不同种植方式对马铃薯生长、土壤化学性质及细菌群落结构的影响。结果表明:高产高效方式(种植密度为82500株/hm^(2),施硫酸钾复合肥1125 kg/hm^(2)、有机肥1500 kg/hm^(2)、生物酶活化磷肥750 kg/hm^(2)、40%硫酸锌15 kg/hm^(2))的株高、茎粗高于农民方式(种植密度为67500株/hm^(2),施750kg/hm^(2)硫酸钾复合肥)和高产方式(种植密度为75000株/hm^(2),施1500 kg/hm^(2)硫酸钾复合肥);2022、2023年高产高效方式的产量分别为28.78、46.83 t/hm^(2),显著高于农民方式和高产方式的;高产高效方式的土壤pH、有机质(SOM)含量和脲酶活性均显著高于农民方式和高产方式的;高产方式显著提高了土壤水解性氮、有效磷、速效钾的含量;采用高通量测序对不同种植方式马铃薯根区土壤细菌群落结构进行分析,结果表明,高产方式的OTUs、Chao1指数最高;主成分分析表明,农民方式与高产方式、高产高效方式的细菌群落组成差异较大,高产高效方式门水平上Proteobacteria和Deferribacterota相对丰度及属水平上Mucispirillum和Lactobacillus相对丰度均高于农民方式和高产方式;RDA分析表明,土壤pH、N、P、K、有机质含量及土壤脲酶活性是影响细菌群落结构的主要环境因子;SEM分析表明,土壤pH和SOM、N、P、K含量是提高马铃薯产量和改变土壤细菌多样性的主要驱动因子。综上所述,与农民方式、高产方式相比,高产高效方式能促进马铃薯植株生长,缓解土壤酸化和提高有机质含量,增加根区土壤细菌主要优势门的相对丰度,显著增加块茎产量。

关键词：马铃薯种植方式密度肥料产量细菌群落

Microwave diagnostics of magnetic field strengths in solar flaring loops

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Science China(Technological Sciences) 2021年第1期64卷 169-178页

作者： ZHU Rui TAN BaoLin SU YingNa tian Hui XU Yu CHEN xingyao SONG YongLiang TAN GuangYu School of Earth and Space Sciences Peking UniversityBeijing 100871China Key Laboratory of Solar Activity National Astronomical ObservatoriesChinese Academy of SciencesBeijing 100012China School of Astronomy and Space Science University of Chinese Academy of SciencesBeijing 100049China Key Laboratory of Dark Matter and Space Astronomy Purple Mountain ObservatoryChinese Academy of SciencesNanjing 210008China School of Astronomy and Space Science University of Science and Technology of ChinaHefei 230026China School of Astronomy and Space Science Nanjing UniversityNanjing 210023China

We have performed microwave diagnostics of the magnetic field strengths in solar flaring loops based on the theory of gyrosynchrotron *** Nobeyama Radioheliograph observations of three flare events at 17 and 34 GHz,we obtained the degree of circular polarization and the spectral index of microwave flux density,which were then used to map the magnetic field strengths in post-flare *** results show that the magnetic field strength typically decreases from ~800 G near the loop footpoints to~100 G at a height of 10-25 *** of our results with magnetic field modeling using a flux rope insertion method is also *** study demonstrates the potential of microwave imaging observations,even at only two frequencies,in diagnosing the coronal magnetic field of flaring regions.

关键词： solar magnetic field solar flare microwave observation gyrosynchrotron emission

The Evaluation of Educational Literacy of Physics Students in Normal Universities Under China’s Professional Certification System

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Journal of Contemporary Educational Research 2022年第1期6卷 56-62页

作者： Zujun Li Qihang Zhou Shiwen Ni tian Liang xingyao Han Faculty of Science Jiamusi UniversityJiamusi 154000China Faculty of Education University Putra MalaysiaKuala Lumpur 43300Malaysia

This article discusses the connotation of the evaluation of educational literacy of physics students in normal universities,provides the evaluation criteria for students’teaching ability,improves the evaluation composition of educational literacy of physics students in normal universities,and provides the score distribution of the 10 items in educational literacy,in hope to improve the training quality of university students.

关键词： Professional certification Physics students in normal university Teaching ability Educational literacy

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湖南省马铃薯病毒病发生情况调查

植物保护 2022年第1期48卷 198-203页

作者：崔红红张幸媛田宇豪甘斌尹燕胡新喜熊兴耀秦玉芝湖南农业大学园艺学院园艺作物种质创新与品种选育教育部工程研究中心长沙410128 中国农业科学院深圳农业基因组研究所深圳518120

为了解湖南省马铃薯种薯质量和主要病毒病发生情况,2019年-2020年马铃薯秋作和冬作期间,对长沙、益阳、湘潭、澧临等马铃薯生产区的155个马铃薯样品,运用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和双抗体夹心酶联免疫吸附检测(DAS-ELISA)技术,筛... 详细信息

为了解湖南省马铃薯种薯质量和主要病毒病发生情况,2019年-2020年马铃薯秋作和冬作期间,对长沙、益阳、湘潭、澧临等马铃薯生产区的155个马铃薯样品,运用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和双抗体夹心酶联免疫吸附检测(DAS-ELISA)技术,筛查6种主要马铃薯病毒,包括马铃薯X病毒Potato virus X(PVX)、马铃薯Y病毒Potato virus Y(PVY)、马铃薯M病毒Potato virus M(PVM)、马铃薯S病毒Potato virus S(PVS)、马铃薯A病毒Potato virus A(PVA)、马铃薯卷叶病毒Potato leaf roll virus(PLRV)。检测结果表明:6种马铃薯病毒病在湖南均有不同程度的发生,单一和两种病毒复合感染植株占比最高,其次是3种病毒复合感染,存在极少数植株复合感染4~5种病毒病情况。在秋作马铃薯中,PVY检出率达到29.41%;PVS和PVA检出率均为27.94%;PVM、PVX、PLRV的检出率分别为20.59%、19.12%、17.65%。在冬作马铃薯中,PVX检出率最高,达到31.03%;其次是PLRV,检出率为25.29%;PVS、PVM、PVA、PVY的检出率依次为19.54%、16.09%、10.34%、5.75%。综上所述,近年来湖南地区马铃薯病毒病发生有抬头之势,其中PVX和PVY最为严重,复合感染增加,受天气和种源影响,秋作马铃薯比冬作马铃薯情况严重。

关键词：马铃薯病毒病调查鉴定 RT-PCR DAS-ELISA

基于反向分子对接的虫草素和三磷酸虫草素的生物活性

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湖南农业大学学报（自然科学版） 2016年第3期42卷 262-267页

作者：程功张国财马玲田树新张星耀东北林业大学林学院黑龙江哈尔滨150040 黑龙江省森林保护研究所黑龙江哈尔滨150040 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所北京100091

分别采用idTarget、Pharm Mapper在线反向分子对接软件预测虫草素和三磷酸虫草素的靶标蛋白（药效团匹配蛋白）,用Ledock分子对接软件模拟虫草素、三磷酸虫草素与靶标蛋白的结合构象,用Lig Plus软件分析结合构象活性口袋内残基与配体的... 详细信息

分别采用idTarget、Pharm Mapper在线反向分子对接软件预测虫草素和三磷酸虫草素的靶标蛋白（药效团匹配蛋白）,用Ledock分子对接软件模拟虫草素、三磷酸虫草素与靶标蛋白的结合构象,用Lig Plus软件分析结合构象活性口袋内残基与配体的相互作用。反向分子对接结果表明：三磷酸虫草素与靶标蛋白的自由结合能比虫草素与靶标蛋白的自由结合能低。分子对接结果表明：与虫草素相比,三磷酸虫草素与靶标蛋白活性口袋内的氨基酸残基可形成更多的氢键,且三磷酸虫草素和靶标蛋白有较好的几何匹配,其自由结合能也较低,其结合构象更稳定。根据正向、反向分子对接结果,认为三磷酸虫草素是虫草素进入人体内发挥生物活性的主要物质。

关键词：蛹虫草虫草素三磷酸虫草素分子模拟靶标蛋白自由结合能

基于体控建模的地震反演在火山岩储层预测中的应用

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大庆石油地质与开发 2015年第5期34卷 135-140页

作者：雒聪田野陈树民印兴耀裴明波中国石油大学地球科学与技术学院山东青岛266555 大庆油田有限责任公司采油工程研究院黑龙江大庆163712 大庆油田有限责任公司勘探开发研究院黑龙江大庆163712

不同于沉积地层,火山岩具有多级次内幕结构,其地层结构、填充类型和叠置关系复杂多变,常规沉积层序地层概念指导下的模型难以反映火山岩地层复杂的地质特征及剧烈的横向变化。因此,基于内幕结构解剖和层序精细划分的火山岩格架模型对提... 详细信息

不同于沉积地层,火山岩具有多级次内幕结构,其地层结构、填充类型和叠置关系复杂多变,常规沉积层序地层概念指导下的模型难以反映火山岩地层复杂的地质特征及剧烈的横向变化。因此,基于内幕结构解剖和层序精细划分的火山岩格架模型对提高反演精度,从而真实反映火山岩储层分布具有重要意义。采取组内划段,段内识别火山岩地层,地层细化火山期次,以期次为时间格架剖分火山岩体的方案,将徐家围子断陷安达地区营城组三段进行了火山岩地层—喷发期次—火山喷发岩体的精细刻画。在多种火山喷发模式和火山岩体约束下,建造出符合火山岩地层特征的地质模型。在此高精度模型的约束下,结合测井敏感参数分析结果,开展多井约束的波阻抗反演和密度反演,实现火山岩储层的定量预测。与钻井揭示结果相对比,火山岩储层预测符合率达到83.33%,显示了基于体控建模的反演方法对火山岩储层预测的可靠性。

关键词：营城组火山岩火山喷发岩体体控模型波阻抗反演储层预测

基于^(60)Co-γ射线辐照的木糖乙醇发酵差异性突变菌株筛选及其发酵特性

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核农学报 2015年第2期29卷 290-295页

作者：熊冬梅曾璐熊兴耀田开忠刘阳石琢苏小军湖南农业大学/湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室湖南长沙410128 中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081 湖南农业大学食品科技学院湖南长沙410128 湖南省植物功能成分利用协同创新中心湖南长沙410128

本研究利用60Co-γ辐射源对树干毕赤酵母CICC1960进行辐照诱变,获取木糖乙醇发酵优良菌株和差异性突变菌株群体,为进一步利用比较基因组学方法深入研究木糖乙醇代谢机制提供菌种材料。经筛选获得7株木糖乙醇转化差异性突变菌株,以乙醇... 详细信息

本研究利用60Co-γ辐射源对树干毕赤酵母CICC1960进行辐照诱变,获取木糖乙醇发酵优良菌株和差异性突变菌株群体,为进一步利用比较基因组学方法深入研究木糖乙醇代谢机制提供菌种材料。经筛选获得7株木糖乙醇转化差异性突变菌株,以乙醇木糖比为指标,可将各突变菌株的发酵能力由高到低排列为:a1、X4、i11、K2、X21、CICC1960、a11、c10,乙醇木糖比均值分别为0.3143、0.3037;0.2911、0.2678、0.2578、0.2311、0.2230、0.1220。其中菌株a1、X4、i11为优良菌株,菌株a1在发酵72h时乙醇产量达到顶峰15.6 g·L-1,高出出发菌株140%,乙醇木糖比高出出发菌株37.9%;菌株X4在发酵60h时乙醇产量达到顶峰15.4 g·L-1,高出出发菌株234.8%,乙醇木糖比高出出发菌株33.1%;菌株i11在发酵60h时乙醇产量达到顶峰14.8 g·L-1,高出出发菌株221.7%,乙醇木糖比高出出发菌株29%。

关键词：树干毕赤酵母 60Co-γ射线辐照木糖乙醇突变菌株发酵