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Knocking-Out OsPDR7 Triggers Up-Regulation of OsZIP9 Expression and Enhances Zinc Accumulation in Rice

Rice science 2023年第1期30卷 36-49页

作者： MENG Lu tanG Mingfeng ZHU Yuxing tan longtao Key Laboratory of Agro-ecological Processes in Subtropical Region Institute of Subtropical AgricultureChinese Academy of SciencesChangsha 410125China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Institute of Agricultural Quality Standard and Testing Technology Chongqing Academy of Agricultural SciencesChongqing 401329China

Zinc(Zn) is an essential trace mineral that is required for plant growth and development. A number of protein transporters, which are involved in Zn uptake, translocation and distribution, are finely regulated to maintain Zn homeostasis in plant. In this study, we functionally characterized an ATP-binding cassette(ABC) transporter gene, OsPDR7, which is involved in Zn homeostasis. Os PDR7 encodes a plasma membrane-localized protein that is expressed mainly in the exodermis and xylem in the rice ***7 mutants resulted in higher Zn accumulation compared with the wild type. Heterogeneous expression of OsPDR7 in a yeast mutant rescued the Zn-deficiency phenotype, implying transport activity of OsPDR7 to Zn in yeast. However, no ZIP genes except for OsZIP9 showed change in expression profile in the ospdr7 mutants, which suggested that OsPDR7 maintains cellular Zn homeostasis through regulating Os ZIP9 expression. RNA-Seq analysis further revealed a set of differentially expressed genes between the wild type and ospdr7 mutants that allowed us to propose a possible OsPDR7-associated signaling network involving transporters, hormone responsive genes, and transcription factors. Our results revealed a novel transporter involved in the regulation of Zn homeostasis and will pave the way toward a better understanding of the fine-tuning of gene expression in the network of transporter genes.

关键词： OsPDR7 OsZIP9 zinc metal accumulation rice ATP-binding cassette transporter

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Genome-wide Targeted Mutagenesis in Rice Using the CRISPR/Cas9 System

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Molecular Plant 2017年第9期10卷 1242-1245页

作者： Lu, Yuming Ye, Xiao Guo, Renming Huang, Jing Wang, Wei tang, Jiuyou tan, longtao Zhu, Jian-kang Chu, Chengcai Qian, Yangwen Biogle Genome Editing Ctr Changzhou 213125 Jiangsu Peoples R China Chinese Acad Sci Natl Ctr Plant Gene Res Beijing Inst Genet & Dev Biol State Key Lab Plant Genom Beijing 100101 Peoples R China Chinese Acad Sci Shanghai Ctr Plant Stress Biol Shanghai 201602 Peoples R China Chinese Acad Sci Ctr Excellence Mol Plant Sci Shanghai 201602 Peoples R China Chinese Acad Sci Inst Subtrop Agr Key Lab Agroecol Proc Subtrop Reg Changsha 410125 Hunan Peoples R China

Dear Editor Since the completion of the rice （Oryza sativa） genome- sequencing project, a major goal of rice research has been the functional characterization of all annotated genetic loci in various biological processes. One of the most efficient and widely-used strategies for studying gene function is genetic mutagenesis. Several rice mutant libraries have been generated in the past decade, providing a wealth of resources for plant research （Chang et al., 2012）. CRISPR/Cas9 （clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated nuclease 9） has recently emerged as a powerful tool for rice research and breeding （Cong et al., 2013; Feng et al., 2013; Miao et al., 2013;

关键词： Genome-wide Targeted Mutagenesis Rice Using the CRISPR Cas9 System

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水稻锌铁转运蛋白ZIP基因家族研究进展

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遗传 2018年第1期40卷 33-43页

作者：孟璐孙亮谭龙涛储成才中国科学院亚热带农业生态研究所长沙410125 不详

锌(zinc,Zn)和铁(iron,Fe)是水稻(Oryza sativa L.)生长必需的矿质元素,也是人体必需的微量元素。水稻体内Zn、Fe含量维持在适宜水平有利于提高其产量和品质,提高稻米中Zn、Fe含量能够在一定程度上解决人体Zn、Fe营养缺乏的问题。因此,... 详细信息

锌(zinc,Zn)和铁(iron,Fe)是水稻(Oryza sativa L.)生长必需的矿质元素,也是人体必需的微量元素。水稻体内Zn、Fe含量维持在适宜水平有利于提高其产量和品质,提高稻米中Zn、Fe含量能够在一定程度上解决人体Zn、Fe营养缺乏的问题。因此,研究水稻中Zn和Fe等微量元素转运蛋白的具体功能对于提高水稻产量和稻米品质具有重要意义。锌铁转运蛋白(zinc-regulated transporters and iron-regulated transporter-like protein,ZIP)负责Zn和Fe等离子的吸收、转运和分配,是维持水稻中Zn和Fe平衡的重要转运蛋白,其表达水平受Zn和Fe水平影响。ZIP基因家族在自然群体中具有丰富的等位变异,而且某些单倍型存在明显的籼粳分化,这可能造成了不同品种间籼、粳稻中Zn和Fe积累的差异。目前,已有大量关于ZIP基因家族的研究,但只有Os ZIP3的作用机制研究的较为清楚。另外,对Zn、Fe在籽粒中的积累机制研究和自然群体中ZIP基因的等位变异研究还不够深入。因此,ZIP转运蛋白家族仍存在较大的研究空间。本文详细介绍了ZIP转运蛋白在水稻体内的亚细胞定位、表达模式、转运机制以及在自然群体中的等位变异等,以期为研究水稻稻米微量元素的积累提供理论基础,为提高稻米品质提供借鉴。

关键词： ZIP基因锌铁转运机制自然变异

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Exploring the potential of extrachromosomal DNA as a novel oncogenic driver

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Science China Life Sciences 2025年第1期 144-157页

作者： Huanbo Zhu longtao Huangfu Junbing Chen Jiafu Ji Xiaofang Xing Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education/Beijing) Division of Gastrointestinal Cancer Translational Research LaboratoryPeking University Cancer Hospital & Institute Department of Gastrointestinal Cancer Center Peking University Cancer Hospital & Institute Department of Liver Surgery & Transplantation Liver Cancer InstituteZhongshan HospitalFudan University Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion Ministry of Education State Key Laboratory of Holistic Integrative Management of Gastrointestinal Cancers Beijing Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational ResearchDivision of Gastrointestinal Cancer Translational Research LaboratoryPeking University Cancer Hospital & Institute

Extrachromosomal DNA(ecDNA) is a form of circular DNA mostly found in tumor cells. Unlike the typical chromosomal DNA, ecDNA is circular, self-replicating, and carries complete or partial gene fragments. Although ecDNA occurrence remains a rare event in cancer, recent studies have shown that oncogene amplification on ecDNA is widespread throughout many types of cancer, implying that ecDNA plays a central role in accelerating tumor evolution. ecDNA has also been associated with increased tumor mutation burden, chromosomal instability, and even tumor microenvironment remodeling. ecDNA may be crucial in influencing tumor heterogeneity, drug sensitivity,oncogenic senescence, and tumor immunogenicity, leading to a worsening prognosis for tumor patients. In this way, several clinical trials have been conducted to investigate the importance of ecDNA in clinical treatment. In this review, we summarize the biogenesis, characteristics, and current research methods of ecDNA, discuss the vital role of ecDNA-caused tumor heterogeneity in cancers, and highlight the potential role of ecDNA in cancer therapy.

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不同苎麻基因型氮素累积与利用效率差异分析

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中国麻业科学 2017年第1期39卷 30-36页

作者：陈继康谭龙涛喻春明陈平朱爱国熊和平中国农业科学院麻类研究所长沙410205

品种改良是提高作物氮素利用效率最有效的途径。当前苎麻生产过量施氮造成严重浪费,但尚未见针对不同基因型苎麻氮素累积与利用特征的研究。本研究采用循环营养液培养法,对30份苎麻资源苗期氮素累积与利用特征进行分析,以期为苎麻遗传... 详细信息

品种改良是提高作物氮素利用效率最有效的途径。当前苎麻生产过量施氮造成严重浪费,但尚未见针对不同基因型苎麻氮素累积与利用特征的研究。本研究采用循环营养液培养法,对30份苎麻资源苗期氮素累积与利用特征进行分析,以期为苎麻遗传改良提供依据。研究表明,不同基因型苎麻间氮素累积量、分布及组成均具有显著差异。苎麻植株氮素更易向地上部累积,且铵态氮含量高于硝态氮。地上部硝态氮累积量是检验不同基因型苎麻氮素利用效率最敏感的指标。不同基因型苎麻间氮素利用效率具有显著差异,变异丰富,具有通过遗传改良显著提高的潜力。

关键词：苎麻苗期氮素利用效率氮素累积

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氮素水平对不同氮效率苎麻纤维发育关键酶的影响

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中国麻业科学 2017年第5期39卷 257-263页

作者：陈继康谭龙涛喻春明朱爱国陈平高钢陈坤梅熊和平中国农业科学院麻类研究所长沙410205

以氮高效(H2000-03)和氮低效(册亨家麻)2个基因型苎麻品种为材料,设置氮素水平(0、6、9、12、15 mmol/L)开展温室盆栽试验,研究氮素调控苎麻纤维发育关键酶的生理机制。结果表明,苎麻蔗糖合成酶(SS)、β-1,3-葡聚糖酶和吲哚乙酸氧化酶(I... 详细信息

以氮高效(H2000-03)和氮低效(册亨家麻)2个基因型苎麻品种为材料,设置氮素水平(0、6、9、12、15 mmol/L)开展温室盆栽试验,研究氮素调控苎麻纤维发育关键酶的生理机制。结果表明,苎麻蔗糖合成酶(SS)、β-1,3-葡聚糖酶和吲哚乙酸氧化酶(IAAO)活性随氮素水平提高呈现逐渐增加的趋势,并在超过9 mmol/L后增幅显著下降。各酶活性随生长发育时期均呈单峰变化趋势,表现为旺长期>幼苗期>成熟期。氮高效基因型的相关酶活性均高于氮低效基因型,且SS和β-1,3-葡聚糖酶活性在幼苗期和旺长期达到显著水平,IAAO活性在旺长期和成熟期达到显著水平(p<0.05)。相关酶对苎麻原麻产量具有重要影响,不同基因型对其响应特征不同,其中氮高效基因型的响应较敏感。苎麻纤维发育存在适氮水平,氮高效基因型可耐受更高氮素水平,并表现出显著较高的生产力和稳产性。

关键词：苎麻氮效率纤维酶氮素水平

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乳腺癌术后重建的相关研究进展

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中国普外基础与临床杂志 2017年第10期24卷 1279-1283页

作者：刘健张英哲王晓红程凯滕晓飞谭龙涛杨振林滨州医学院附属医院甲状腺与乳腺外科山东滨州256600

目的了解乳腺癌术后重建的基本术式和发展现状。方法对国内外有关乳腺癌术后重建的相关文献进行复习并对新观念进行总结。结果随着乳腺癌发病率的上升及治疗手段的进步,乳腺癌术后重建逐渐成为一种趋势,只要病情允许均可进行乳房重建。... 详细信息

目的了解乳腺癌术后重建的基本术式和发展现状。方法对国内外有关乳腺癌术后重建的相关文献进行复习并对新观念进行总结。结果随着乳腺癌发病率的上升及治疗手段的进步,乳腺癌术后重建逐渐成为一种趋势,只要病情允许均可进行乳房重建。目前乳腺癌术后重建大体可分为植入物型重建、自体重建、脂肪填充重建等,不同的重建方式对应不同的适应证并有其相应的并发症,对不同患者应结合患者的具体病情以及术后是否行放射治疗和化学治疗以及患者对术后外观的要求进行综合评估,为患者选择最为合适的重建方式。结论乳腺癌术后重建在国外已趋于成熟,国内也早已开展相应的研究,并且国内外之间一直进行着不断的交流学习,相信随着中外交流的不断深入和技术的进步,在不久的将来,乳腺癌术后重建或许会成为我国乳腺癌患者术后的常规选项之一。

关键词：乳腺癌乳房重建术后并发症

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Correction Factors of the Approximate Theories for Axisymmetric Modes of Longitudinal Waves in Circular Rods

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Acta Mechanica Solida Sinica 2022年第5期35卷 824-833页

作者： longtao Xie Chunlei Bian Ji Wang Piezoelectric Device Laboratory School of Mechanical Engineering and MechanicsNingbo UniversityNingbo315211China TXC-NBU Joint Center of Research School of Mechanical Engineering and MechanicsNingbo UniversityNingbo315211China

The longitudinal waves guided by rods are widely used in broad engineering *** theories are required to improve the understanding of the longitudinal wave propagation in finite rods in *** correction factors are commonly used in the vibration analyses of beams and plates,but are seldom adopted to the longitudinal wave propagation in rods in a similar *** this paper,the longitudinal and radial displacements in axisymmetric problems of circular rods are expanded in infinite power series of the radial *** using Hamilton’s principle,an infinite one-dimensional system of equations of motion is *** high-order components of stress and strain,and their relations are introduced to obtain the infinite one-dimensional system for the axisymmetric wave propagation in elastic rods.A proper truncation of the infinite equations leads to an approximate theory of a specific *** improve the truncated equations,some high-order components of strain are multiplied by the correction *** correction factors for the first-to fourth-order approximations are systematically determined to ensure that the cutoff frequencies are the same as the exact values calculated by the Pochhmammer–Chree *** frequency spectra,via the well-known Pochhmammer–Chree equation and the approximate theories of order one to four,are presented for comparison in a region where the longitudinal wave is not attenuating and the wavelength in the axial direction is longer than the diameter of the *** to the approximate theories without correction factors,the approximate theories with correction factors show some advantages in accuracy when the branches are high.

关键词： Symmetric wave Approximate theory of rods Correction factor Frequency

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乳腺癌新辅助化疗疗效生物学预测指标的研究进展

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中国普外基础与临床杂志 2017年第12期24卷 1546-1550页

作者：谭龙涛滕晓飞程凯王晓红刘健张英哲杨振林滨州医学院附属医院甲状腺乳腺外科山东滨州256600

目的总结乳腺癌新辅助化疗疗效生物学预测指标的研究进展。方法阅读近年来相关文献,对预测乳腺癌行新辅助化疗后疗效的生物学指标进展加以综述。结果既往研究显示,许多生物学指标可能与乳腺癌新辅助化疗疗效相关,如人表皮生长因子受体-2... 详细信息

目的总结乳腺癌新辅助化疗疗效生物学预测指标的研究进展。方法阅读近年来相关文献,对预测乳腺癌行新辅助化疗后疗效的生物学指标进展加以综述。结果既往研究显示,许多生物学指标可能与乳腺癌新辅助化疗疗效相关,如人表皮生长因子受体-2(HER-2)基因、雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、Ki-67、P53基因、中性粒细胞和淋巴细胞的比值(NLR)、血小板水平、血小板平均体积(MPV)等,但具体预测价值尚未达成一致结论。结论各种因子对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值尚不确定,需待进一步研究。

关键词：乳腺癌新辅助化疗生物学标志物病理完全缓解综述

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Variational bounds of the effective moduli of piezoelectric composites

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2012年第11期55卷 2106-2113页

作者： WAN YongPing XIE longtao ZHONG Zheng School of Aerospace Engineering and Applied Mechanics Tongji UniversityShanghai 200092China

The classical Hashin-Shtrikman variational principle was re-generalized to the heterogeneous piezoelectric *** auxiliary problem is very much simplified by selecting the reference medium as a linearly isotropic elastic *** electromechanical fields in the inhomogeneous piezoelectrics are simulated by introducing into the homogeneous reference medium certain eigenstresses and eigen electric fields.A closed-form solution can be obtained for the disturbance fields,which is convenient for the manipulation of the energy *** an application,a two-phase piezoelectric composite with nonpiezoelectric matrix is *** of upper and lower bounds for the overall electromechanical moduli of the composite can be *** bounds are shown better than the Voigt-Reuss type ones.

关键词： variational bound piezoelectric composite effective modulus

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