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Development of Genomic Microsatellite Multiplex PCR Using Dye-Labeled Universal Primer and Its Validation in Pedigree Analysis of Pacific Oyster(Crassostrea gigas)

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Journal of Ocean University of China 2017年第1期16卷 151-160页

作者： LIU Ting LI Qi song junlin YU Hong Key Laboratory of Mariculture of Ministry of Education Ocean University of ChinaQingdao 266003P.R.China

There is an increasing requirement for traceability of aquaculture products, both for consumer protection and for food safety. There are high error rates in the conventional traceability systems depending on physical labels. Genetic traceability technique depending on DNA-based tracking system can overcome this problem. Genealogy information is essential for genetic traceability, and microsatellite DNA marker is a good choice for pedigree analysis. As increasing genotyping throughput of microsatellites, microsatellite multiplex PCR has become a fast and cost-effective technique. As a commercially important cultured aquatic species, Pacific oyster Crassostrea gigas has the highest global production. The objective of this study was to develop microsatellite multiplex PCR panels with dye-labeled universal primer for pedigree analysis in C. gigas, and these multiplex PCRs were validated using 12 full-sib families with known pedigrees. Here we developed six informative multiplex PCRs using 18 genomic microsatellites in C. gigas. Each multiplex panel contained a single universal primer M13(-21) used as a tail on each locus-specific forward primer and a single universal primer M13(-21) labeled with fluorophores. The polymorphisms of the markers were moderate, with an average of 10.3 alleles per locus and average polymorphic information content of 0.740. The observed heterozygosity per locus ranged from 0.492 to 0.822. Cervus simulations revealed that the six panels would still be of great value when massive families were analysed. Pedigree analysis of real offspring demonstrated that 100% of the offspring were unambiguously allocated to their parents when two multiplex PCRs were used. The six sets of multiplex PCRs can be an important tool for tracing cultured individuals, population genetic analysis, and selective breeding program in C. gigas.

关键词： Crassostrea gigas traceability microsatellites universal primer multiplex PCR pedigree analysis

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考虑不同灌浆效果的海上风电顶部灌浆桩基础竖向抗拔承载力数值研究

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甘肃科学学报 2024年第2期36卷 50-58页

作者：宋俊霖朱文轩上海交通大学海洋工程国家重点实验室上海200240 上海交通大学土木工程系上海200240

海上风电大直径钢管桩与导管架常用灌浆连接形成闭口桩,而现有闭口桩设计不考虑或是低估了灌浆段的承载力贡献,而且施工的不确定性可能导致灌浆体深度不足或是渗透性过大,因此研究不同灌浆效果对承载力的影响可为闭口桩设计提供参考。... 详细信息

海上风电大直径钢管桩与导管架常用灌浆连接形成闭口桩,而现有闭口桩设计不考虑或是低估了灌浆段的承载力贡献,而且施工的不确定性可能导致灌浆体深度不足或是渗透性过大,因此研究不同灌浆效果对承载力的影响可为闭口桩设计提供参考。通过岩土数值软件ABAQUS设置水单元及调整灌浆段渗透性等方式模拟不同灌浆效果,并进行影响因素分析。模型采用修正剑桥本构,考虑黏土地层并引入黏结接触模拟灌浆段底部与土体的相互作用。结果表明,不同灌浆效果的荷载-位移曲线均存在明显拐点,灌浆不足和灌浆正常两种工况下的极限抗拔承载力基本一致,灌浆段的承载力分担比约占14.4%;而灌浆渗漏的极限抗拔承载力相比则存在明显差距,其主要来源于灌浆段部分。竖向抗拔承载力的影响因素分析结果表明,随着接触面刚度系数的增大,抗拔承载力也随之增大;随着长径比增大,抗拔承载力逐渐减小;桩壁厚度的影响并不能单纯以桩体内外径尺寸来评判。

关键词：海上风电灌浆效果顶部灌浆桩基础黏结接触抗拔承载力分担比

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Multi-omics analysis reveals the molecular regulatory network underlying the prevention of Lactiplantibacillus plantarum against LPS-induced salpingitis in laying hens

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2024年第1期15卷 427-441页

作者： Dan song Aike Li Bingxu Chen Jia Feng Tao Duan junlin Cheng Lixian Chen Weiwei Wang Yuna Min College of Animal Science and Technology Northwest A&F UniversityShaanxiPeople’s Republic of China Key Laboratory of Grain and Oil Biotechnology of National Food and Strategic Reserves Administration Academy of National Food and Strategic Reserves AdministrationBeijingPeople’s Republic of China

Background Salpingitis is one of the common diseases in laying hen production, which greatly decreases the economic outcome of laying hen farming. Lactiplantibacillus plantarum was effective in preventing local or systemic inflammation, however rare studies were reported on its prevention against salpingitis. This study aimed to investigate the preventive molecular regulatory network of microencapsulated Lactiplantibacillus plantarum(MLP) against salpingitis through multi-omics analysis, including microbiome, transcriptome and metabolome analyses.Results The results revealed that supplementation of MLP in diet significantly alleviated the inflammation and atrophy of uterus caused by lipopolysaccharide(LPS) in hens(P < 0.05). The concentrations of plasma IL-2 and IL-10 in hens of MLP-LPS group were higher than those in hens of LPS-stimulation group(CN-LPS group)(P < 0.05). The expression levels of TLR2, MYD88, NF-κB, COX2, and TNF-α were significantly decreased in the hens fed diet supplemented with MLP and suffered with LPS stimulation(MLP-LPS group) compared with those in the hens of CN-LPS group(P < 0.05). Differentially expressed genes(DEGs) induced by MLP were involved in inflammation, reproduction, and calcium ion transport. At the genus level, the MLP supplementation significantly increased the abundance of Phascolarctobacterium, whereas decreased the abundance of Candidatus_Saccharimonas in LPS challenged hens(P < 0.05). The metabolites altered by dietary supplementation with MLP were mainly involved in galactose, uronic acid, histidine, pyruvate and primary bile acid metabolism. Dietary supplementation with MLP inversely regulates LPSinduced differential metabolites such as Lyso PA(24:0/0:0)(P < 0.05).Conclusions In summary, dietary supplementation with microencapsulated Lactiplantibacillus plantarum prevented salpingitis by modulating the abundances of Candidatus_Saccharimonas, Phascolarctobacterium, Ruminococcus_torques_group and Eubacterium_hallii_group while downregulating the levels of plasma metabol

关键词： Laying hen Metabolome Microbiome Microencapsulated Lactiplantibacillus plantarum Salpingitis Transcriptome

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Pipeline Embolization Device for intracranial aneurysms presenting with mass effect:a large Chinese cohort

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Stroke & Vascular Neurology 2024年第1期9卷 50-58页

作者： Yang Zhao junlin Lu Hongqi Zhang Tianxiao LI Donglei song Sheng Guan Aisha Maimaitili Yunyan Wang Wenfeng Feng Yang Wang Jieqing Wan Guohua Mao Huaizhang Shi Xinjian Yang Jianmin Liu Yuanli Zhao Department of Neurosurgery Beijing Tiantan HospitalCapital Medical UniversityBeijingChina Department of Neurosurgery Peking University International HospitalBeijingChina Department of Neurosurgery West China HospitalSichuan UniversityChengduSichuanChina Department of Neurosurgery Xuanwu HospitalCapital Medical UniversityBeijingChina Department of Interventional Neuroradiology Zhengzhou University People's HospitalZhengzhouHenanChina Department of Neurosurgery Shanghai Donglei Brain HospitalShanghaiChina Department of Interventional Neuroradiology The First Affiliated Hospital of Zhengzhou UniversityZhengzhouHenanChina Department of Neurosurgery The First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical UniversityUrumqiXinjiangChina Department of Neurosurgery Qilu Hospital of Shandong University QingdaoJinanShandongChina Department of Neurosurgery Nanfang HospitalSouthern Medical UniversityGuangzhouGuangdongChina Department of Neurosurgery The First Affiliated Hospital of Nanchang UniversityNanchangJiangxiChina Department of Neurosurgery Renji HospitalSchool of MedicineShanghai Jiao Tong UniversityShanghaiChina Department of Neurosurgery The Second Affiliated Hospital of Nanchang UniversityNanchangJiangxiChina Department of Neurosurgery The First Affiliated Hospital of Harbin Medical UniversityHarbinHeilongjiangChina Department of Neurosurgery Changhai HospitalNaval Medical UniversityShanghaiChina

Background Unruptured intracranial aneurysm treatment aims to reduce the risk of aneurysm rupture and bleeding,relieves symptoms and improve the quality of life for patients.This study aimed to assess the safety and efficacy of Pipeline Embolization Device(PED,Covidien/Medtronic,Irvine,CA)treatment for intracranial aneurysms presenting with mass effect in real-world settings.Methods We selected patients from the PED in China Post-Market Multi-Center Registry Study with mass effect presentation.The study endpoints included postoperative mass effect deterioration and mass effect relief at follow-up(3–36 months).We conducted multivariate analysis to identify factors associated with mass effect relief.Subgroup analyses by aneurysm location,size and form were also performed.Results This study included 218 patients with a mean age of 54.3±11.8 years and a female predominance of 74.0%(162/218).The postoperative mass effect deterioration rate was 9.6%(21/218).During a median follow-up period of 8.4 months,the mass effect relief rate was 71.6%(156/218).Notably,immediate aneurysm occlusion following treatment was significantly associated with mass effect relief(OR 0.392,95%CI,0.170 to 0.907,p=0.029).Subgroup analysis demonstrated that adjunctive coiling contributed to mass effect relief in cavernous aneurysms,while dense embolism impeded symptom relief in aneurysms<10mm and saccular aneurysms.Conclusions Our data confirmed the efficacy of PED in relieving mass effect.The findings of this study provide support for endovascular treatment to alleviate mass effect in unruptured intracranial aneurysms.Trial registration number NCT03831672.

关键词： aneurysm intracranial Irvine

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高温高压井水泥环缺失对多层套管应力影响规律

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西南石油大学学报（自然科学版） 2024年第1期46卷 170-178页

作者：宋琳舒振辉吴彦先练章华史君林中国石油新疆油田公司工程技术研究院新疆克拉玛依834000 中国石油新疆油田公司工程技术处新疆克拉玛依834000 油气藏地质及开发工程全国重点实验室·西南石油大学四川成都610500

由于高温高压井中,固井工况复杂,套管与水泥环之间会出现缺失现象,导致套管损坏,尤其多层套管时上述问题更为突出而复杂。针对上述问题,以准噶尔盆地南缘某高温高压高产气井为研究对象,建立了套管水泥环缺失套管水泥环套管地层轴对称有... 详细信息

由于高温高压井中,固井工况复杂,套管与水泥环之间会出现缺失现象,导致套管损坏,尤其多层套管时上述问题更为突出而复杂。针对上述问题,以准噶尔盆地南缘某高温高压高产气井为研究对象,建立了套管水泥环缺失套管水泥环套管地层轴对称有限元模型,模型中水泥环缺失处采用圈闭流体单元,岩石和水泥环采用EDP本构模型,相互界面间用接触力学有限元模型。研究结果表明,该模型能够准确分析复杂条件下水泥环缺失套管受力情况,解决了以前的模型无法模拟水泥环缺失处流固耦合问题;当套管环空出现环状缺失时,水泥环缺失的交界面附近应力最大且水泥环缺失处液体性质对套管强度有较大影响。为保证其井筒完整性,在深井、超深井中,建议优化水泥环返高,使水泥环不返到井口,减小固井段长度,消除水泥环缺失问题。

关键词：水泥环缺失套管损坏有限元分析圈闭流体单元固井质量

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文氏喷漆室文丘里管CFD模拟

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涂料工业 2019年第1期49卷 74-79页

作者：宋峻林唐荣联王洪重庆理工大学化学化工学院重庆400054 中机中联工程有限公司重庆4000039

利用Ansys Fluent软件对文氏喷漆室文丘里管中流体流动状况进行了数值模拟,主要探究了收缩管长度(X1)和喉管长度(X2)对文丘里管内部压力场和速度场的影响。研究结果表明:收缩管为390 mm、喉管长度为162 mm时,文氏管内产生的压差最佳、... 详细信息

利用Ansys Fluent软件对文氏喷漆室文丘里管中流体流动状况进行了数值模拟,主要探究了收缩管长度(X1)和喉管长度(X2)对文丘里管内部压力场和速度场的影响。研究结果表明:收缩管为390 mm、喉管长度为162 mm时,文氏管内产生的压差最佳、速度场最大,最利于清洗水雾化,净化喷漆室。模拟分析结果对于文氏喷漆室文丘里管结构参数的设计具有一定的指导意义。

关键词：喷漆室文丘里管压力速度收缩管长度喉管长度

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基于学校创新创业教育框架的“专创融合”教育改革探索

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创新创业理论研究与实践 2024年第5期7卷 194-198页

作者：柴俊霖臧琛宋力内蒙古工业大学能源与动力工程学院内蒙古呼和浩特010051

专业教育与创新创业教育的融合是提升创新型专业人才培养质量的重要途径。该文基于学校创新创业教育整体发展的“1-1-5-4-3”框架介绍,指出创新创业教育融入专业教育过程中在教育理念、课程体系、底层运行机制等方面存在的主要问题,并... 详细信息

专业教育与创新创业教育的融合是提升创新型专业人才培养质量的重要途径。该文基于学校创新创业教育整体发展的“1-1-5-4-3”框架介绍,指出创新创业教育融入专业教育过程中在教育理念、课程体系、底层运行机制等方面存在的主要问题,并从创新管理办法、改革“专创融合”课程、细化“专业导师制”任务、严抓“专创融合”工作质量4个方面梳理总结了推进“专创融合”的有效路径,以期为高校各专业开展“专创融合”教育改革提供参考。

关键词：创新创业教育 “专创融合” 教育改革专业人才专业教师人才培养

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城市滨河景观生态建设评价与安全管理——以宝鸡市为例

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干旱区资源与环境 2010年第5期24卷 27-30页

作者：刘引鸽宋军林文彦君宝鸡文理学院灾害监测与机理模拟陕西省重点实验室宝鸡721007

城市滨水区的自然生态功能和景观功能对城市的发展有重要作用。依据城市滨河景观生态建设原则,采用公众调查问卷以及模糊统计方法,以宝鸡市为例对渭河滨水景观生态建设进行了评价分析。结果表明:滨河景观生态建设泄洪安全性较好,人工自... 详细信息

城市滨水区的自然生态功能和景观功能对城市的发展有重要作用。依据城市滨河景观生态建设原则,采用公众调查问卷以及模糊统计方法,以宝鸡市为例对渭河滨水景观生态建设进行了评价分析。结果表明:滨河景观生态建设泄洪安全性较好,人工自然景观生态的审美欣赏性好,受到人们的好评,但滨水区生态功能、人工湖水面景观的亲水性和可持续性差,开放空间系统性不足。从景观视觉形象、环境生态绿化、城市河流的文化价值以及大众行为心理考虑,提出了强调景观生态综合效应、安全性以及加强城市滨水景观生态建设动态管理措施。

关键词：滨河景观生态建设评价安全管理

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结合深度学习的机械臂视觉抓取控制

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载人航天 2018年第3期24卷 299-307页

作者：白成超晏卓宋俊霖哈尔滨工业大学航天工程系哈尔滨150001 西安航空动力试验技术研究所西安710000

针对基于视觉的机械臂抓取精确抓取的需求,考虑传统的视觉识别算法受环境、对象变化的制约且在识别正确率及快速性上存在的问题,在现有研究的基础上,提出了一种基于深度学习的目标精确检测与识别方法。首先基于深度学习改进了YOLO算法,... 详细信息

针对基于视觉的机械臂抓取精确抓取的需求,考虑传统的视觉识别算法受环境、对象变化的制约且在识别正确率及快速性上存在的问题,在现有研究的基础上,提出了一种基于深度学习的目标精确检测与识别方法。首先基于深度学习改进了YOLO算法,通过对数据集的训练,基于英伟达Jetson TX1高性能处理单元实现了复杂环境下多目标的识别与定位,给出了目标的类别与位置等信息;以此为基础,结合利用Move It!功能包完成的机械臂运动轨迹的求解与规划,以及基于李群李代数建立的递推正逆动力学模型,设计了机械臂抓取控制的滑模控制律。仿真及实物验证表明,基于深度神经网络的方法学习到的特征对复杂背景具有较强的鲁棒性和稳定性;所设计的滑模控制算法在0.21 s时跟踪误差在2%,取得了较高的控制精度。可为后续视觉抓取任务提供参考。

关键词：机械臂李群李代数正逆动力学滑模控制深度学习

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某带高位长悬挑桁架的超限结构设计

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建筑结构 2020年第20期50卷 23-30页

作者：张龑华甄伟盛平宋俊临北京市建筑设计研究院有限公司北京100045

南京扬子江国际会议中心是海峡两岸企业家峰会永久会址,其C区单体外观和内部空间形态复杂多变,是具有6项不规则的超限结构。本单体4层至5层采用单斜拉腹杆布置的跨层钢桁架搭建悬挑12.9~14.6m的高位长悬挑空间。结构分析发现:时程法计... 详细信息

南京扬子江国际会议中心是海峡两岸企业家峰会永久会址,其C区单体外观和内部空间形态复杂多变,是具有6项不规则的超限结构。本单体4层至5层采用单斜拉腹杆布置的跨层钢桁架搭建悬挑12.9~14.6m的高位长悬挑空间。结构分析发现:时程法计算所得竖向地震系数可能大于等效静力法和反应谱法,需进行包络设计;在悬挑根部并沿向内跨延伸方向的楼板拉力较大,需对楼板进行加强,而改进施工次序后的无支撑安装法可以显著减小楼板拉力;悬挑侧桁架构件多由非地震工况控制,根跨构件多由地震工况控制;在通高桁架轴跨中部增加立柱可以增强悬挑桁架的空腹桁架作用,增强结构的防连续倒塌能力;合理布置TMD可以有效降低悬挑桁架的竖向振动加速度,从而满足舒适度设计要求。

关键词：钢结构悬挑桁架竖向地震施工模拟性能化设计防连续倒塌舒适度

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