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广西肝癌高、低发区人群乙型肝炎病毒核心基因启动子突变株的流行特征

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中华实验和临床病毒学杂志 2003年第2期17卷 140-142页

作者：方钟燎庄辉王佑春葛宪民杨进业龚健李荣成 roger ling TimJ Harrison 广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁530021 北京大学医学部中国药品生物制品检定所广西工人医院 Rowland HillSt London NW3 2PFUKCentrefor HepatologyRoyal Free HospitalUniversity of London

目的　了解广西肝癌高、低发地区乙型肝炎病毒 (HBV)核心基因启动子突变株的流行特征。方法　用套式PCR(nPCR)扩增 77例广西原发性肝癌高发地区隆安县和低发地区桂林市人群HBV无症状携带者血清HBVDNA核心基因启动子 ,阳性者用直接测序... 详细信息

目的　了解广西肝癌高、低发地区乙型肝炎病毒 (HBV)核心基因启动子突变株的流行特征。方法　用套式PCR(nPCR)扩增 77例广西原发性肝癌高发地区隆安县和低发地区桂林市人群HBV无症状携带者血清HBVDNA核心基因启动子 ,阳性者用直接测序法测序。结果　发现 77例HBsAg无症状携带者中 39例HBVDNA阳性 ,阳性率为 5 0 6 % (39 77)。隆安县标本HBVDNA阳性率为 5 5 6 % (2 0 36 ) ,其中 35 %标本核心基因启动子发生突变 ,常见的突变类型为双突变 (nt176 2A→T、nt 176 4G→A) ,占 2 5 % (5 2 0 ) ;桂林市标本HBVDNA阳性率为 4 6 3% (19 4 1) ,其中 4 7 4 %标本有突变 ,常见的突变类型也是双突变 ,占 4 19,两地区T1 76 2 A1 76 4突变株流行率差异无显著性 (P >0 0 5 )。结论　广西T1 76 2 A1 76 4突变株流行分布与肝癌发病率分布不成正相关关系。

关键词：广西肝癌高发区低发区人群乙型肝炎病毒核心基因启动子突变株流行特征

广西地区乙型肝炎病毒无症状携带者乙型肝炎病毒前C区突变分析

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中华流行病学杂志 2002年第6期23卷 453-456页

作者：方钟燎庄辉杨进业葛宪民王学燕龚健李荣成 roger ling Tim J Harrison 广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁530021 北京大学基础医学院广西职业病防治研究所 DepartmentofMedicine Royal Free Campus University College London

目的　调查广西地区乙型肝炎病毒 (HBV)无症状携带者HBV前C区基因突变株的流行情况。方法　用套式聚合酶链反应 (nPCR)对 77例广西南部、北部地区人群HBV无症状携带者血清HBV前C区进行扩增 ,阳性者用直接测序法进行序列分析。结果　 39... 详细信息

目的　调查广西地区乙型肝炎病毒 (HBV)无症状携带者HBV前C区基因突变株的流行情况。方法　用套式聚合酶链反应 (nPCR)对 77例广西南部、北部地区人群HBV无症状携带者血清HBV前C区进行扩增 ,阳性者用直接测序法进行序列分析。结果　 39例HBsAg无症状携带者血清HBVDNA阳性 ,阳性率为 5 0 .7% (39 77) ,突变株出现率为 2 2 .1% (17 77)。南部地区阳性率为5 5 .6 % (2 0 36 ) ,其中 6份标本出现突变株 ,占 30 % ,常见的突变类型是nt185 8位发生点突变 (T→C) ,只有一份标本在nt1896发生点突变 (G→A) ,导致终止密码产生 ,该标本同时伴有nt1837点突变(A→G) ;北部地区阳性率为 4 6 .3% (19 4 1) ,其中有 11份标本出现突变株 ,占 5 7.9% ,常见的突变类型是nt1896位发生点突变 (G→A) ,这些标本中有 4份同时在nt184 6发生点突变 (A→T) ,2份同时在nt186 2发生点突变 (G→T) ;标本 734分别在nt185 6、185 8发生点突变 (C→T、T→C)。结论　广西地区HBV无症状携带者HBV前C区突变株的流行率居全国中等水平 ,广西南部、北部是否存在主要突变类型不同值得进一步研究。

关键词：广西乙型肝炎病毒无症状携带者前C区基因突变套式聚合酶链反应

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肝癌组织中HBV核心基因启动子突变的研究

中国病毒学 2000年第3期15卷 243-248页

作者：方钟燎杨进业王学燕庄辉 roger ling Tim J Harrison 广西壮族自治区卫生防疫站南宁市530021 北京医科大学北京100083 Royal Free Hospital School of Medicine University of LondonRowl and HillSt.Lond on NW32PFUK

为深入了解乙肝病毒 (HBV)致癌机理 ,用套式PCR对广西 14例血清HBVDNA阳性的原发性肝癌患者癌组织、10例乙型病毒性肝炎患者血清及 10例乙肝病毒无症状携带者血清HBV核心基因启动子进行扩增 ,阳性者用Sanger氏双脱氧法做序列分析 ,发现... 详细信息

为深入了解乙肝病毒 (HBV)致癌机理 ,用套式PCR对广西 14例血清HBVDNA阳性的原发性肝癌患者癌组织、10例乙型病毒性肝炎患者血清及 10例乙肝病毒无症状携带者血清HBV核心基因启动子进行扩增 ,阳性者用Sanger氏双脱氧法做序列分析 ,发现肝癌组织 10例PCR阳性 ,阳性率 71.4 % ,所有PCR阳性标本的整合体均有乙肝病毒核心基因启动子双突变序列 (nt 176 2A→T ,176 4G→A) ,并且在其周围各序列都有不同部位的点突变 ,标本C14核苷酸的缺失突变高达10个。乙肝患者 6例PCR阳性 ,其中 3例乙肝病毒核心基因启动子发生双突变。无症状携带者中 4例PCR阳性 ,其中仅 1例发生双突变。结果提示乙肝病毒核心基因启动子双突变在肝癌患者中较常见 ,肝炎患者次之 ,无症状携带者居最后。

关键词：乙肝病毒核心基因启动子突变原发性肝癌

乙肝肝硬化患者HBV前C区和基本核心基因启动子序列分析

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临床肝胆病杂志 2003年第3期19卷 183-184页

作者：方钟燎庄辉杨进业葛宪民王学燕龚健李荣成王佑春 roger ling Tim J Harrison 广西壮族自治区疾病预防与控制中心广西南宁530021 北京大学医学部北京100083 广西职业病防治研究所广西南宁530021 中国药品生物制品检定所北京100050 英国伦敦大学Royal Free Hospital

用套式PCR(nPCR)对 3 5例肝硬化患者血清HBV前C区和基本核心基因启动子 (BCP)进行扩增 ,阳性者用直接测序法进行序列分析。结果 2 3例HBVDNA阳性 ,阳性率为 65 7% ( 2 3 / 3 5 ) ,无正常序列标本 ,与e抗原产生有关的突变 :nt1762、176... 详细信息

用套式PCR(nPCR)对 3 5例肝硬化患者血清HBV前C区和基本核心基因启动子 (BCP)进行扩增 ,阳性者用直接测序法进行序列分析。结果 2 3例HBVDNA阳性 ,阳性率为 65 7% ( 2 3 / 3 5 ) ,无正常序列标本 ,与e抗原产生有关的突变 :nt1762、1764双突变 (AT、GA) ,占 73 9% ( 17/ 2 3 ) ;nt1896点突变 (GA) ,导致终止密码产生 ,占2 1 7% ( 5 / 2 3 ) ;nt185 8点突变 (TC) ,占 2 1 7% ,其中标本 417、42 6、43 0同时在nt 185 6发生点突变 (CT)。其它的突变有nt1799点突变 (CG) ,占 47 8% ( 11/ 2 3 ) ,为无义突变 ;有 6例在nt1846发生点突变AT ,4例nt180 2 - 180 4发生突变 (TTCCGT) ;4例nt175 2位点突变 (AG) ;标本 43 2在nt175 1插入TG导致移码突变 ,并在nt1774- 1874发生缺失突变。说明HBVBCP和前C突变株在肝硬化患者中很常见。

关键词：肝硬化 HBV前C区基本核心基因启动子序列分析乙型肝炎

广西原发性肝癌患者HBV-DNA核心基因启动子突变的研究

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应用预防医学 1997年第4期 5-8页

作者：方钟燎,王树声,麦威,黄春松,ＲｏｇｅｒＬｉｎｇ,ＴｉｍＪＨａｒrｉｓｏｎ广西壮族自治区卫生防疫站广西壮族自治区人民医院英国伦敦大学医学系皇家免费医院内科

用套式ＰＣＲ（ｎｅｓｔｅｄＰＣＲ）对广西１６例原发性肝癌患者血清ＨＢＶＤＮＡ核心基因启动子进行扩增，阳性者用Ｓａｎｇｅｒ氏ＤＮＡ测序法进行序列分析。结果表明１４例患者ＰＣＲ阳性，阳性率为８７．５０％，其中除唯一的ＨＢ... 详细信息

用套式ＰＣＲ（ｎｅｓｔｅｄＰＣＲ）对广西１６例原发性肝癌患者血清ＨＢＶＤＮＡ核心基因启动子进行扩增，阳性者用Ｓａｎｇｅｒ氏ＤＮＡ测序法进行序列分析。结果表明１４例患者ＰＣＲ阳性，阳性率为８７．５０％，其中除唯一的ＨＢｅＡｇ阳性者（Ｃ２３）外，均具有双突变（即第１７６２位Ａ→Ｔ，１７６４位Ｇ→Ｔ核苷酸的点突变），而且所有的血清标本在这突变点周围均有不同部位的点突变，但在标本Ｃ２３整个启动子中，未发现任何碱基突变。本文对这种突变株可能的致癌机理进行了讨论。

关键词： HBV,核心基因启动子,突变株,原发性肝细胞癌,聚合酶链反应

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隆安县乙肝疫苗免疫逃避株的研究

应用预防医学 2004年第1期10卷 1-4页

作者：杨进业,方钟燎,李艳萍,李荣成,龚健,Tim J Harrison,roger ling 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西壮族自治区疾病预防控制中心广西壮族自治区疾病预防控制中心广西壮族自治区疾病预防控制中心广西壮族自治区疾病预防控制中心英国伦敦大学皇家免费医院肝炎中心英国伦敦大学皇家免费医院肝炎中心南宁530021 南宁530021 南宁530021 南宁530021 南宁530021

目的查明隆安县部分乙肝疫苗免疫失败的原因。方法用套式PCR(nPCR)扩增41例隆安县接受乙肝疫苗免疫的儿童及其母亲血清HBVS基因 ,阳性者用直接测序法测序。结果23例HBVDNA阳性 ,阳性率为56%(23/41) ;表面抗原的4个主要亚型 (adr、adw、... 详细信息

目的查明隆安县部分乙肝疫苗免疫失败的原因。方法用套式PCR(nPCR)扩增41例隆安县接受乙肝疫苗免疫的儿童及其母亲血清HBVS基因 ,阳性者用直接测序法测序。结果23例HBVDNA阳性 ,阳性率为56%(23/41) ;表面抗原的4个主要亚型 (adr、adw、ayr、ayw)都出现在本研究中 ,其中以adw为主 ,占65.2 %(15/23) ,标本3及27儿童感染的亚型 (adw)不同于他们母亲感染的亚型 (adr及ayw) ;标本46兄弟俩及标本37均在aa145发生突变 (甘氨酸→精氨酸 ) ,标本64也在aa145发生突变 (甘氨酸→丙氨酸 )。另外 ,标本38在aa120发生突变 (脯氨酸→丝氨酸 ) ,标本27在aa129发生突变 (谷氨酰胺→精氨酸 )。结论隆安县存在乙肝疫苗免疫逃避株 ,提示免疫逃避株的产生是隆安县部分乙肝疫苗免疫失败的原因之一 ,这些免疫逃避株是目前阻断乙肝病毒母婴传播的难点。

关键词：乙肝病毒 S基因突变疫苗免疫逃避株

新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析

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中国病毒学 2001年第1期16卷 28-33页

作者：王佑春张华远辜文杰 rogerling 李河民 TimJHarrison 中国药品生物制品检定所北京100050 CenterforHepatologyRoyalFreeCampus UniversityCollegeLondon

用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因... 详细信息

用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因型 ,但不同于已报道的HEVI型、II型和III型 ,为一新的基因型。T1和T11与I型在该区的核苷酸同源性为 79%～ 82 % ;与II型的同源性为 80 %～ 81% ;和III型的同源性为 83%～ 85 %

关键词：戊型肝炎病毒基因型同源性开放读码框架序列分析

典型树种挥发性有机物(VOCs)排放成分谱及排放特征

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中国环境科学 2019年第12期39卷 4966-4973页

作者：李玲玉 Alex BGuenther 顾达萨 roger Seco Sanjeevi Nagalingam 青岛大学环境科学与工程学院山东青岛266071 加州大学尔湾分校地球系统科学系美国加利福尼亚州尔湾92697 香港科技大学环境与可持续发展学部香港999077

为研究典型树种的挥发性有机物(VOCs)排放特征,并获得基础排放速率,应用动态封闭式采样系统对毛果杨、北美枫香和马尾松的排放进行了实验室测量.利用热脱附-气相色谱-飞行质谱仪对排放样品进行定性和定量分析,包括异戊二烯、单萜烯、倍... 详细信息

为研究典型树种的挥发性有机物(VOCs)排放特征,并获得基础排放速率,应用动态封闭式采样系统对毛果杨、北美枫香和马尾松的排放进行了实验室测量.利用热脱附-气相色谱-飞行质谱仪对排放样品进行定性和定量分析,包括异戊二烯、单萜烯、倍半萜烯、烷烃和烯烃,计算获得各树种VOCs排放速率及其排放谱特征.研究表明:毛果杨、北美枫香和马尾松的总VOCs排放速率分别为19.51、17.19和0.67μg/(g·h).毛果杨的异戊二烯排放最高(18.51μg/(g.h)),占其总排放的94.86%;马尾松排放的异戊二烯仅占4.03%,单萜烯贡献最高,为49.09%;北美枫香的单萜烯排放速率最高,为0.84μg/(g.h);3个树种排放的倍半萜烯占各自VOCs总排放的比重均较小(<1.5%);各树种的烷烃排放强度高于倍半萜烯,部分化合物甚至高于异戊二烯和单萜烯的排放强度.反式-β-罗勒烯是毛果杨排放最多的单萜烯化合物,占其单萜烯总排放的99.84%;北美枫香排放的单萜烯主要以香桧烯和β-蒎烯为主;马尾松以α-蒎烯、香桧烯和β-蒎烯为主.石竹烯、葎草烯、δ-杜松烯和β-愈创木烯是主要的倍半萜烯物种.烷烃排放主要为C4和C5的化合物,特别是异丁烷和正丁烷;各树种排放的烯烃中,1-丁烯排放占比最高.

关键词：挥发性有机物天然源排放速率排放成分谱

短期干旱胁迫对马尾松排放挥发性有机物的影响

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中国环境科学 2020年第9期40卷 3776-3780页

作者：李玲玉 Alex B.Guenther 顾达萨 roger Seco Sanjeevi Nagalingam 青岛大学环境科学与工程学院山东青岛266071 加州大学尔湾分校地球系统科学系美国加利福尼亚州尔湾92697 香港科技大学环境与可持续发展学部香港九龙999077

为探究干旱环境对BVOCs排放的影响,应用动态封闭式采样系统和热脱附-气相色谱-飞行质谱仪,对短期干旱胁迫作用下马尾松的BVOCs排放进行了实验室测量,定量分析BVOCs排放速率和排放组成的变化.结果表明,干旱胁迫时异戊二烯的排放受到抑制... 详细信息

为探究干旱环境对BVOCs排放的影响,应用动态封闭式采样系统和热脱附-气相色谱-飞行质谱仪,对短期干旱胁迫作用下马尾松的BVOCs排放进行了实验室测量,定量分析BVOCs排放速率和排放组成的变化.结果表明,干旱胁迫时异戊二烯的排放受到抑制,排放速率降低约50%;单萜烯和倍半萜烯的排放水平增强,排放速率分别为137.85和0.98μg/(m^2·h),是未受胁迫时的2.9和2.0倍.除反式-α-香柠檬烯外,干旱胁迫促进各单萜烯和倍半萜烯化合物的排放,是未受胁迫时的1.3~42.4倍,其中3-蒈烯排放的响应最敏感,α-葑烯、α-水芹烯和石竹烯的响应最弱.干旱胁迫时单萜烯和倍半萜烯的排放组成有所变化,但主导的化合物种类不变,单萜烯以α-蒎烯、香桧烯和β-蒎烯为主,占比分别为48%、17%和17%;倍半萜烯以石竹烯和长叶烯为主,占比分别为57%和34%.

关键词：挥发性有机物 BVOCs 萜烯干旱胁迫土壤水分植物