新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析
Sequence Analysis of ORF3 and Partial ORF1 Region from Two Patients Infected with New Genotype of Hepatitis E Virus(HEV)作者机构:中国药品生物制品检定所北京100050 CenterforHepatologyRoyalFreeCampusUniversityCollegeLondon
出 版 物:《中国病毒学》 (Virologica Sinica)
年 卷 期:2001年第16卷第1期
页 面:28-33页
核心收录:
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
主 题:戊型肝炎病毒 基因型 同源性 开放读码框架 序列分析
摘 要:用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因型 ,但不同于已报道的HEVI型、II型和III型 ,为一新的基因型。T1和T11与I型在该区的核苷酸同源性为 79%~ 82 % ;与II型的同源性为 80 %~ 81% ;和III型的同源性为 83%~ 85 %