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Molecular characterization and antibiotic resistance of Salmonella enterica serovar 1,4,[5],12:i:-environmental isolates from poultry farms

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Food Quality and Safety 2022年第4期6卷 579-587页

作者： Xiaojie Qin Linlin Xiao Jiaming Li Mingzhe Yang Changying Yang qingli dong School of Health Science and Engineering University of Shanghai for Science and TechnologyShanghaiChina

Salmonella enterica serovar 1,4,[5],12:i:-(S.1,4,[5],12:i:-)has been recognized as an emerging foodborne pathogen in recent *** can cause human salmonellosis predominated by the contamination of animal-derived foods such as raw poultry and *** study aimed to characterize the genetic diversity,plasmid replicon types,and antibiotic resistance of 15 S.1,4,[5],12:i:-environmental isolates collected from two poultry farms using pulsed-field gel electrophoresis(PFGE),multilocus sequence typing(MLST),polymerase chain reaction-based replicon typing,and minimum inhibitory concentration *** different PFGE genotypes were detected,indicating a high diversity among these S.1,4,[5],12:i:-*** sequence types(ST19,ST1544,ST34)were identified by *** them,ST1544 was first detected in S.1,4,[5],12:i:-environmental isolates from poultry *** isolates were resistant to cefazolin,cefotetan,tobramycin,amikacin,and gentamicin,but susceptible to piperacillin-tazobactam,aztreonam,ceftazidime,cefepime,and *** incompatibility groups(Inc)of plasmids were identified,including IncFIIs(66.7%),IncHI2(20%),IncI1(6.7%),IncN(6.7%),and IncQ(6.7%).Among these isolates,80%carried at least one plasmid replicon type,and 20%carried multiple plasmid replicon ***,the multidrug-resistant isolate 263 carried numerous resistance genes(***,aac(6ʹ)-Ib-cr,bla_(TEM),bla_(CTX-M-9),bla_(OXA-1),sul1,sul2,sul3,floR,and mcr-1)and class I integronase gene intI1,which possessed both IncHI2 and IncQ plasmids,suggesting that resistance genes may be horizontally transferred by the combination of IncHI2 and IncQ ***,antibiotic-resistant S.1,4,[5],12:i:-isolates were first found in poultry farm environments in China,and surveillance should be strengthened to prevent their further spread from poultry farms to foods.

关键词： Salmonella enterica serovar 1,4,,12:i:- PFGE typing MLST typing plasmid replicon typing antibiotic resistance food safety

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Establishment of probabilistic model for Salmonella Enteritidis growth and inactivation under acid and osmotic pressure

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Food Science and Human Wellness 2017年第4期6卷 176-186页

作者： Yujiao Shi Hong Liu Baozhang Luo Yangtai Liu Siyuan Yue Qing Liu qingli dong School of Medical Instrument and Food Engineering University of Shanghai for Science and TechnologyShanghai 200093PR China Department of Food Hygiene Shanghai Municipal Center for Disease Control and PreventionShanghai 200336PR China

The growth and survival characteristic of Salmonella Enteritidis under acidic and osmotic conditions were ***,a probabilistic model based on the theory of cell division and mortality was established to predict the growth or inactivation of *** experimental results demonstrated that the growth curves of planktonic and detached cells showed a significant difference(p<0.05)under four conditions,including pH5.0+0.0%NaCl,pH7.0+4.0%NaCl,pH6.0+4.0%NaCl,and pH5.0+4.0%*** the established primary and secondary models could describe the growth of *** well by estimating four mathematics evaluation indexes,including determination coefficient(R2),root mean square error(RMSE),accuracy factor(Af)and bias factor(Bf).Moreover,sequential treatment of 15%NaCl stress followed by pH 4.5 stress was the best condition to inactivate *** in 10 h at 25◦*** probabilistic model with Logistical or Weibullian form could also predict the inactivation of *** well,thus realize the unification of predictive model to some extent or generalization of inactivation ***,the primary 4-parameter probabilistic model or generalized inactivation model had slightly higher applicability and reliability to describe the growth or inactivation of *** than Baranyi model or exponential inactivation model within the experimental range in this study.

关键词： Acid Osmotic pressure Salmonella Enteritidis Probabilistic model Unification Generalization

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Failure of Cronobacter sakazakii to acquire direct and cross-protection against lethal stresses after exposure to sublethal ethanol

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Food Quality and Safety 2024年第1期8卷 81-91页

作者： Hongmei Niu Xiang Wang Yuan Wang Xiaojie Qin Yangtai Liu Zhuosi Li Xu Wang Wantong Zhang qingli dong School of Health Science and Engineering University of Shanghai for Science and TechnologyShanghaiChina School of Food and Drugs Shanghai Zhongqiao Vocational and Technical UniversityShanghaiChina Yili Group Innovation Centre ShanghaiChina Yili Yinuo Technology(Shanghai)Co. Ltd.ShanghaiChina

Cronobacter sakazakii may encounter subinhibitory concentrations of ethanol stress over its *** tolerance to homologous or heterologous stress agents may be altered as a result of ethanol adaptive ***,the tolerance of ethanol-exposed and control cells to subsequent lethal stresses was evaluated in the current *** was discovered that sublethal ethanol exposure increased the susceptibility to lethal ethanol stress in *** as determined by the Weibull ***,sublethal ethanol concentration exposure in *** did not lead to any cross-tolerance against other stressors such as benzalkonium chloride(120 mg/L),heat(55°C),cold(4°C),simulated gastric fuid(pH 3.0),osmotic stress(sorbitol,0.75 g/mL),and desiccation *** of zeta potential,scanning electron microscope,and surface-enhanced Raman spectroscopy spectra revealed that cellular injury and changes in cellular chemical composition may contribute to the reduced resistance of *** after ethanol ***,sublethal ethanol exposure resulted in an elevated proportion of unsaturated fatty acids(USFA),while reducing the proportion of saturated fatty acids(SFA)and the ratio of SFA to *** developed inactivation models can serve as a valuable source of data to support quantitative microbial risk ***,a better understanding of the response of *** to sublethal ethanol exposure may provide valuable insights into the prevention and control of ***.

关键词： Cronobacter sakazakii ethanol exposure stress tolerance direct resistance cross-resistance mechanisms.

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Systematic review of Listeria monocytogenes from food and clinical samples in Chinese mainland from 2010 to 2019

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Food Quality and Safety 2022年第3期6卷 365-374页

作者： Ying Cheng qingli dong Yangtai Liu Hong Liu Hongzhi Zhang Xiang Wang School of Health Science and Engineering University of Shanghai for Science and TechnologyShanghaiChina Shanghai Municipal CenterforDisease Control and Prevention ShanghaiChina

Listeria monocytogenes(***),a foodborne pathogen,can cause human *** is a potentially fatal gastrointestinal illness,which is closely related to the spread of food to *** review the literature published during 2010-2019 to better understand the prevalence of *** in food products,incidence of human listeriosis,and their characteristics in Chinese *** found the main sequence types(STs)strains from foods are similar globally,and the prevalence of *** from raw meat was the highest among all food *** most common STs in food products and clinical cases were ST9(serogroup I.2)strains and ST87(serogroup Il.2)strains,*** ST87 strains being the most common STs of clinical cases might be related to the existence of Listeria pathogenicity island 4 gene and Chinese eating habits for ready-to-eat foods,among which the prevalence of ST87 strain was the highest in ready-to-eat ***,more research should be conducted to explore the reasons for the *** isolates differences in food and clinical sources.

关键词： Listeriosis foodborne pathogens subtype epidemiology food safety

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气调包装冷却猪肉中假单胞菌生长概率模型的构建

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农业工程学报 2012年第13期28卷 257-262页

作者：邱静董庆利程飞上海理工大学医疗器械与食品学院上海200093

为了延长冷却猪肉的货架期,以及为其气调包装组分选择提供依据,该文模拟实际生产情况,将气调保鲜冷却猪肉中优势腐败菌之一的假单胞菌接种到灭菌肉上,在(4±1)℃下,运用Logistic方程构建不同气调CO2比例下假单胞菌的生长概率模型,建立生... 详细信息

为了延长冷却猪肉的货架期,以及为其气调包装组分选择提供依据,该文模拟实际生产情况,将气调保鲜冷却猪肉中优势腐败菌之一的假单胞菌接种到灭菌肉上,在(4±1)℃下,运用Logistic方程构建不同气调CO2比例下假单胞菌的生长概率模型,建立生长/不生长边界曲线,研究气调保鲜冷却猪肉中假单胞菌的生长概率。研究表明,假单胞菌在无CO2或低CO2体积分数的情况下,O2的体积分数和初期接种量的提高会使得假单胞菌生长概率变大;在高CO2体积分数情况下,假单胞菌生长概率会随之减小甚至为0,此时O2的体积分数和初期接种量对假单胞菌生长概率不构成影响。Logistic模型的拟合度较好,决定系数r2均高于0.85,实际观测值与模型预测值的决定系数R2均高于0.95,预测整体正确率为93.3%。文中定义了概率模型中模型预测的"有效-安全","有效-危险","无效-安全","无效-危险"等4种情况,进一步验证模型的有效性以及保证气调包装组分的安全选择。研究结果为气调保鲜肉制品生产中气体组分的选择提供技术依据。

关键词：包装模型 CO2 气调冷却猪肉生长概率假单胞菌

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抗生物黏附材料的构建及在食品领域的应用进展

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食品科学 2024年第3期45卷 217-226页

作者：茹义博董庆利马悦上海理工大学健康科学与工程学院上海200093

食源性致病菌生物被膜在食品供应链中的广泛存在给食品微生物安全造成了巨大的负面影响,严重威胁着消费者的身体健康和生命安全。通过改变食品接触表面的理化性质,削弱与生物污染物之间的相互作用,减少生物黏附,可有效防控生物被膜的生... 详细信息

食源性致病菌生物被膜在食品供应链中的广泛存在给食品微生物安全造成了巨大的负面影响,严重威胁着消费者的身体健康和生命安全。通过改变食品接触表面的理化性质,削弱与生物污染物之间的相互作用,减少生物黏附,可有效防控生物被膜的生成,保障食品微生物安全。本文归纳总结了国内外抗生物黏附材料的研究进展,首先利用DLVO理论量化生物污染物与材料表面之间的相互作用,在此基础上,将现有的抗生物黏附材料分为“疏水”和“亲水”两类,并总结了各类材料的典型构建方法及其抗生物黏附的内在机制,最后结合抗生物黏附材料在食品领域的应用现状,展望了未来的发展方向。本文旨在为新型抗生物黏附材料的开发提供理论指导,以期更好地保障食品微生物安全。

关键词：抗生物黏附生物被膜 DLVO理论食品微生物安全

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基于不同初始接菌量的铜绿假单胞菌生长模型

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农业机械学报 2015年第12期46卷 246-252页

作者：董庆利王忻苏亮刘箐上海理工大学医疗器械与食品学院上海200093 国家食品安全风险评估中心北京100022

基于单细胞生长流动成像系统,探究铜绿假单胞菌单细胞生长规律,并运用随机建模方法建立单细胞与群体细胞生长之间的关系,获得不同初始接菌量下铜绿假单胞菌生长迟滞时间以及最大生长速率的分布,通过代入Baranyi模型修改式,结合单细胞水... 详细信息

基于单细胞生长流动成像系统,探究铜绿假单胞菌单细胞生长规律,并运用随机建模方法建立单细胞与群体细胞生长之间的关系,获得不同初始接菌量下铜绿假单胞菌生长迟滞时间以及最大生长速率的分布,通过代入Baranyi模型修改式,结合单细胞水平建模(Individual-based modeling,Ib M)的方法,对不同初始接菌量下铜绿假单胞菌的随机生长过程进行模拟。结果表明,随着初始接菌量的增大,铜绿假单胞菌生长迟滞期减小,25℃下平均迟滞时间由2.91 h减小至2.55 h,变异系数由29.90%减小至2.96%,35℃下平均迟滞时间由1.49 h减小至0.99 h,变异系数由22.53%减小至4.64%。最大生长速率随不同初始接菌量变化不明显,其主要受温度的影响,由25℃下约0.70 ln CFU/h增加至35℃下约1.00 ln CFU/h,变异系数变化无明显规律。通过Ib M模拟群体细胞生长发现,虽然单细胞的生长具有随机性,但随着初始接菌量的增大,微生物群体细胞生长的变异性逐渐降低,最终呈现出决定性生长的状态。相较于传统采用确定性模型进行的微生物生长建模,单细胞水平的生长动力学研究可为食品安全风险评估以及风险决策者提供更加准确与直观的风险指导。

关键词：铜绿假单胞菌初始接菌量生长模型预测微生物学

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食源性致病微生物风险管理与控制

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食品科学 2016年第17期37卷 281-288页

作者：张东来董庆利上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所上海201403 上海理工大学医疗器械与食品学院上海200093

介绍食品安全管理的框架方法,包括采样和微生物检验,概述良好卫生规范及危害分析关键控制点系统如何达到某一食品或加工过程的特定食品安全目标(food safety objective,FSO)。FSO是企业在特定食品或食品操作中选择并实施控制危害的措施... 详细信息

介绍食品安全管理的框架方法,包括采样和微生物检验,概述良好卫生规范及危害分析关键控制点系统如何达到某一食品或加工过程的特定食品安全目标(food safety objective,FSO)。FSO是企业在特定食品或食品操作中选择并实施控制危害的措施,为管理机构制定并实施监督程序以评估企业采纳管理措施的适当性,以及在不同国家监督程序的等同性方面的定量提供了科学基础。微生物检验是食品安全管理的有效手段,然而应在了解其局限性及其应用的益处和目的的情况下选择和应用微生物检验。食品工业制定有效的管理系统控制食品中特定的危害,其对于负有评估企业是否已经建立并充分实施食品安全管理系统职责的管理机构来说同样有效。

关键词：食品安全目标良好卫生规范危害分析关键控制点适当保护水平风险评估

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Optical non-destructive techniques for small berry fruits: A review

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Artificial Intelligence in Agriculture 2019年第2期2卷 85-98页

作者： Shuping Li Hongpei Luo Menghan Hu Miao Zhang Jianlin Feng Yangtai Liu qingli dong Baolin Liu Shanghai Key Laboratory of Multidimensional Information Processing East China Normal UniversityShanghai 200241China School of Medical Instrument and Food Engineering University of Shanghai for Science and Technology516 Jun Gong Rd.Shanghai 200093China Meng Xiancheng College of ECNU East China Normal UniversityShanghai 200241China College of Fine Arts East China Normal UniversityShanghai 200241China

Small berries including strawberry and blueberry are extensively consumed fruits with great economic values due to their characteristic flavor and appearance as well as potential health *** review elaborated the optical non-destructive techniques ***-NIR spectroscopy,computer vision system,hyperspectral imaging,multispectral imaging,laser-induced method and thermal imaging,and their applications for quality and safety control of small berry *** discussion regarding the photoacoustic technique,X-ray technique,Terahertz spectroscopy,odor imaging,micro-destructive testing and smart mobile terminal-based analyzer was also ***,we proposed our personal understanding of the technical challenges and further trends for these optical non-destructive techniques:1)owing to the relatively low detection limit,the so-called micro-destructive techniques may be alternative to the traditional non-destructive techniques in both practical and fundamental research;2)we suggest that the research articles like“collecting data first,and then modeling the relevant properties of agricultural products by machine learning”should be less produced in related ***'s because such research methods are likely to be suspected of“cheating”.It is recommended that some modeling competitions can be carried out in the agricultural engineering field to avoid or reduce the“cheating”model.

关键词： Berry fruit Optical non-destructive measurement Food quality and safety

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因果推断方法在微生物研究领域中的应用与展望

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食品科学 2023年第9期44卷 374-381页

作者：窦鑫刘阳泰裴晓燕董庆利上海理工大学健康科学与工程学院上海200093 内蒙古乳业技术研究院有限责任公司内蒙古呼和浩特010080

微生物群落的相互作用关系复杂,可单独或协同对宿主健康产生影响。通过应用因果推断方法分析微生物群与宿主观测数据间的关系特征,推断微生物对宿主健康的作用机制,以降低产生不良健康后果的可能性。本文综述了近年来因果推断在微生物... 详细信息

微生物群落的相互作用关系复杂,可单独或协同对宿主健康产生影响。通过应用因果推断方法分析微生物群与宿主观测数据间的关系特征,推断微生物对宿主健康的作用机制,以降低产生不良健康后果的可能性。本文综述了近年来因果推断在微生物领域的研究进展,介绍了因果关系的概念发展,阐述了因果推理、建模和解释的关系路径,同时也总结了其他领域中因果推理的方法与应用,重点讨论了微生物领域中应用因果推断方法解决的实际问题,但仍有大量微生物群落及其与外界的因果作用机制未探明。应用因果推断方法开展微生物群落分析或将是未来研究热点之一,需进一步完善因果推断的理论与方法,从而阐明微生物群落的相互作用机制及其与人体健康间的因果关系。

关键词：微生物群落人体健康因果推断风险评估机器学习

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