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Real-world data on ALK rearrangement test in Chinese advanced non-small cell lung cancer(RATICAL):a nationwide multicenter retrospective study

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Cancer Communications 2024年第9期44卷 992-1004页

作者： Lin Li Wencai Li ChunyanWu Yanfeng Xi Lei Guo Yuan Ji Lili Jiang Ji Li Jingping Yun Gang chen Yuan Li Yueping Liu DianbinMu Yuchen Han Leina Sun Qingxin Xia Xiaodong Teng nanying che WeiWu Xueshan Qiu Chao Liu Xiaochu Yan Daiqiang Li Zhihong Zhang ZheWang Yujun Li ZhengWang Lingchuan Guo Xiu Nie Jingshu Geng Jianhua Zhou Jianming Ying Department of Pathology National Cancer Center/National Clinical Research Center for Cancer/Cancer HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking UnionMedical CollegeBeijingP.R.China Department of Pathology the First Affiliated Hospital of Zhengzhou UniversityZhengzhouHenanP.R.China Department of Pathology Shanghai Pulmonary HospitalSchool of MedicineTongji UniversityShanghaiP.R.China Department of Pathology Cancer Hospital Affiliated to Shanxi Medical UniversityShanxi Province Cancer HospitalShanxi Hospital Affiliated to Cancer HospitalChinese Academy of Medical SciencesTaiyuanShanxiP.R.China Department of Pathology Zhongshan HospitalFudan UniversityShanghaiP.R.China Department of Pathology West China Hospital of Sichuan UniversityChengduSichuanP.R.China Department of Pathology Peking Union Medical College HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijingP.R.China Department of Pathology Sun Yat-sen University Cancer CenterState Key Laboratory of Oncology in South ChinaCollaborative Innovation Center for Cancer MedicineGuangzhouGuangdongP.R.China Department of Pathology Fujian Cancer HospitalFujian Medical University Cancer HospitalFuzhouFujianP.R.China Department of Pathology Department of OncologyFudan University Cancer CenterShanghaiMedical College of Fudan UniversityShanghaiP.R.China Department of Pathology The Fourth Hospital of Hebei Medical UniversityShijiazhuangHebeiP.R.China Department of Pathology Shandong Cancer HospitalJinanShandongP.R.China Department of Pathology Shanghai Chest HospitalShanghai Jiao Tong UniversityShanghaiP.R.China Department of Pathology Tianjin Medical University Cancer Institute and HospitalTianjinP.R.China Department of Pathology the Affiliated Cancer Hospital of Zhengzhou UniversityHenan Provincial Cancer HospitalZhengzhouHenanP.R.China Department of Pathology the First Affiliated HospitalCollege of MedicineZhejiang UniversityHangzhouZhejiangP.R.China Department of Pathology Bei

Background:Anaplastic lymphoma kinase(ALK)test in advanced non-small cell lung cancer(NSCLC)can help physicians provide target therapies for patients harboring ALK gene *** study aimed to investigate the real-world test patterns and positive rates of ALK gene rearrangements in advanced ***:In this real-world study(ChiCTR2000030266),patientswith advanced NSCLC who underwent an ALK rearrangement test in 30 medical centers in China between October 1,2018 and December 31,2019 were retrospectively *** training was conducted before the study was *** controls were performed at participating centers using immunohistochemistry(IHC)-*** positive ALK gene rearrangement rate and consistency rate were *** associated clinicopathological characteristics of ALK gene rearrangement were investigated as ***:The overall ALK gene rearrangement rate was 6.7%in 23,689 patients with advanced NSCLC and 8.2%in 17,436 patients with advanced lung *** quality control analysis of IHC-VENTANA-D5F3 revealed an intrahospital consistency rate of 98.2%(879/895)and an inter-hospital consistency rate of 99.2%(646/651).IHC-VENTANA-D5F3 was used in 53.6%,real-time polymerase chain reaction(RT-PCR)in 25.4%,next-generation sequencing(NGS)in 18.3%,and fluorescence in-situ hybridization(FISH)in 15.9%in the adenocarcinoma *** specimens tested with multiple methods,the consistency rates confirmed by IHC-VENTANA-D5F3 were 98.0%(822/839)for FISH,98.7%(1,222/1,238)forNGS,and 91.3%(146/160)for *** overall ALK gene rearrangement rateswere higher in females,patients of≤35 years old,never smokers,tumor cellularity of>50,and metastatic specimens used for testing in the total NSCLC population and adenocarcinoma subgroup(all P<0.05).Conclusions:This study highlights the real-world variability and challenges of ALK test in advanced NSCLC,demonstrating a predominant use of IHCVENTANA-D5F3 with high co

关键词： anaplastic lymphoma kinase diagnosis gene fusion non-small cell lung cancer

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课程思政融入结核病教学中的探索

中国当代医药 2024年第6期31卷 137-140+145页

作者：杜伟丽车南颖首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所病理科

结核病是一种古老的传染病，由结核分枝杆菌感染所引起，传染性强、发病率高。我国是结核病高负担国家，居全球第三位，防治形势严峻。结核病是国家重点控制的传染病，我国高度重视结核病防控工作，虽然结核病发病率和死亡率逐年稳步下... 详细信息

结核病是一种古老的传染病，由结核分枝杆菌感染所引起，传染性强、发病率高。我国是结核病高负担国家，居全球第三位，防治形势严峻。结核病是国家重点控制的传染病，我国高度重视结核病防控工作，虽然结核病发病率和死亡率逐年稳步下降，但结核病并没有走远，仍然影响着人类健康。结核病涉及多个学科领域，是医学教育课程中的一个重要病种。课程思政的目的是把思想教育的理念融入常规教学中，使二者相互渗透，相互融合，旨在立德树人，培养医术高超和道德情操良好的医学生。在结核病教学中，把结核病领域的思政元素充分融入结核病的教育教学活动中，凸显爱国主义教育、职业素养教育和生命观教育，有助于解决高校结核病教学中思政教育与专业教学脱节现象，能提升学生道德情操和职业认同感、自豪感。

关键词：课程思政结核病教学立德树人职业素养

医学研究生科研文献阅读能力水平的提升策略研究

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中国当代医药 2024年第19期31卷 131-134页

作者：车南颖杜伟丽首都医科大学附属北京胸科医院病理科北京101149

科研文献是国际上学术交流的重要媒介,也是重大研究成果传播的载体。医学研究发展迅速,现有医学教育教学实践已满足不了日益增长的知识需求。高效阅读科研文献是医学研究生掌握相关研究领域内最新研究进展,学习新技术、新理论,提升科研... 详细信息

科研文献是国际上学术交流的重要媒介,也是重大研究成果传播的载体。医学研究发展迅速,现有医学教育教学实践已满足不了日益增长的知识需求。高效阅读科研文献是医学研究生掌握相关研究领域内最新研究进展,学习新技术、新理论,提升科研思维的重要手段。尚未开展科研任务的医学研究生在科研文献阅读方面缺乏经验,加之基础知识匮乏,普遍存在阅读较浅,抓不住文献主旨等情况。针对研究生教育中的这一问题,本文详细介绍了阅读科研文献的意义,医学研究生阅读科研文献存在的问题以及提高医学研究生科研文献阅读能力水平的事实策略。本文为研究生高效阅读科研文献提供了新的思路和建议,有助于引导学生高效全面掌握领域内的研究内容和最新动态,解决自身的科研问题和困惑,优化和推动自己的科研课题。

关键词：医学研究生科研文献高效阅读文献汇报能力培养建议

基于深度学习模型的非小细胞肺癌新辅助免疫联合化疗疗效预测

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中国肿瘤临床 2024年第11期51卷 561-566页

作者：谭婧赵宏杨墨轩熊佳航赵丹周立娟车南颖首都医科大学附属北京胸科医院病理科北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病研究北京市重点实验室北京市101149 首都师范大学物理系透彻未来实验室

目的:基于深度学习算法,使用临床数据构建人工智能(artificial intelligence,AI)模型,评估其预测非小细胞肺癌(nonsmall cell lung cancer,NSCLC)新辅助免疫联合化疗疗效的可行性。方法:收集2020年1月至2024年1月于首都医科大学附属北... 详细信息

目的:基于深度学习算法,使用临床数据构建人工智能(artificial intelligence,AI)模型,评估其预测非小细胞肺癌(nonsmall cell lung cancer,NSCLC)新辅助免疫联合化疗疗效的可行性。方法:收集2020年1月至2024年1月于首都医科大学附属北京胸科医院确诊且接受新辅助免疫联合化疗的132例NSCLC患者的临床病理数据。对影响新辅助免疫联合化疗疗效的主要因素进行统计学分析。根据统计学分析结果以及查阅相关文献对变量进行筛选,构建变量数据集。基于多层感知机(multi-layer perceptron,MLP)算法采用5折交叉验证建立深度学习模型,应用接收者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估模型性能。结果:132例患者中单因素分析显示获得主要病理缓解(major pathological response,MPR)组与未获得MPR组的患者在性别(P=0.020)、吸烟史(P=0.004)、癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)(P=0.038)及程序性死亡配体-1(programmed death-ligand 1,PD-L1)是否≥1%(P=0.038)方面差异具有统计学意义;获得完全病理缓解(complete pathological response,pCR)组与未获pCR组患者在肿瘤大小是否≤3 cm(P=0.007)和CEA水平方面(P=0.010)差异具有统计学意义。经5折交叉验证后,MPR预测模型在验证集和测试集的平均受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)值分别为0.72及0.71。结论:该深度学习模型能够有效预测NSCLC患者新辅助免疫联合化疗疗效。

关键词：肺癌新辅助治疗深度学习

将课程思政融入病理学教学过程中的实践与思考

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首都食品与医药 2024年第3期31卷 101-104页

作者：董宇杰赵丹杜鹃车南颖首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所北京101149

医学生课程思政教育的目的是培养具有社会主义核心价值观的现代化医疗人才。病理学是医学重要的组成部分,在临床诊疗中起着至关重要的作用。在精准医疗快速发展的新形式下,培养德才兼备的优秀病理医生是医学教育的根本任务之一。将课程... 详细信息

医学生课程思政教育的目的是培养具有社会主义核心价值观的现代化医疗人才。病理学是医学重要的组成部分,在临床诊疗中起着至关重要的作用。在精准医疗快速发展的新形式下,培养德才兼备的优秀病理医生是医学教育的根本任务之一。将课程思政教育引入病理学教学,将医学专业知识与课程思政内容有机融合,并贯穿整个教与学过程,实现专业传授与德育教育的统一,达到教书育人的目的。

关键词：病理学课程思政教学方法

小细胞肺癌患者骨髓肿瘤细胞的检测及其临床价值

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中华肿瘤杂志 2024年第5期46卷 419-427页

作者：王莹鲁葆华高远刘艳霞胡明明车南颖林海峰李红霞张红梅张同梅首都医科大学附属北京胸科医院、北京市结核病胸部肿瘤研究所综合科北京101149 首都医科大学附属北京胸科医院、北京市结核病胸部肿瘤研究所病理科北京101149 首都医科大学基础临床联合实验室北京101149

目的探讨小细胞肺癌(SCLC)患者骨髓肿瘤细胞的检测与临床特征及疗效和预后的关系。方法前瞻性纳入2018年1月至2022年10月首都医科大学附属北京胸科医院诊断的初治SCLC患者113例,治疗前抽取骨髓液分别采用液基细胞学检测肿瘤细胞、采用... 详细信息

目的探讨小细胞肺癌(SCLC)患者骨髓肿瘤细胞的检测与临床特征及疗效和预后的关系。方法前瞻性纳入2018年1月至2022年10月首都医科大学附属北京胸科医院诊断的初治SCLC患者113例,治疗前抽取骨髓液分别采用液基细胞学检测肿瘤细胞、采用差相富集-免疫荧光原位杂交(SE-iFISH)平台检测播散肿瘤细胞(DTCs)。采用χ^(2)检验分析两种方法检测结果与患者临床特征及疗效的相关性,采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,采用Cox比例风险回归模型进行生存分析。结果骨髓液基细胞学阳性率为15.93%(18/113),液基细胞学阳性患者中肝及骨转移率均高于阴性患者(肝转移率分别为55.56%和11.58%;P<0.001;骨转移率分别为77.78%和16.84%,P<0.001),血小板减低更多见(16.67%和2.11%,P=0.033)。SE-iFISH检测DTCs阳性率为92.92%(105/113),DTCs≥111个/3 ml的患者中肝及骨转移率均明显高于DTCs<111个/3 ml的患者(肝转移率分别为37.93%和11.90%,P=0.002;骨转移率分别为44.83%和20.23%,P=0.010),血小板减低发生率明显升高(13.79%和1.19%,P=0.020)。疾病控制组和疾病进展组的骨髓液基细胞学阳性率分别为12.00%(12/100)和46.15%(6/13),差异有统计学意义(P=0.002),骨髓SE-iFISH检测DTCs分别为29(8,110)个/3 ml和64(15,257)个/3 ml,差异无统计学意义(P=0.329)。骨髓液基细胞学阳性患者中位无进展生存时间(PFS)为6.33个月,低于阴性患者(中位PFS为9.27个月,P=0.019),中位总生存时间(OS)为8.03个月,亦低于阴性患者(中位OS为19.50个月,P=0.033)。骨髓SE-iFISH检测DTCs≥111个/3 ml患者的中位PFS为6.83个月,低于DTCs<111个/3 ml患者(中位PFS为9.50个月,P=0.004),中位OS为11.20个月,也低于DTCs<111个/3 ml患者(中位OS为20.60个月,P=0.019)。多因素Cox回归分析显示,疾病分期(HR=2.806,95%CI:1.499~5.251,P=0.001)和骨髓SE-iFISH检测DTCs数量(HR=1.841,95%CI:1.095~3.095,P=0.021)是SCLC患者PFS的独立影响因素,疾病分期是SCLC患者OS的独立影响因素(HR=2.538,95%CI:1.169~5.512,P=0.019)。结论骨髓液基细胞学检测肿瘤细胞和SE-iFISH检测DTCs两种方法临床可行,液基细胞学阳性或DTCs≥111个/3ml均与患者远处脏器转移相关,DTCs≥111个/3 ml是SCLC患者较差PFS的独立影响因素。

关键词：小细胞肺癌骨髓液基细胞学差相富集-免疫荧光原位杂交播散肿瘤细胞转移预后

SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测联合细胞学检查在支气管灌洗液标本诊断肺癌中的应用价值

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中华临床医师杂志（电子版） 2024年第2期18卷 139-143页

作者：陈学敬周立娟赵宏张莉孙组钰车南颖首都医科大学附属北京胸科医院病理科北京101149

目的探讨在支气管灌洗液标本中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测联合液基细胞学对肺癌的诊断价值。方法收集2023年3月至7月于北京胸科医院病理科检测的106例疑似肺癌患者(肺癌组84例,肺部良性疾病组22例)的气管灌洗液样本,分别做甲基化检... 详细信息

目的探讨在支气管灌洗液标本中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测联合液基细胞学对肺癌的诊断价值。方法收集2023年3月至7月于北京胸科医院病理科检测的106例疑似肺癌患者(肺癌组84例,肺部良性疾病组22例)的气管灌洗液样本,分别做甲基化检测和液基细胞学诊断,以组织病理结果为金标准,对比两种方法的检测结果。结果SHOX2和RASSF1A联合检测的灵敏度是52.4%(44/84)、特异度是(100%)。在亚型分组中,联合检测在小细胞癌、鳞癌和腺癌中检测的阳性率分别是(66.7%;8/12)、(72%;18/25)和(35.9;14/39)。在临床分期中,联合检测在晚期肺癌高达60.0%,明显高于早期检出率(P<0.05)。液基细胞学诊断的敏感性是(44.0%;37/84),特异性是(95.2%;20/21),甲基化检测和液基细胞学检查两种方法联合应用,检测的敏感性为(65.5%,55/84)。结论SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测在诊断肺癌中有较高的敏感性和特异性,可以作为支气管灌洗液细胞病理学诊断的有效辅助手段,两者结合可进一步提高肺癌的诊断效能。

关键词：肺癌基因甲基化 SHOX2基因 RASSF1A基因

Efficient LEC2 activation of OLEOSIN expression requires two neighboring RY elements on its promoter

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Science China(Life Sciences) 2009年第9期52卷 854-863页

作者： che nanying,YANG Yang,LI YanDong,WANG LiLi,HUANG Ping,GAO Yin & An chengCai The National Laboratory of Protein Engineering and Plant Genetic Engineering,School of Life Sciences,Peking University,Beijing 100871,China The National Laboratory of Protein Engineering and Plant Genetic Engineering School of Life Sciences Peking University Beijing China

As the main structural protein of oil body,OLEOSIN is highly expressed only during seed development. OLEOSIN promoter is a very useful tool for seed-specific gene engineering and seed bioreactor designing. The B3 domain transcription factor leafy cotyledon2 (LEC2) plays an important role in regulating seed development and seed-specific gene expression. Here,we first report how seed-specific B3 domain transcription factor leafy cotyledon2 (LEC2) efficiently activates OLEOSIN expression. The central promoter region of OLEOSIN,responsible for seed specificity and LEC2 activation,was determined by 5'-deletion analysis. Binding experiments in yeast cells and electrophoretic mobility shift assays showed that LEC2 specifically bound to two conserved RY elements in this region. In transient expression assays,mutation in either RY element dramatically reduced LEC2 activation of OLEOSIN promoter activity,while double mutation abolished it. Analysis of the distribution of RY elements in seed-specific genes activated by LEC2 also supported the idea that genes containing neighboring RY elements responded strongly to LEC2 activation. Therefore,we conclude that two neighboring RY elements are essential for efficient LEC2 activation of OLEOSIN expression. These findings will help us better utilize seed-specific promoter activity.

关键词： OLEOSIN LEC2 gene expression seed-specific gene RY element B3 domain transcription factor

Super-ARMS法检测肺腺癌患者血浆循环肿瘤DNA表皮生长因子受体T790M基因突变的临床研究

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中国肿瘤临床 2021年第15期48卷 767-771页

作者：周傲雪史亮李琨车南颖刘喆北京市结核病胸部肿瘤研究所/首都医科大学附属北京胸科医院肿瘤一科北京市101149

目的:探讨真实世界中Super-ARMS法检测肺腺癌患者外周血标本循环肿瘤脱氧核糖核酸(circulating tumor DNA,ctDNA)中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)T790M基因突变的临床应用价值。方法:收集2019年1月至2020年6月在首都医科大学附属北京胸科医院确诊的肺腺癌患者307例,突变扩增系统(amplification refractory mutation system,ARMS)检测组织中EGFR基因突变情况,Super-ARMS法检测血浆中EGFR的基因突变情况。通过生存分析比较不同标本检测EGFR T790M基因突变患者的无进展生存时间(progression-free survival,PFS)。结果:153例患者疾病进展接受再活检。74例进行组织再活检,其中34例(45.9%)检测到EGFR T790M基因突变。141例患者进行液体再活检,其中51例(36.2%)EGFR T790M基因突变。Kaplan-Meier生存分析显示,组织和外周血EGFR T790M突变阳性患者接受第三代EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs)的中位PFS比较差异无统计学差异(16.3个月vs.11.4个月,x2=1.138,P>0.05)。组织和外周血EGFR T790M突变阴性患者未接受第三代EGFR-TKIs治疗的中位PFS比较差异无统计学意义(7.0个月vs.7.0个月,x2=0.470,P>0.05)。结论:真实世界中Super-ARMS法检测外周血标本有望应用于检测EGFR T790M基因突变情况,外周血标本可一定程度上补充组织标本检测EGFR T790M基因突变结果,预测患者对第三代EGFR-TKIs治疗的疗效。

关键词：肺腺癌表皮生长因子受体基因突变循环肿瘤脱氧核糖核酸突变扩增系统