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基于全基因组SNPs分析陆丰黄牛和雷琼牛的群体结构与遗传多样性特征

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中国农业科学 2023年第14期56卷 2798-2811页

作者：童雄罗威闵力张志飞马新燕罗成龙陈卫东徐斌李大刚广东省农业科学院动物科学研究所/畜禽育种国家重点实验室/岭南现代农业科学与技术广东省实验室河源分中心/广东省畜禽育种与营养研究重点实验室

【目的】研究陆丰黄牛和雷琼牛与世界不同地域家牛中的系统发育关系，解析不同家牛群体的遗传多样性，为地方家牛资源的鉴定与保护奠定理论基础。【方法】采集12头陆丰黄牛和17头雷琼牛的组织样品进行全基因组重测序，整合世界范围内分... 详细信息

【目的】研究陆丰黄牛和雷琼牛与世界不同地域家牛中的系统发育关系，解析不同家牛群体的遗传多样性，为地方家牛资源的鉴定与保护奠定理论基础。【方法】采集12头陆丰黄牛和17头雷琼牛的组织样品进行全基因组重测序，整合世界范围内分布的24个品种92个体的NCBI公共基因组数据，共计25个品种121个个体的信息开展群体遗传学研究。选用Bos taurus ARS-UCD1.2作为参考基因组，经基因组序列比对与质量控制获取高质量Reads，应用GATK软件检测基因组SNPs。进一步基于群体SNPs，利用系统进化树构建、PCA聚类和Admixture评估进行群体结构分析，通过核苷酸多样性（Pi）、杂合度（Hp）和连锁不平衡（LD）水平研究群体的遗传多样性。【结果】29头广东地方牛经基因组测序获取6 905 944 306个Clean Reads，每个样本平均基因组覆盖率为97.99%，平均测序深度分别为12.78×。整合NCBI公共基因组数据，经质控后共检测出14 664 391个群体SNPs。整合系统进化树、PCA、Admixture的结果发现普通牛与瘤牛分化，瘤牛群体存在中国瘤牛与印度瘤牛分化，普通牛群体中东北亚普通牛（韩牛、延边牛）和西藏牛与欧洲普通牛分化，温岭高峰牛和舟山牛从中国瘤牛群体中分化。陆丰黄牛和雷琼牛均属于纯正的中国瘤牛，但陆丰黄牛与皖南牛之间、雷琼牛与吉安牛之间呈现最近的亲缘关系，说明陆丰黄牛与地域临近的雷琼牛属于两个独立的品种。部分陆丰黄牛与雷琼牛均存在欧洲普通牛和东北亚普通牛的血统混杂，且混杂比例较高，说明这两个品种牛急需加强群体内的提纯复壮。相较于欧洲普通牛和韩牛，中国家牛群体的LD衰减速率更快，核苷酸多样性Pi和杂合度Hp更高，说明其遗传多样性更丰富。相较于其他中国家牛，陆丰黄牛和雷琼牛的LD水平更低，杂合度Hp更高，且核苷酸多样性Pi和杂合度Hp的密度分布更为集中，说明两者受人工选择强度较低，且维持较高的群体遗传多样性。【结论】通过全基因组SNPs标记，系统解析了陆丰黄牛与雷琼牛的群体遗传结构和多样性特征，为这两个品种独立分类及其保护利用提供数据支撑。

关键词：陆丰黄牛雷琼牛全基因组SNPs 群体结构遗传多样性

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山区机场高填方边坡工程实践与研究

防灾减灾工程学报 2018年第2期38卷 385-400页

作者：吴红刚冯文强艾挥马新岩张印涛周凯顾红强中铁西北科学研究院有限公司甘肃兰州730000 甘肃省交通规划勘察设计院股份有限公司甘肃兰州730030 中国民航机场建设集团公司北京100101 马克菲尔新型支档科技开发有限公司湖南长沙410600 中国中铁滑坡工程实验室甘肃兰州730070 西部环境岩土及场地修复技术工程实验室甘肃兰州730070

在山区机场工程建设中,由于地形地貌的限制,高填方工程一般兼具有地形起伏较大,地质条件复杂,工程量巨大等特点,由此给山区机场带来一系列特殊性工程问题,尤其是高填方边坡工程的稳定性问题是目前机场研究的热点和难点。由于山区机场高... 详细信息

在山区机场工程建设中,由于地形地貌的限制,高填方工程一般兼具有地形起伏较大,地质条件复杂,工程量巨大等特点,由此给山区机场带来一系列特殊性工程问题,尤其是高填方边坡工程的稳定性问题是目前机场研究的热点和难点。由于山区机场高填方边坡稳定性问题涉及影响因素较多,为便于分析,从变形机理和控制技术两方面对机场高填方边坡工程问题进行了深入研究。（1）变形机理方面,结合工程实践及对现有资料进行分析归纳,从填筑体下覆坡体结构、降雨及地下水、地震、填料特性、施工工艺等方面研究其对填方边坡稳定性的影响,重点提出了4类填筑体下覆坡体结构类型,并深入分析各类型的变形破坏特征。（2）变形控制技术方面：以＂三面一体＂控制论为核心,结合实例分析了土方平衡、地基处理及交接面加固、排水、支挡结构四个方面,对高填方边坡变形的控制效果。该研究可为我国山区机场高填方边坡变形机理的深入研究和控制技术的提高和改进提供参考和借鉴。

关键词：山区机场高填方边坡填方边坡变形机理控制技术

MCU在低氧诱导肉鸡心肌细胞线粒体损伤中的作用

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畜牧兽医学报 2021年第12期52卷 3641-3650页

作者：庞聪颖乔娜陈汉明马欣艳张辉潘家强唐兆新李英华南农业大学兽医学院广州510642

旨在探讨线粒体钙单向转运体(mitochondrial calcium uniporter,MCU)介导线粒体Ca^(2+)转运是否参与低氧诱导的肉鸡心肌细胞线粒体损伤。试验通过分离白羽肉鸡鸡胚原代心肌细胞,在低氧条件下(3%O 2,5%CO 2,92%N 2)培养24、48、72 h,同... 详细信息

旨在探讨线粒体钙单向转运体(mitochondrial calcium uniporter,MCU)介导线粒体Ca^(2+)转运是否参与低氧诱导的肉鸡心肌细胞线粒体损伤。试验通过分离白羽肉鸡鸡胚原代心肌细胞,在低氧条件下(3%O 2,5%CO 2,92%N 2)培养24、48、72 h,同时使用RU360抑制MCU的表达并在低氧条件下处理72 h后,使用流式细胞术检测细胞内Ca^(2+)浓度、线粒体Ca^(2+)浓度、线粒体活性氧水平和线粒体膜电位,检测MCU及其调节因子的mRNA和蛋白表达。结果显示,通过差速贴壁方法培养的心肌细胞纯度可达90%以上;低氧培养24 h,诱导心肌细胞MCU、MICU 1 mRNA表达增加(P<0.05),胞浆和线粒体内Ca^(2+)浓度显著上升(P<0.05),线粒体膜电位增加(P<0.05);低氧培养48 h,诱导MCUR 1和MICU 1 mRNA表达减少(P<0.05),细胞Ca^(2+)浓度上升(P<0.05);低氧培养72 h,诱导MCU mRNA表达增加(P<0.01),细胞和线粒体内Ca^(2+)增加(P<0.01),线粒体膜电位下降(P<0.01),活性氧增加(P<0.01)。低氧处理72 h后,与低氧组相比,RU360预处理组细胞和线粒体内Ca^(2+)减少,线粒体膜电位上升,活性氧生成减少(P<0.01),MCU mRNA表达减少(P<0.01)。结果表明:低氧诱导MCU上调导致线粒体钙超载,促使线粒体功能降低并发生损伤,进而心肌细胞发生损伤;抑制MCU表达可以减轻低氧诱导的心肌细胞线粒体钙超载,保护线粒体。

关键词：钙稳态低氧 MCU 心肌细胞

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60份产科护理病历存在的问题及对策

护理研究 2010年第36期24卷 3362-3363页

作者：麻昕燕陈素仙王丽华山西省忻州市人民医院

护理病历书写质量不仅体现了护理人员的业务水平、敬业态度,同时也是评价医院护理质量和管理水平的一项指标[1].修订后的中规定,当病人或家属与医院发生医疗护理纠纷时,可以要求复印住院病历,其中也包括护理病历.因此,对护理病历的书写... 详细信息

护理病历书写质量不仅体现了护理人员的业务水平、敬业态度,同时也是评价医院护理质量和管理水平的一项指标[1].修订后的中规定,当病人或家属与医院发生医疗护理纠纷时,可以要求复印住院病历,其中也包括护理病历.因此,对护理病历的书写也提出了高的要求.根据我院护理部下发的,随机抽取2008年1月-2010年6月60份产科护理病历进行分析,找出存在问题,并进行原因分析,制定相应的对策,以提高护理病历书写的质量[2,3].

关键词：护理病历产科护士长书写质量产妇

基于改进PSENet-CRNN的工件编码字符识别算法

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信息技术与信息化 2024年第5期 76-79页

作者：熊新炎马宏伟哈尔滨商业大学黑龙江哈尔滨150028

由于传统识别方法在面对工业环境的复杂性时表现出较低的准确率和鲁棒性,提出了一种基于改进PSENet-CRNN的工件编码字符识别算法。结合了PSENet在字符分割方面的优势和CRNN在序列建模方面的特长,旨在提高在复杂工业环境下的字符识别性... 详细信息

由于传统识别方法在面对工业环境的复杂性时表现出较低的准确率和鲁棒性,提出了一种基于改进PSENet-CRNN的工件编码字符识别算法。结合了PSENet在字符分割方面的优势和CRNN在序列建模方面的特长,旨在提高在复杂工业环境下的字符识别性能。通过改进网络结构、优化训练策略等手段,新算法有效解决了字符粘连、光照不均、背景干扰等问题,显著提升了识别准确率和鲁棒性。实验结果表明,新算法在多种评价指标上均优于传统方法和其他先进算法,为智能制造领域提供了一种高效、稳定的字符识别解决方案。

关键词：工件编码字符识别 PSENet CRNN 评价指标

高铜日粮对肉鸡肾氧化损伤和Nrf2信号通路相关基因表达的影响

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畜牧兽医学报 2019年第9期50卷 1714-1721页

作者：裴若男杨帆廖建昭马飞洋马欣艳林毓茵姚启发唐兆新梁昭平华南农业大学兽医学院广州510642 江西农业大学动物群发性疾病监测与防控研究所南昌330045

为了研究高铜日粮对肉鸡肾氧化损伤和Nrf2信号通路相关基因表达的影响,选用48只1日龄健康白羽肉鸡,随机分为4组,每组12只,分别喂以基础日粮(Cu 11 mg·kg^-1,对照组)和高铜日粮(Cu 110 mg·kg^-1,高铜Ⅰ组;Cu 220 mg·kg^-1,高铜Ⅱ组;Cu... 详细信息

为了研究高铜日粮对肉鸡肾氧化损伤和Nrf2信号通路相关基因表达的影响,选用48只1日龄健康白羽肉鸡,随机分为4组,每组12只,分别喂以基础日粮(Cu 11 mg·kg^-1,对照组)和高铜日粮(Cu 110 mg·kg^-1,高铜Ⅰ组;Cu 220 mg·kg^-1,高铜Ⅱ组;Cu 330 mg·kg^-1,高铜Ⅲ组),并于49日龄采集肾组织作为样品,制作组织切片观察肾病理变化,检测超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)、谷胱甘肽还原酶(GR)和总抗氧化能力(T-AOC)等指标的变化,并通过实时荧光定量PCR检测核转录相关因子2(Nrf2)、谷氨酰半胱氨酸连接酶催化亚基(GCLC)、谷氨酰半胱氨酸合成酶修饰亚基(GCLM)、血红素氧化酶(HO-1)、NAD(P)H醌氧化还原酶1(NQO1)的mRNA相对转录量。结果显示,高铜组肉鸡的肾间质变宽,肾小管上皮细胞出现脱落;高铜Ⅲ组肾的T-AOC、SOD和GR活性与对照组相比显著下降;MDA含量无显著变化;高铜Ⅱ组和高铜Ⅲ组Nrf2和GCLC mRNA相对转录量与对照组相比显著升高,高铜组GCLM和HO-1 mRNA相对转录量与对照组相比显著上调,而NQO1 mRNA的相对转录量则无显著变化。结果表明,高铜日粮可诱导肉鸡肾发生氧化损伤和Nrf2信号通路相关基因的表达。

关键词：铜氧化损伤 Nrf2信号通路肾肉鸡

畜禽养殖场典型臭味成分吲哚和3⁃甲基吲哚形成及消解机制

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广东畜牧兽医科技 2023年第3期48卷 18-23,41页

作者：邓盾余琴翁光英马新燕卢钰升马现永广东省农业科学院动物科学研究所/畜禽育种国家重点实验室/农业农村部华南动物营养与饲料重点实验室/广东省畜禽育种与营养研究重点实验室/广东畜禽肉品质量安全控制与评定工程技术研究中心广东广州510640 广东省农业科学院农业资源与环境研究所广东广州510640

因养殖恶臭味引发的环境案件频发,养殖场强化臭气减排工作日益紧迫。该文主要对畜禽养殖场典型臭味成分吲哚和3⁃甲基吲哚的形成机制、降解方法以及防控过程中存在的问题进行详细阐述。色氨酸是吲哚和3⁃甲基吲哚形成的源头,采用发酵饲料... 详细信息

因养殖恶臭味引发的环境案件频发,养殖场强化臭气减排工作日益紧迫。该文主要对畜禽养殖场典型臭味成分吲哚和3⁃甲基吲哚的形成机制、降解方法以及防控过程中存在的问题进行详细阐述。色氨酸是吲哚和3⁃甲基吲哚形成的源头,采用发酵饲料、酸化剂和益生菌能够从源头控制吲哚的形成。改变肠道pH值也能够显著减少3⁃甲基吲哚的生成;添加微生物及一些酶制剂能够很好控制粪污储存过程中吲哚和3⁃甲基吲哚的形成;在猪舍设计时,考虑使用环控设备,强化物理除臭手段,对吲哚和3⁃甲基吲哚进行进一步消减,从而实现系统性控制吲哚类恶臭物形成和传播。该文为科学防控养殖场恶臭物污染提供了参考依据。

关键词：臭气:吲哚 3⁃甲基吲哚降解养殖环境

基于临床决策中台的医保智能审核平台构建与应用研究

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中国数字医学 2023年第9期18卷 74-78页

作者：马欣妍宋飞飞郑林张燕李强清华大学附属北京清华长庚医院清华大学临床医学院北京102218

目的:全面实时监控医保相关诊疗行为,规避违规事件,提升医院医保管理水平。方法:以某三级综合医院医保业务流程为样本,结合中台知识,抽象出逻辑触发机制、应用结果反馈、策略维护、数据监测等交互模型,集成医保智能审核规则库、临床医... 详细信息

目的:全面实时监控医保相关诊疗行为,规避违规事件,提升医院医保管理水平。方法:以某三级综合医院医保业务流程为样本,结合中台知识,抽象出逻辑触发机制、应用结果反馈、策略维护、数据监测等交互模型,集成医保智能审核规则库、临床医学知识库、医药标准对照库,构建基于临床决策中台的医保智能审核体系,并通过平台上线前后的医保数据,分析平台的实施成效。结果:系统已在该医院55个临床科室应用,系统上线后,月医保拒付率平均下降87%,违规事件均可事中监控、事后追责,有效提升了医院医保基金监管的质量和效率。结论:该平台改善了医院医疗数据整合及运用效率不佳、监控平台智能化程度受限、临床应用一体化程度较低等影响医保审核平台应用效果的各类问题。本研究提出的方案达到了设计目标,能灵活且高效地应用于临床系统复杂多变的场景。

关键词：医保基金智能审核中台临床决策支持知识库集成

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对新型冠状病毒肺炎流行病学调查的几点思考

医学动物防制 2020年第10期36卷 961-963页

作者：张世勇赵川马新颜闫玉英石家庄市疾病预防控制中心河北050011

流行病学调查多用于常见疾病病因探讨和疾病特征分布描述,在此次新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)疫情传染源溯源和密切接触者判定过程中也发挥着重要作用。笔者在对新冠肺炎病例的流调过程中发现,受流调人员本身、被流调对象和公众对流... 详细信息

流行病学调查多用于常见疾病病因探讨和疾病特征分布描述,在此次新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)疫情传染源溯源和密切接触者判定过程中也发挥着重要作用。笔者在对新冠肺炎病例的流调过程中发现,受流调人员本身、被流调对象和公众对流调工作认知度等因素影响,个别病例的流调质量不高,病例溯源和密切接触者判定工作受阻,直接影响疫情防控效果。笔者提出在今后工作中通过采取加强流调人员队伍建设、改进流调手段、开展公众普法宣传、及时进行经验总结等措施提高对新发和再发传染病的流调质量,进而及时有效处置各类疫情。

关键词：新型冠状病毒肺炎流行病学调查思考防制