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Comparative analysis of whole-genome sequences of Streptococcus suis

Chinese Science Bulletin 2006年第10期51卷 1199-1209页

作者： WEI Wu DING Guohui WANG Xiaojing SUN dingchun tu Kang HAO Pei WANG Chuan CAO Zhiwei SHI Tieliu LI Yixue Bioinformation Center Shanghai Institutes for Biological Sciences/Graduate School of the Chinese Academy of Sciences Shanghai 200031 China Shanghai Center for Bioinformation Technology Shanghai 200235 China

The outbreak of Streptococcus suis re-cently in some districts of Sichuan Province in China has caused over 30 deaths and over 200 infections in human beings. In order to study the pathogenicity mechanism and to prevent the bacteria from spreading and infecting human beings and swine, we have annotated and analyzed the genomes of two strains, Streptococcus suis P1/7 and 89-1591 re-spective1y. The whole length of P1/7 is 2.007 Mb, and has 1969 ORFs. In contrast, the partial genome sequence of 89-1591 is 1.98 Mb in length and exists in 177 contigs with 1918 ORFs. Analysis shows that the average lengths of CDSs in two genomes are very close, and the numbers of the homolog ORFs are 1306 between those two strains. Most of the tox-icity factors of the two strains are homologeous, but there are still some significant differences between those two strains. For example, among the 11 genes (cps2A―cps2K) encoding for the capsules in P1/7, 4 (cps2A, 2B, 2I, 2J) are not detected in strain 89-1591. At the same time, the genes encoding EF and Haemolysin in P1/7 are also not found in strain 89-1591. Besides, the genes related to DNA replica-tion, repair and recombination differ from each other significantly and there also exist certain differences among the surface proteins. Those characteristics indicate that those two strains have evolved their ownspecific functions to adapt to the different environ-ments and that the pathogenesis of the two strains is different. We have accumulated comprehensive ge-nomics information for future systematic studies of S. sui. Our results are helpful for disease prevention, vaccine development, as well as drug design for S. suis.

关键词：链球菌 P1/7菌株 89-1591菌株比较分析基因序列分析

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Diagnosis and treatment of primary pulmonary enteric adenocarcinoma:Report of Six cases

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World Journal of Clinical Cases 2021年第30期9卷 9236-9243页

作者： Ling-Fang tu Ling-Yan Sheng Jian-Ying Zhou Xue-Fen Wang Yue-Hong Wang Qian Shen Yi-Hong Shen Department of Respiratory Medicine The First Affiliated HospitalZhejiang University School of MedicineHangzhou 310003Zhejiang ProvinceChina

BACKGROUND Primary pulmonary enteric adenocarcinoma(PEAC)is a very rare subtype of invasive adenocarcinoma,and there have been no large studies on PEAC to ***,it is necessary to obtain much more information about the clinical and pathological features,diagnosis,differential diagnosis,and treatment of *** SUMMARY All clinical data of six patients with confirmed PEAC from 2013 to 2018 were collected,and data on diagnosis,differential diagnosis,and treatment of PEAC are discussed combined with all the associated *** mean age of six patients was 64.0±5.6(59-73)years *** clinical manifestations were heterogeneous,and during their disease course,there were no gastrointestinal *** was no evidence from colonoscopy or imaging studies to suggest digestive tract tumors or new *** most commonly mutated gene was KRAS(50.0%),and the pathological features of the six cases were similar to those of colorectal ***2(83.3%)and CK7(66.7%)had the highest positive rates upon immunohistochemical *** the associated literature,252 cases were identified,and the most commonly mutated gene was KRAS(42.9%).Additionally,CDX2(68.3%)and CK7(85.8%)had the highest positive *** mainly received surgery,chemotherapy,and radiotherapy,immunotherapy was not *** Positive results for CDX2 and CK7 play an important role in the diagnosis and differential diagnosis of PEAC,and immunotherapy or targeted therapy focused on KRAS needs to be further studied for the treatment of PEAC.

关键词： Pulmonary enteric adenocarcinoma Immunohistochemistry Diagnosis Treatment KRAS Case report

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Construction of adenovirus vectors encoding the lumican gene by gateway recombinant cloning technology

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International Journal of Ophthalmology(English edition) 2016年第9期9卷 1271-1275页

作者： Gui-Fang Wang Bing Qi Lei-Lei tu Lian Liu Guo-Cheng Yu Jing-Xiang Zhong Department of Ophthalmology the First Affiliated Hospital of Jinan University

AIM： To construct adenovirus vectors of lumican gene by gateway recombinant cloning technology to further understand the role of lumican gene in myopia. METHODS： Gateway recombinant cloning technology was used to construct adenovirus vectors. The wild-type （wt） and mutant （mut） forms of the lumican gene were synthesized and amplified by polymerase chain reaction （PCR）. The lumican cDNA fragments were purified and ligated into the adenovirus shuttle vector pDown- multiple cloning site （MCS）-/internal ribozyme entry site （IRES）/enhanced green fluorescent protein （EGFP）. Then the desired DNA fragments were integrated into the destination vector *** yielding the final expression constructs ***-CMV〉wt-lumican/IRES/ EGFP and ***-cytomegalovirus （CMV）〉mutlumican/IRES/EGFP, ***： The adenovirus plasmids ***-CMV〉 wt-lumican/IRES/EGFP and ***-CMV 〉mutlumican/IRESlEGFP were successfully constructed by gateway recombinant cloning technology. Positive clones identified by PCR and sequencing were selected and packaged into recombinant adenovirus in HEK293 cells. CONCLUSION： We construct adenovirus vectors containing the lumican gene by gateway recombinant cloning technology, which provides a basis for investigating the role of lumicangene in the pathogenesis of high myopia.

关键词： myopia lumican adenovirus vector gateway recombinant cloning technology

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山蒟化学成分的研究(Ⅰ)

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中草药 2005年第1期36卷 13-15页

作者：周亮杨峻山涂光忠中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所北京10009 北京微量化学研究所北京100060

目的研究山Piperhancei藤茎的化学成分,为阐明其有效成分提供依据。方法利用硅胶、聚酰胺柱色谱进行化合物的分离,根据光谱数据(IR,UV,MS,1H-NMR,13C-NMR)和化学方法鉴定其结构。结果从其氯仿萃取物中分离得到9个化合物,分别鉴定为:... 详细信息

目的研究山Piperhancei藤茎的化学成分,为阐明其有效成分提供依据。方法利用硅胶、聚酰胺柱色谱进行化合物的分离,根据光谱数据(IR,UV,MS,1H-NMR,13C-NMR)和化学方法鉴定其结构。结果从其氯仿萃取物中分离得到9个化合物,分别鉴定为:凤藤酰胺(futoamide,)、毛穗胡椒碱(trichostachine,)、假荜拨酰胺A(retrofractamideA,)、胡椒次碱(pipercide,)、几内亚胡椒碱(guineensine,)、胡椒碱(piperine,)、胡椒亭(piperettine,)、卵形椒碱(piperovatine,)及(2E,4E)-N-异丁基-7-(3,4-次甲二氧基苯基)-2,4-二烯庚酰胺[(2E,4E)-N-isobutyl-7-(3,4-methylenedioxyphenyl)-hepta-2,4-dienamide,]。结论化合物～和～均为首次从该植物中分离得到。

关键词：山蒟化学成分生物碱

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利用RIL群体对水稻再生力及相关农艺性状的QTL分析

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作物学报 2012年第7期38卷 1240-1246页

作者：杨川航王玉平涂斌李婷胡亮李仕贵四川农业大学水稻研究所四川温江611130 四川省自贡市农业科学研究所四川自贡643000

以粳糯稻品种糯89-1与籼型重穗型杂交稻骨干恢复系蜀恢527杂交构建的籼粳交F7代RIL群体的169个家系为作图群体,构建了一张含105个微卫星(SSR)标记的分子连锁图谱。定位了水稻正季7个农艺性状的QTL15个,分布在第1、第2、第3、第5、第6、... 详细信息

以粳糯稻品种糯89-1与籼型重穗型杂交稻骨干恢复系蜀恢527杂交构建的籼粳交F7代RIL群体的169个家系为作图群体,构建了一张含105个微卫星(SSR)标记的分子连锁图谱。定位了水稻正季7个农艺性状的QTL15个,分布在第1、第2、第3、第5、第6、第7、第10染色体上,LOD值介于2.10～7.51,贡献率3.77%～25.37%,其中贡献率10.0%以上的QTL7个,单个性状的QTL1～4个;定位了水稻再生季7个农艺性状的QTL19个,分布在第1、第2、第3、第4、第5、第6、第7、第10染色体上,LOD值介于2.17～18.34,贡献率3.23%～37.66%,其中贡献率10.0%以上的QTL7个,单个性状的QTL1～5个;定位了影响水稻再生力(最终再生率)的QTL2个(qRA4,qRA5),分别在第4和第5染色体上,贡献率分别为8.17%和7.09%,加性效应分别为0.32和0.39,贡献率和加性效应均较小,属微效基因。共检测到两季农艺性状QTL36个,同一性状被重复检测的QTL8个。水稻再生力与正季稻有效穗呈极显著负相关;水稻再生力与再生稻有效穗呈极显著正相关,与每穗总粒数和着粒密度呈显著负相关。QTL定位结果揭示了有效穗是影响再生力的主要因素。

关键词：水稻重组自交系再生力农艺性状 QTL

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PAAS高吸水树脂对重金属离子盐溶液的吸液及吸附性能

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功能材料 2007年第8期38卷 1331-1333页

作者：谢建军吴海刚蒋佳星屠国平中南林业科技大学材料科学与工程学院湖南长沙410004

　　用聚丙烯酸高吸水树脂（PAAS）研究了单一和混合重金属离子硝酸盐溶液中的吸液和吸附性能。在Pb^2＋、Ni^2＋、Cd^2＋、Zn^2＋、Mn^2＋和Cu^2＋的一、二元溶液中,PAAS的吸液倍率随时间延长而增加,约50min达吸液平衡,一元金属离子溶... 详细信息

　　用聚丙烯酸高吸水树脂（PAAS）研究了单一和混合重金属离子硝酸盐溶液中的吸液和吸附性能。在Pb^2＋、Ni^2＋、Cd^2＋、Zn^2＋、Mn^2＋和Cu^2＋的一、二元溶液中,PAAS的吸液倍率随时间延长而增加,约50min达吸液平衡,一元金属离子溶液中平衡吸液倍率为160～190g/g,而对Cr^3＋溶液,最大为120g/g;二元金属离子混合溶液中平衡吸液倍率都在150～180g/g之间,有Cr^3＋存在时平衡吸液倍率最小。对上述单一金属离子的吸附量随时间延长而增加,约180min达吸附平衡,平衡吸附量顺序为：Pb^2＋〉Cd^2＋〉Ni^2＋〉Cu^2＋〉Zn^2＋〉Mn^2＋〉Cr^3＋。对二元混合金属离子溶液,吸附量随时间增加而增加,30min后逐渐变慢,约70min后达吸附平衡。

关键词：高吸水树脂聚丙烯酸吸液倍率吸附量重金属离子

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Sr和Nb复合掺杂Bi4Ti3O12基高温压电陶瓷的研究

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人工晶体学报 2011年第6期40卷 1471-1477页

作者：杨庆江向平余祖灯涂娜陈超陈燕景德镇陶瓷学院材料工程系江西省先进陶瓷材料重点实验室景德镇333001 广东道氏技术股份有限公司恩平529441

采用传统固相法制备了Bi4Ti3O12+0.91wt%Nb2O5+xwt%SrCO3(BTNO-Sr,0.00≤x≤1.50)层状压电陶瓷,研究了Sr掺杂对BTNO系陶瓷微观结构与电性能的影响。结果表明所有样品均为单一的铋层状结构相陶瓷。适量引入Sr能使BTNO系陶瓷的晶粒尺寸细... 详细信息

采用传统固相法制备了Bi4Ti3O12+0.91wt%Nb2O5+xwt%SrCO3(BTNO-Sr,0.00≤x≤1.50)层状压电陶瓷,研究了Sr掺杂对BTNO系陶瓷微观结构与电性能的影响。结果表明所有样品均为单一的铋层状结构相陶瓷。适量引入Sr能使BTNO系陶瓷的晶粒尺寸细化与均一,表现出介电弥散性,并改善其压电﹑机电和铁电性能。当x=0.50时,样品性能最佳:相对密度ρ=98.8%,压电常数d33=22 pC/N,平面机电耦合系数kp=9.5%,机械品质因子Qm=4462,剩余极化强度Pr=13.01μC/cm2,居里温度Tc=620℃。此外,介电性能和热稳定性能研究显示材料x=0.50具有好的压电稳定性,适合于制备高温高频压电器件。

关键词：压电陶瓷微观结构机电性能 Bi4Ti3O12

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基于多副本的动态自适应数据传输模型的研究

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计算机工程与设计 2007年第7期28卷 1667-1670页

作者：梁鸿郭兰图余芳中国石油大学计算机与通信工程学院山东东营257061

提出了基于多副本的动态自适应数据传输模型,并详细介绍了该模型所采用的动态任务分配算法,对比分析了与传统的基于单一副本数据传输方法的区别,最后运用GridFTP对两种方法作了详细的验证和比较。实验结果表明基于多副本的动态自适应数... 详细信息

提出了基于多副本的动态自适应数据传输模型,并详细介绍了该模型所采用的动态任务分配算法,对比分析了与传统的基于单一副本数据传输方法的区别,最后运用GridFTP对两种方法作了详细的验证和比较。实验结果表明基于多副本的动态自适应数据传输模型具有较好的传输性能。

关键词：网格数据传输副本元数据并行传输条状传输

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基于浸入边界-谱元法的流体柔性体耦合运动研究

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水动力学研究与进展（A辑） 2020年第3期35卷 285-292页

作者：涂昌健陈龙祥蔡国平李晔上海交通大学船舶海洋与建筑工程学院工程力学系上海200240 上海交通大学船舶海洋与建筑工程学院多功能拖曳水池上海200240

为了模拟大变形柔性体与黏性流体耦合运动的动力学行为,该文发展了一套基于浸入边界-谱元法的数值模拟方法。该数值方法中,流体运动在欧拉坐标下采用谱元法模拟,柔性体运动在拉格朗日坐标系采用有限差分法求解,两者的耦合通过浸入边界... 详细信息

为了模拟大变形柔性体与黏性流体耦合运动的动力学行为,该文发展了一套基于浸入边界-谱元法的数值模拟方法。该数值方法中,流体运动在欧拉坐标下采用谱元法模拟,柔性体运动在拉格朗日坐标系采用有限差分法求解,两者的耦合通过浸入边界法实现。首先对低雷诺数方柱绕流后柔性悬臂梁流固耦合振动问题进行数值模拟,并将计算结果与其它文献计算结果进行比较,验证了该耦合计算方法的可靠性。然后研究了高雷诺数下方柱绕流后柔性悬臂梁流固耦合振动情况,得到柔性结构的耦合振动特性和流场动态分布特征。该文的数值方法放宽了由大拉伸系数引起的稳定性限制,能更灵活地被运用于复杂柔性边界条件的情况,为后续对各种柔性体流体耦合的研究提供了基础。

关键词：浸入边界法谱元法数值模拟流固耦合方柱附加柔性悬臂梁

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La对Al_2O_(3f)/Al-Mg复合材料凝固溶质偏析的影响

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特种铸造及有色合金 2006年第8期26卷 465-467页

作者：刘政涂弢江西理工大学

利用挤压铸造法制备了Al2O3f/Al-Mg-La复合材料。研究了La在铝合金基体中的分布,并探讨了La对基体凝固时溶质元素偏析的影响。结果表明,La富集在界面附近,有利于改善铝合金液对Al2O3f的润湿性,但是在界面上未发现任何富稀土相的形成。L... 详细信息

利用挤压铸造法制备了Al2O3f/Al-Mg-La复合材料。研究了La在铝合金基体中的分布,并探讨了La对基体凝固时溶质元素偏析的影响。结果表明,La富集在界面附近,有利于改善铝合金液对Al2O3f的润湿性,但是在界面上未发现任何富稀土相的形成。La的加入对基体合金中的Mg的偏聚没有很明显的影响,Mg和La作为表面活性元素都在界面处富集,且它们的分布位置大致一样。

关键词：稀土La 合材料溶质偏析 Al2O3f Al-Mg合金

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