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Asian Herpetological Research 2014年第1期5卷 38-48页

作者： Mi ZHAO Yan SHI Jian ZHAO Xinping ZHU kunci chen Debo PAN chengqing WEI Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fishery Resource Application and Cultivation Ministry of AgriculturePearl River Fishery Research Institute Chinese Academic of Fishery Science

Matrix metallopeptidase 3 is a zinc-containing proteinase that participates in tissue remodeling and immune responses. In this study, a cDNA encoding matrix metallopeptidase 3 was isolated and characterized from the Asian yellow pond turtle Mauremys mutica（designated as MaMMP3）. The MaMMP3 cDNA is 1805 bp and consists of a 5＇-untranslated region（UTR） of 56 bp, a 3＇-UTR of 243 bp, and an open reading frame（ORF） of 1506 bp encoding 481 amino acids. Homology analysis of MaMMP3 revealed that the MaMMP3 shared 25%–63% similarity to other known MMP3 sequences. The genomic sequence covers 6007 bp. Comparative analysis of the cDNA sequence revealed that the Asian yellow pond turtle MMP3 has eight exons and seven introns. The phylogenetic tree showed that the MaMMP3 is closely related to Gallus gallus MMP3 and Taeniopygia guttata MMP3. The mRNA expression of the MaMMP3 in normal group without any bacterial challenge could be detected in all studied tissues including kidney, heart, live and spleen, with the highest level in the spleen. The results of immune challenge showed that the expression level of MaMMP3 was up-regulated in the spleen and liver. These results provided an important information for studying the roles of Asian yellow pond turtle MMP3 in immunity further.

关键词： Asian yellow pond turtle Mauremys mutica Serratia marcescens Matrix metallopeptidase 3 Immune responses

Geometric morphometric variations of the carapace variation among different populations of Mauremys mutica in China

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2014年中国水产学会学术年会

作者： Jian ZHAO Wei LI Dandan ZHANG Xinping ZHU Yongle chen kunci chen Key Laboratory of Tropical & Subtropical Fishery Resource Application & Cultivation of Ministry of Agriculture Pearl River Fisheries Research Institute Chinese Academy of Fishery Sciences College of Fisheries and Life Science Shanghai Ocean University

Mauremys mutica is a widely distributed but endangered species in Asia. Several studies focusing on turtle evolution indicated significant genetic divergence between samples from Zhejiang and Vietnam, also morphometrically distinguishable by Chinese rural farmers and researchers. This study focused on the shape variations of the carapace and plastron of the major four populations distributed and cultured in China using geometric morphometric methods. Principal component analysis was performed on the superimposed data of landmarks, 4 components for carapace and 5 components for plastron accumulated 60.08% and 65.91% of total variance, and significant differentiation（P＜0.01） was detected according to Multivariate analysis. Discriminate function analysis could clearly separate the four populations using carapace and correctly separate 81.7% using plastron. The relationship of the four populations is consistent to the geographic distributions indicating divergence aroused from natural population segregation.

关键词： Mauremys mutica population geometric morphometrics TPS

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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池养美洲鲥卵巢周年发育和血清激素变化研究

基因组学与应用生物学 2016年第10期35卷 2696-2701页

作者：洪孝友朱新平陈昆慈潘德博李凯彬中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室广州510380 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

采用形态测量、组织化学以及酶联免疫测定等技术方法,研究了淡水池养美洲鲥卵巢发育和促性腺激素(LH和FSH)和性类固醇激素(T和E2)的年周期变化规律。结果表明,美洲鲥产卵类型属非同步分批产卵,按组织学特点其卵母细胞发育可分为5个时相... 详细信息

采用形态测量、组织化学以及酶联免疫测定等技术方法,研究了淡水池养美洲鲥卵巢发育和促性腺激素(LH和FSH)和性类固醇激素(T和E2)的年周期变化规律。结果表明,美洲鲥产卵类型属非同步分批产卵,按组织学特点其卵母细胞发育可分为5个时相,依据形态特征其卵巢发育可划分为相应的5个时期。在性腺发育过程中,雌鱼性腺指数(GSI)和肝脏指数(HSI)没有出现明显的变化(p>0.05);LH在第Ⅴ时期的表达量显著性低于第Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ时期的表达量(p0.05)。不同激素间的两两相关性表明血清中LH水平和FSH水平存在显著正相关关系(r=0.613,p0.05)。通过与野生美洲鲥以及其他一些硬骨鱼类卵巢发育规律比较表明:在目前养殖条件下美洲鲥雌鱼营养积累不足,其性腺发育调控受到影响。

关键词：美洲鲥卵巢发育组织学血清激素

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孟加拉鲥、美洲鲥和中国鲥形态学比较分析

华南农业大学学报 2013年第2期34卷 203-206页

作者：洪孝友朱新平陈昆慈潘德博李凯彬中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室广东广州510380

观察、解剖107尾孟加拉鲥Tenualosa ilisha、美洲鲥Alosa sapidissima和中国鲥Tenualosa reevesii,详细记叙了孟加拉鲥外部形态和内部结构,运用传统形态学方法比较分析了3种鲥鱼的形态差异.三者形态7项可量性状比值的聚类分析结果显示,... 详细信息

观察、解剖107尾孟加拉鲥Tenualosa ilisha、美洲鲥Alosa sapidissima和中国鲥Tenualosa reevesii,详细记叙了孟加拉鲥外部形态和内部结构,运用传统形态学方法比较分析了3种鲥鱼的形态差异.三者形态7项可量性状比值的聚类分析结果显示,孟加拉鲥和中国鲥先聚为一类,再和美洲鲥聚为一类,这与它们的分类地位相一致.外观上,孟加拉鲥臀鳍鳍条短,被1层薄鳞覆盖;美洲鲥的纵列鳞数及体长/体高、体长/头长都大于其他2种鲥鱼.可数性状上,第一外鳃弓鳃耙和脊椎骨数目能明显区分3种鲥鱼.孟加拉鲥、中国鲥和美洲鲥的第一外鳃弓鳃耙数分别为181～219+153～224、95～131+170～175和24～31+47～55;脊椎骨数分别为46～48、37～39和55～57.在内部结构上,根据胃的形状、盲囊部的大小、幽门垂的长短和数量、肠道的弯曲数目及相对长度可以准确鉴定这3种鲥鱼.孟加拉鲥肠道最长,中国鲥次之,美洲鲥肠道最短.3种鲥鱼在消化道结构的差异,预示食性已产生分化.

关键词：孟加拉鲥美洲鲥中国鲥形态学

一种乌鳢与斑鳢线粒体PCR-RFLP鉴定方法

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生物技术通报 2014年第8期30卷 59-64页

作者：董传举张松皓陈坤慈宋迎楠徐鹏孙效文中国水产科学研究院生物技术研究中心北京100141 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 中国水产科学院珠江水产研究所广州510380

为了高效的鉴别乌鳢与斑鳢,采用PCR-RFLP技术,对乌鳢与斑鳢开展分子生物学鉴定方法研究。通过比对乌鳢和斑鳢线粒体全序列,发现1处单核苷酸多态性位点,可以明确区分两个物种。利用1对引物对乌鳢与斑鳢线粒体基因组该区域进行PCR扩增,用... 详细信息

为了高效的鉴别乌鳢与斑鳢,采用PCR-RFLP技术,对乌鳢与斑鳢开展分子生物学鉴定方法研究。通过比对乌鳢和斑鳢线粒体全序列,发现1处单核苷酸多态性位点,可以明确区分两个物种。利用1对引物对乌鳢与斑鳢线粒体基因组该区域进行PCR扩增,用限制性内切酶EcoR I分别对扩增产物进行酶切,并用1.5%的琼脂糖凝胶检测酶切结果。PCR-RFLP检测结果显示,斑鳢的PCR扩增产物被EcoR I酶切后生成两个不同大小的片段,分别为315 bp和875 bp,乌鳢则保持不变。由此可将乌鳢与斑鳢在酶切图谱上鉴别出来。

关键词：乌鳢斑鳢线粒体基因组 PCR-RFLP 鉴定

斑鳢、乌鳢及其杂交种遗传差异的AFLP分析

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基因组学与应用生物学 2010年第4期29卷 673-678页

作者：刘苏朱新平陈昆慈赵建潘德博李凯彬中国水产科学研究院珠江水产研究所广州510380 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

本文采用AFLP分子标记技术对斑鳢、乌鳢和杂交鳢(斑鳢(母本)与乌鳢(父本))共85个个体(其中斑鳢、乌鳢各30个,杂交鳢25个)进行了遗传差异分析。结果表明11对引物组合共检出了459个不同的扩增片段,扩增出的多态谱带数350条,多态性比例为76... 详细信息

本文采用AFLP分子标记技术对斑鳢、乌鳢和杂交鳢(斑鳢(母本)与乌鳢(父本))共85个个体(其中斑鳢、乌鳢各30个,杂交鳢25个)进行了遗传差异分析。结果表明11对引物组合共检出了459个不同的扩增片段,扩增出的多态谱带数350条,多态性比例为76.25%,平均每对引物组合扩增出31.8条多态条带。乌鳢与斑鳢种群间存在稳定的、可以简单地借以进行群体鉴别的标记条带169条,其中父本(乌鳢)特异性条带78条,72条能够稳定地遗传给杂交鳢;母本(斑鳢)特异性条带89条,71条能够稳定地遗传给杂交鳢。杂交鳢另外出现了3条非双亲的条带。遗传差异的分子方差分析结果发现,斑鳢与乌鳢种群间的遗传相似度为0.5161,杂交鳢与斑鳢和乌鳢种群间的遗传相似度相近,分别为0.7189和0.7476,斑鳢与乌鳢之间以及杂交鳢与斑鳢和乌鳢之间的种群间遗传距离分别为0.6615、0.3300和0.2909,即AMOVA分析显示斑鳢、乌鳢和杂交鳢间存在极显著的遗传分化。UPGMA聚类分析显示,在个体间,斑鳢与乌鳢能区分成两大类,杂交鳢则分散于斑鳢和乌鳢种群中;在群体间,杂交鳢首先与乌鳢聚类,然后与斑鳢相聚,表明杂交鳢种群总体上更偏向于父本乌鳢。研究结果表明,杂交鳢与斑鳢和乌鳢发生混杂的可能性很大,应该对杂交鳢进行隔离养殖。本文结果将为斑鳢、乌鳢和杂交鳢的遗传分析提供实验依据,也为其种质的合理利用提供参考。

关键词：斑鳢乌鳢杂交鳢 AFLP 遗传差异

基于DNA条码基因的鳢科鱼类系统进化与物种鉴定

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中国水产科学 2018年第4期25卷 793-802页

作者：赵建梁宏伟孙博李伟朱新平叶朝阳上官清陈昆慈中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室中国水产科学研究院长江水产研究所中国水产科学研究院黑龙江水产研究所中国水产科学研究院特殊生境鱼类种质特性与抗逆育种重点实验室上海海洋大学水产与生命学院

鳢科(Channidae)鱼类在亚洲分布广泛,其中中国的土著种类是重要养殖品种,国外很多种类主要作为观赏鱼引进我国。本研究利用线粒体COΙ基因序列,对分布于我国的鳢科鱼类不同种群样本序列,及在Gen Bank中获得其他鳢科鱼类的序列进行分析,... 详细信息

鳢科(Channidae)鱼类在亚洲分布广泛,其中中国的土著种类是重要养殖品种,国外很多种类主要作为观赏鱼引进我国。本研究利用线粒体COΙ基因序列,对分布于我国的鳢科鱼类不同种群样本序列,及在Gen Bank中获得其他鳢科鱼类的序列进行分析,探讨其作为DNA条形码基因对鳢科进行物种鉴定和系统进化分析的可行性。通过对本研究采集的149个鳢样本和122条Gen Bank中已有序列进行分析,结果显示,所研究的鳢科鱼类的COΙ基因576 bp片段中不存在碱基插入缺失现象,其平均碱基含量A+T(51.4%)高于G+C含量(48.6%),存在偏倚性;多态位点占47.2%。利用Mega 6.0软件基于Kimura’s 2-parameter模型计算25种鳢种内平均遗传距离为0.028,其中巴卡鳢(Channidae barca)种内遗传距离最大,为0.137,超过了某些种间遗传距离;种间遗传距离为0.0300.302,平均为0.217。其中最大距离0.302为饰鳍鳢(Channidae ornatipinnis)和黑体鳢(Channidae melasoma)之间,甚至超过了与外群之间的距离。利用邻接法(Neighbour-Joining,NJ)和最大似然法(Maximum Likelihood Tree,ML)分别构建系统进化树,同种个体获得较高支持率,而不同种间的关系支持率较低,同时发现存在由多个种组成的巴卡鳢和南鳢复合支系。本研究表明,进行我国土著鳢科鱼类物种鉴定时COI基因是有效的工具,而进行外来观赏鱼鉴定,尤其是巴卡鳢、斯氏鳢等物种进行鉴定时,需结合多方面信息;COI基因不适合鳢科鱼类种间遗传进化关系的研究。

关键词：鳢线粒体COI基因 DNA条码

斑鳢基因组中微卫星分布特征及野生种群遗传结构分析

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南方水产科学 2020年第3期16卷 47-60页

作者：上官清陈昆慈刘海洋欧密罗青王亚坤徐晟云赵建中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室广东广州510380 上海海洋大学上海201306

斑鳢(Channa maculata)是华南地区的本土经济鱼类,也是杂交鳢的亲本之一。养殖个体逃逸可能会对野生种群产生影响,存在种质混杂的风险,亟须开展野生资源的遗传背景分析。该研究分析了斑鳢基因组中微卫星标记的分布特征,筛选获得20个多... 详细信息

斑鳢(Channa maculata)是华南地区的本土经济鱼类,也是杂交鳢的亲本之一。养殖个体逃逸可能会对野生种群产生影响,存在种质混杂的风险,亟须开展野生资源的遗传背景分析。该研究分析了斑鳢基因组中微卫星标记的分布特征,筛选获得20个多态性位点构建多重PCR体系,对广州、化州、江华、南宁、阳江和邵武6个野生群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果显示,6个野生群体各位点的等位基因(Na)为3~28、有效等位基因(Ne)为1.28~14.88、观测杂合度(Ho)为0.10~1.00、期望杂合度(He)为0.14~0.95以及多态信息含量(PIC)为0.13~0.95。UPGAM系统进化树结果显示,化州和福建种群遗传关系最近,化州和江华种群遗传关系最远。该研究结果将为斑鳢的遗传监测和亲缘关系鉴定提供技术支持,为斑鳢种质资源养护及管理提供参考。

关键词：斑鳢遗传结构微卫星标记野生种群

大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种及其杂交子代的遗传分析

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中国水产科学 2012年第1期19卷 70-76页

作者：蔡磊白俊杰李胜杰陈昆慈樊佳佳马冬梅中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室上海海洋大学水产与生命学院

用18对微卫星引物对大口黑鲈北方亚种(Micropterus salmoides salmoides,N)、佛罗里达亚种(*** floridanus,F)及其正交子代(N♀×F♂)和反交子代(F♀×N♂)进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明,18对引物扩增出的等位基因数为28个,... 详细信息

用18对微卫星引物对大口黑鲈北方亚种(Micropterus salmoides salmoides,N)、佛罗里达亚种(*** floridanus,F)及其正交子代(N♀×F♂)和反交子代(F♀×N♂)进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明,18对引物扩增出的等位基因数为28个,平均等位基因数为5.0。检测到6对(Jzl48、Jzl68、Jzl84、MiSaTPW76、Msal21、Mdo6和Mdo7)亚种间特异性引物,其中有2对引物(Jzl48和Mdo7)可以用来鉴别大口黑鲈北方亚种、佛罗里达亚种和其杂交子代。平均有效等位基因数、平均期望杂合度和平均多态信息含量均为杂交组合F♀×N♂最高,分别为3.199 7,0.638 9和0.570 6,平均观测杂合度为杂交组合N♀×F♂最高(0.848 8)。对亲代与杂交子代间的遗传分化分析表明,正反交子代均与北方亚种的遗传分化最小(0.092和0.119 6)。基于Nei’s遗传距离构建的UPGMA系统进化树显示正交子代N♀×F♂与母本N聚为一支,反交子代F♀×N♂与父本N聚为一支。

关键词：大口黑鲈北方亚种佛罗里达亚种杂交微卫星标记遗传关系

斑鳠血清促性腺激素的季节变化和埋植甲基睾酮对斑鳠促性腺激素分泌的影响

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中山大学学报（自然科学版） 2009年第5期48卷 103-107页

作者：周立斌刘晓春马细兰林浩然李大疆陈焜慈李恒颂邬国民中山大学有害生物控制与资源利用国家重点实验室//水生经济动物研究所和广东省水生经济动物良种繁育重点实验室广东广州510275 惠州学院生命科学系和生物技术研究所广东惠州516007 中国水产科学研究院珠江水产研究所广东广州510380

采用鲤鱼GtHβ-亚基(cGtHβ)的标准品和抗血清建立了斑鳠异源的促性腺激素(Gonadotropin,GtH)放射免疫测定技术,并对斑鳠性腺指数(Gonadosomatic index,GSI)和GtH分泌的季节变化,以及埋植甲基睾酮(17α-methyl-testosterone,MT)对斑鳠GtH分泌的影响进行了研究。结果表明:斑鳠雌雄鱼GSI值分别在5月份和6月份达到最高,与其他月份相比有显著性提高(P0.05);埋植MT对斑鳠雌雄鱼血清GtH水平有一定影响,在性腺发育初期能提高雌雄鱼血清GtH水平,而在性腺成熟和排卵期能降低雌雄鱼血清GtH水平。上述结果表明在斑鳠的人工繁殖中可以采用埋植MT的方法对斑鳠进行催熟和催产。

关键词：斑鳠促性腺激素季节变化 MT