斑鳢基因组中微卫星分布特征及野生种群遗传结构分析

作     者：上官清 陈昆慈 刘海洋 欧密 罗青 王亚坤 徐晟云 赵建 SHANGGUAN Qing;CHEN Kunci;LIU Haiyang;OU Mi;LUO Qing;WANG Yakun;XU Shengyun;ZHAO Jian

作者机构：中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室广东广州510380 上海海洋大学上海201306 

出 版 物：《南方水产科学》 (South China Fisheries Science)

年 卷 期：2020年第16卷第3期

页      面：47-60页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：广州市科技计划项目珠江科技新星专项(201710010174) 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-46) 中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2020TD34 2019XT0601) 广东省海洋渔业科技与产业发展专项(A201501A08) 

主　　题：斑鳢 遗传结构 微卫星标记 野生种群 

摘      要：斑鳢(Channa maculata)是华南地区的本土经济鱼类,也是杂交鳢的亲本之一。养殖个体逃逸可能会对野生种群产生影响,存在种质混杂的风险,亟须开展野生资源的遗传背景分析。该研究分析了斑鳢基因组中微卫星标记的分布特征,筛选获得20个多态性位点构建多重PCR体系,对广州、化州、江华、南宁、阳江和邵武6个野生群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果显示,6个野生群体各位点的等位基因(Na)为3~28、有效等位基因(Ne)为1.28~14.88、观测杂合度(Ho)为0.10~1.00、期望杂合度(He)为0.14~0.95以及多态信息含量(PIC)为0.13~0.95。UPGAM系统进化树结果显示,化州和福建种群遗传关系最近,化州和江华种群遗传关系最远。该研究结果将为斑鳢的遗传监测和亲缘关系鉴定提供技术支持,为斑鳢种质资源养护及管理提供参考。