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Comparative phosphoproteomic analysis of BR-defective mutant reveals a key role of GhSK13 in regulating cotton fiber development

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Science China(Life Sciences) 2020年第12期63卷 1905-1917页

作者： Lingling Wang Han Cheng Fangjie Xiong Shuya Ma Lei Zheng Yun Song kexuan deng Huanhuan Wu Fuguang Li Zuoren Yang Zhengzhou Research Base State Key Laboratory of Cotton BiologyZhengzhou UniversityZhengzhou 450001China State Key Laboratory of Cotton Biology Institute of Cotton ResearchChinese Academy of Agricultural SciencesAnyang 455000China Key Laboratory for Ecology of Tropical Islands Ministry of EducationCollege of Life SciencesHainan Normal UniversityHaikou 571158China School of Life Sciences Chongqing UniversityChongqing 401331China

Brassinosteroid(BR), a steroid phytohormone, whose signaling transduction pathways include a series of phosphorylation and dephosphorylation events, and GSK3 s are the main negative regulator kinases. BRs have been shown to play vital roles in cotton fiber elongation. However, the underlying mechanism is still elusive. In this study, fibers of a BR-defective mutant Pagoda 1(pag1), and its corresponding wild-type(ZM24) were selected for a comparative global phosphoproteome analysis at critical developmental time points: fast-growing stage(10 days after pollination(DPA)) and secondary cell wall synthesis stage(20DPA). Based on the substrate characteristics of GSK3, 900 potential substrates were identified. Their GO and KEGG annotation results suggest that BR functions in fiber development by regulating GhSKs(GSK3s of Gossypium hirsutum L.) involved microtubule cytoskeleton organization, and pathways of glucose, sucrose and lipid metabolism. Further experimental results revealed that among the GhSK members identified, GhSK13 not only plays a role in BR signaling pathway, but also functions in developing fiber by respectively interacting with an AP2-like ethylene-responsive factor GhAP2L, a nuclear transcription factor GhDNFYB19, and a homeodomain zipper member GhHDZ5. Overall, our phosphoproteomic research advances the understanding of fiber development controlled by BR signal pathways especially through GhSKs, and also offers numbers of target proteins for improving cotton fiber quality.

关键词： phosphoproteome brassinosteroid GSK3 GhSK13 cotton fiber development

构建杂化酶体系解析对羟基苯乙酸脱羧酶小亚基的功能

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重庆大学学报（自然科学版） 2016年第3期39卷 95-100页

作者：于力华熊方杰邓可宣重庆大学生命科学学院重庆400044

对羟基苯乙酸(HPA)脱羧酶是一类甘氨酸自由基脱羧酶,催化前体对羟基苯乙酸或吲哚乙酸的脱羧反应,形成终产物对羟基甲苯和对甲基吲哚。由于其蛋白质结构中小亚基(HpdC)的存在,使其显示了一些不同于其他已知的几种甘氨酸自由基体系的特性... 详细信息

对羟基苯乙酸(HPA)脱羧酶是一类甘氨酸自由基脱羧酶,催化前体对羟基苯乙酸或吲哚乙酸的脱羧反应,形成终产物对羟基甲苯和对甲基吲哚。由于其蛋白质结构中小亚基(HpdC)的存在,使其显示了一些不同于其他已知的几种甘氨酸自由基体系的特性,被认为是一类新型的甘氨基自由基酶体系。前期的研究结果初步显示了HpdC在整个脱羧酶体系中的重要性,但缺乏系统的实验验证。通过构建系列杂化脱羧酶(包括组合杂化酶体系与嵌合杂化酶体系)高表达质粒,对相应的编码蛋白质进行分离纯化以及酶活性检测等,探究了小亚基在整个脱羧酶体系中的功能。研究结果证明,小亚基HpdC的存在,一方面直接影响整个编码蛋白质的溶解性及复合物的稳定性,另一方面则通过介导脱羧酶高级聚合状态的形成,决定着酶的催化活性。

关键词：对羟基苯乙酸脱羧酶小亚基杂化酶甘氨酸自由基酶

基于网络药理学探讨沙棘治疗酒精性肝损伤的作用机制

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食品工业科技 2024年第14期45卷 25-33页

作者：邓斌陈洁李想娄可轩周立权周一苗肖作为湖南中医药大学药食同源创新实验室湖南长沙410208 湖南省健康产品与生命科技工程技术研究中心湖南长沙410208 湖南中医药大学湘杏学院湘阴校区湖南岳阳414615

目的:基于网络药理学预测沙棘治疗酒精性肝损伤(Alcohol Liver Injury)的作用机制,并通过建立斑马鱼酒精性肝损伤动物模型来验证沙棘治疗酒精性肝损伤的功效。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Sy... 详细信息

目的:基于网络药理学预测沙棘治疗酒精性肝损伤(Alcohol Liver Injury)的作用机制,并通过建立斑马鱼酒精性肝损伤动物模型来验证沙棘治疗酒精性肝损伤的功效。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)、Uniprot数据库收集有效成分及其作用靶标,Venny2.1寻找交集靶点。通过GeneCards及OMIM数据库收集和筛选疾病靶点,STRING v12.0数据库进行PPI网络分析,PDB及PubChem进行蛋白质结构及小分子结构确认。通过Cytoscape(Version 3.9.1)软件网络图构建沙棘治疗酒精性肝损伤关联网络。利用Metascape数据库对共有靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Gene,KEGG)数据库通路富集分析。通过斑马鱼实验进行功能验证:选取受精后3 d(3 dpf)野生型AB品系斑马鱼,正常组喂养于正常饲养用水,其余各组饲养于2%的无水乙醇溶液中建立酒精性肝损伤模型。沙棘组给予不同浓度的沙棘溶液,28℃处理2 d后,确定沙棘对酒精性肝损伤模型斑马鱼的最大耐受浓度(MTC)剂量,并根据MTC结果进行下一步给药,测定样品肝保护功效评价表型实验结果。结果:筛选后得到沙棘活性成分33个,主要包括槲皮素、花葵素、儿茶酸等;治疗酒精性肝损伤的潜在靶点1434个,主要包括ADH1C、CTNNB1、TGFB1等。调控这些核心靶点的信号通路主要富集在Lipid and atherosclerosis、Fluid shear stress and atherosclerosis、PI3K-Akt signaling pathway等多条信号通路中。动物实验结果显示:与模型组相比,沙棘可显著降低酒精性肝损伤模型斑马鱼肝脏不透明值(P<0.01),改善肝脏和卵黄囊肿大(P<0.01),下调AST和ALT的活力值(P<0.001),改善肝细胞核肿大,减少肝组织脂肪空泡样变性的功效。结论:沙棘可改善酒精性肝损伤,其机制可能与改善脂肪酸氧化、细胞代谢和抑制细胞凋亡有关。

关键词：沙棘网络药理学酒精性肝损伤

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马铃薯Shaker基因家族全基因组鉴定和分析

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重庆科技学院学报（自然科学版） 2019年第3期21卷 104-108,116页

作者：尹欢卓凤萍邓可宣任茂智重庆大学生命科学学院重庆401331 重庆科技学院重庆401331

钾素营养在植物的生长发育过程中具有重要作用。Shaker家族基因参与植物对低钾环境胁迫的响应过程,可帮助植物从土壤中吸收钾素。将拟南芥Shaker蛋白质序列作为源序列,在马铃薯数据库PGSC中搜索获得22个StShaker基因;通过多序列比对和... 详细信息

钾素营养在植物的生长发育过程中具有重要作用。Shaker家族基因参与植物对低钾环境胁迫的响应过程,可帮助植物从土壤中吸收钾素。将拟南芥Shaker蛋白质序列作为源序列,在马铃薯数据库PGSC中搜索获得22个StShaker基因;通过多序列比对和保守结构域分析,最终从马铃薯基因组中鉴定出9个StShaker基因。通过分析其外显子内含子结构、系统发育树、染色体分布、蛋白质序列等,发现StShaker基因能够分为5组,有4个保守的结构域,所有的StShaker基因在结构域I中都有一个核心的GYGDE基序。低钾胁迫对大多数StShaker基因在转录水平上没有显著影响,StShaker可能是受转录后水平上的调控来影响马铃薯对钾离子的吸收。

关键词： Shaker基因家族马铃薯钾离子吸收表达模式系统发育

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价值取向和社会距离对大学生合作行为的影响

校园心理 2024年第1期22卷 37-41页

作者：陈可炫邓永光吴铁钧苏州城市学院社会服务系江苏苏州215104 苏州大学教育学院江苏苏州215123

目的探究社会困境下不同社会价值取向与社会距离对中国大学生合作行为的影响特点。方法选取60名在校大学生进行囚徒困境测验,采取2(价值取向:亲自我取向和亲社会取向)×4(社会距离:家人、同学、老乡和陌生人)混合实验设计。结果社会距... 详细信息

目的探究社会困境下不同社会价值取向与社会距离对中国大学生合作行为的影响特点。方法选取60名在校大学生进行囚徒困境测验,采取2(价值取向:亲自我取向和亲社会取向)×4(社会距离:家人、同学、老乡和陌生人)混合实验设计。结果社会距离的主效应具有统计学意义,价值取向的主效应和交互作用不具有统计学意义,当对象为家人时,被试的合作率高于老乡、同学、陌生人。结论人们的合作行为受社会距离的影响,相比较亲自我者,亲社会者对老乡表现出了更多的合作行为。

关键词：社会价值心理距离合作行为囚徒困境

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烤烟‘渝金香1号’致香物质含量分析

中国农学通报 2022年第19期38卷 146-151页

作者：周东张艳吕俊张建奎邓可宣宗学凤戴秀梅四川中烟工业有限责任公司成都610066 重庆烟草科学研究所重庆400716 西南大学农学与生物科技学院重庆400716

对烤烟新品种‘渝金香1号’的致香物质含量进行分析,为该品种的栽培技术改进以及卷烟配方应用提供依据。取重庆市巫山县烟区的‘渝金香1号’以及主栽烤烟品种‘云烟87’、‘K326’(对照)中部C3F等级烟叶,经蒸馏萃取后,采用气相色谱质谱... 详细信息

对烤烟新品种‘渝金香1号’的致香物质含量进行分析,为该品种的栽培技术改进以及卷烟配方应用提供依据。取重庆市巫山县烟区的‘渝金香1号’以及主栽烤烟品种‘云烟87’、‘K326’(对照)中部C3F等级烟叶,经蒸馏萃取后,采用气相色谱质谱联用法测定其致香成分及含量。试验检测出70种致香物质或潜香物质成分;‘渝金香1号’萜烯类、醛、酮类物质的含量稍低于对照品种‘云烟87’和‘K326’;氮杂环类和酚类物质含量稍高于‘云烟87’和‘K326’;醇类、酯类和酸类物质低于‘云烟87’,高于‘K326’;致香物质占测出致香或潜香物质总量的比例为23.48%,高于‘云烟87’(22.74%)和‘K326’(17.98%),有利于在陈化过程中快速降解生成致香成分;新植二烯与致香物质总量的比例低于‘云烟87’和‘K326’,对于降低烟气的刺激性、协调吃味有利;植物呋喃类含量与新植二烯含量的比例高于‘云烟87’和‘K326’,类胡萝卜素重要致香降解产物总量比‘云烟87’和‘K326’分别高5.92%和5.22%,叶面分泌物降解产物或衍生物总量(34.310μg/g)高于对照品种‘云烟87’(32.996μg/g)和‘K326’(32.490μg/g),有利于彰显‘渝金香1号’烤后烟叶的香气特征。‘渝金香1号’致香物质含量较高,比例较协调,香气质量较好。

关键词：烤烟品种 ‘渝金香1号’ 致香物质烟叶质量

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蛇肽保健酒对小鼠佐剂性关节炎的影响

重庆医学 2013年第28期42卷 3395-3397页

作者：曹娟娟和七一赵瑛张荣春魏世蓉邹家丽邓可宣余晓东重庆市动物生物学重点实验室/重庆市生物活性物质工程研究中心/重庆师范大学生命科学学院 400047

目的研究蛇肽保健酒对小鼠佐剂性关节炎(AA)的影响。方法将健康雄性昆明种小鼠随机分为6组,即对照组、模型组、阳性对照组(1mg/kg地塞米松)、酒基组(10mL/kg)、蛇肽保健酒低剂量组(8.3mL/kg)和高剂量组(33.2mL/kg);每隔7d分别测定小鼠... 详细信息

目的研究蛇肽保健酒对小鼠佐剂性关节炎(AA)的影响。方法将健康雄性昆明种小鼠随机分为6组,即对照组、模型组、阳性对照组(1mg/kg地塞米松)、酒基组(10mL/kg)、蛇肽保健酒低剂量组(8.3mL/kg)和高剂量组(33.2mL/kg);每隔7d分别测定小鼠右后足趾、踝关节直径和体质量,实验第34天处死小鼠,进行脾脏指数、血清循环免疫复合物(CIC)水平的测定。结果蛇肽保健酒低剂量组对降低AA小鼠的血清CIC水平效果显著(P<0.05),对降低足趾和踝关节肿胀度、脾脏指数效果均极显著(P<0.01)。结论蛇肽保健酒对小鼠佐剂性关节炎具有抑制作用。

关键词：蛇肽保健酒佐剂性关节炎脾脏指数肿胀度小鼠

抗青枯病烟草品种在重庆市武隆烟区的适应性研究

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植物医学 2023年第6期2卷 36-42页

作者：梁颖涛代先强杨昌全彭一洪郑子豪邓可宣陈少鹏中国烟草总公司重庆市公司重庆400020 西南大学农学与生物科技学院重庆400715

武隆是渝东南烟草青枯病高发烟区之一.为筛选适合重庆渝东南烟区种植的优良青枯病抗性品种,保障渝东南烟区烟草产量和品质,本研究以武隆当地主栽烟草品种“云烟87”和“K326”为研究对象,与近年来选育的青枯病抗性新品种“安烟2号”“安... 详细信息

武隆是渝东南烟草青枯病高发烟区之一.为筛选适合重庆渝东南烟区种植的优良青枯病抗性品种,保障渝东南烟区烟草产量和品质,本研究以武隆当地主栽烟草品种“云烟87”和“K326”为研究对象,与近年来选育的青枯病抗性新品种“安烟2号”“安烟3号”“湘烟7号”和“贵烟36”进行对照试验,对各品种的青枯病抗病性、生育期、植物学性状、农艺性状、经济和品质性状等进行综合评价.结果表明,“贵烟36”的青枯病发病率低于“K326”和“云烟87”,病情指数与“K326”相当,低于“云烟87”.其次为“湘烟7号”,“湘烟7号”的发病率和病情指数均略高于“K326”和“云烟87”.“安烟2号”和“安烟3号”表现较差,发病率和病情指数均远高于“K326”和“云烟87”.经济性状显示“湘烟7号”和“贵烟36”每667 m 2的产值分别为3031.8元和3075.3元,与“云烟87”相当,略低于“K326”;烟叶内在化学成分分析显示“安烟3号”和“湘烟7号”表现较好.综合试验结果表明,“湘烟7号”可进一步在渝东南地区进行验证推广.

关键词：烟草烟草青枯病抗性品种筛选经济性状化学品质

多烯大环类抗生素合成酶结构域的差异进化分析及应用于一株产四霉素链霉菌菌株的筛选(英文)

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上海交通大学学报（农业科学版） 2011年第1期29卷 1-9页

作者：王绛唐克轩邓子新黄曦上海交通大学生命科学技术学院教育部微生物代谢重点实验室上海200030 上海交通大学农业与生物学院上海200240 中国科学院上海有机化学研究所生命有机国家重点实验室上海200032

多烯大环类抗生素的生物合成酶属于典型的I类聚酮合酶(PKS),这些生物大分子有着非常相似的化学结构和模块合成的形式。在本研究中,每个多烯聚酮合酶的单一结构域被作为系统进化分析的对象。我们发现,各类结构域在进化上出现了不同方向... 详细信息

多烯大环类抗生素的生物合成酶属于典型的I类聚酮合酶(PKS),这些生物大分子有着非常相似的化学结构和模块合成的形式。在本研究中,每个多烯聚酮合酶的单一结构域被作为系统进化分析的对象。我们发现,各类结构域在进化上出现了不同方向的倾向,其中,KS域在进化树中归成三大类,分别对应多烯结构的三大块区域;相对于KS域和ACP域表现出基因水平转移的倾向而言,AT和KR域则大部分都在单一的基因簇内部发生复制或者重组;而七烯类的FR-008和四烯类的匹马菌素的合成基因簇则极可能源自同一祖先,由此也佐证了多烯抗生素的共轭双键数目是由结构域的组织分布决定的。这些结果都为多烯大环组合生物工程提供了重要的启示。同时利用FR-008和匹马菌素的高度同源性,基于基因筛选的手段,我们分离到了一株新的产四烯大环类抗生素四霉素的链霉菌。

关键词：多烯大环结构域差异进化聚酮合酶四霉素