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Plant multiscale networks:charting plant connectivity by multi-level analysis and imaging techniques

Science China(Life Sciences) 2021年第9期64卷 1392-1422页

作者： Xi Zhang Yi Man Xiaohong Zhuang Jinbo Shen Yi Zhang Yaning Cui Meng Yu Jingjing Xing Guangchao Wang Na Lian Zijian Hu Lingyu Ma Weiwei Shen Shunyao Yang Huimin Xu jiahui bian Yanping Jing Xiaojuan Li Ruili Li Tonglin Mao Yuling Jiao Sodmergen Haiyun Ren Jinxing Lin Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design Beijing Forestry UniversityBeijing 100083China College of Biological Sciences and Biotechnology Beijing Forestry UniversityBeijing 100083China School of Life Sciences Centre for Cell&Developmental Biology and State Key Laboratory of AgrobiotechnologyThe Chinese University of Hong KongHong Kong 999077China State Key Laboratory of Subtropical Silviculture Zhejiang A&F UniversityHangzhou 311300China Key Laboratory of Cell Proliferation and Regulation Biology Ministry of EducationCollege of Life ScienceBeijing Normal UniversityBeijing 100875China Key Laboratory of Plant Stress Biology School of Life SciencesHenan UniversityKaifeng 457004China College of Biological Sciences China Agricultural UniversityBeijing 100193China State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry Department of Plant SciencesCollege of Biological SciencesChina Agricultural UniversityBeijing 100193China State Key Laboratory of Plant Genomics Institute of Genetics and Developmental BiologyChinese Academy of Sciencesand National Center for Plant Gene ResearchBeijing 100101China Key Laboratory of Ministry of Education for Cell Proliferation and Differentiation College of Life SciencesPeking UniversityBeijing 100871China

In multicellular and even single-celled organisms,individual components are interconnected at multiscale levels to produce enormously complex biological networks that help these systems maintain homeostasis for development and environmental *** biology studies initially adopted network analysis to explore how relationships between individual components give rise to complex biological *** analysis has been applied to dissect the complex connectivity of mammalian brains across different scales in time and space in The Human Brain *** plant science,network analysis has similarly been applied to study the connectivity of plant components at the molecular,subcellular,cellular,organic,and organism *** of these multiscale networks contributes to our understanding of how genotype determines *** this review,we summarized the theoretical framework of plant multiscale networks and introduced studies investigating plant networks by various experimental and computational *** next discussed the currently available analytic methodologies and multi-level imaging techniques used to map multiscale networks in ***,we highlighted some of the technical challenges and key questions remaining to be addressed in this emerging field.

关键词： multiscale network connectivity cytoskeleton membrane contact site organelle interaction multicellularity connectome cytoarchitecture topological analysis multi-level imaging techniques

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华北板块南缘早二叠世煤中微量元素赋存特征及主控机制

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地质科技通报 2023年第5期42卷 138-149页

作者：袁铎恩边家辉刘紫璇张利伟潘思东中国地质大学(武汉)构造与油气资源教育部重点实验室武汉430074 中国地质大学(武汉)资源学院武汉430074

煤中关键金属是矿产资源勘探开发的新领域。目前对华北板块南缘早二叠世煤中微量元素赋存特征及主控机制研究较少,制约了关于该区煤沉积物源、沉积环境的认识以及煤的清洁高效利用。基于X射线衍射(XRD)、X射线荧光光谱(XRF)、电感耦合... 详细信息

煤中关键金属是矿产资源勘探开发的新领域。目前对华北板块南缘早二叠世煤中微量元素赋存特征及主控机制研究较少,制约了关于该区煤沉积物源、沉积环境的认识以及煤的清洁高效利用。基于X射线衍射(XRD)、X射线荧光光谱(XRF)、电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)等分析方法,对华北板块南缘早二叠世中煤矿物学与煤地球化学特征进行了研究。结果表明,华北板块南缘早二叠世煤中矿物主要发育高岭石、伊利石、铵伊利石、绿泥石和方解石等,主量元素以SiO_(2),Al_(2)O_(3)与CaO为主。煤层样品中Li元素相对富集,质量分数为54.5×10^(-6)~116×10^(-6)(均值76.83×10^(-6));Zr、Th元素轻微富集,质量分数分别为34.14×10^(-6)~160.73×10^(-6)(均值73.81×10^(-6))和3.22×10^(-6)~17.79×10^(-6)(均值7.85×10^(-6));其他元素质量分数接近或低于世界硬煤平均值,其中Co、Zn、Rb、Cd和Cs等元素明显贫化。通过相关性分析与地球化学解释得出以下结论:①华北板块南缘早二叠世煤中Li元素主要赋存于高岭石等黏土矿物中,其含量主要受控于陆源碎屑;②受华力西构造运动影响,北部阴山古陆中元古代钾长花岗岩与石炭系本溪组古风化壳铝土矿被抬升风化剥蚀,并成为华北板块南缘早二叠世煤的主要供源区;③泥炭沼泽水介质偏咸与缺氧还原的沉积环境有利于Li元素被高岭石等黏土矿物吸附并沉积聚集。

关键词：华北板块南缘 Li元素黏土矿物煤沉积环境

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紫花苜蓿的皂苷研究

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草业科学 2019年第1期36卷 261-271页

作者：罗雯王丹边佳辉孙占敏唐益雄吴燕民兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室/兰州大学农业农村部草牧业创新重点实验室/兰州大学草地农业科技学院甘肃兰州730020 中国农业科学院生物技术研究所北京100081

紫花苜蓿(Medicago Sativa)被誉为"牧草之王",是我国种植面积最大的豆科牧草。紫花苜蓿含有大量的次生代谢产物,其中皂苷是一种分布广、含量高的生物活性物质,具有降低胆固醇、调节脂质代谢、增强机体免疫、抗氧化等功能。为此查阅近年... 详细信息

紫花苜蓿(Medicago Sativa)被誉为"牧草之王",是我国种植面积最大的豆科牧草。紫花苜蓿含有大量的次生代谢产物,其中皂苷是一种分布广、含量高的生物活性物质,具有降低胆固醇、调节脂质代谢、增强机体免疫、抗氧化等功能。为此查阅近年来国内外研究进展,阐述了紫花苜蓿皂苷的理化性质、分布及含量、分离及提取等,并对其应用前景进行了展望,指出紫花苜蓿皂苷作为一种绿色的植物附加产物将会有很大的开发和利用价值,也为紫花苜蓿皂苷的进一步研究提供重要资料。

关键词：紫花苜蓿皂苷理化性质提取分离

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转PeDREB2a和KcERF基因紫花苜蓿的表型及抗旱耐盐性

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草业科学 2023年第3期40卷 732-739页

作者：罗雯孙占敏边佳辉刘自扬唐益雄冉启凡吴燕民中国农业科学院生物技术研究所北京100081 兰州大学草地农业科技学院甘肃兰州730020 重庆市畜牧科学院重庆402460

以紫花苜蓿(Medicago sativa)‘中苜1号’为受体材料,通过根癌农杆菌介导法将抗旱基因PeDREB2a、KcERF转入‘中苜1号’,获得转基因抗性苗66株,基因组PCR检测阳性率为93.94%,RT-PCR检测表明目的基因在转录水平上能够稳定表达;利用Taqman ... 详细信息

以紫花苜蓿(Medicago sativa)‘中苜1号’为受体材料,通过根癌农杆菌介导法将抗旱基因PeDREB2a、KcERF转入‘中苜1号’,获得转基因抗性苗66株,基因组PCR检测阳性率为93.94%,RT-PCR检测表明目的基因在转录水平上能够稳定表达;利用Taqman PCR方法检测目的基因的拷贝数,结果表明PeDREB2a、KcERF基因在转基因株系Z6、Z7、Z9中均为单拷贝。在正常生长条件下,转基因株系Z6和Z7株高、分枝数、叶片吲哚乙酸含量、纤维素含量均显著高于野生型,而叶片乙烯含量显著低于野生型(P<0.05)。用20%PEG-3350和250 mmol·L^(-1)NaCl胁迫处理进行表型观测和抗逆生理指标检测,表明转基因株系与野生型相比抗旱、耐盐能力明显增强。本研究为进一步培育抗逆优质高产苜蓿新品种提供了新种质。

关键词：遗传转化干旱胁迫盐胁迫转录因子抗逆

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GB 2759—2015《食品安全国家标准冷冻饮品和制作料》问卷调查反馈意见分析

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中国食品卫生杂志 2023年第4期35卷 593-599页

作者：王晓芬宋亚静王正亮卞加慧张雅芬中国计量大学浙江杭州310018

目的调查了解全国相关单位人员对GB 2759—2015《食品安全国家标准冷冻饮品和制作料》的知晓及贯彻落实情况,为标准的修订提出建议和参考。方法采用问卷调查方式进行研究。主要调查对象是食品生产经营企业人员、卫生健康部门人员、市场... 详细信息

目的调查了解全国相关单位人员对GB 2759—2015《食品安全国家标准冷冻饮品和制作料》的知晓及贯彻落实情况,为标准的修订提出建议和参考。方法采用问卷调查方式进行研究。主要调查对象是食品生产经营企业人员、卫生健康部门人员、市场监管部门人员、检测机构人员等。数据采用Microsoft Excel 2013和SPSS 20.0软件进行统计分析。结果本次调查共收回有效调查问卷440份。被调查对象对GB 2759—2015的知晓率为55.5%(244/440),一致认可标准在冷冻饮品质量、食品安全的重要作用,对实施效果的总体评价为“良好”(均值为4.42分)。得到有效反馈问题24条,有意见建议人员数36人,占比15%。结论全国相关单位人员对GB 2759—2015的知晓情况一般。不同调查对象之间对知晓率差异有统计学意义(P<0.05)。调查发现,仍有35.4%(51/144)的监管人员和检验人员不了解、不清楚其关注行业应遵守产品标准GB 2759—2015。今后应加大食品安全国家标准的宣传力度,在冷冻饮品定义和微生物限量方面也亟须结合现场调研和专家咨询等进行研究和修订。

关键词：食品安全标准冷冻饮品和制作料跟踪评价反馈

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百脉根分子生物学主要领域研究进展

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草业科学 2019年第11期36卷 2871-2886页

作者：李宗英王丹边佳辉孙占敏傅华吕嘉卫吴燕民兰州大学草地农业科技学院甘肃兰州730020 中国农业科学院生物技术研究所北京100081 上海金柯劳沃生物科技有限公司上海200000

百脉根(Lotus corniculatus)作为质量优良的多年生豆科牧草,其营养丰富、适口性好、生态适应性强,可广泛应用于畜牧养殖业、园林绿化以及土壤修复等,亦可用于草药制剂,治疗某些人类疾病。为扩大百脉根在生产实践中的应用,国内外对其开... 详细信息

百脉根(Lotus corniculatus)作为质量优良的多年生豆科牧草,其营养丰富、适口性好、生态适应性强,可广泛应用于畜牧养殖业、园林绿化以及土壤修复等,亦可用于草药制剂,治疗某些人类疾病。为扩大百脉根在生产实践中的应用,国内外对其开展了深入研究。本文简述了百脉根的7个研究领域包括遗传多样性与系统进化分析、抗逆境胁迫、抗除草剂、根瘤固氮、缩合单宁、作为生物反应器以及药理学应用的研究进展,分析了百脉根研究中存在的不足,并对百脉根的应用前景进行了展望,以期为百脉根的深入研究提供参考。

关键词：百脉根遗传多样性缩合单宁根瘤固氮分子生物学

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数据冗余信息引导的低剂量心肌灌注CT成像方法

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南方医科大学学报 2018年第1期38卷 27-33页

作者：林嘉慧边兆英马建华黄静陶熙曾栋郭宏南方医科大学生物医学工程学院//广州市医用放射成像与检测技术重点实验室广东广州510515 天津医科大学总医院医学影像科天津300052

目的心提出一种数据冗余信息引导的低剂量心肌灌注CT成像方法。方法考虑到心肌灌注CT图像帧内含有丰富的结构冗余性,且帧间具有高度的相似性,本文提出基于非局部均值滤波(NLM)和全变分(TV)混合框架的惩罚加权最小二乘(PWLS)图像重建模型... 详细信息

目的心提出一种数据冗余信息引导的低剂量心肌灌注CT成像方法。方法考虑到心肌灌注CT图像帧内含有丰富的结构冗余性,且帧间具有高度的相似性,本文提出基于非局部均值滤波(NLM)和全变分(TV)混合框架的惩罚加权最小二乘(PWLS)图像重建模型,简称为PWLS-avi NLM-TV。该模型利用了帧间结构相似性和帧内数据冗余性,能有效消除重建图像中的噪声和伪影,提高灌注序列图像帧内空间分辨率与帧间时间分辨率。结果 PWLS-avi NLM-TV相比PWLS-TV和PWLSavi NLM能更好地去除心肌灌注图像中的噪声和伪影,同时较好保持图像边缘和细节信息,进而有效区分缺血心肌与正常心肌。结论数据冗余信息引导的重建算法可有效改善低剂量心肌灌注CT成像质量,更好地为临床影像诊断服务。

关键词：低剂量心肌灌注CT 非局部均值正则化全变分正则化

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UeRbf1调控菰黑粉菌丝状生长和致病力的作用研究

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植物病理学报 2022年第2期52卷 165-178页

作者：胡映莉卞加慧郭月美彭辉汤近天夏文强叶子弘张雅芬中国计量大学生命科学学院/浙江省生物计量与检验检疫技术重点实验室杭州310018

基于菰黑粉菌的全基因组序列,克隆得到了UeRbf1(GenBank登录号:MW375682),该基因的开放阅读框为1 281 bp,无内含子,编码426个氨基酸,经预测具有3个C_(2)H_(2)锌指结构域,提示其具有转录调控功能。进一步在菰黑粉菌中敲除UeRbf1后进行体... 详细信息

基于菰黑粉菌的全基因组序列,克隆得到了UeRbf1(GenBank登录号:MW375682),该基因的开放阅读框为1 281 bp,无内含子,编码426个氨基酸,经预测具有3个C_(2)H_(2)锌指结构域,提示其具有转录调控功能。进一步在菰黑粉菌中敲除UeRbf1后进行体外生长及侵染试验,发现:在体外培养时,UeRbf1的缺失没有改变菌株的生长速率及单倍体形态,也未改变两个性亲和UeRbf1缺失突变体的融合及菌丝形成能力,但是融合菌丝的丝状生长能力显著减弱,而且在侵染时UeRbf1缺失突变体丧失了菌丝形成及丝状生长能力,人工接种野茭后也无法使其茎部膨大。以上结果表明,UeRbf1是调控菰黑粉菌丝状生长和侵染能力的一个重要因子。另外,UeRbf1缺失突变后,在体外融合及侵染时相关丝状生长和致病力的调控因子Biz1、Clp1、Hdp1和UeKpp6呈下调表达,其中Biz1的下调表达最为显著,在突变体中几乎不表达,说明UeRbf1对菰黑粉菌丝状生长和致病力的影响,可能是通过调控Biz1来实现的。

关键词：菰黑粉菌 UeRbf1 丝状生长致病力

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紫花苜蓿基因工程改良研究进展

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草业科学 2020年第1期37卷 139-155页

作者：边佳辉刘自扬李宗英赵媛媛唐益雄孙占敏吕嘉卫张金林吴燕民兰州大学农业农村部草牧业创新重点实验室/兰州大学草地农业科技学院甘肃兰州730020 中国农业科学院生物技术研究所北京100081 上海金柯劳沃生物科技有限公司上海200000

紫花苜蓿(Medicago sativa)具有适应性强、蛋白含量高、适口性好和营养价值丰富等特点,是全球栽培面积最大的优良牧草。随着生物技术的快速发展,利用基因工程改良紫花苜蓿已成为国内外研究的热点。本文就紫花苜蓿载体介导法、DNA直接导... 详细信息

紫花苜蓿(Medicago sativa)具有适应性强、蛋白含量高、适口性好和营养价值丰富等特点,是全球栽培面积最大的优良牧草。随着生物技术的快速发展,利用基因工程改良紫花苜蓿已成为国内外研究的热点。本文就紫花苜蓿载体介导法、DNA直接导入法和种质系统介导法三类转化方法和抗生物胁迫、抗非生物胁迫、抗除草剂、品质改良及生物反应器开发五方面的转基因与遗传改良研究进行了全面的综述与分析,并对其应用前景及相关安全性等问题进行了展望,以期为紫花苜蓿基因工程改良的后续研究提供参考与借鉴。

关键词：紫花苜蓿基因工程遗传转化性状改良

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基于细长体理论和船舶参数方程对阻力优化

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船舶工程 2024年第S01期46卷 297-302页

作者：周亚兰卞嘉辉朱振涛上海船舶设备研究所上海200031 上海佳豪船舶设计研究院上海201612

针对无人双体平台的阻力优化展开了研究。根据最佳阻力下的船舶参数方程推导各个航速下的船型参数,采用三维线型设计和细长体理论计算全船阻力,寻求不同航速下的最小阻力解,数值化分析各参数对兴波阻力的影响。通过该方法可较快地确定... 详细信息

针对无人双体平台的阻力优化展开了研究。根据最佳阻力下的船舶参数方程推导各个航速下的船型参数,采用三维线型设计和细长体理论计算全船阻力,寻求不同航速下的最小阻力解,数值化分析各参数对兴波阻力的影响。通过该方法可较快地确定最优阻力条件下的船型参数,提高无人双体平台的经济性和竞争力。

关键词：双体船兴波阻力细长体理论

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